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        基于壓縮感知的醫(yī)學圖像重建方法

        2019-12-31 03:38:54張國平牟忠德
        生物醫(yī)學工程學進展 2019年4期
        關鍵詞:測量信號

        張國平,牟忠德

        江蘇省腫瘤醫(yī)院,江蘇省腫瘤防治研究所,南京醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院(南京,210009)

        1 壓縮感知

        壓縮感知基本構成通常包括稀疏表示、編碼測量、重構算法等內容[1-3],其理論框架詳見圖1,該理論適合對信號的采樣和編碼,對原始的信號線性投影以后,獲得測量信號值,然后通過重構算法,對該測量值進行重構,進而得到重建的信號[4-5]。

        圖1 壓縮感知框架示意圖

        (1)

        其中,φ表示對信號的稀疏變換域,Y表示信號X在φ域上的投影值。如果Y向量中只有K個系數,不為零或遠大于其它的系數,則稱X是K稀疏的,或者是可壓縮的,即可得信號X的稀疏表達如式(2)[6-7]。

        Y=φTX

        (2)

        2)根據壓縮感知理論中的非相關性準則,使用矩陣ψ對信號Y進行觀測,經式(3)可得測量矩陣。

        S=ψφTX

        (3)

        3)假設Θ=ψφT,則有S=ΘX,最后在l0范數框架下優(yōu)化求解X,結果如下:

        min‖φTX‖0s.t.ΘX=S

        (4)

        對于這個欠定方程(M

        2 重構算法分析

        在壓縮感知理論中,從稀疏系數中重構出原始信號就是信號的重構過程,重構算法可以轉化為線性規(guī)劃(Linear Programming,LP)問題的求解,直接求解方法即轉換為求解最小l0范數問題[8-9]。

        2.1 BP算法

        通過求解最小l0范數,來解決信號重構問題,即求解最小l0范數下的最優(yōu)化問題,以求得最優(yōu)化的重構結果,但是其計算復雜度較高。但是找到合適的稀疏信號,也就等于解決了式(4)的問題

        (4)

        其中,‖c‖0是序列{Ck}中非零項的個數。利用BP算法來解決式(5)的問題

        (5)

        BP算法的求解過程中,原始信號記為x,φ,為觀測矩陣,基矩陣φ已知,求解s等同于求解x,其中s,xRN,yRM,M

        2.2 OMP算法

        OMP算法是基于匹配追蹤算法的正交匹配追蹤算法,來解決信號重構問題[10-12],該算法的具體步驟如下:

        1)尋找殘值r和矩陣ψj積中的最大元素的索引λ;

        2)將索引集更新,記錄經由傳感矩陣φ進行重構后的原子集合,詳細表示方式如下:

        Λt=Λt-1∪{λt}

        (6)

        φt=[φt-1,ψλt]

        (7)

        3)實現式(8)中的最小二乘法;

        (8)

        4)借助式(9),更新殘值,t=t+1;

        (9)

        5)對Step 4中t進行判斷,滿足條件t>K,則迭代停止;如果不滿足,則繼續(xù)執(zhí)行步驟 1。

        2.3 StOMP算法

        StOMP算法是由Donoho等對正交匹配算法進行改進,并提出了分段正交匹配追蹤算法,該算法在正交匹配追蹤算法的基礎上做了簡化[13-14]。StOMP算法具體步驟如下:

        1)對數值進行初始化設置,設定最大的迭代步長,求解最大的迭代誤差e,s=1;

        2)將小波變換后,獲得的變換系數,記為稀疏矩陣y,然后隨機選取測量數據,得式(10):

        Θs=φTrs-1

        (10)

        3)對Θ進行如式(11)的規(guī)范化處理,其中K為Θ信號的長度

        (11)

        4)對Θ進行閾值處理,如式(12):

        ∑S={j:|ΘS(j)|>λS}

        (12)

        5)最新合并兩次變換所得的坐標索引,并對IS集合進行一致化處理如式(13),得IS:

        IS=IS-1∪ ∑S

        (13)

        6)求解線性方程組,min(‖xs‖1)s.t.y=φXS,計算公式如(14)。

        (14)

        7)計算殘差rS,如式(15):

        rs=y-sS

        (15)

        8)稀疏解的精度判定,如rs

        3 實驗結果與分析

        3.1 使用Shepp Logan的實驗結果

        為了比較不同的壓縮感知圖像重構算法,我們選擇Shepp Logan模型來作為測試圖像,對其取Haar小波變換并進行仿真實驗,分別采用BP算法、OMP算法、StOMP算法進行圖像重構,在相同的采樣頻率下,比較其重構時間和重構效果如圖2所示。

        圖2 采樣率為10%的Shepp Logan重構結果

        3.2 使用真實MRI圖像的實驗結果

        為比較不同采樣頻率,在實際的臨床MRI醫(yī)學圖像條件下,觀察壓縮感知算法的重建效果,在欠采樣率為10%-50%范圍內,分別選擇15%和25%兩種采樣情形下,觀察這三種算法對實際的臨床MRI醫(yī)學圖像的重構效果如圖3和圖4所示。

        4 結論

        綜上所述,可以得到如下結論:(1)借助壓縮感知理論,通過合理的算法設計,是可以近似重構出醫(yī)學圖像的,并且整體圖像質量不會明顯下降。(2)在相同欠采樣率的情況下,BP算法的重構結果是最好的,但運算時間最長;OMP算法的重構結果次之,是運算時間比BP算法少;StOMP結果最差,不適用于精確的圖像重建。

        圖3 采樣率15%的MRI重構結果

        圖4 采樣率25%的MRI-Brain重構結果

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