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        數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在醫(yī)療信息系統(tǒng)中的應(yīng)用

        2019-10-21 18:21:48孔明霞韓文英王龍
        科學(xué)與財富 2019年10期
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)挖掘

        孔明霞 韓文英 王龍

        摘 要:計算機技術(shù)在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用越來越引起人們的重視,數(shù)據(jù)挖掘是其中新興的熱門學(xué)科,應(yīng)用在醫(yī)療系統(tǒng)中可以處理已經(jīng)積累起來的病人資料數(shù)據(jù)庫中大量的歷史數(shù)據(jù),利用已有的這些信息,通過各種技術(shù)和方法找出其中蘊涵的、先前未知的,但非常有用的規(guī)則或模式,即找出新的病因或發(fā)現(xiàn)新的治療方法。也就是說數(shù)據(jù)挖掘的目的是要發(fā)現(xiàn)新的知識,這些新知識必將促進醫(yī)療事業(yè)的發(fā)展。 本文介紹了數(shù)據(jù)挖掘的概念、主要的技術(shù)方法及其實施步驟,以及該技術(shù)在醫(yī)療信息系統(tǒng)中的應(yīng)用。

        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)挖掘;關(guān)聯(lián)規(guī)則;分類規(guī)則;臨床信息系統(tǒng)(CIS)

        1 數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)概述

        1) 概念[1]

        數(shù)據(jù)挖掘(Data Mining),又稱數(shù)據(jù)庫中的知識發(fā)現(xiàn)(Knowledge Discovery in Database, KDD),是指從大型數(shù)據(jù)庫或數(shù)據(jù)倉庫中提取隱含的、未知的、非平凡的及有潛在應(yīng)用價值的信息或模式,它是數(shù)據(jù)庫研究中的一個很有應(yīng)用價值的新領(lǐng)域,融合了數(shù)據(jù)庫、人工智能、機器學(xué)習(xí)、統(tǒng)計學(xué)等多個領(lǐng)域的理論和技術(shù)。數(shù)據(jù)挖掘工具能夠?qū)淼内厔莺托袨檫M行預(yù)測,從而很好地支持人們的決策。

        2) 數(shù)據(jù)挖掘的技術(shù)方法

        數(shù)據(jù)挖掘的技術(shù)主要有關(guān)聯(lián)分析、序列模式分析、分類分析、聚類分析、統(tǒng)計分析、基于模糊集合的分析、基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的分析等等。

        ●關(guān)聯(lián)分析法:利用關(guān)聯(lián)規(guī)則進行數(shù)據(jù)挖掘,其目的是挖掘隱藏在數(shù)據(jù)間的相互關(guān)系,它能發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫中形如"90%的顧客在一次購買活動中購買商品A的同時購買商品B"之類的知識。采用關(guān)聯(lián)分析法可以從醫(yī)療信息系統(tǒng)(如CIS)的數(shù)據(jù)庫或為此建立的數(shù)據(jù)倉庫、數(shù)據(jù)集市的細節(jié)或事務(wù)中尋找出重新出現(xiàn)概率很高的模式。即從CIS的數(shù)據(jù)庫中分析某種疾病治療過程中誘發(fā)其他疾病的概率以及與時間的關(guān)系等[3]。

        ●序列模式分析法:與關(guān)聯(lián)分析相似,其目的也是為了挖掘數(shù)據(jù)之間的聯(lián)系,但其側(cè)重點在于分析數(shù)據(jù)間的前后序列關(guān)系。它能發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)庫中形如"在某一段時間內(nèi),顧客購買商品A,接著購買商品B,而后購買商品C,即序列A→B→C出現(xiàn)的頻度較高"之類的知識。

        ●分類分析法:設(shè)有一個數(shù)據(jù)庫和一組具有不同特征的類別(標記),該數(shù)據(jù)庫中的每一個記錄都賦予一個類別的標記,這樣的數(shù)據(jù)庫稱為示例數(shù)據(jù)庫或訓(xùn)練集。分類分析就是通過分析示例數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù),為每個類別做出準確的描述或建立分析模型或挖掘出分類規(guī)則,然后用這個分類規(guī)則對其它數(shù)據(jù)庫中的記錄進行分類。目前已有多種分類分析模型得到應(yīng)用,其中幾種典型模型是線性回歸模型、決策樹模型、基本規(guī)則模型和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型。

        ●聚類分析法:通過分析數(shù)據(jù)庫中的記錄數(shù)據(jù),根據(jù)一定的分類規(guī)則,合理地劃分記錄集合,確定每個記錄所在類別。它所采用的分類規(guī)則是由聚類分析工具決定的。聚類分析的方法很多,其中包括系統(tǒng)聚類法、分解法、加入法、動態(tài)聚類法、模糊聚類法、運籌方法等。采用不同的聚類方法,對于相同的記錄集合可能有不同的劃分結(jié)果。

        2數(shù)據(jù)挖掘的實施步驟

        數(shù)據(jù)挖掘是一個利用各種分析工具在海量數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)模型和數(shù)據(jù)間關(guān)系的過程,它是一個交互式的迭代過程。主要包括以下實施步驟[2]:

        1)取得數(shù)據(jù)源

        數(shù)據(jù)挖掘最理想的數(shù)據(jù)源是數(shù)據(jù)倉庫。數(shù)據(jù)倉庫由來自多個數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)組成,并消除他們之間的不一致。如數(shù)據(jù)倉庫不可得,則要從各個數(shù)據(jù)庫中取得數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)挖掘有時還需要對原有數(shù)據(jù)庫進行改造以得到可用的數(shù)據(jù)源,例如延長歷史的保留期等。

        2)數(shù)據(jù)預(yù)處理

        這包括消除來自不同數(shù)據(jù)庫甚至不同類型計算機數(shù)據(jù)表示的不一致,在數(shù)據(jù)中加入新的數(shù)據(jù)項(例如對原有數(shù)據(jù)項進行有意義的數(shù)學(xué)計算而得到新的數(shù)據(jù)項),以發(fā)現(xiàn)更多的規(guī)律,將數(shù)據(jù)分為訓(xùn)練集和測試集等方面。

        3) 構(gòu)造和訓(xùn)練模型

        這個步驟依賴于具體的數(shù)據(jù)挖掘方法。常用的方法有規(guī)則歸納、決策樹、遺傳算法、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、粗集方法、鄰近搜索方法、模糊邏輯、可視化技術(shù)等。

        4) 評價模型

        用測試數(shù)據(jù)集來測試模型以估計模型的正確率。最后一步是驗證模型,比如通過對病人診療數(shù)據(jù)分析后得到一個模型,不管它與歷史數(shù)據(jù)多么吻合,在進行臨床使用前,都必須首先進行臨床試驗。

        3 數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在醫(yī)療信息系統(tǒng)中的應(yīng)用

        下面以序列模式分析法為例,介紹了數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在醫(yī)療中的重要作用。

        給定一個病人就診數(shù)據(jù)庫D,每條就診記錄包含進行該就診的病人標識、就診時間和診斷出的疾病數(shù)據(jù)項。數(shù)據(jù)項集是數(shù)據(jù)項的非空集合,序列是數(shù)據(jù)項集的有序集。

        設(shè)Sa=〈A1,A2,…,AK〉,Sb=〈B1,B2,…,Bn〉是兩個序列,如果存在整數(shù)1≤i

        一個病人在一段時間內(nèi)進行的所有診斷可看作一個序列:S=〈item set(T1), item set(T2),…, item set(Tn)〉,其中item set(Ti)表示診斷Ti診斷出的疾病集,序列中的元素是按診斷時間排列的,這樣一個序列叫這個病人的病人序列。

        如果一個序列S包含在一個病人的病人序列中,則稱這個病人序列支持序列S。在一個診斷數(shù)據(jù)庫中,一個序列的支持度是支持這個序列的病人數(shù)占全部診斷病人數(shù)的比例。

        對一個診斷數(shù)據(jù)庫D,挖掘序列模式的任務(wù)就是在D中找出所有的最大序列,這些序列滿足用戶指定的最小支持度,這樣的一個序列叫做序列模式。具有最小支持度的序列叫頻繁序列。

        在診斷數(shù)據(jù)庫D中挖掘序列模式是先將D轉(zhuǎn)換為病人序列庫Q,然后通過對Q多次掃描找出各個長度的頻繁序列,序列的長度指序列包含項的個數(shù)。如果用戶指定的最小支持度為37%(即有兩個病人支持),則挖掘的序列模式如下:

        S1=〈{1003},{1009}〉和S2=〈{1003},{1004,1007}〉。

        這樣對醫(yī)院的就診數(shù)據(jù)庫進行一些必要的預(yù)處理,選取一類病情,然后利用挖掘序列模式的算法,挖掘滿足支持度限制的序列模式,就可以發(fā)現(xiàn)一些病情的發(fā)展模式,從而有針對性的預(yù)防某些疾病的發(fā)生,同時給病人一些實際數(shù)據(jù)的說明,使病人高度重視某些疾病,防止病情進一步發(fā)展。

        4 結(jié)束語

        本文通過舉例介紹了數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在醫(yī)療系統(tǒng)中的應(yīng)用,通過醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的專業(yè)知識和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的結(jié)合,收集大量穩(wěn)定、可靠的醫(yī)療數(shù)據(jù),反復(fù)實踐,不斷提高挖掘知識的質(zhì)量,合理應(yīng)用,必將對醫(yī)學(xué)研究、疾病診斷和治療起到重要的促進作用。

        參考文獻:

        [1]屈竟輝,醫(yī)學(xué)信息數(shù)據(jù)庫的建立與數(shù)據(jù)挖掘,第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報,2001年第22期。

        [2]付階輝,趙林度,數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在HIS中的應(yīng)用,東南大學(xué)學(xué)報,2002年10月。

        [3]顏延,秦興彬,樊建平,王磊,醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)研究綜述,科研信息化技術(shù)與應(yīng)用,2014(06)

        [4]王淑,陳敏,于廣軍,舒林華,基于數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的典型兒童呼吸道感染性疾病臨床決策支持系統(tǒng)研究,中國數(shù)字醫(yī)學(xué),2015(12)

        [5]于婷,大數(shù)據(jù)時代的數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)與應(yīng)用,通訊世界,2018年12月。

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