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        基于定量蛋白質(zhì)組學解析西瓜 嫁接苗耐冷性的分子機制

        2019-09-19 19:26:04施先鋒王希波程菲曹海順梁歡魯軍陽孔秋生別之龍
        中國瓜菜 2019年8期
        關(guān)鍵詞:冷性嫁接苗光合作用

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        目的與意義: 西瓜是一種重要的喜溫經(jīng)濟作物。低溫是西瓜生產(chǎn)的主要環(huán)境限制因素之一。砧木嫁接是提高西瓜耐冷性的有效途徑。然而,其分子機制知之甚少。本研究通過植株表型、光合作用及膜損傷程度等指標證實南瓜砧木嫁接提高了西瓜耐冷性,采用基于iTRAQ技術(shù)的蛋白質(zhì)組學方法鑒定了低溫處理2 d后西瓜嫁接苗的蛋白質(zhì),分析了參與相關(guān)代謝途徑的差異豐度蛋白,為從蛋白水平上揭示嫁接提高西瓜耐冷性的分子機制提供新的線索。

        材料與方法: 選用西瓜自交系‘97103(低溫敏感型)和南瓜品種‘青研砧1號(耐冷性強)為試材進行嫁接,待西瓜自嫁苗(SG)和南瓜砧木嫁接苗(RG)4片真葉時進行低溫處理(10 °C/5 °C;12 h/12 h),以正常溫度(28 °C/18 °C;12 h/12 h)為對照。低溫處理48 h后分別用電導儀和LI-6400型便攜式光合作用測量系統(tǒng)測定幼苗葉片的相對電導率和凈光合速率。同時,取樣用于蛋白質(zhì)提取,按iTRAQ試驗流程操作鑒定低溫響應(yīng)蛋白質(zhì),并結(jié)合生物學(COG、GO及KEGG)對差異蛋白質(zhì)進行分類。選取8個差異蛋白對應(yīng)的基因進行了實時熒光定量PCR分析。

        結(jié)果與分析: (1)與RG比較,低溫處理48 h后SG的葉片呈現(xiàn)更嚴重的萎蔫。REL和Pn結(jié)果也表明南瓜砧木嫁接顯著減輕了西瓜的低溫傷害。(2)獲得的iTRAQ數(shù)據(jù)與西瓜組學數(shù)據(jù)比對,共鑒定到4 796個低溫響應(yīng)蛋白質(zhì),通過肽數(shù)量、不同分子量蛋白質(zhì)的分布及鑒定肽段的蛋白質(zhì)序列覆蓋率等分析,表明iTRAQ數(shù)據(jù)可信度高。(3)與常溫嫁接苗比較,低溫脅迫后SG和RG中共鑒定752個差異豐度蛋白。通過COG數(shù)據(jù)庫比對,752個差異蛋白中557個被分為22類;GO分析結(jié)果表明,催化活性和結(jié)合是主要的分子功能;代謝過程和細胞過程是主要的生物過程;細胞器、細胞及細胞部分是主要的細胞成分。KEGG顯著富集結(jié)果表明,在SG中包括α-亞麻酸代謝、氧化磷酸化、嘌呤代謝及碳代謝等。而在RG中包括核糖體、剪接體、光合作用天線蛋白、mRNA監(jiān)督、MAPK信號途徑及谷胱甘肽代謝等通路顯著富集。綜合COG、GO 及KEGG結(jié)果和相關(guān)文獻,分析了參與光合作用(13個)、碳代謝和能量代謝(19個)、脅迫防御(15個)、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控(15個)、蛋白質(zhì)動態(tài)平衡(55個)、精氨酸合成(6個)及信號轉(zhuǎn)導(11個)等代謝途徑的差異蛋白質(zhì)。

        結(jié)? ? 論: 基于蛋白質(zhì)組學結(jié)果,南瓜砧木嫁接苗的耐冷性可能與光合作用、碳代謝和氧化磷酸化等過程產(chǎn)生的能量有關(guān)。南瓜砧木嫁接苗可以通過提高ROS的清除能力和精氨酸的生物合成來應(yīng)對低溫脅迫。此外,轉(zhuǎn)錄后調(diào)控和蛋白質(zhì)動態(tài)平衡在西瓜嫁接苗應(yīng)對低溫脅迫起重要作用。值得注意的是蛋白激酶可能是南瓜砧木嫁接苗中作為正調(diào)節(jié)因子應(yīng)對低溫脅迫。生理指標和8個蛋白質(zhì)對應(yīng)基因轉(zhuǎn)錄水平的結(jié)果證實了iTRAQ結(jié)果是可靠的。

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