郭曉強
美國遺傳學家劉易斯發(fā)明了互補測試,并進一步闡明果蠅體節(jié)發(fā)育與調控基因之間的共線性關系,為發(fā)育生物學研究奠定了堅實基礎,因此榮膺1995年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎。
生命從一個受精卵最終形成完整個體的過程稱為發(fā)育。這個過程既至關重要,又高度復雜,因此它的精細調控,無疑成為眾多生命科學家試圖破解的難題之一。1970年代末,多位果蠅遺傳學家鑒定了發(fā)育調控的一系列關鍵基因,從而為發(fā)育生物學研究打開一扇嶄新的大門,美國科學家劉易斯(Edward Butts Lewis)為此做出了奠基性貢獻。
鐘情果蠅
1918年5月20日,劉易斯出生于美國賓夕法尼亞州威爾克斯-巴里一個中產階級家庭,父親是一位鐘表制造商和珠寶商。然而,1929年席卷全球的經濟危機,給劉易斯一家?guī)砭薮鬀_擊,幸運的是在叔叔照顧下,最終渡過了難關。
劉易斯具有良好的藝術天賦。10歲時,劉易斯從叔叔那里收到一根木笛作為禮物,幾年后又從父親那兒得到一根銀色長笛,還憑借自身努力,成為當地交響樂團的一員。由于在音樂方面的成績,他獲得了一份獎學金,有機會進人藝術氣息濃厚的賓夕法尼亞州巴克內爾學院。
除藝術天分外,劉易斯還對科學尤其是生物學充滿了熱愛之情。在邁爾斯高中時,劉易斯就與摯友諾維茨基(Edward Novitski,后來也成為一名偉大的果蠅遺傳學家)一起加入學校生物學俱樂部。1933年,兩人從美國《科學》雜志上看到一則廣告,提及1美元可購買100只實驗室果蠅。當時,果蠅由于摩爾根(T.H.Morgan)及其同事的廣泛研究而成為一種明星級的遺傳學模式生物,此外果蠅由于飼養(yǎng)簡易、繁殖快等眾多優(yōu)點而受到研究人員青睞。兩人花費了俱樂部僅有的4美元,購置了果蠅和相關飼養(yǎng)設備,在學校實驗室開啟了果蠅研究的生涯。閑暇時間,兩位愛德華(Edward)到他們的“果蠅實驗室”去觀察突變體,希望找到期待中的變異果蠅。慢慢地,劉易斯喜歡上了果蠅這種“小精靈”,把它作為自己鐘愛一生的科研伴侶[2]。
由于對果蠅的癡迷和摯愛,劉易斯在巴克內爾學院僅一年時間就轉到明尼蘇達大學。他之所以選擇明尼蘇達大學,一方面是學費不貴,個人可以承受,另一方面在于能繼續(xù)從事果蠅研究。在這里,劉易斯遇到人生第一位科學導師——遺傳學教授奧利弗(C.P.Oliver)。奧利弗是摩爾根學生穆勒(H.J.Muller,1946年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎獲得者)的博士生,從這個角度講,劉易斯稱得上摩爾根遺傳學派的第四代傳人。奧利弗非常欣賞劉易斯,在自己辦公室為劉易斯準備了一個工作臺,并鼓勵他繼續(xù)做自己高中階段的果蠅研究。1939年,劉易斯從明尼蘇達大學畢業(yè),獲得生物統計學學位。
1939年在奧利弗推薦下,劉易斯成功獲得了加州理工學院獎學金,并成為著名遺傳學家斯特蒂文特(A.H.Sturtevant)的學生。斯特蒂文特是摩爾根學生,這樣劉易斯也得以升為摩爾根學派第三代,不過更重要的是,劉易斯真正開始了自己的果蠅科研生涯,從早期的單純愛好轉變?yōu)榻K身事業(yè)。
果蠅遺傳
在加州理工學院,劉易斯的研究重點在于探索染色體上基因位置對表型的影響。他發(fā)現,存在兩種果蠅眼睛形態(tài)異常的突變體,但無法確定這兩種突變體究竟是由相同的基因控制,還是受兩個基因影響。經過縝密思考,劉易斯開創(chuàng)了著名的順反測驗(cis-trans test),又稱互補實驗?!绊樂础币辉~借鑒了有機化學概念,如2-丁烯有兩種同分異構體,兩個甲基在雙鍵同側稱順式,在對側則稱反式。在此以紅眼果蠅遺傳為例來理解順反測驗原理。野生型果蠅眼睛是紅色,這是因為紅色的形成由兩個基因A和B控制,如果A或者B突變形成a或b,則喪失紅色合成能力,因此純合aa或bb為白眼果蠅。讓雙基因純顯性AABB與雙基因純隱性aabb雜交,其F1代為AaBb,由于A和B在同一條染色體上,即為順式結構,果蠅表型為紅眼(野生型)。讓單基因純顯性和單基因純隱性果蠅AAbb和aaBB雜交,產生的F1代基因型為AabB,由于A和B在兩條染色體上,因此二者為反式關系。此時可能有兩種表型,若為紅眼,則意味著表型互補,表明A和B為兩個不同基因;若仍為白眼,則說明互補失敗,因此a和b應為同一基因內部不同位置的突變。順反測驗為鑒別表型相同的兩個甚至多個突變體,究竟由相同還是不同基因控制,提供了有效的研究手段,即使今天仍是經典遺傳學的基本方法之一。尤其重要的是,順反測驗為劉易斯將來進行果蠅發(fā)育研究奠定了堅實基礎。
劉易斯又鑒定出多種果蠅突變體的相關基因,并利用順反測驗確定了它們之間的關聯,因此于1942年獲得理學博士。這也意味著果蠅遺傳學領域的一顆新星正在冉冉升起。
1941年底爆發(fā)的珍珠港事件,促使美國投入第二次世界大戰(zhàn),也打斷了劉易斯進一步深造的計劃。為服務軍隊,劉易斯學習了一年的氣象學知識,并隨后加入美國空軍,負責駐扎在太平洋軍艦上的氣象預報工作。
1946年,從戰(zhàn)場歸來的劉易斯重回加州理工學院,再次開啟自己鐘愛的果蠅事業(yè)。當時恰逢著名遺傳學家比德爾(G.W.Beadle,1958年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎獲得者)從斯坦福大學轉到加州理工學院并擔任生物系主任,他對果蠅同樣情有獨鐘。當時加州理工學院尚缺一名果蠅倉庫保管員,于是招募自己的學生帕梅拉(Pamela Harrah)負責此事,并將她介紹給劉易斯相識。雙方一見鐘情,不久走人婚姻殿堂。婚后的帕梅拉既是劉易斯生活上的伴侶,彼此相敬如賓;又是劉易斯在科研上的助手,兩人夫唱婦隨。劉易斯負責誘導果蠅突變和進行雜交實驗,帕梅拉負責鑒定和篩選果蠅突變體。
果蠅發(fā)育
果蠅屬于節(jié)肢動物門昆蟲綱,其身體基本結構從前到后分為頭部(head)、胸部(thorax)和腹部(abdomen),各部又可進一步分節(jié),如胸部3節(jié)(T1—T3)、腹部8節(jié)(A1—A8),其中第二胸節(jié)(T2)生長一對翅膀。1915年,摩爾根的學生布里吉斯(C.B.Bridges)發(fā)現一種發(fā)育異常的果蠅突變體,竟然長出兩對翅膀。解剖發(fā)現,這是源于第三胸節(jié)(T3)轉換為第二胸節(jié)(T2),從而獲得了翅膀生長的能力。這種突變被命名為同源異形(homeosis),這種果蠅則被稱為雙胸突變體。后又鑒定出另外兩種異形突變體,分別稱超級雙胸果蠅和雙胸樣果蠅。由于通過遺傳作圖發(fā)現了控制這些性狀的三個基因,緊密排列在同一條染色體上,因而將其統稱為雙胸基因復合物(bithorax gene complex,BX-C)。布里吉斯一直試圖揭開其中的謎題,遺憾的是因早逝而未能完成,但他慷慨捐出異形果蠅和自己的研究數據,以期后人來實現他未盡的心愿。
劉易斯很早就熟悉異形果蠅,但苦于沒有思路而一直未接觸這一課題。1951年的一天,劉易斯突發(fā)奇想,決定接受這個挑戰(zhàn),全面研究BX-C調控果蠅發(fā)育的機制。當時他沒有料到,此后自己花費了近30年時間才取得重大突破。
劉易斯首先采用X射線照射和化學誘導的策略,制備更多的果蠅異形突變體。意想不到的是,這些突變基因都位于同一條染色體。
劉易斯因此將這些基因分為幾個亞類,BX-C只是其中之一。他隨后采用X射線照射,引發(fā)發(fā)育相關基因的大片段缺失,并通過進一步的單基因回補策略,來判斷特定基因的功能。在基因工程與轉基因技術尚未誕生的年代,劉易斯只能借助果蠅雜交的方法實現回補效應,困難程度可想而知。由于果蠅發(fā)育本身的復雜性和技術手段的局限性,劉易斯幾十年如一日地重復著果蠅誘變、雜交、觀察、篩選和統計等工作,以期從繁雜的數據中梳理出科學真相。此外,劉易斯還時刻關注著生命科學的最新進展,如操縱子學說提出后,他迅速將該理論應用到發(fā)育調控研究,在拓展認識上得到重要幫助。他還特別看重學術討論,從中汲取了大量有價值的思想與觀點。
1978年,劉易斯發(fā)表了發(fā)育生物學領域一篇具有里程碑意義的論文,總結回顧了自己近30年來關于BC-X復合物及相關基因調控果蠅發(fā)育的研究成果。在這篇論文中,劉易斯主要提及兩個重大發(fā)現:首先定義了9類發(fā)育相關基因,這些基因與9個體節(jié)(T3和A1—A8)呈共線性關系,即一類基因控制一個體節(jié)發(fā)育,并且基因在染色體上的排布與果蠅體節(jié)的順序呈現嚴格的一一對應關系;其次發(fā)現了許多發(fā)育調節(jié)基因,如BC-X復合物,可通過影響其他基因的表達(激活一類基因表達,同時抑制另一類基因表達)而執(zhí)行生物學功能。
劉易斯對果蠅發(fā)育的高度洞察力、科學思維的獨創(chuàng)性、科研過程獨有的個人魅力以及近乎完美的天才解釋,革新了大家對發(fā)育過程的理解。劉易斯常一人躬耕于實驗室,以果蠅為伴,與科研為伍。這種看起來有點“愚笨”的研究策略、這種專注和執(zhí)著,代表了那個時代科學家的高貴品質。即使在幾十年無明顯進展的情況之下,仍然義無反顧,甘坐“冷板凳”,追求這個在當時看來“冷門”的領域。
1978年文章的發(fā)表,立刻引起學術界極大的關注,“卅年窗下無人問”的劉易斯,可謂“不鳴則已,一鳴驚人”。眾多科學家迅速加入果蠅發(fā)育領域,而該領域也迅速成為生命科學研究的一大熱點。因此可以說,劉易斯以一人之力,在一定程度上扭轉了發(fā)育生物學研究的走向。德國女科學家福爾哈德(C.Niisslein-Volhard)和美國遺傳學家威紹斯(E.F.Wieschaus)采用化學誘變策略,制備出眾多新型的果蠅異形突變體,進一步鑒定出更多的發(fā)育調控基因,從而拓展和延伸了劉易斯的成果。1995年,三位科學家憑借著對“早期胚胎發(fā)育遺傳控制”原理的發(fā)現,分享了諾貝爾生理學或醫(yī)學獎。
劉易斯發(fā)現的另一大意義在于,促使科學家開始研究BY-C復合物的具體生物學功能。進入1980年代,研究人員借助基因測序的方法,鑒定出這些異形基因都包含一段180個堿基的保守序列,命名為異形框(homeobox),其對應的60個氨基酸則被稱為同源異形域(homeodomain)。因此,異形基因實際上編碼的是一類轉錄調控因子,這些轉錄因子通過保守的同源異形域與靶基因特定的DNA序列結合,從而發(fā)揮轉錄調控作用。這些研究極大地加深了對發(fā)育過程的理解與認識。
進化及癌癥研究
劉易斯很早就對進化抱有濃厚興趣。最初的關注點在于新基因產生的原理。1951年,劉易斯在前人工作的基礎上提出,同源基因之間通過不對等重組,可產生串聯重復基因,進一步借助突變而使基因功能發(fā)生分化,最終形成基因簇結構。
果蠅發(fā)育基因異形框的發(fā)現,促使科學家開始尋找其他生物發(fā)育基因的特征,結果在哺乳動物中發(fā)現廣泛存在一般稱為Hox的基因,它們是進化上最保守的基因家族。人類擁有39個Hox基因,可被進一步分為四個亞類,分別定位于四條染色體。后來借助基因敲除技術,證明Hox基因控制小鼠胚胎發(fā)育也遵循共線性規(guī)則。這一發(fā)現使得劉易斯的科學貢獻得到極大提升,也使科學家意識到發(fā)育是一個高度保守的過程。該發(fā)現也是利用果蠅等模式動物研究人類疾病發(fā)生機制的重要理論基礎(同源基因具有保守的生物學功能)。
上述發(fā)現還徹底改變了對器官進化過程的理解,例如同源器官(homologous organ)。同源器官是指不同生物的某些器官在基本結構、彼此間相互關系以及胚胎發(fā)育過程等方面具一定相似性,但外形并不相似,功能也有差別,如鳥的翅膀、蝙蝠的翼手、鯨的胸鰭、狗的前肢以及人的上肢等。異形框的發(fā)現為同源器官的演變過程提供了重要支持,引發(fā)了生命進化研究與發(fā)育學的融合,進而誕生了一門新學科——進化發(fā)育生物學。劉易斯本人也以果蠅為模型,來研究進化進程。他觀察到,四翅突變果蠅與蜻蜓非常相似,而十胸節(jié)突變果蠅又和蜈蚣類似等,從而提示了不同昆蟲之間有著進化上的關聯。
1950年代,劉易斯在研究果蠅胚胎發(fā)育之謎的同時,還從事了另一項重要研究,即輻射對人類健康的影響。關于輻射,主流觀點認為存在閾值效應,低于一定劑量(閾值)就不會增加癌癥發(fā)生風險。憑借著在果蠅突變體制備方面的豐富經驗,劉易斯敏銳意識到這一說法存在重大問題。他和好友對廣島與長崎遭受原子彈襲擊的幸存者進行了實地調查,還對接觸放射線的臨床醫(yī)生及患者的白血病發(fā)生情況進行了分析,最終得出結論:輻射劑量與白血病發(fā)生呈線性關系,并不存在所謂的安全輻射閾值。1957年,劉易斯發(fā)表了這一結果,立刻引發(fā)了一場爭論,最終他用詳實的數據表明了自己理論的正確性。
功成身就
1988年,70歲的劉易斯從自己奉獻一生的科研崗位退休,但并未離開實驗室和所鐘愛的果蠅。即使在去世前一個月,他仍在實驗室里忙碌,并完成人生的最后一篇論文。劉易斯實驗記錄本的最后一行,清晰記載了“果蠅雜交53 446”這個數據,代表自1941年第一次雜交開始,在漫長60多年科研生涯中,劉易斯完成的雜交實驗總次數(近900次/年)。2004年7月21日,劉易斯因前列腺癌而在帕薩迪納當地的亨廷頓紀念醫(yī)院去世,享年86歲。
劉易斯在科研上堪稱人生贏家,除諾貝爾獎外還獲得美國遺傳學會摩爾根獎章(1983年)、加拿大加德納基金會國際獎(1987年)、以色列沃爾夫醫(yī)學獎(1987年)、美國國家科學獎章(1990年)、拉斯克基礎醫(yī)學獎(1991年)和美國哥倫比亞大學霍維茨獎(1992年)等,可以說把相關的重要獎項囊括無遺,算得上贏了個科學獎的大滿貫。1968年,劉易斯當選美國科學院院士,此外還是英國皇家學會外籍會員(1989年)。
劉易斯整個科研生涯都以“特立獨行”著稱。他很少發(fā)表論文,因為篤信從事科研唯一動力就是興趣。他的思維受英國哲學家羅素(B.Rusell)影響甚大,非??粗爻橄笏季S在科學研究中的重要性,非常喜歡從錯綜復雜的數據中抽絲剝繭,找到科學原埋所在。在長期研究不被主流看好的壓力下從不氣餒,一如既往地堅守自己的信念。
劉易斯繼承了摩爾根學派的優(yōu)良傳統,那就是不指派具體研究課題給研究生或博士后,相反鼓勵他們自我探索,因為他相信,興趣和方向是學生自發(fā)形成的而非外界強加的??赡芨@個緣故有關,他一生培養(yǎng)的學生數量有限。劉易斯在科研上還非??犊蠖?,免費為同行提供研究材料和相關信息,尤其對剛進人果蠅研究領域的年輕人更是關愛有加,大力提攜,幫助他們迅速成長為領域內佼佼者。他的科學成就和個人魅力也吸引了眾多年輕學子加入果蠅遺傳和發(fā)育研究這個領域并加以發(fā)揚光大。值得提及的是,劉易斯算得上當仁不讓的摩爾根衣缽傳人。摩爾根最得意三位弟子穆勒、特蒂文特和布里吉斯均影響了他。劉易斯跟隨穆勒的學生走進了果蠅研究殿堂,跟隨特蒂文特掌握了揭開果蠅之謎的鑰匙,沿著布里吉斯足跡最終榮登諾貝爾獎領獎臺。1966年,劉易斯成為摩爾根講座教授。
2018年,恰逢劉易斯一百周年誕辰,撰此文以示懷念。
[1]The Nobel Prize Organisation.Edward B.Lewis.https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/1995/lewis/facts,2019-02-17.
[2]Crow J F,Bender W.Edward B.Lewis,1918-2004.Genetics,2004,168(4):1773.
[3]Duncan I,Montgomery G E B.Lewis and the bithorax complex:Part I.Genetics,2002,160(4):1265.
[4]Sakonju S.Remembering the year with E.B.Lewis.Dev Dyn,2005,232(3):547.
[5]Lewis E B.The bithorax complex:The first fifty years.Int J Dev Biol,1998,42(3):403.
[6]Lewis E B.A gene complex controlling segmentation in Drosophila.Nature,1978,277(5688):565.
[7]Duncan I,Montgomery G E B.Lewis and the bithorax complex:Part II.From cis-trans test to the genetic control of development.Genetics,2002,161(1):1.
[8]Lipshitz H D.From fruit flies to fallout:Ed Lewis and his science.Dev Dyn,2005,232(3):529.
[9]Lewis E B.Leukemia and ionizing radiation.Science,1957,125(3255):965.
[10]Duncan I,Celniker S E.In memoriam:Edward B.Lewis(1918-2004).Dev Cell,2004,7(4):487.
關鍵詞:劉易斯 ?果蠅 ?發(fā)育 ?共線性 ?癌癥