亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        應(yīng)用多種遺傳標(biāo)記甄別全同胞和半同胞關(guān)系1例

        2019-07-12 06:51:50廖勇吳峰侯東林吳艷玲陶歡李成濤萬華靖
        法醫(yī)學(xué)雜志 2019年3期
        關(guān)鍵詞:基因座張氏兄妹

        廖勇,吳峰,侯東林,吳艷玲,陶歡,李成濤,萬華靖

        (1.四川基因格司法鑒定所,四川 成都 610041;2.司法鑒定科學(xué)研究院 上海市法醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 上海市司法鑒定專業(yè)技術(shù)服務(wù)平臺(tái),上海 200063)

        同胞關(guān)系鑒定是法醫(yī)物證學(xué)親緣關(guān)系鑒定中的難點(diǎn),特別是在全同胞鑒定案例中,在當(dāng)事人隱瞞等原因造成存在半同胞關(guān)系而鑒定人不知情的情況下,會(huì)干擾甚至造成錯(cuò)誤鑒定意見,讓鑒定機(jī)構(gòu)和鑒定人承擔(dān)較高風(fēng)險(xiǎn)。

        目前,同胞關(guān)系鑒定使用的遺傳標(biāo)記包括常染色體短串聯(lián)重復(fù)(short tandem repeat,STR)序列基因座、性染色體STR基因座和線粒體DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)高變區(qū)(hypervariable region,HVR)序列,判別方法主要包括基于常染色體STR基因座分型結(jié)果的狀態(tài)一致性評(píng)分法(identity by state,IBS)[1]、ITO法、判別函數(shù)法[2-3]及家系重建[4]等。2014年,我國司法部司法鑒定管理局針對(duì)全同胞關(guān)系鑒定頒布了《生物學(xué)全同胞關(guān)系鑒定實(shí)施規(guī)范》(以下簡(jiǎn)稱《規(guī)范》)[1],按照《規(guī)范》,全同胞鑒定采用的標(biāo)準(zhǔn)遺傳標(biāo)記是常染色體STR基因座(必要時(shí)補(bǔ)充性染色體STR基因座、mtDNA高變區(qū)序列分析),判別方法為IBS評(píng)分法,該方法簡(jiǎn)單、直觀、準(zhǔn)確率較高并容易掌握,但該《規(guī)范》使用的適用范圍是甄別全同胞與無關(guān)個(gè)體關(guān)系。在實(shí)際檢案中,由于當(dāng)事人隱瞞、不知情等原因造成誤將半同胞關(guān)系當(dāng)作全同胞關(guān)系來鑒定,會(huì)造成較高鑒定風(fēng)險(xiǎn)。

        筆者在實(shí)際工作中受理了一起存疑全同胞鑒定案例,綜合應(yīng)用了多種遺傳標(biāo)記(常染色體STR基因座、性染色體STR基因座以及mtDNA HVR序列)、多種判斷標(biāo)準(zhǔn)(基于常染色體STR的IBS法、ITO法、判別函數(shù)法及家系重建),最終獲得了可靠的鑒定意見,現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 對(duì)象與方法

        1.1 對(duì)象

        據(jù)委托方自訴,張氏四兄妹是同父同母全同胞兄妹,父母去世,現(xiàn)需要上戶口,特委托四川基因格司法鑒定所對(duì)張氏四兄妹之間是否存在全同胞關(guān)系進(jìn)行檢驗(yàn)和鑒定。

        張氏四兄妹:張1(男)、張2(男)、張3(女)、張4(女),四人指尖血血痕(載體為濾紙片)。

        1.2 方法

        按照《法庭科學(xué)DNA實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)范》[5]提取上述檢材的DNA,常染色體STR基因座分型采用EX20試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司),X染色體STR(X-STR)基因座分型采用X19試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司),Y染色體STR(Y-STR)基因座分型采用Data Y24試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)。對(duì)上述PCR產(chǎn)物,用Applied BiosystemsTM3730xl基因分析儀(美國Thermo Fisher Scientific公司)進(jìn)行毛細(xì)管電泳和基因型分析。IBS評(píng)分及同胞關(guān)系判定依據(jù)《規(guī)范》[1]進(jìn)行,19個(gè)必檢基因座同胞關(guān)系判定標(biāo)準(zhǔn):(1)IBS≥22,傾向性認(rèn)為全同胞;(2)22>IBS>13,無法給出傾向性意見;(3)IBS≤13,傾向性認(rèn)為無關(guān)個(gè)體。

        全同胞指數(shù)(full sibling index,F(xiàn)SI)、半同胞指數(shù)(half sibling index,HSI)及同胞關(guān)系判定參照文獻(xiàn)[2-3]采用ITO法計(jì)算,15個(gè)基因座同胞關(guān)系判定標(biāo)準(zhǔn):(1)FSI和 HSI均<1為無關(guān)個(gè)體;(2)FSI∶HSI≥1為全同胞關(guān)系;(3)FSI∶HSI<1為半同胞關(guān)系。

        判別函數(shù)法計(jì)算及同胞關(guān)系判定參照文獻(xiàn)[3]進(jìn)行,將15個(gè)基因座上等位基因全不同的基因座數(shù)、全相同的基因座數(shù),代入全同胞-半同胞鑒別函數(shù)公式,得到全同胞D值(DFS4)、半同胞D值(DHS4),按以下標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行判定:(1)DFS4>DHS4為全同胞關(guān)系;(2)DFS4<DHS4為半同胞關(guān)系。

        mtDNA提取及HVR-Ⅰ、HVR-Ⅱ序列分析按照《法庭科學(xué)DNA實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)規(guī)范》[5]進(jìn)行,PCR引物設(shè)計(jì)和擴(kuò)增體系參照文獻(xiàn)[6],PCR產(chǎn)物測(cè)序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。

        2 結(jié) 果

        2.1 常染色體STR基因座分型結(jié)果分析

        張氏四兄妹血痕的D3S1358等19個(gè)常染色體STR基因分型結(jié)果見表1。

        表1 張氏四兄妹常染色體STR基因座分型結(jié)果

        依據(jù)以上常染色體STR分型結(jié)果,參照《規(guī)范》[1],對(duì)張氏四兄妹樣本兩兩之間進(jìn)行IBS評(píng)分,獲得累積IBS值(表2):張2、張3、張4之間傾向性認(rèn)為是全同胞關(guān)系,張1與張2、張3、張4之間全同胞關(guān)系無法給出傾向性意見。

        表2 張氏四兄妹IBS評(píng)分

        為進(jìn)一步驗(yàn)證和明確張氏四兄妹之間的同胞關(guān)系,同樣依據(jù)常染色體STR分型結(jié)果,得到張氏四兄妹之間在D3S1358等15個(gè)基因座上的FSI、HSI值及FSI∶HSI值。結(jié)果(表3)提示:張2、張3、張4兩兩之間存在全同胞關(guān)系,這與IBS結(jié)果相一致;張1與張2、張3、張4之間可能存在半同胞關(guān)系,但是需要進(jìn)一步佐證。

        為了驗(yàn)證張1與張2、張3、張4之間半同胞關(guān)系,采用判別函數(shù)法得到張氏四兄妹之間在D3S1358等15個(gè)基因座上DFS4、DHS4:張2、張3、張4兩兩之間存在全同胞關(guān)系,這一結(jié)果再次得到支持;張1分別與張2、張3、張4之間存在半同胞關(guān)系,這一結(jié)果和ITO法相一致(表4)。

        表3 張氏四兄妹FSI∶HSI比值

        表4 張氏四兄妹DFS4、DHS4值

        表5 張氏四兄妹X染色體STR基因座分型結(jié)果

        2.2 性染色體STR基因座分型結(jié)果及mtDNA HVR測(cè)序分析

        為支持張1與張2、張3、張4之間半同胞關(guān)系,并進(jìn)一步分析是同母異父還是同父異母關(guān)系,對(duì)張氏四兄妹樣本進(jìn)行X-STR和Y-STR基因分型以及mtDNA HVR-Ⅰ和HVR-Ⅱ測(cè)序分析。

        X-STR基因分型結(jié)果(表5)顯示:張3、張4在每個(gè)基因座上均能找到一個(gè)相同的分型(來自相同生父),結(jié)合張2基因型(來自相同生母),可推斷出全同胞張2、張3、張4的生父母基因型(表6),并且張1基因型均能從推斷的生母基因型中找到來源(表6),由此提示張氏四兄妹來自同一生母。

        表6 張2、張3、張4生父母X染色體STR基因型推斷及與張1比對(duì)

        mtDNA HVR-Ⅰ和HVR-Ⅱ測(cè)序結(jié)果顯示,張1、張2、張3、張4 mtDNA與標(biāo)準(zhǔn)序列(Anderson序列)相比,在HV-Ⅰ(16024~16415nt)、HV-Ⅱ(73~340nt)堿基片段發(fā)生變異的序列一致(16129SG-A,16183SAC,16189ST-C,16193IC,16217ST-C,16234SC-T,263SA-G,306ICCC,315IC)。mtDNA屬于母系遺傳標(biāo)記,可用來進(jìn)行母系親緣認(rèn)定,根據(jù)遺傳學(xué)原理和遺傳規(guī)律,同一母系個(gè)體的mtDNA來自相同的母系祖先,結(jié)合X-STR分型結(jié)果,支持張1、張2、張3、張4來自同一生母。

        Y-STR基因分型結(jié)果顯示,張1與張2在DYS3891、DYS389Ⅱ、DYS439、DYS456、DYS458、DYS437、DYS635、DYS448、DYS527a/b、DYS447、DYS19、DYS392、DYS522、DYS393、DYS390、DYS385a/b共18個(gè)Y染色體STR基因座上分型不一致。Y染色體為男性所特有,Y染色體STR是父系遺傳標(biāo)記之一,可用來進(jìn)行父系親緣認(rèn)定,根據(jù)遺傳規(guī)律,同一父系的男性Y染色體來自相同的父系祖先,因此排除張1與張2來自同一生父。

        至此,多種遺傳標(biāo)記(常染色體STR、性染色體STR、線粒體DNA)檢測(cè)結(jié)果相互驗(yàn)證和補(bǔ)充,綜合分析后,支持以下鑒定意見:(1)支持張2、張3、張4兩兩之間存在全同胞關(guān)系;(2)支持張1分別與張2、張3、張4之間為同母異父半同胞關(guān)系。

        根據(jù)此鑒定意見,通過常染色體STR結(jié)果推斷張2、張3、張4父母基因型,并與張1比對(duì)驗(yàn)證。結(jié)果顯示,推斷的張2、張3、張4父母基因型均符合遺傳規(guī)律(單個(gè)基因座不超過4個(gè)基因型);從推斷的父母基因型中,在D3S1358等16個(gè)基因座,張1基因型能找到來源,但在D13S317、D8S1179、D5S818基因座只能找到一個(gè)等位基因來源,不符合同父同母遺傳規(guī)律,支持張1與張2、張3、張4半同胞關(guān)系。

        3 討 論

        同胞關(guān)系鑒定是親權(quán)關(guān)系鑒定中檢案量?jī)H次于親子鑒定的項(xiàng)目,但由于技術(shù)手段的有限性及實(shí)際工作的復(fù)雜性,一直是司法鑒定中的難點(diǎn)和研究熱點(diǎn)。

        《規(guī)范》中的IBS法是通過計(jì)算兩個(gè)個(gè)體間常染色體STR共有等位基因數(shù)來判斷全同胞關(guān)系,與ITO、判別函數(shù)法相比,無需使用等位基因頻率數(shù)據(jù),計(jì)算簡(jiǎn)單、直觀、有效,準(zhǔn)確率在99%以上[7],已廣泛用于全同胞關(guān)系鑒定[8],但在使用時(shí)要注意兩點(diǎn):(1)適用范圍。適用于在雙親皆無情形下甄別生物學(xué)全同胞與無關(guān)個(gè)體關(guān)系,若兩名被鑒定人之間存在其他親緣關(guān)系(如半同胞、堂表親等),則本《規(guī)范》不適用。(2)系統(tǒng)效能。檢測(cè)19、29、39個(gè)STR基因座時(shí),系統(tǒng)效能分別約為75%、85%、95%;增加STR基因座雖然能提高系統(tǒng)效能,但是要求增加的STR基因座個(gè)體識(shí)別率(discrimination power,DP)值要大于0.9。筆者在實(shí)際鑒定工作中(包括本案例)遇到多起由于當(dāng)事人隱瞞等原因,誤將半同胞作為全同胞鑒定的案例,在客觀上違背了《規(guī)范》使用前提。根據(jù)筆者經(jīng)驗(yàn),在增加STR基因座檢測(cè)時(shí),若選擇的試劑盒基因座大部分DP值小于0.9則可能會(huì)造成誤判,同時(shí)由于目前市面上很少有DP值均大于0.9的商品化試劑盒可用,因此,本案例使用必檢的19個(gè)基因座(準(zhǔn)確率依然大于99%),雖然系統(tǒng)效能相對(duì)較低,出現(xiàn)對(duì)張1與張2、張3、張4是否存在全同胞關(guān)系無法給出傾向性意見情況,但錯(cuò)判率極低[9]。因此,在使用《規(guī)范》時(shí)鑒定人要注意甄別和核實(shí)委托方實(shí)際情況,注意適用范圍及系統(tǒng)效能,并建議同時(shí)使用其他方法和增加遺傳標(biāo)記加以相互驗(yàn)證和甄別,以免不當(dāng)使用試劑盒和方法干擾鑒定意見、甚至錯(cuò)誤鑒定。

        ITO法是計(jì)算個(gè)體間某種血緣關(guān)系的經(jīng)典方法,與IBS法相比,可用于全同胞、半同胞、無關(guān)個(gè)體關(guān)系鑒定,適用范圍更廣,但是需要等位基因頻率數(shù)據(jù)、計(jì)算較為復(fù)雜,鑒定人較難掌握。陸惠玲等[3]利用日常鑒定累積的1050個(gè)樣本,通過15個(gè)常染色體STR基因分型結(jié)果在ITO法基礎(chǔ)上建立了一套價(jià)值較高的鑒定全同胞、半同胞的方法,指出FSI∶HSI≥1與FSI∶HSI<1可分別作為全同胞與半同胞的判別標(biāo)準(zhǔn),交互準(zhǔn)確率為87.5%;同時(shí)在此基礎(chǔ)上建立了全同胞-半同胞等4組判別函數(shù),進(jìn)一步簡(jiǎn)化了計(jì)算,只需根據(jù)分型結(jié)果統(tǒng)計(jì)等位基因匹配情況,帶入相應(yīng)公式求出D值,比較D值高低即可作出判斷,準(zhǔn)確率在84.4%~97.7%。本案中,IBS法無法對(duì)張1與張2、張3、張4間全同胞關(guān)系給出傾向性意見,使用ITO及判別函數(shù)法計(jì)算后,提示張1與張2、張3、張4間存在半同胞關(guān)系,初步甄別出本案中隱藏的半同胞關(guān)系,但是由于準(zhǔn)確率較低,還需其他遺傳標(biāo)記支持。

        由于父系及母系遺傳特點(diǎn),性染色體STR以及mtDNA高變區(qū)序列多態(tài)性檢測(cè)在同胞鑒定中可作為重要的支持和補(bǔ)充證據(jù)。X-STR可作為同父女性間鑒定的遺傳標(biāo)記,若參與鑒定的個(gè)體足夠多,還可用于家系重建并為同母關(guān)系鑒定提供依據(jù)[7];無論性別,mtDNA高變區(qū)序列多態(tài)性可作為同母關(guān)系鑒定的重要參考遺傳標(biāo)記;Y-STR是同父男性間鑒定的可靠遺傳標(biāo)記。本案中,由于參與鑒定人較多,結(jié)合性別,綜合使用了X和Y染色體STR及mtDNA檢測(cè),結(jié)合常染色體STR分型結(jié)果,支持張2、張3、張4之間存在全同胞關(guān)系,支持張1與張2、張3、張4存在同母異父半同胞關(guān)系。

        基于常染色體STR分型結(jié)果的家系重建,在隔代親緣鑒定中具有重要的參考價(jià)值[4]。本案例由于參與鑒定的全同胞個(gè)體較多,根據(jù)常染色體STR分型結(jié)果可推斷出父母基因型,根據(jù)孟德爾遺傳規(guī)律,在每一個(gè)父母基因座可推斷出≤4種基因型,其他存疑的全同胞或半同胞個(gè)體可在推斷出的每一個(gè)基因座找到兩個(gè)均相同或至少一個(gè)相同基因型,比對(duì)結(jié)果可支持最終的鑒定意見。

        隨著社會(huì)發(fā)展,親權(quán)鑒定工作不斷增多,案情的復(fù)雜性和風(fēng)險(xiǎn)性隨之增高,在疑難、復(fù)雜、存疑的鑒定案例中要注意甄別和核實(shí),而多種遺傳標(biāo)記的綜合應(yīng)用是鑒定機(jī)構(gòu)和鑒定人降低鑒定風(fēng)險(xiǎn)、獲得可靠鑒定意見的有效手段[7]。法醫(yī)物證學(xué)鑒定機(jī)構(gòu)和鑒定人要在實(shí)際工作中不斷積累經(jīng)驗(yàn),正確運(yùn)用各種遺傳標(biāo)記和計(jì)算方法以相互驗(yàn)證、支持,以得到可靠的鑒定意見,提高鑒定意見準(zhǔn)確性和鑒定工作質(zhì)量。

        猜你喜歡
        基因座張氏兄妹
        張氏頭針治療兒童多發(fā)性抽動(dòng)癥的隨機(jī)對(duì)照臨床研究
        猴兄妹分桃子
        慢熱兄妹
        二十一載的異族兄妹
        中國公路(2017年14期)2017-09-26 11:51:45
        岳陽張氏正骨氣血理論之以氣為先
        DXS101基因座稀有等位基因的確認(rèn)1例
        臨夏回族自治州撒拉族人群15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性
        DYF387S1基因座分型異?,F(xiàn)象
        食管疾病(2015年3期)2015-12-05 01:45:11
        DNA數(shù)據(jù)庫“標(biāo)準(zhǔn)三聯(lián)體”親緣關(guān)系比中應(yīng)用價(jià)值初探
        “妻管嚴(yán)”沈括
        幸?!傋x(2011年8期)2011-12-19 02:08:50
        91精品91| 精品日产卡一卡二卡国色天香| 色狠狠一区二区三区香蕉| av无码天堂一区二区三区| 午夜免费福利在线观看| 厕所极品偷拍一区二区三区视频| 人妻精品久久久一区二区| 免费国产一区二区视频| 亚洲精品第一国产综合精品 | 成人av在线免费播放| 国产在线观看免费视频软件| 欧美 丝袜 自拍 制服 另类| 久久国产热精品波多野结衣av| 最新永久免费AV网站| 国产高清人肉av在线一区二区| 久久精品99国产精品日本| 亚洲人成77777在线播放网站| 国产人在线成免费视频| 亚洲日韩一区二区一无码| 亚洲av一区二区三区网站 | 神马影院午夜dy888| 人与禽交av在线播放| 久久亚洲av成人无码软件| 亚洲捆绑女优一区二区三区| 天堂а在线中文在线新版| 女人下面毛多水多视频| 日本VA欧美VA精品发布| 女同国产日韩精品在线| 三上悠亚亚洲精品一区| 国产又粗又黄又爽的大片| 中文字幕亚洲乱码熟女在线萌芽| 国产又爽又黄又不遮挡视频| 国产一区在线视频不卡| 手机看黄av免费网址| 99久久久无码国产aaa精品| 国产精品原创永久在线观看| 中文乱码字幕人妻熟女人妻| 亚洲乱码中文字幕在线| 人人妻人人澡人人爽欧美一区九九| 国产精品对白交换视频| 91久久精品一二三区蜜桃|