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        86份酸棗種質(zhì)資源篩選和遺傳多樣性分析

        2019-07-10 09:29:59李世鵬陳葉郭明欣田珊劉紅霞趙旭升
        安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年11期
        關(guān)鍵詞:遺傳多樣性酸棗農(nóng)藝性狀

        李世鵬 陳葉 郭明欣 田珊 劉紅霞 趙旭升

        摘要 [目的]綜合酸棗種質(zhì)資源主要農(nóng)藝性狀評(píng)價(jià)和遺傳多樣性分析結(jié)果,篩選優(yōu)良酸棗種質(zhì)資源。[方法]對(duì)86份酸棗種質(zhì)資源的15個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行表型鑒定,并利用9個(gè)ISSR標(biāo)記進(jìn)行遺傳多樣性分析。[結(jié)果]通過(guò)對(duì)15個(gè)農(nóng)藝性狀綜合評(píng)價(jià),從86份酸棗種質(zhì)資源中篩選出5份優(yōu)良種質(zhì)資源。9對(duì)ISSR引物共擴(kuò)增出20條多態(tài)性條帶,多態(tài)性信息量(polymorphism information content,PIC)為0.60~0.81,平均值為0.70。在遺傳系數(shù)0.57的水平上86份酸棗種質(zhì)資源被分為兩大類(lèi),其中79份種質(zhì)資源聚為A類(lèi),7份種質(zhì)資源聚為B類(lèi)。[結(jié)論]該研究為酸棗種質(zhì)資源分類(lèi)、鑒定和新品種選育等提供理論依據(jù)。

        關(guān)鍵詞 酸棗;農(nóng)藝性狀;ISSR標(biāo)記;遺傳多樣性

        中圖分類(lèi)號(hào) S603文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A

        文章編號(hào) 0517-6611(2019)11-0051-05

        doi:10.3969/j.issn.0517-6611.2019.11.017

        開(kāi)放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識(shí)碼(OSID):

        Abstract [Objective] The main agronomic traits and genetic diversity analysis results were studied to screen the excellent sour jujube germplasm resources.[Method] 15 agronomic traits of 86 sour jujube germplasm resources were identified,and 9 intersimple sequence repeat (ISSR) primers were used for genetic diversity analysis.[Result] Through the comprehensive evaluation of 15 agronomic traits,5 excellent germplasm resources were selected from 86 sour jujube individuals.A total of 20 polymorphic bands were amplified by 9 ISSR primers.The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.60 to 0.81 with an average of 0.70.Clustering analysis showed that the 86 sour jujube germplasm resources could be divided into 2 groups at the genetic similarity coefficient of 0.57,79 sour jujube individuals were grouped into class A and 7 sour jujube individuals were grouped into class B.[Conclusion] This study provides a useful basis for the classification,identification and variety selection of sour jujube germplasm resources.

        Key words Sour jujube;Agronomic traits;ISSR;Genetic diversity

        基金項(xiàng)目 河南省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(162300410198);河南省科技開(kāi)放合作計(jì)劃項(xiàng)目(172106000049)。

        作者簡(jiǎn)介 李世鵬(1986—),男,河南開(kāi)封人,講師,博士,從事棗樹(shù)遺傳育種研究。*通信作者,教授,碩士,從事林木育種研究。

        收稿日期 2018-12-07

        酸棗(Z.acidojujuba C.Y.Cheng et M.J.Liu)為鼠李科(Rhamnaceae)棗屬(Ziziphus Mill)植物,原產(chǎn)于我國(guó),主要分布于我國(guó)北方各省,多生長(zhǎng)于丘陵、山區(qū)[1-2]。 酸棗是栽培棗的原始野生種,具有耐旱、耐寒、耐堿等特點(diǎn),是栽培棗最主要的砧木[3-5]。酸棗仁具有較高的藥用價(jià)值,味酸、性平,具有補(bǔ)肝寧心、鎮(zhèn)靜安神、斂汗、生津等功效,是一種藥食同源食品[6]。《神農(nóng)本草經(jīng)》中記載酸棗能夠治療“心腹寒熱,邪結(jié)氣聚,四肢酸痛濕痹”,可以起到“安五臟,輕身延年”的作用?,F(xiàn)代藥理研究表明,酸棗仁含有皂苷、黃酮、生物堿和脂肪酸等多種活性物質(zhì)[7-12]。

        酸棗類(lèi)型眾多,種植資源豐富。楊雷[13]對(duì)149份酸棗種質(zhì)資源的生物學(xué)性狀和營(yíng)養(yǎng)成分進(jìn)行了系統(tǒng)分析,從中篩選出10份可用于鮮食、加工用的種質(zhì)資源。孫亞強(qiáng)等[14]對(duì)60份酸棗資源的7個(gè)果實(shí)表型性狀和13個(gè)品質(zhì)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果表明,酸棗主要農(nóng)藝性狀遺傳變異豐富能夠?yàn)闂棙?shù)育種提供優(yōu)良的親本材料和嫁接砧木。隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展,人們開(kāi)始利用分子標(biāo)記對(duì)酸棗的遺傳多樣性進(jìn)行研究。張春梅[15]利用雙抑制PCR技術(shù)開(kāi)發(fā)了10對(duì)酸棗SSR多態(tài)性引物,并對(duì)43份酸棗材料進(jìn)行了遺傳多樣性分析。張鵬飛等[16]利用7個(gè)SSR標(biāo)記對(duì)16份棗品種和17份酸棗材料的遺傳多樣性進(jìn)行分析。結(jié)果表明,酸棗的遺傳多樣性高于棗,酸棗與棗之間基因交流比較頻繁。

        ISSR(intersimple sequence repeat)簡(jiǎn)單序列重復(fù)技術(shù)是一種基于微衛(wèi)星序列的分子標(biāo)記,以16~25 bp的重復(fù)序列作為引物擴(kuò)增相鄰反向重復(fù)序列之間的區(qū)域[17]。ISSR具有操作簡(jiǎn)便、無(wú)需預(yù)知基因組序列、引物多態(tài)性高等特點(diǎn),是研究遺傳多樣性、系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化生物學(xué)的一種快速、簡(jiǎn)單且廉價(jià)的方法[18]。棗基因組包含高密度簡(jiǎn)單序列重復(fù)序列[19],因此非常適合使用ISSR標(biāo)記進(jìn)行遺傳多樣性分析。筆者對(duì)收集的86份酸棗種質(zhì)資源的單果重、可食率、果實(shí)風(fēng)味等15個(gè)主要果實(shí)性狀進(jìn)行分析,并利用ISSR標(biāo)記進(jìn)行遺傳多樣性分析,旨在為酸棗種質(zhì)資源創(chuàng)新、新品種選育和分子標(biāo)記輔助育種提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料 86份酸棗種質(zhì)資源收集于新疆、河南、山西等地區(qū),于2016年嫁接到洛陽(yáng)師范學(xué)院棗樹(shù)種質(zhì)資源圃。供試材料編號(hào)為US01~86。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 果實(shí)性狀調(diào)查。

        2017年9月下旬至10月上旬收集各供試材料脆熟期棗果用于表型性狀調(diào)查。調(diào)查果實(shí)性狀包括單果重、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、單核重、果核縱徑、果核橫徑、果核指數(shù)和可食率9個(gè)果實(shí)品質(zhì)性狀;果肉質(zhì)地、粗細(xì)、風(fēng)味、汁液和異味5個(gè)感官性狀。各性狀調(diào)查標(biāo)準(zhǔn)參照《棗種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》[20]。

        1.2.2 DNA提取與檢測(cè)。

        2017年5月中旬采集各供試材料的幼嫩葉片1~2 g,采用CTAB法[21]提取基因組總DNA。用NanoDrop2000檢測(cè)DNA質(zhì)量,并稀釋至50 ng/μL。

        1.2.3 ISSR引物合成與分析。

        根據(jù)British Columbia大學(xué)公布的100條ISSR引物,由華大基因公司合成。PCR反應(yīng)體系(10 μL):2.0 μL基因組DNA,0.4 μL引物(10 μmol/L),0.8 μL dNTP (2.5 mmol/L),1.0 μL 10×Buffer,0.2 μL Taq DNA Polymerase (Solarbio公司)和 5.6 μL ddH2O。ISSR擴(kuò)增在Applied Biosystems公司2720 Thermal Cycler型PCR儀上進(jìn)行。ISSR 擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性 3 min,然后94 ℃變性30 s,50/55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1.5 min, 35個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分離,在凝膠成像分析儀(BIORADGEIDOCXR+)下拍照。

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        根據(jù)ISSR擴(kuò)增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠上的相對(duì)位置,對(duì)多態(tài)性條帶進(jìn)行記錄,分別以“1”和“0”表示同一位置條帶的有無(wú),建立原始數(shù)據(jù),用NTSYSpc 2.10e軟件進(jìn)行聚類(lèi)分析[22]。

        ISSR位點(diǎn)的多態(tài)性信息量(polymorphism information content,PIC)按如下計(jì)算公式進(jìn)行計(jì)算: PIC=1-Pi2,式中,Pi 表示第i個(gè)等位位點(diǎn)出現(xiàn)的頻率[23]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 酸棗資源果實(shí)品質(zhì)性狀分析

        對(duì)收集的86份酸棗資源的單果重、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、單核重、果核縱徑、果核橫徑、果核指數(shù)和可食率9個(gè)重要果實(shí)性狀進(jìn)行分析(圖1)。結(jié)果表明,單果重變異系數(shù)最高,為42.09%,變異范圍為0.99~11.37 g;單核重變異系數(shù)次之,為27.66%,變異范圍為0.19~0.87 g。可食率的變異系數(shù)最小,為491%,變異范圍為69.95%~95.00%。其他果實(shí)品質(zhì)性狀的變異系數(shù)在10.81%~19.10%(表1)。

        47卷11期李世鵬等 86份酸棗種質(zhì)資源篩選和遺傳多樣性分析

        通過(guò)分析果肉質(zhì)地、粗細(xì)、風(fēng)味、汁液和異味5個(gè)感官性狀對(duì)上述種質(zhì)資源進(jìn)行口感綜合評(píng)價(jià)。結(jié)果表明,果肉質(zhì)地以致密為主,其中較致密和致密型所占比例分別為43.0%和24.4%。果肉粗細(xì)以中等為主,所占比例為62.8%。果肉汁液以中等或偏少為主,汁液較多的種質(zhì)僅占3.5%。果實(shí)風(fēng)味以酸、酸甜為主,風(fēng)味較好的甜酸型占19.8%,未發(fā)現(xiàn)甜型的酸棗材料。少部分酸棗(20.9%)存在苦味或青草味等異味(表2)。

        上述結(jié)果表明,酸棗種質(zhì)資源遺傳變異豐富,綜合上述9個(gè)果實(shí)品質(zhì)性狀和5個(gè)口感性狀,從中篩選出5份大果型、可食率高、口感好的優(yōu)良種質(zhì)資源(表3)。

        2.2 酸棗種質(zhì)資源遺傳多樣性分析

        為了進(jìn)一步研究酸棗種質(zhì)資源的遺傳多樣性,利用ISSR標(biāo)記對(duì)86份酸棗種質(zhì)資源的遺傳變異和親緣關(guān)系進(jìn)行研究。利用12份酸棗種質(zhì)資源對(duì)100個(gè)ISSR引物進(jìn)行擴(kuò)增,從中篩選出25個(gè)能擴(kuò)增出多態(tài)性條帶的引物(圖2)。根據(jù)擴(kuò)增效果,從中選出9個(gè)多態(tài)性和重復(fù)性好的引物用于86份酸棗種質(zhì)資源的分析(表4)。9個(gè)引物在86份種質(zhì)中共擴(kuò)增出29條帶,其中多態(tài)性條帶為20條,占總條帶數(shù)的69%。每個(gè)引物擴(kuò)增出的條帶數(shù)為2~5條,平均條帶數(shù)為3.2條。每個(gè)引物具有多態(tài)性條帶2~3條,平均多態(tài)性條帶數(shù)為2.2條。各引物PIC值為060~0.81,平均值為0.70。

        基于9對(duì)ISSR引物的擴(kuò)增結(jié)果,對(duì)86份酸棗種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析。由圖3可知,86份種質(zhì)資源在遺傳系數(shù)0.57的水平上被分為兩大類(lèi)。A類(lèi)包括79份種質(zhì)資源,B類(lèi)包括剩余的7份種質(zhì)資源。A類(lèi)種質(zhì)資源在遺傳系數(shù)0.62的水平上進(jìn)一步被分為4個(gè)亞類(lèi):A-1包括37份種質(zhì)資源,A-2包括38份種質(zhì)資源,A-3和A-4分別包括3份和1份種質(zhì)資源。B類(lèi)種質(zhì)資源在遺傳系數(shù)0.59的水平上被進(jìn)一步分為2個(gè)亞類(lèi),B-1和B-2分別包括5份和2份種質(zhì)資源。5份優(yōu)良種質(zhì)資源中US60屬于A-1亞類(lèi),US40、US51和US86屬于A-2亞類(lèi),US73屬于B-1亞類(lèi),遺傳系數(shù)在0.56~0.80。

        Note:M.D2000 plus DNA Ladder

        3 結(jié)論與討論

        酸棗多為灌木或小喬木,抗逆性極強(qiáng),且酸棗仁具有較高的藥用價(jià)值[24]。武媛林[25]對(duì)62份酸棗種質(zhì)資源的果實(shí)性狀、營(yíng)養(yǎng)成分及其種仁的生物學(xué)性狀、藥用成分含量等進(jìn)行了系統(tǒng)分析,將酸棗分為適合于鮮食、藥用、鮮食藥用兼用3種類(lèi)型。王僧虎等[26]從邢臺(tái)山區(qū)的野生酸棗資源中選育出一個(gè)優(yōu)良加工制汁、藥用酸棗新品種邢州1號(hào)。邢州1號(hào)質(zhì)地致密、較脆、汁液適中、味酸甜,平均單果重3.0 g,可食率81.2%。王春桐[27]從山東濟(jì)南南部山區(qū)野生酸棗資源中篩選出一個(gè)極早熟鮮食新品種‘脆酸棗。該品種肉質(zhì)致密、脆、汁液多、酸甜適口,單果重6.1 g,可食率87%。張建英等[28]從野生酸棗中篩選到2個(gè)優(yōu)良酸棗鮮食品種:‘藍(lán)貓1號(hào)和‘藍(lán)貓2號(hào)。2個(gè)品種單果重為4.86和4.78 g,可食率均為89%。上述研究篩選到的酸棗品種與棗樹(shù)主要栽培種相比果實(shí)較小、可食率較低[25-28]。該研究從86份酸棗種質(zhì)資源中篩選出5份優(yōu)良鮮食酸棗種質(zhì)資源。其中,US86單果重達(dá)11.17 g,可食率為95%,這說(shuō)明酸棗優(yōu)良品種選育仍有較大的潛力。

        酸棗分布廣泛、表型變異豐富,目前酸棗新品種的選育主要依靠形態(tài)學(xué)鑒定。利用分子標(biāo)記構(gòu)建酸棗種質(zhì)資源的指紋圖譜有助于酸棗種質(zhì)資源的鑒定。根據(jù)25個(gè)ISSR引物的擴(kuò)增結(jié)果,選擇PIC值最高的4個(gè)引物JISSR11、JISSR25、JISSR43和JISSR47可以鑒定出63份酸棗種質(zhì)資源。這些特異性條帶可以作為酸棗種質(zhì)資源鑒定和新品種選育的分子依據(jù)。

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