空軍軍醫(yī)大學衛(wèi)生統(tǒng)計學教研室(710032)
譚志軍 王 陵 梁 英 楊 喆 張海悅 李 晨 尚 磊 夏結來 張玉?!?/p>
【提 要】 SigmaPlot是一款常用的科研數(shù)據(jù)分析與圖形可視化軟件包,在我教研室設置的研究生醫(yī)學數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析軟件選修課中是一個重要的講授內容。本文介紹了SigmaPlot的功能特點和在醫(yī)學研究生中的教學實踐,從數(shù)據(jù)管理、統(tǒng)計分析、統(tǒng)計制圖三個方面總結了SigmaPlot的教學體會,以期為SigmaPlot在醫(yī)學研究生科研能力培養(yǎng)中發(fā)揮更重要的作用。
SigmaPlot是一款常用的科研數(shù)據(jù)分析與圖形可視化軟件包,廣泛應用于生物、化學、實驗室、臨床研究等領域的數(shù)據(jù)管理與分析[1-3]。目前,SigmaPlot在醫(yī)學研究生教學中并不常見。本教研室開設的醫(yī)學研究生選修課醫(yī)學數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析軟件中,SigmaPlot是主要講授內容。現(xiàn)簡要介紹SigmaPlot的功能特點,并總結近幾年積累的一些粗淺的教學經(jīng)驗與體會,以期為SigmaPlot在醫(yī)學研究生科研能力培養(yǎng)中發(fā)揮更重要作用。
作為一款極佳的科學制圖軟件,SigmaPlot主要有以下三個功能特點[4]:
1.制圖精密美觀。SigmaPlot可繪制100多種常見的2D或3D的統(tǒng)計圖、曲線擬合圖,生成的學術圖形精密美觀,幾乎不用修改就能夠達到各類學術雜志的發(fā)表要求,還提供了EPS、TIFF、JPEG等多種輸出格式,可以滿足不同展示載體的質量要求。
2.統(tǒng)計功能全面。嵌入Systat模塊后,其統(tǒng)計分析功能覆蓋了醫(yī)學基礎統(tǒng)計方法(t檢驗、方差分析、非參數(shù)檢驗、卡方檢驗等)、高級統(tǒng)計方法(多元線性回歸、logistic回歸、生存分析等)和基本的樣本量估計方法。此外,還內建了100多組擬合方程。統(tǒng)計分析功能可以滿足醫(yī)學領域中實驗室和臨床研究數(shù)據(jù)分析的需求。
3.操作簡單靈活。操作界面類似于Office中的Excel,使用者只須有辦公軟件操作經(jīng)驗便可輕易操作。SigmaPlot可導入多種格式的二維數(shù)據(jù)表和數(shù)據(jù)庫,可與其他的應用軟件如Word、Excel和PowerPoint無縫對接。系統(tǒng)自帶的圖庫使圖形繪制工作簡單高效。
1.課程設置背景
醫(yī)學統(tǒng)計學是我校醫(yī)學研究生的公共必修課程,該課程配套了軟件實習課。但是,實習課的學時數(shù)不足,學員難以系統(tǒng)地掌握應用統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)處理的技能。此外,實習課授課內容的針對性和軟件的可選擇性不強,導致實習重點不夠清晰,學習興趣不高。為提高我校研究生科研能力培養(yǎng)水平,滿足基礎與臨床方向的不同需求,教研室單獨開設了醫(yī)學數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析軟件選修課,講授SPSS、PASS、SigmaPlot和Origin四個常用軟件。該課程針對性和實用性強,授課效果較好,受到醫(yī)學研究生的普遍歡迎。
2.SigmaPlot教學內容
SigmaPlot在SPSS和PASS軟件之后講授,分配12個學時,授課內容和知識點見表1。由于SPSS已講授各類統(tǒng)計方法的基本原理和統(tǒng)計結果解讀,SigmaPlot授課更側重于統(tǒng)計繪圖。授課形式為教員演示+學員操作+課堂答疑(主講教員和輔講教員)。教員演示采用SigmaPlot自帶的統(tǒng)計實例數(shù)據(jù),學員實習采用研究生用書《醫(yī)學統(tǒng)計學》(孫振球主編,第4版)的配套數(shù)據(jù)[5]??己瞬捎蒙蠙C操作的形式。
經(jīng)過三年的教學實踐,現(xiàn)將SigmaPlot軟件在數(shù)據(jù)管理、統(tǒng)計分析、統(tǒng)計制圖的教學體會以及整體教學效果作簡要總結。
1.數(shù)據(jù)管理
在數(shù)據(jù)管理方面,SigmaPlot有兩個突出的優(yōu)點。一是同一種統(tǒng)計分析方法兼容多種數(shù)據(jù)結構,例如進行t檢驗或方差分析時,數(shù)據(jù)既可以是一組觀測為一列的Raw結構,也可以是含樣本量、均數(shù)、標準差或標準誤等中間結果的結構,還可以是分組因素單獨成列、觀測指標為一列的indexed結構。二是可以將一次分析中的數(shù)據(jù)和產生的統(tǒng)計分析報告、圖形結果等不同類型的文件,打包存儲在一個后綴為.jnb的文件中,下次只需打開jnb文件即可同時打開數(shù)據(jù)、統(tǒng)計分析結果和圖形。以上兩個優(yōu)點使得醫(yī)學研究數(shù)據(jù)的管理更為方便、靈活和高效,但學生習慣了SPSS單一數(shù)據(jù)管理模式后,需要一定的時間來適應和掌握。
表1 SigmaPlot的授課內容與知識點
2.統(tǒng)計分析
SigmaPlot以資料類型和分析目的為依據(jù)劃分統(tǒng)計分析功能,將其分為Single Group、Compare Two Groups、Compare Many Groups、Before and After、Repeated Measures、Rate and Proportions、Regression、Correlation、Survival等幾大塊,這種劃分能使非統(tǒng)計專業(yè)或者初學者更容易找到合適的統(tǒng)計分析方法。同時,還提供了非常實用的Adivisor導航功能,當使用者不知道選用何種統(tǒng)計方法時,該功能可通過一步步設問幫助使用者選擇合適的統(tǒng)計分析方法。當資料滿足正態(tài)性而選擇了非參數(shù)檢驗時,系統(tǒng)會彈出“正態(tài)性檢驗通過,是否更改檢驗方法”的提醒,進一步降低錯用統(tǒng)計分析方法的可能性。SigmaPlot幫助文件中提供了Statistical Samples實例庫,涵蓋了所有統(tǒng)計分析功能的實例,每一個實例打包了數(shù)據(jù)、統(tǒng)計結果、圖形,是非常好的教學案例和初學者練習材料。與SPSS和SAS統(tǒng)計分析結果相比,SigmaPlot的統(tǒng)計分析結果文件對結論的文字解釋更多、更貼近學術論文中的表述方式,部分結論可直接用于學術論文的結果表達。不足之處在于,分析結果沒有采用表格形式,結構性不強,這一點不及SPSS和SAS方便,有待進一步改進。
3.統(tǒng)計制圖
在統(tǒng)計制圖方面,除提供了包括100多種圖形的圖庫外,使用者還可以基于統(tǒng)計分析結果文件繪制相應的統(tǒng)計圖,例如配對設計t檢驗中的Before&After Line Plot、方差分析中的Multiple Comparison Plot和Main Effects圖、相關分析中的Scatter Matrix Plot、生存分析中的Adjusted Survival Curves。對于醫(yī)學基礎研究中常用的誤差圖,SigmaPlot通過調整類型、Error bar的方向和大小,可個性化定制10多種形式各異的誤差條圖[6]。SigmaPlot具備強大的后期編輯功能,使用者可在初步繪制的統(tǒng)計圖上,像操作Office一樣靈活精準地作形式、顏色、文本、大小等方面的修改。SigmaPlot的Graph Page文件一頁可存放多張統(tǒng)計圖且可自動排版,當需要集中展示多張圖時,可省去后期合成圖片的麻煩,是一項非常實用的功能。
4.教學效果
近3年的教學評價問卷調查結果顯示,選課學員對統(tǒng)計制圖軟件需求較大,通過系統(tǒng)學習之后,86.36%的學生贊同目前的授課內容能夠滿足實際應用的需求,對于Sigmaplot軟件,有53.49%的學生認為其主要優(yōu)點是繪圖精美,且大部分學生(90.91%)能夠掌握數(shù)據(jù)分析與統(tǒng)計制圖的基本技能。在使用意愿方面,有32.56%的學生愿意選擇Sigmaplot繪制統(tǒng)計圖??梢姡n程教學提高了SigmaPlot的認知度和使用率,但普及程度有待進一步提高。
綜合近幾年的教學、實踐經(jīng)驗以及選課學員的反饋來看,SigmaPlot是一款非常實用的統(tǒng)計分析與制圖軟件,使醫(yī)學研究非統(tǒng)計專業(yè)人員多了一項選擇。相比統(tǒng)計分析功能,學員使用統(tǒng)計制圖功能的頻率更高,在以后的教學中要更加注重制圖授課的系統(tǒng)性、實用性和趣味性,不斷改善教學效果,進一步提高普及度和使用率,發(fā)揮SigmaPlot在醫(yī)學研究生科研數(shù)據(jù)分析與結果展示能力培養(yǎng)中的作用。