曹金玲,張 燁,張方淋,李大強,
1.復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)研究院,上海 200032;
2.復(fù)旦大學(xué)腫瘤研究所,復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系,上海 200032
乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤,發(fā)病率逐年增加,死亡率居女性惡性腫瘤的前列[1]。多聚ADP核糖聚合酶1[poly(ADP ribose)polymerase 1,PARP1]是核酶PARP家族表達最為豐富的一種亞型[2-3],負責(zé)細胞內(nèi)90%的聚ADP核糖聚合體的形成,可以通過聚ADP核糖基化修飾各種核蛋白[3]。聚ADP核糖基化修飾在DNA損傷修復(fù)、染色質(zhì)重塑、基因轉(zhuǎn)錄以及調(diào)節(jié)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化等多種細胞生物學(xué)過程中扮演著重要的角色[2,4-5]。2014年P(guān)ARP抑制劑olaparib被批準(zhǔn)用于BRCA基因突變的卵巢癌治療,確定了其在癌癥治療中的臨床重要性,證實了PARP1可以作為癌癥治療的一個新靶點[6]。盡管PARP1是PARP蛋白家族中被廣泛研究的成員之一,但它的許多生物學(xué)特征仍未被發(fā)現(xiàn)[3]。
環(huán)指蛋白144A(ring finger protein 144A,RNF144A)是環(huán)指間環(huán)(ring-between-ring,RBR)E3泛素連接酶家族中一個成員,它的特點是具有3個重要的結(jié)構(gòu)域,包括RING1結(jié)構(gòu)域、IBR結(jié)構(gòu)域以及RING2結(jié)構(gòu)域[7-11]。迄今為止,RNF144A的生物學(xué)功能和作用機制尚不清楚。已有文獻報道RNF144A是DNA依賴性蛋白激酶(DNA-dependent protein kinase,DNA-DPK)的E3泛素連接酶,可促進DNA損傷誘導(dǎo)的細胞凋亡[12]。本實驗室的前期研究發(fā)現(xiàn),RNF144A是一種潛在的腫瘤抑制基因[13],并且在乳腺癌細胞中RNF144A促進PARP1蛋白的泛素化修飾和降解,從而影響乳腺癌細胞對PARP抑制劑olaparib的敏感性[14]。但是,PARP1是否對RNF144A具有調(diào)節(jié)作用尚未見報道。
本課題將探究PARP1是否對RNF144A具有調(diào)節(jié)作用,以及這種調(diào)節(jié)作用對乳腺癌細胞凋亡的影響,為進一步探索PARP1對RNF144A調(diào)節(jié)作用的機制奠定基礎(chǔ),為臨床上治療乳腺癌提供新的理論依據(jù)和治療思路。
收集復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院2017年1月—2017年6月經(jīng)外科手術(shù)切除、病理學(xué)檢查證實為Ⅰ~Ⅲ期乳腺癌患者標(biāo)本142例,患者均為女性,年齡為26~77歲,平均49.22歲。所有病例的臨床資料完整,術(shù)前均未進行任何放化療(表1)。本研究獲得復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院倫理委員會的批準(zhǔn),所有患者均知情同意。
表 1 142例乳腺癌患者臨床病理特征Tab. 1 Clinicopathological features of 142 breast cancer patients
人胚腎上皮細胞HEK-293T、人乳腺癌細胞MDA-MB-231、MCF-7、Hs578T均來自中國科學(xué)院典型培養(yǎng)物保藏委員會細胞庫/中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細胞資源中心,PARP1小干擾RNA(small interference,siRNA)套裝購自上海華津生物科技有限公司,實時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)試劑盒購自寶生物工程(大連)有限公司,AnnexinⅤ-PE/7-AAD細胞凋亡檢測試劑盒購自上海翊圣生物科技有限公司,Neofect DNA轉(zhuǎn)染試劑購自上海騰易生物科技有限公司,PARP抑制劑olaparib購自美國Selleck公司。pCDH-HA-PARP1質(zhì)粒和pCDH-Flag-RNF144A質(zhì)粒見文獻報道[14],pLVX-Flag-RNF144A質(zhì)粒由本實驗室自行構(gòu)建。兔抗人RNF144A多克隆抗體購自美國Lifespan公司(貨號:LS-C162648),鼠抗人PARP1單克隆抗體購自美國Santa Cruz公司(貨號:sc-8007),小鼠抗人Vinculin單克隆抗體購自美國Sigma公司(貨號:V9131),山羊抗兔IgG二抗(貨號:7076V)和山羊抗小鼠IgG二抗(貨號:7074V)均購自美國Cell Signaling公司。
1.3.1 免疫組織化學(xué)染色
實驗操作按照免疫組織化學(xué)試劑盒說明書進行,用PBS代替一抗作為陰性對照。將乳腺癌組織切片先行抗原修復(fù),加入PARP1一抗,4 ℃溫育過夜,加二抗37 ℃溫育30 min,加顯色劑顯色。上面每個步驟間均用PBS沖洗3次,每次3 min。然后采用蘇木精復(fù)染,脫水透明、封片、鏡下觀察。細胞核黃色著色細胞為陽性細胞。陽性判定按陽性細胞數(shù)及染色強度綜合分析。顯色細胞數(shù)<10%計1分,11%~50%計2分,51%~80%計3分,大于80%計4分。染色強度:不著色計0分,淺黃色計1分,棕黃色計2分,褐黃色計3分。染色強度與細胞所占百分比的積分相乘,0分為陰性,1~4分為弱陽性,4~6分為中等陽性,大于6分為強陽性。
1.3.2 pCDH-HA-PARP1質(zhì)粒和pLVX-Flag-RNF144A質(zhì)粒慢病毒包裝
計數(shù)鋪HEK-293T細胞(1×107個/10 cm培養(yǎng)皿),第2天轉(zhuǎn)染目的質(zhì)粒。慢病毒包裝采用二質(zhì)粒系統(tǒng),目的質(zhì)粒:包裝質(zhì)粒(pMD2.G和psPAX2)=1∶1,包裝質(zhì)粒pMD2.G∶包裝質(zhì)粒psPAX2=1∶3。轉(zhuǎn)染步驟參照Neofect DNA轉(zhuǎn)染試劑說明書。轉(zhuǎn)染48 h后收上清液,用0.45 μm的無菌濾膜過濾器過濾,過濾后的病毒上清液可以直接感染目的細胞,也可以分裝后保存在-80 ℃冰箱。
1.3.3 細胞全蛋白提取
棄去培養(yǎng)液,用1×PBS漂洗細胞兩次,棄凈。加入適量的含有蛋白酶抑制劑、磷酸酶抑制劑A、磷酸酶抑制劑B的RIPA裂解液,使細胞的表面能被裂解液均勻覆蓋,4 ℃搖床上裂解20 min,用刮子將細胞刮下后進行離心,14 000 r/min,4 ℃,離心15 min,將上清液轉(zhuǎn)移至新的Eppendof試管中,然后用BCA法定量。蛋白樣品定量配制完成后在100 ℃的金屬浴中煮5 min,離心混勻即可。
1.3.4 蛋白質(zhì)印跡法(Western blot)檢測
按照十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)凝膠的配方制備合適濃度的 SDS-PAGE凝膠膠板。將制備好的SDSPAGE膠板安裝好,加入電泳緩沖液,將蛋白樣品取合適的體積加入到凝膠內(nèi)的上樣孔中,90 V電壓電泳,電泳完畢后開始轉(zhuǎn)膜,用甲醇激活PVDF 膜,準(zhǔn)備4張濾紙,分別在轉(zhuǎn)膜夾板兩側(cè)覆蓋上一張海綿及兩張濾紙,將PVDF膜、PAGE凝膠放在轉(zhuǎn)膜夾板的濾紙上夾好,按照電源的正負放入轉(zhuǎn)膜槽內(nèi),90 V轉(zhuǎn)膜。轉(zhuǎn)膜完畢后,根據(jù)目的條帶大小切膜,晾干,甲醇激活,采用5%的牛血清白蛋白室溫封閉 1 h。加入一抗RNF144A(1∶1 000稀釋)、PARP1(1∶1 000稀釋)以及Vinculin(1∶10 000稀釋),4 ℃搖床上溫育過夜。第2天用1×PBST洗膜3次,每次10 min,加入對應(yīng)于一抗種屬來源的HRP標(biāo)記的二抗(山羊抗兔IgG二抗和山羊抗小鼠IgG二抗均為1∶5 000稀釋),在室溫搖床上溫育1~2 h,用1×PBST洗膜3次,每次10 min,然后曝光成像。
1.3.5 RTFQ-PCR檢測
按照TRIzol法提取細胞RNA,然后按照寶生物工程(大連)有限公司反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書將提取的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。使用10 μL體系,包括4 μL模板(cDNA稀釋5倍),1 μL前引物和后引物混合物(前引物和后引物混合物濃度為2 μmol/L),5 μL 2×SYBGREEN Mix,3個復(fù)孔。采用PCR儀器完成RTFQ-PCR后進行數(shù)據(jù)處理,其中使用的引物見表2。
表 2 RTFQ-PCR使用的引物信息Tab. 2 Primer sequences for RTFQ-PCR analysis
1.3.6 AnnexinⅤ-PE/7-AAD雙染法流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡的功能恢復(fù)實驗
計數(shù)鋪MCF-7細胞,第2天密度匯合至50%,按照設(shè)計好的實驗,用慢病毒表達空載體、HA-PARP1和HA-PARP1+Flag-RNF144A感染MCF-7細胞,10 cm培養(yǎng)皿加培養(yǎng)基6 mL,慢病毒加3 mL(慢病毒HA-PARP1∶慢病毒Flag-RNF144A=1∶1),加Polybrene(終質(zhì)量濃度為6 μg/mL)提高慢病毒對細胞的感染效率,24 h后加PARP抑制劑olaparib(終濃度20 μmol/L)誘導(dǎo)細胞凋亡,對照組加DMSO試劑處理。加藥24 h后收集細胞,按照AnnexinⅤ-PE/7-AAD細胞凋亡檢測試劑盒(貨號:40310ES60)說明書處理細胞,處理好的細胞采用流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡。
實驗中所有的數(shù)據(jù)均以x±s表示,兩個樣本間比較均使用t檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
免疫組織化學(xué)染色結(jié)果顯示PARP1染色陽性主要為細胞核黃色著色。圖1A顯示PARP1在乳腺癌組織中不同的染色強度,PARP1高表達(強陽性、中等強度陽性、弱陽性)97例,PARP1低表達(陰性)45例。采用Kaplan-Meier方法分析兩者總生存和無復(fù)發(fā)生存情況,經(jīng)Log-rank檢驗分析發(fā)現(xiàn)PARP1高表達的乳腺癌患者總生存率(P=0.043)與無病生存率(P=0.034)較低。這些結(jié)果表明PARP1表達水平與乳腺癌患者的預(yù)后相關(guān),PARP1在乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展過程中可能扮演著癌基因的角色(圖1)。
在共轉(zhuǎn)染RNF144A和PARP1的HEK-293T細胞中,隨著PARP1的逐漸增加,RNF144A的蛋白表達量逐漸下降,說明在HEK-293T細胞中PARP1在蛋白水平負向調(diào)控RNF144A。我們又在HEK-293T、MCF-7中瞬時過表達PARP1,采用Western blot檢測RNF144A的蛋白表達。結(jié)果顯示過表達PARP1后,RNF144A的蛋白水平降低(圖2)。
為了進一步確定細胞中PARP1對RNF144A的調(diào)節(jié)作用,我們在乳腺癌細胞MCF-7中,利用短發(fā)夾RNA(shRNA)干擾PARP1的表達,在MCF-7、Hs578T和HEK-293T中用siRNA敲低PARP1,然后用Westrn blot檢測RNF144A的蛋白表達。結(jié)果顯示,在PARP1敲低的情況下,RNF144A的蛋白表達水平明顯上升。為了檢測PARP1是否影響RNF144A轉(zhuǎn)錄水平,我們在敲低了PARP1的MCF-7、Hs578T和HEK-293T共3株細胞中,采用RTFQ-PCR檢測了RNF144A的mRNA表達水平。結(jié)果顯示,敲低PARP1對RNF144A mRNA水平?jīng)]有明顯影響(圖3)。這些結(jié)果說明PARP1在蛋白水平而非轉(zhuǎn)錄水平調(diào)節(jié)RNF144A。
圖 1 免疫組織化學(xué)染色PARP1表達水平與乳腺癌患者生存率的相關(guān)性分析Fig. 1 The analysis of correlation between PARP1 expression level and survival rate of breast cancer patients by immunohistochemistry
圖 2 Western blot 檢測過表達PARP1對RNF144A蛋白表達水平的影響Fig. 2 The effects of PARP1 overexpression on protein expression levels of RNF144A detected by Western blot
為了探討PARP1調(diào)節(jié)RNF144A對乳腺癌細胞凋亡的影響,我們在MCF-7細胞中瞬時共轉(zhuǎn)染空載體、HA-PARP1和HA-PARP1+Flag-RNF144A,24 h后加20 μmol/L的PARP抑制劑olaparib誘導(dǎo)細胞凋亡。采用流式細胞術(shù)分析結(jié)果顯示在DMSO處理組空載體、HA-PARP1和HA-PARP1+Flag-RNF144A表達細胞的凋亡率(早期凋亡+晚期凋亡,下同)分別為(8.1±0.5)%、(5.4±0.1)%和(6.8±0.3)%。經(jīng)olaparib處理24 h后空載體、HA-PARP1和HA-PARP1+Flag-RNF144A表達細胞的凋亡率分別為(19.35±0.5)%、(13.25±0.45)%和(16.3±0.9)%。在DMSO以及olaparib處理組,與表達空載體的細胞相比,過表達PARP1后細胞凋亡率有所下降,但在過表達PARP1的細胞里重新過表達RNF144A后,凋亡率有一定程度的恢復(fù),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(圖4)。這些結(jié)果表明RNF144A在一定程度上能解除PARP1對乳腺癌細胞的凋亡抑制作用,因此我們推測PARP1通過調(diào)節(jié)RNF144A抑制乳腺癌細胞的凋亡。
圖 3 Western blot和RTFQ-PCR分析敲低PARP1對RNF144A蛋白與mRNA表達水平的影響Fig. 3 The effects of PARP1 knockdown on protein and mRNA expression levels of RNF144A detected by Western blot and RTFQ-PCR
圖 4 Annexin Ⅴ-PE/7-AAD雙染法流式細胞術(shù)檢測MCF-7細胞凋亡Fig. 4 Flow cytometry analysis of apoptosis of MCF-7 cells using Annexin Ⅴ-PE/7-AAD double staining
乳腺癌是一種具有較高異質(zhì)性的腫瘤[15],根據(jù)不同的分子分型治療方法不盡相同。盡管我們在乳腺癌治療方面的研究取得了很大的進展,乳腺癌仍然是女性癌癥死亡的主要原因[16]。
PARP1和RNF144A在乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展和凋亡調(diào)控等生物學(xué)過程中發(fā)揮著重要作用。Diamantopoulos等[17]的研究顯示,PARP1在DNA損傷時通過與DNA損傷部位結(jié)合,招募修復(fù)酶,修復(fù)DNA損傷,但如果損傷嚴重,它可能通過半胱天冬酶活化導(dǎo)致細胞凋亡。Ho等[18]的研究顯示,當(dāng)細胞遭受持續(xù)或嚴重的DNA損傷時,RNF144A通過誘導(dǎo)DNA-DPK泛素化降解參與p53介導(dǎo)的細胞凋亡。目前PARP1對RNF144A的調(diào)節(jié)作用還鮮見報道。蛋白質(zhì)豐度的直接影響因素包括相應(yīng)蛋白質(zhì)對應(yīng)的mRNA豐度、蛋白質(zhì)合成速率和降解速率。通過敲低和過表達PARP1后,檢測RNF144A蛋白和mRNA水平后發(fā)現(xiàn)PARP1從蛋白水平上調(diào)控RNF144A,而對其轉(zhuǎn)錄水平無影響。關(guān)于PARP1對E3泛素連接酶的調(diào)節(jié)作用機制,Zhou等[19]的研究表明,端錨聚合酶(PARP的一種)可以聚ADP核糖基化E3泛素連接酶RNF146,隨后泛素化聚ADP核糖基化的 RNF146,導(dǎo)致RNF146經(jīng)26s蛋白酶體途徑降解[19]。本文探討了PARP1在蛋白水平上對RNF144A有調(diào)節(jié)作用,但其調(diào)控機制還需進一步探討。
癌癥的一個重要特征是對細胞凋亡具有固有或獲得性抵抗[20]。目前越來越多的研究者認為藥物的療效與其誘導(dǎo)細胞凋亡的能力有關(guān)。腫瘤細胞對治療的反應(yīng)是發(fā)生凋亡并在體液循環(huán)中釋放細胞成分。因此,這些成分可以作為評估治療反應(yīng)的生物標(biāo)志物,但是介紹這種方法的文獻資料很少,還需要大規(guī)模的前瞻性研究來驗證這種方法并更充分地闡明其臨床用途[15]。我們的免疫組化和Kaplan-Meier分析說明PARP1表達水平高與乳腺癌患者生存率有關(guān),因此PARP1對RNF144A的調(diào)節(jié)作用可能與患者預(yù)后有直接的臨床相關(guān)性。AnnexinⅤ-PE/7-AAD雙染法流式細胞術(shù)檢測細胞凋亡功能恢復(fù)實驗結(jié)果顯示,RNF144A能解除PARP1對小分子抑制劑olaparib誘導(dǎo)的細胞凋亡的抑制作用。細胞凋亡的目的在于清除受損細胞,此功能障礙會導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生、發(fā)展[21]。因此,誘導(dǎo)腫瘤細胞凋亡是抗癌治療中的重要環(huán)節(jié)。
本研究顯示PARP1通過調(diào)節(jié)RNF144A抑制乳腺癌細胞的凋亡,過表達RNF144A能解除PARP1對olaparib誘導(dǎo)的細胞凋亡的抑制作用,本研究結(jié)果對乳腺癌患者預(yù)后、乳腺癌細胞凋亡耐藥、化療藥及腫瘤小分子抑制劑的療效的研究均具有臨床指導(dǎo)意義,可望為乳腺癌的分子靶向治療提供新的線索。