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        甲狀腺結(jié)節(jié)穿刺標(biāo)本中BRAF V600E突變檢測的臨床意義

        2019-04-29 07:33:08周曉燕高麗麗稽慶海朱曉麗
        中國癌癥雜志 2019年3期
        關(guān)鍵詞:細(xì)胞學(xué)靈敏度結(jié)節(jié)

        張 玲,周曉燕,陳 穎,張 皓,高麗麗,王 宇,稽慶海,平 波,朱曉麗

        1.復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院病理科,復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系,上海 200032;

        2.復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院頭頸外科,復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院腫瘤學(xué)系,上海 200032

        甲狀腺癌是最常見的內(nèi)分泌系統(tǒng)惡性腫瘤,其發(fā)病率近年來快速上升[1]。目前,甲狀腺細(xì)針抽吸細(xì)胞學(xué)檢查(fine-needle aspiration cytology,F(xiàn)NAC)以其微創(chuàng)、易行及準(zhǔn)確率高的特點(diǎn),成為臨床上診斷甲狀腺結(jié)節(jié)良惡性最常用的方法,但仍有20%的病例無法明確診斷[2]。在甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)中,BRAF V600E突變是迄今報(bào)道最多的突變類型[3-5]。檢測B超引導(dǎo)下甲狀腺結(jié)節(jié)穿刺細(xì)胞中的BRAF V600E突變可輔助細(xì)胞學(xué)診斷,提高診斷的靈敏度和準(zhǔn)確率。突變特異性擴(kuò)增系統(tǒng)(amplification refractory mutation system,ARMS)方法利用特異性引物和雙環(huán)探針技術(shù),將BRAF V600E檢測靈敏度提高到1%的突變比例,大幅提高了檢出率。本研究使用該方法對甲狀腺穿刺細(xì)胞液進(jìn)行BRAF V600E突變檢測,以組織病理學(xué)診斷為金標(biāo)準(zhǔn),評估BRAF V600E檢測與細(xì)胞學(xué)診斷的靈敏度和特異度。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 研究對象

        2016年6月—2017年4月在復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院接受B超引導(dǎo)下甲狀腺結(jié)節(jié)FNAC患者共563例,穿刺細(xì)胞液同時(shí)行細(xì)胞學(xué)診斷及BRAF V600E突變檢測。

        1.1.2 主要試劑與設(shè)備

        QIAamp DNA Mini Kit試劑盒購自德國QIAGEN公司,人類BRAF V600E突變檢測試劑盒購自廈門艾德生物醫(yī)藥科技股份有限公司。Eppendorf 5810R低速離心機(jī)購自德國Eppendorf AG公司,Thermo-Shaker恒溫金屬浴購自美國Thermo Fisher Scientific公司,QIAcube核酸提取儀購自德國QIAGEN公司,Thermo NANOdrop2000核酸濃度測定儀購自美國Thermo Fisher Scientific公司,ABI7500實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)儀購自美國Life Technologies公司。

        1.2 方法

        1.2.1 DNA提取

        穿刺細(xì)胞液用Eppendorf 5810R低速離心機(jī)4 000 r/min離心30 min,去上清液,吸取沉淀加入裂解液放入Thermo-Shaker恒溫金屬浴56 ℃消化過夜。用QIAcube核酸提取儀提取DNA,用Thermo NanoDrop2000核酸濃度測定儀進(jìn)行定量,并將濃度統(tǒng)一稀釋至2 ng/μL。

        1.2.2 RTFQ-PCR檢測

        按上機(jī)樣本數(shù)量配制RTFQ-PCR混合液,混勻后以每管35 μL分裝到8聯(lián)管中,將稀釋好的DNA每個(gè)樣本取5 μL加入反應(yīng)管?;靹蚝笠? 000 r/min離心15~20 s后放入ABI7500 RTFQPCR儀進(jìn)行RTFQ-PCR并采集熒光信號,生成熒光信號值。RTFQ-PCR程序?yàn)椋?5 ℃ 5 min,1個(gè)循環(huán)(第一階段);95 ℃ 25 s,64 ℃ 20 s,72 ℃ 20 s,15個(gè)循環(huán)(第二階段);93 ℃ 25 s,60 ℃ 35 s,72 ℃ 20 s,31個(gè)循環(huán)(第三階段)。信號收集:第三階段60 ℃時(shí)收集突變FAM和內(nèi)控HEX(或VIC)信號,執(zhí)行RTFQ-PCR,保存文件。

        1.2.3 BRAF V600E突變結(jié)果判讀

        按管號順序依次選擇單一突變檢測反應(yīng)管進(jìn)行檢測分析。需要同時(shí)選擇陽性質(zhì)控品反應(yīng)孔、陰性對照孔和樣品反應(yīng)孔,可根據(jù)實(shí)際情況調(diào)節(jié)Threshold至擴(kuò)增曲線升起的拐點(diǎn)處,得到突變FAM信號或內(nèi)控HEX(或VIC)信號的Ct值。確定試驗(yàn)是否成功可信:待測樣品的內(nèi)控HEX(或VIC)信號應(yīng)有明顯擴(kuò)增曲線,且Ct值應(yīng)在13~21之間。若內(nèi)控Ct值>21或HEX信號無明顯擴(kuò)增,說明加入的DNA含有RTFQ-PCR抑制劑或DNA加入數(shù)量不夠,需要重新提取DNA或增加DNA用量后再進(jìn)行試驗(yàn);但若FAM信號有明顯的擴(kuò)增曲線,且Ct值<28,該樣本無需重復(fù)檢測,檢測結(jié)果為BRAF V600E突變陽性。若內(nèi)控Ct值<13,說明加入的DNA過量,應(yīng)減少DNA加入量再進(jìn)行試驗(yàn);但若FAM信號無明顯擴(kuò)增曲線或Ct值>28,該樣本無需重復(fù)檢測,檢測結(jié)果為BRAF V600E突變陰性。質(zhì)控品的FAM信號Ct值一般<20,但可能會由于不同儀器的不同閾值設(shè)置而發(fā)生波動。若樣本的FAM信號Ct值≥28,則樣本為陰性(或低于試劑盒的檢測下限);若樣本的FAM信號Ct值<28,則樣本為陽性。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

        采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        在563例進(jìn)行BRAF V600E突變檢測的患者中,男女比例為1.0∶3.7(120∶443),年齡1~79歲,平均年齡(45.0±0.9)歲(表1)。BRAF V600E檢測成功率為99.3%(559/563),4例檢測失敗,無法判斷結(jié)果(ARMS方法檢測無HEX峰升起,提示擴(kuò)增失?。珺RAF V600E的總體突變率為50%。將標(biāo)本按細(xì)胞學(xué)診斷分為6級,其中良性32例,未見腫瘤細(xì)胞182例,非典型病變42例,個(gè)別異型細(xì)胞9例,疑濾泡性腫瘤6例,PTC及疑PTC 292例。

        表 1 甲狀腺結(jié)節(jié)FNAC標(biāo)本中BRAF V600E突變檢出率、細(xì)胞量及DNA濃度Tab. 1 BRAF V600E mutation, cell number and DNA concentration in the FNAC samples of thyroid nodule

        388例FNAC標(biāo)本做細(xì)胞量評估,樣本總體均數(shù)可信區(qū)間為95%,細(xì)胞量評估>60個(gè)細(xì)胞的樣本提取的DNA濃度均值為(9.0±1.2)ng/μL,細(xì)胞量評估<60個(gè)細(xì)胞的樣本提取的DNA濃度均值為(6.0±1.7)ng/μL,兩組平均濃度均小于10 ng/μL。成組設(shè)計(jì)的t檢驗(yàn)進(jìn)行兩樣本均數(shù)比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        209例患者接受手術(shù)并有組織病理學(xué)診斷結(jié)果,將組織病理學(xué)診斷作為金標(biāo)準(zhǔn),評估細(xì)胞學(xué)及BRAF V600E檢測的準(zhǔn)確率。細(xì)胞學(xué)診斷PTC的靈敏度為86.6%,特異度為100%,陽性預(yù)測值為100%,陰性預(yù)測值為20.6%。BRAF V600E單獨(dú)診斷甲狀腺惡性腫瘤的靈敏度為78.2%,特異度為100.0%,陽性預(yù)測值為100.0%,陰性預(yù)測值為13.7%。FNAC聯(lián)合BRAF V600E診斷PTC的靈敏度為92.1%,特異度為100.0%,陽性預(yù)測值為100.0%,陰性預(yù)測值為30.4%(表2)。FNAC聯(lián)合BRAF V600E檢測的陽性檢出率高于單獨(dú)FNAC及單獨(dú)BRAF V600E檢測,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.005)。

        組織病理學(xué)診斷為PTC的患者中,有11例患者細(xì)胞學(xué)診斷未見腫瘤細(xì)胞,但BRAF V600E檢測陽性,其中9例為微小PTC,2例為PTC,4例細(xì)胞量評估>60,4例細(xì)胞量評估<60,3例不滿意。

        表 2 細(xì)胞學(xué)診斷和BRAF V600E診斷與組織病理學(xué)診斷金標(biāo)準(zhǔn)的比對Tab. 2 Comparison of cytological diagnosis and BRAF V600E diagnosis with histopathologic diagnosis

        3 討 論

        PTC是最常見的內(nèi)分泌系統(tǒng)惡性腫瘤,約占甲狀腺惡性腫瘤的80%[6],近年來發(fā)病率明顯增高。目前研究發(fā)現(xiàn),在PTC中BRAF V600E突變是最常見的基因異常,突變率為45%~80%[7-8]。BRAF V600E突變后可持續(xù)性激活Ras基因/絲蘇氨酸蛋白激酶/絲裂原活化蛋白激酶激酶/絲裂原活化蛋白激酶(Ras/serine/threonine-protein kinase/mitogenactivated protein kinase kinase/mitogen-activated protein kinase,Ras/Raf/MAPKK/MAPK)信號通路促使甲狀腺細(xì)胞增殖,使濾泡上皮細(xì)胞發(fā)生惡變,并可促進(jìn)高分化乳頭狀癌細(xì)胞發(fā)展為低分化和未分化癌細(xì)胞[9]。

        目前甲狀腺結(jié)節(jié)穿刺的細(xì)胞學(xué)診斷是術(shù)前良惡性診斷的重要手段,但是約20%的甲狀腺FNAC標(biāo)本細(xì)胞學(xué)無法明確診斷[10-13],其惡性風(fēng)險(xiǎn)度為1.7%~6.6%[14],該組患者常需要再次穿刺或易漏檢。因此,有學(xué)者開始將分子檢測應(yīng)用于FNAC標(biāo)本,期望提高FNAC術(shù)前診斷的準(zhǔn)確率。本研究用ARMS方法檢測B超引導(dǎo)下甲狀腺FNAC組織中的BRAF V600E突變,檢測成功率高達(dá)99.3%,方法簡便快速,適用于臨床術(shù)前輔助診斷。本研究中,評估比較細(xì)胞量>60和<60個(gè)細(xì)胞的兩組FNAC標(biāo)本的DNA提取濃度,均低于10 ng/μL,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,細(xì)胞量的多少未影響DNA提取的濃度,可能由于細(xì)胞學(xué)評估并不能完全反映穿刺液中的實(shí)際細(xì)胞量。分析4例BRAF V600E突變檢測失敗的病例,細(xì)胞量的多少和DNA濃度的高低與檢測是否成功并不相關(guān),推測導(dǎo)致ARMS方法檢測失敗的因素可能有DNA質(zhì)量差和殘留的熒光抑制劑等。本研究中,甲狀腺結(jié)節(jié)細(xì)胞學(xué)診斷的靈敏度為86.6%,將細(xì)胞學(xué)診斷與BRAF V600E檢測結(jié)果相結(jié)合,靈敏度提高到92.1%,說明細(xì)胞學(xué)診斷聯(lián)合BRAF V600E檢測的準(zhǔn)確率優(yōu)于單獨(dú)細(xì)胞學(xué)診斷或單獨(dú)BRAF V600E檢測。分析11例組織病理學(xué)診斷及BRAF V600E檢測陽性、細(xì)胞學(xué)診斷陰性的病例,其中9例術(shù)后診斷為微小PTC,說明在微小PTC中,可能穿刺所得腫瘤細(xì)胞量較少,導(dǎo)致細(xì)胞學(xué)診斷時(shí)易發(fā)生漏檢,而分子檢測BRAF V600E突變是將DNA呈指數(shù)級放大,檢測靈敏度更高,因此對于微小PTC,BRAF V600E突變與細(xì)胞學(xué)檢測二者結(jié)合可明顯提高診斷準(zhǔn)確率,降低漏檢率。

        綜上所述,術(shù)前甲狀腺結(jié)節(jié)FNAC標(biāo)本中用ARMS方法檢測BRAF V600E成功率高,是臨床上簡單易行的方法,細(xì)胞學(xué)診斷與BRAF V600E同時(shí)檢測,可提高甲狀腺結(jié)節(jié)FNAC的術(shù)前診斷準(zhǔn)確率。

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