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        基于BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和遺傳算法優(yōu)化番茄紅素發(fā)酵培養(yǎng)基

        2019-04-25 07:29:12馮玲然余曉斌
        關(guān)鍵詞:隱層番茄紅素氮源

        王 強(qiáng),馮玲然,余曉斌

        (1.河南師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,河南 新鄉(xiāng)453007;2.江南大學(xué) 生物工程學(xué)院 江蘇 無錫 214122)

        番茄紅素是一種重要的類胡蘿卜素,在生物體中具有抗氧化、抗衰老、提高免疫力等生理功能[1-3]。目前,番茄紅素市場尚處于發(fā)展階段,主要體現(xiàn)在昂貴的價(jià)格和日益擴(kuò)增的市場需求方面。根據(jù)Global Industrial Analysts公司的報(bào)告,類胡蘿卜素的全球市場價(jià)值將在2017年達(dá)到13億美元。天然提取法仍是目前獲得番茄紅素的主要途徑,但也面臨著植物中色素含量低和純化工藝復(fù)雜等問題。盡管化學(xué)合成番茄紅素成本低廉,但是其副產(chǎn)物多,產(chǎn)品難以達(dá)到食品安全的要求。近年來,隨著生物技術(shù)的蓬勃發(fā)展,利用微生物發(fā)酵生產(chǎn)番茄紅素受到越來越多人的關(guān)注[4]。然而,低產(chǎn)量帶來的高成本仍然是發(fā)酵法生產(chǎn)番茄紅素規(guī)?;a(chǎn)的重要限制因素,雖然已經(jīng)有部分企業(yè)實(shí)現(xiàn)了番茄紅素的工業(yè)化生產(chǎn),但番茄紅素產(chǎn)量仍需進(jìn)一步提升。

        適宜的培養(yǎng)基可顯著提高發(fā)酵產(chǎn)物的產(chǎn)量,不同菌株對(duì)發(fā)酵培養(yǎng)基的要求不同,同一菌株在誘變前后對(duì)發(fā)酵基質(zhì)的要求往往也會(huì)發(fā)生改變。在已報(bào)道的文獻(xiàn)中,番茄紅素發(fā)酵培養(yǎng)基的組成成分及各組分的含量有較大差異,這說明三孢布拉霉的酶系豐富,可利用的碳氮源非常廣泛[5-7]。然而,這也給之后的研究者造成了困惑,不得不重新優(yōu)化培養(yǎng)基的組成,在培養(yǎng)基的選擇上參考價(jià)值較低,通常需要重新優(yōu)化,而合適的培養(yǎng)基優(yōu)化方法就顯得格外重要。番茄紅素發(fā)酵培養(yǎng)基多數(shù)采用天然培養(yǎng)基,成分復(fù)雜,各因素之間相互影響,使試驗(yàn)因素與結(jié)果之間具有較強(qiáng)的離散型,培養(yǎng)基各組分與產(chǎn)量之間存在著非線性關(guān)系,常規(guī)方法建立的數(shù)學(xué)模型往往不能準(zhǔn)確的描述這種關(guān)系,試驗(yàn)結(jié)果不盡如人意。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)(Artificial Neural Network,ANN)是對(duì)人類大腦的一種物理結(jié)構(gòu)上的模擬。誤差反向傳播神經(jīng)網(wǎng)絡(luò) (Error Back Propagation Neural Network,BPN)是人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中應(yīng)用極廣的重要模型之一,在擬合復(fù)雜的非線性關(guān)系方面具有顯著優(yōu)勢,并且對(duì)輸入輸出端點(diǎn)數(shù)沒有顯著,已廣泛應(yīng)用于發(fā)酵工業(yè),如培養(yǎng)基優(yōu)化[8-9]、發(fā)酵過程控制[10]等。遺傳算法(Genetic Algorithms,GA)是一種基于自然選擇學(xué)說和遺傳學(xué)原理的群體尋優(yōu)算法,將繁殖、雜交、變異、競爭、選擇等概念引入算法,非常適合與BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)相結(jié)合尋求最優(yōu)解[11-12]。

        為了提高發(fā)酵生產(chǎn)水平,人們首先考慮的是優(yōu)良菌種的選育。在完成菌種選育之后,發(fā)酵工藝的優(yōu)化則是另一項(xiàng)基礎(chǔ)而重要的任務(wù)。發(fā)酵工藝優(yōu)化的實(shí)質(zhì)是考察各變量對(duì)優(yōu)化目標(biāo)的影響,以獲得影響因子與目標(biāo)值之間的關(guān)系,進(jìn)而確定最優(yōu)發(fā)酵條件。本研究以誘變育種得到的番茄紅素高產(chǎn)突變株B.trisporaI5(-)和正菌為發(fā)酵菌種,基于 BP(Back Propagation)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模擬發(fā)酵培養(yǎng)基各組分含量與番茄紅素產(chǎn)量之間的函數(shù)關(guān)系,再用遺傳算法優(yōu)化番茄紅素發(fā)酵培養(yǎng)基的組成。

        1 材料與方法

        1.1 菌種

        實(shí)驗(yàn)室保藏的三孢布拉霉菌Blakeslea trisporaNRRL 2895(+)和番茄紅素高產(chǎn)突變株Blakeslea trisporaI5(-)。

        1.2 培養(yǎng)基

        1)固體培養(yǎng)基。 5°麥芽汁,瓊脂 20 g/L,pH 自然,1×105Pa 滅菌 20 min。

        2)種子培養(yǎng)基(g/L)。玉米粉 47,黃豆粉 23,KH2PO40.5,維生素 B10.002,蒸餾水 1 000 mL,pH 6.3,1×105Pa 滅菌 20 min[13]。

        3)發(fā)酵培養(yǎng)基(g/L,優(yōu)化前)。 玉米粉 19,黃豆粉 44, 大豆油 80,KH2PO41.5,MgSO4·7H2O 0.6,維生素 B10.002,蒸餾水 1 000 mL,pH 6.5,1×105Pa滅菌20 min[13]。

        1.3 培養(yǎng)方法

        1)固體培養(yǎng)。菌種涂布或劃線接種于固體平板后,25 ℃培養(yǎng) 4~5 d。

        2)種子培養(yǎng)。將生長4 d的孢子用無菌生理鹽水洗下,調(diào)整B.trispora(+)和B.trispora(-)孢子濃度分別為105mL-1和106mL-1。各吸取正、負(fù)菌孢子1 mL分別接種于50 mL種子培養(yǎng)基,25℃、180 r/min培養(yǎng)48 h。

        3)發(fā)酵培養(yǎng)。 將正、負(fù)菌種子液以 1∶5(v∶v)的比例混合后接種于發(fā)酵培養(yǎng)基,接種量為10%。25℃、180 r/min培養(yǎng)120 h,在發(fā)酵48 h時(shí)添加0.1 g/L的2-甲基咪唑(番茄紅素環(huán)化酶抑制劑)。

        1.4 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型設(shè)計(jì)

        1.4.1 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型本試驗(yàn)以發(fā)酵培養(yǎng)基的組成作為BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的輸入,番茄紅素的體積產(chǎn)量作為輸出,采用3層網(wǎng)絡(luò)。一般輸入層為多個(gè)變量,輸出變量為一個(gè)或多個(gè),但為了使模型更好,訓(xùn)練過程更方便,通常選一個(gè)輸出變量。輸入層包括碳源、氮源、植物油、磷酸二氫鉀、硫酸鎂,分別標(biāo)記為X1、X2、X3、X4、X5;隱層的節(jié)點(diǎn)數(shù)n通過試驗(yàn)確定;輸出層為番茄紅素體積產(chǎn)量,標(biāo)記為Y。模型的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)為5-n-1,見圖1。隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)的選擇是影響B(tài)P網(wǎng)絡(luò)模型性能的重要因素之一,但目前尚無理論方法確定隱層節(jié)點(diǎn)數(shù),一般通過經(jīng)驗(yàn)公式和試錯(cuò)法確定。為了保證足夠高的模擬性能和泛化能力,通常在滿足精度要求的情況下盡可能選擇較少的節(jié)點(diǎn)數(shù)[14]。通過試錯(cuò)法確定隱層節(jié)點(diǎn)數(shù),即通過試驗(yàn),以模型預(yù)測值與實(shí)際測量值之間的誤差大小為標(biāo)準(zhǔn),選取合適的節(jié)點(diǎn)數(shù)。BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型建模和遺傳算法尋優(yōu)均在Matlab R2012b軟件中進(jìn)行。

        圖1 拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)為5-n-1的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)圖Fig.1 Topology of BP network 5-n-1

        1.4.2 數(shù)據(jù)樣本為了獲得典型的數(shù)據(jù)樣本,參照正交設(shè)計(jì)思想,設(shè)計(jì)49組試驗(yàn),隨機(jī)選取其中40組作為訓(xùn)練樣本,另外9組作為檢驗(yàn)樣本,49組試驗(yàn)設(shè)計(jì)及結(jié)果如表1所示。其中,每組設(shè)置3個(gè)重復(fù),番茄紅素產(chǎn)量取平均值。將輸入樣本和輸出樣本的樣本數(shù)值分別導(dǎo)入Matlab,分別賦予變量名inputdata和 outputdata,并保存為 sample.mat。

        表1 BP網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練樣本Table 1 Training sample of BP network g/L

        續(xù)表1

        1.4.3 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)程序代碼將原始樣本數(shù)據(jù)導(dǎo)入MATLAB后,隨機(jī)分為訓(xùn)練樣本(40個(gè))和檢驗(yàn)樣本 (9個(gè))。分別試驗(yàn)在1~20個(gè)隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)情況下,預(yù)測結(jié)果與實(shí)際結(jié)果的誤差絕對(duì)值之和,由此確定隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)。之后,對(duì)樣本建模,輸入層向隱含層傳遞的函數(shù)用tansig(S型正切函數(shù)),隱含層向輸出層傳遞的函數(shù)選用purelin(純線性函數(shù)),訓(xùn)練函數(shù)選擇traingdx。源程序如下

        1)確定隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)程序

        load sample%導(dǎo)入原始樣本

        data=inputdata';%矩陣轉(zhuǎn)置

        result=outputdata';

        n=randperm(49);%1-49 隨機(jī)排列

        p=data(:,n(1:40));%取 40 個(gè)樣本用于訓(xùn)練

        t=result(:,n(1:40));

        test=data(:,n(41:49));%取剩余 9 個(gè)樣本用于檢驗(yàn)

        b=result(:,n(41:49));

        save bpdata%將上述變量保存于bpdata.mat

        [pn,pp]=mapminmax(p);%歸一化處理

        minp=pp.ymin;

        maxp=pp.ymax;

        [tn,tt]=mapminmax(t);

        mint=tt.ymin;

        maxt=tt.ymax;

        fori=1:20%循環(huán)

        net =newff (pn,tn,i,{'tansig','purelin'},'traingdx');%構(gòu)建神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

        net.divideParam.trainRatio=100/100;%修改訓(xùn)練樣本比例

        net.divideParam.valRatio=0/100;

        net.divideParam.testRatio=0/100;

        net.trainParam.epochs=2000;%最大訓(xùn)練次數(shù)

        net.trainParam.lr=0.05;%學(xué)習(xí)步長

        net.trainParam.goal=0.00001;%學(xué)習(xí)目標(biāo)

        net=train(net,pn,tn);%訓(xùn)練函數(shù)

        testn=mapminmax('apply',test,pp);%歸一化測試樣本

        an=sim(net,testn);%預(yù)測

        a=mapminmax('reverse',an,tt);%反歸一化

        sse=sum((b-a).^2) %誤差平方和

        r(i)=norm(sse);%輸出不同隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)下的誤差平方和

        end

        2)BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建模程序

        load bpdata

        [pn,pp]=mapminmax(p);

        minp=pp.ymin;

        maxp=pp.ymax;

        [tn,tt]=mapminmax(t);

        mint=tt.ymin;

        maxt=tt.ymax;

        net=newff (pn,tn,12,{'tansig','purelin'},'traingdm');

        net.divideParam.trainRatio=100/100;

        net.divideParam.valRatio=0/100;

        net.divideParam.testRatio=0/100;

        net.trainParam.epochs=20000;

        net.trainParam.lr=0.05;

        net.trainParam.goal=0.00001;

        net=train(net,pn,tn);

        testn=mapminmax('apply',test,pp);

        an=sim(net,testn);

        a=mapminmax('reverse',an,tt);

        figure(1)

        plot(a,':og')

        hold on

        plot(b,'-*');

        legend('預(yù)測產(chǎn)量 ','實(shí)際產(chǎn)量 ')

        title('BP網(wǎng)絡(luò)預(yù)測和實(shí)際產(chǎn)量')

        xlabel('樣本 ')

        ylabel('番茄紅素產(chǎn)量(g·L^{-1})')

        save net

        1.5 遺傳算法的尋優(yōu)設(shè)計(jì)

        上述BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)發(fā)酵培養(yǎng)基組成與番茄紅素體積產(chǎn)量之間的關(guān)系進(jìn)行建模,預(yù)測培養(yǎng)基成分不同含量下番茄紅素的產(chǎn)量。為了獲得各組分的最優(yōu)含量,本文采用遺傳算法(Genetic Algorithm)進(jìn)行尋優(yōu)。

        在MATLAB R2012b中輸入命令optimtool打開優(yōu)化工具箱,求解器選擇GA-Genetic Algorithm,變量數(shù)選擇5,變量上下限分別為[20 4 20 0.8 0.2]和[50 16 50 2 0.8],初始種群20,種群類型選雙精度,種群選擇方法選Roulette,交叉點(diǎn)選單點(diǎn)交叉,交叉概率為0.8,變異概率選0.05,進(jìn)化代數(shù)為100,其他保持默認(rèn)。適應(yīng)度函數(shù)為@fit,函數(shù)代碼如下

        function fitness=fit(x)

        load net

        x=x';

        xn=mapminmax('apply',x,pp);

        yn=sim(net,xn);

        y=mapminmax('reverse',yn,tt);

        fitness=-y;

        1.6 生物量和番茄紅素產(chǎn)量的測定

        發(fā)酵結(jié)束后,取10 mL發(fā)酵液,8 000 r/min離心10 min,蒸餾水洗滌3次。菌絲體干重的測定采用稱重法,105℃烘干至恒重后稱重。番茄紅素的測定則將洗滌后的菌絲體在40℃真空干燥后研磨破壁,然后用石油醚萃取至菌絲體無色,合并萃取液用于番茄紅素含量的測定。番茄紅素的測定采用比色法,萃取液經(jīng)適當(dāng)稀釋后在502 nm波長下測定吸光值,并用標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算番茄紅素質(zhì)量濃度[15]。見圖2。

        圖2 番茄紅素標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.2 Standard curve of lycopene

        2 結(jié)果與分析

        2.1 碳源種類對(duì)生物量和番茄紅素產(chǎn)量的影響

        碳源不僅是構(gòu)成細(xì)胞和番茄紅素的碳骨架,也是維持細(xì)胞生命活動(dòng)的重要能量來源,常見的碳源包括糖類、有機(jī)酸、低級(jí)醇、油脂等。針對(duì)已有文獻(xiàn)報(bào)道及B.trispora的生長特性,本文選取玉米粉、麥芽糊精、可溶性淀粉、葡萄糖、蔗糖這5中常見碳源,每種碳源3個(gè)濃度水平,考察其對(duì)B.trispora產(chǎn)番茄紅素及生物量的影響。其中,碳源低、中、高質(zhì)量濃度水平分別為20、30、40 g/L,結(jié)果如圖3所示。由圖可知,玉米粉對(duì)番茄紅素產(chǎn)量和生物量的影響均明顯優(yōu)于其他碳源。因此,選擇玉米粉作為碳源進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。

        圖3 不同碳源對(duì)番茄紅素產(chǎn)量發(fā)酵的影響Fig.3 Effect of different carbon source on lycopene fermentation

        2.2 氮源種類對(duì)生物量和番茄紅素產(chǎn)量的影響

        氮源用于細(xì)胞物質(zhì)(如蛋白質(zhì)、核酸等)和含氮代謝物的合成,常見的氮源可以分為有機(jī)氮源和無機(jī)氮源兩類。無機(jī)氮源主要包括銨鹽、硝酸鹽、氨水等;有機(jī)氮源主要包括黃豆粉、玉米漿、黃豆餅粉、蛋白胨、棉籽餅粉、酵母粉等。本論文選取黃豆粉、玉米漿干粉、蛋白胨、硝酸鈉、硫酸銨這五種常見氮源,每種氮源選取3個(gè)濃度水平,考察其對(duì)番茄紅素產(chǎn)量和生物量的影響。由于黃豆粉中氮的利用率較低,其低、中、高濃度水平分別為 20、30、40 g/L;其它氮源的低、中、高濃度水平分別為 6、10、12 g/L,結(jié)果如圖4所示。有機(jī)氮源對(duì)番茄紅素產(chǎn)量和生物量的影響明顯優(yōu)于無機(jī)氮源,且玉米漿干粉的效果最佳。因此,玉米漿干粉被選為后續(xù)試驗(yàn)的氮源。

        圖4 不同氮源對(duì)番茄紅素發(fā)酵的影響Fig.4 Effect of different nitrogen source on lycopene fermentation

        2.3 不同植物油對(duì)生物量和番茄紅素產(chǎn)量的影響

        植物油作為輔助碳源經(jīng)常被用于工業(yè)發(fā)酵中,如抗生素的生產(chǎn)等,植物油可被微生物分泌的胞外脂肪酶分解,進(jìn)而吸收利用。本試驗(yàn)選取棉籽油、大豆油、花生油、菜籽油、亞麻籽油和橄欖油這6中常見植物油,每種植物油選取低、中、高3個(gè)濃度水平,分別為30、40、50 g/L,考察其對(duì)生物量和番茄紅素產(chǎn)量的影響,結(jié)果見圖5。在添加大豆油或亞麻籽油的情況下,單位菌體番茄紅素產(chǎn)量較其它試驗(yàn)組高,但亞麻籽試驗(yàn)組的生物量明顯低于大豆油試驗(yàn)組。因此,綜合考慮單位菌體番茄紅素產(chǎn)量和生物量,選擇大豆油作為輔助碳源進(jìn)行后續(xù)試驗(yàn)。

        圖5 不同植物油對(duì)番茄紅素發(fā)酵的影響Fig.5 Effect of different plant oils on lycopene fermentation

        2.4 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型的建立與檢驗(yàn)

        根據(jù)碳源、氮源、植物油種類的選擇試驗(yàn)結(jié)果,本試驗(yàn)選取玉米粉、玉米漿干粉、大豆油、磷酸二氫鉀、硫酸鎂作為輸入變量,變量的取值范圍如表1所示。采用3層BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行建模,輸入層傳遞函數(shù)為tansig,輸出層傳遞函數(shù)為purelin,訓(xùn)練函數(shù)為traingdx。由于確定了輸入層節(jié)點(diǎn)數(shù)、輸出層節(jié)點(diǎn)數(shù)、傳遞函數(shù)和層數(shù)等參數(shù),所以隱層的節(jié)點(diǎn)數(shù)將在很大程度上決定網(wǎng)絡(luò)性能。為了獲得更好的網(wǎng)絡(luò)性能,依次選擇1~20個(gè)隱層節(jié)點(diǎn)數(shù),經(jīng)過2 000次訓(xùn)練后,得到相應(yīng)的誤差平方和,結(jié)果如圖6所示。當(dāng)隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)為12和17時(shí),誤差平方和較小,選取這兩個(gè)節(jié)點(diǎn)數(shù)做進(jìn)一步訓(xùn)練,結(jié)果表明,隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)為12時(shí)誤差平方和最小。因此,選擇12個(gè)隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)對(duì)BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行2萬次的訓(xùn)練,訓(xùn)練目標(biāo)為均方誤差達(dá)到10-5,學(xué)習(xí)步長為0.05。網(wǎng)絡(luò)經(jīng)過19 848次迭代后均方誤差達(dá)到目標(biāo)值,網(wǎng)絡(luò)性能達(dá)到穩(wěn)定,訓(xùn)練曲線如圖7所示。

        圖6 不同隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)下的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的誤差平方和Fig.6 Sum squared error of BP neural network in different hidden layer nodes

        圖7 BP網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練曲線Fig.7 Training curve of BP network

        為了進(jìn)一步確定網(wǎng)絡(luò)的模擬性能和泛化能力,將檢驗(yàn)樣本的自變量輸入模型,經(jīng)過模擬仿真后得到預(yù)測值,比較預(yù)測值與實(shí)際值的差別,結(jié)果如圖8所示。

        圖8 檢驗(yàn)樣本預(yù)測產(chǎn)量與實(shí)際產(chǎn)量比較Fig.8 Comparison of simulation and actual production of test sample

        從誤差曲線可以看出,預(yù)測值與實(shí)際值之間的誤差非常小,正負(fù)誤差均在4%范圍內(nèi),二者的吻合度非常高。因此,所建立的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型穩(wěn)定且泛化能力較強(qiáng),可用于估算培養(yǎng)基成分不同含量下番茄紅素產(chǎn)量。

        2.5 利用遺傳算法優(yōu)化培養(yǎng)基組成

        在BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建模成功后,利用BP網(wǎng)絡(luò)捕獲的輸入與輸出之間的映射關(guān)系,作為遺傳算法的適應(yīng)度函數(shù)。再根據(jù)訓(xùn)練數(shù)據(jù)樣本確定5種培養(yǎng)基組分的變化范圍(搜索空間),在搜索空間內(nèi)隨機(jī)選擇20種組合作為初始群里,經(jīng)過不斷的選擇、交叉、變異操作,直到滿足終止條件(見圖 9(a))。最終,當(dāng)玉米粉、玉米漿干粉、大豆油、磷酸二氫鉀、硫酸鎂的含量分別為 41.2、8.93、26.5、1.39、0.46 g/L 時(shí), 獲得番茄紅素產(chǎn)量最大預(yù)測值1.27 g/L(見圖9(b))。與初始培養(yǎng)基相比,變化較大的為玉米粉和大豆油的質(zhì)量濃度,玉米粉的質(zhì)量濃度從初始培養(yǎng)基的19 g/L增加到優(yōu)化后的41.2 g/L,大豆油的質(zhì)量濃度從初始培養(yǎng)基的80 g/L減少到優(yōu)化后的26.5 g/L。二者均作為碳源,其中玉米粉是較易利用的碳源,在發(fā)酵過程前期,微生物將優(yōu)先利用玉米粉快速生長,在發(fā)酵中后期,隨著玉米粉的逐漸耗盡,微生物開始大量利用大豆油作為碳源維持生命活動(dòng)。大豆油的添加雖然可以延長發(fā)酵周期,促進(jìn)產(chǎn)物形成,但是過量的大豆油也會(huì)影響溶氧、pH等。為了驗(yàn)證預(yù)測結(jié)果的可靠性,以此組合作為培養(yǎng)基的配方,做3組重復(fù)試驗(yàn),測定番茄紅素的實(shí)際產(chǎn)量。結(jié)果表明,在此條件下,番茄紅素的單位菌體番茄紅素質(zhì)量濃度和生物量分別為28.1 mg/g和44.4 g/L,體積產(chǎn)量為1.25±0.02 g/L,與預(yù)測值的相對(duì)誤差不超過5%,較優(yōu)化前(0.95±0.02 g/L)提高了 31.6%。因此,BP 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型可以很好的模擬發(fā)酵培養(yǎng)基各組分含量與番茄紅素產(chǎn)量的關(guān)系,與遺傳算法相結(jié)合,可以快速得到培養(yǎng)基的最優(yōu)組成。

        圖9 遺傳算法尋優(yōu)軌跡Fig.9 Evolution of generations for lycopene production process optimization

        3 討論

        在碳源的選擇中,玉米粉固形物含量高,有利于絲狀真菌的附著和蔓延,因此生物量較大。而其他可溶性碳源由于固形物含量低,菌絲體容易結(jié)團(tuán),嚴(yán)重影響傳質(zhì)和攝氧,從而影響菌絲體的生長和番茄紅素的合成。此外,玉米粉不僅含有豐富的碳水化合物,還含有多種生長因子和微量元素,更有利于番茄紅素的合成。在氮源的比較中,無機(jī)氮源質(zhì)量穩(wěn)定,但成分單一,缺乏營養(yǎng)物質(zhì),作為唯一氮源效果往往不好。在有機(jī)氮源中,玉米漿干粉不僅氨基酸含量豐富,還含有多種微量元素、生物素等,而且較玉米漿成分更加穩(wěn)定,有利于菌體的生長和番茄紅素的合成。當(dāng)快速利用碳源消耗殆盡時(shí),植物油可為微生物的生長提供碳骨架和能量來源,延長發(fā)酵周期。在番茄紅素的發(fā)酵生產(chǎn)過程中,植物油的分解產(chǎn)物乙酰輔酶A不僅可進(jìn)入三羧酸循環(huán),為細(xì)胞生長提供能量,還可作為脂肪和番茄紅素合成的共同前體物質(zhì)。因此,植物油的添加不僅可明顯提高生物量,還可以顯著促進(jìn)番茄紅素的合成。

        單因素試驗(yàn)忽略了不同培養(yǎng)基成分之間的交互作用,可能會(huì)錯(cuò)過最優(yōu)條件,而且試驗(yàn)次數(shù)很多;響應(yīng)面優(yōu)化法通常用的模型是二次多項(xiàng)式,在實(shí)際應(yīng)用中,只能用到2~3個(gè)水平;正交設(shè)計(jì)和均勻設(shè)計(jì)都會(huì)受到因素的限制。遺傳算法已被證實(shí)非常適用于多因素多水平、非線性優(yōu)化的問題,但遺傳算法存在容易丟失歷史數(shù)據(jù)的問題。人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能很好的捕獲和訓(xùn)練數(shù)據(jù),它允許用戶直接用一種穩(wěn)定的形式來訪問歷史數(shù)據(jù),這正好彌補(bǔ)了遺傳算法的缺點(diǎn)。因此,人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可以幫助研究者處理歷史數(shù)據(jù),獲得培養(yǎng)基組分與產(chǎn)物之間的一種隱函數(shù)關(guān)系,遺傳算法可利用這種函數(shù)關(guān)系作為適應(yīng)度函數(shù),從而快速搜索得到最優(yōu)解。利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和遺傳算法相結(jié)合優(yōu)化培養(yǎng)基組成的報(bào)道很多,Nagata等[16]利用人工神經(jīng)網(wǎng)路和遺傳算法優(yōu)化海因酶發(fā)酵培養(yǎng)基組成,獲得的最大產(chǎn)量比多項(xiàng)式優(yōu)化結(jié)果高出14%;Weuster-botz等[17]利用遺傳算法優(yōu)化甲酸脫氫酶發(fā)酵培養(yǎng)基,甲酸脫氫酶的產(chǎn)量提高了50%;Sivapathasekaran等[18]采用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和遺傳算法相結(jié)合優(yōu)化生物表面活性劑的發(fā)酵培養(yǎng)基,其產(chǎn)量提高了約70%。

        4 結(jié) 語

        本研究采用拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)為5-12-1的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建立培養(yǎng)基各組分含量與番茄紅素產(chǎn)量的網(wǎng)絡(luò)模型,很好的模擬了它們之間關(guān)系,與遺傳算法相結(jié)合,快速得到了培養(yǎng)基的最優(yōu)組成,經(jīng)驗(yàn)證,番茄紅素產(chǎn)量較優(yōu)化前提高了31.6%。因此,BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)合遺傳算法是番茄紅素乃至其它代謝產(chǎn)物發(fā)酵培養(yǎng)基優(yōu)化的有力工具。

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