王文珍,王慧慧,陳美雯,徐如飛,蔣培蓉,蒲首丞,鞏菊芳,孫梅好
(浙江師范大學(xué)化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,浙江金華321004)
丙酮酸激酶(EC2.7.1.40,PK)催化磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)對核苷二磷酸(NDP)的磷酸化產(chǎn)生核苷三磷酸(NTP)[1-2]和丙酮酸,二價陽離子和核苷酸形成的復(fù)合體是胞內(nèi)蛋白的配體[3-5]。不同物種來源的PK,其反應(yīng)速率達到最大反應(yīng)速率1/2時的底物濃度Km(ADP)具有較大差異。如大腸桿菌PKII和蓖麻 PK的 Km(ADP)約為 50 mol/L[6-7],而人和褐家鼠PK的Km(ADP)均大于 1 mmol/L[8-9]。PK的最適pH大多為中性,而部分植物和剛地弓形蟲的最適pH 在 8.0 左右[6,10-11]。乳酸脫氫酶(EC1.1.1.27,LDH)催化NADH還原丙酮酸生成乳酸和NAD+及其逆反應(yīng)[12]。Km(NADH),Km(pyruvate),Km(NAD),Km(lactate)在不同的物種中具有很大差別,目前報道最大的Km(lactate)是美洲螯龍蝦LDH的1100mmol/L[13],而來自惡性瘧原蟲的 Km(lactate)僅為 47 mol/L[14]。LDH的最適pH大多為中性,來自牛[15]和鉤蟲貪銅菌[16]的LDH具有目前報道的最高且最適pH值(9.8)。PK和LDH是生物體內(nèi)糖酵解過程中重要的氧化還原酶[17],廣泛存在于動植物組織和各種微生物細(xì)胞內(nèi)。通過測定NADH光吸收的變化,可以間接反映丙酮酸濃度的變化,從而可計算出PK以及LDH的酶活[12]。大多數(shù)嗜熱酶在高溫條件下仍然保持很高的催化活性,所以,嗜熱酶是目前研究和開發(fā)最多的酶之一。嗜熱菌是當(dāng)前獲得嗜熱酶最直接和可靠的來源。在浙江師范大學(xué)化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能實驗室的前期工作中,發(fā)現(xiàn)蒼白空氣芽孢桿菌(Aeribacillus pallidus JH-7)為中度嗜熱菌(最適生長溫度為50℃),可分泌抑菌活性物質(zhì)。
本研究克隆并表達嗜熱芽孢桿菌丙酮酸激酶(ApPK)和乳酸脫氫酶(ApLDH),并測定其動力學(xué)常數(shù),分析其作為工具酶的可行性。
嗜熱蒼白空氣芽孢桿菌(Aeribacillus pallidus JH-7),菌株 E.coli DH5α 及 BL21(DE3),原核表達載體pET24a,克隆載體pMD19-Tsimple等,均保存于浙江師范大學(xué)化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能實驗室-80℃冰箱。
還原型輔酶 I(NADH)、氧化型輔酶 I(NAD+)、異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)、苯甲基磺酰氟(PMSF)、三磷酸腺苷(ATP)、鳥苷二磷酸(GDP)、脲苷二磷酸(UDP)、胞苷二磷酸(CDP)、腺苷二磷酸(ADP)、磷酸烯醇式丙酮酸、鎳柱親和層析樹脂、溶菌酶、二硫蘇糖醇、丙酮酸、L-乳酸鈉和抑肽素均購自于合肥海伯萊生物技術(shù)有限公司;兔肌肉丙酮酸激酶(OcPK)、兔肌肉乳酸脫氫酶(O-cLDH)購自于羅氏公司;DNA聚合酶,dNTP Mixture,BamH I,Sal I,EcoR I,Not I,Xho I等限制性內(nèi)切酶購自于杭州皓豐生物技術(shù)有限公司;細(xì)菌基因組提取試劑盒(CW0552S)購自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司;其他常規(guī)生化試劑為國產(chǎn)分析純。
1.3.1 嗜熱菌pk和ldh基因克隆 參照細(xì)菌基因組提取試劑盒的使用說明,提取ApJH-7基因組,并保存于-20℃以及參考貢莎莎等[18]的原核表達載體構(gòu)建。以所提基因組為模板,利用PCR擴增Appk(pkF:ACGCGTCGACCCATGCGAAAAACGAA;pkR:ATAAGAATGCGGCCGCCTCGAGTAGAACG)和 Apldh(ldhF:CCACGCGGATCCGAATTCATGAAT AAAGA;ldhR:ACGCGTCGACAATGACAGATTTCA TCGTAT)。將純化的 PCR產(chǎn)物連接至pMD19-T simple載體,通過熱激法轉(zhuǎn)入 E.coli,DH5α。提取經(jīng)測序驗證含Appk和Apldh的質(zhì)粒載體,雙酶切相應(yīng) Appk(Sal I和 Not I)和 Apldh(BamH I和 Sal I)載體,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳回收、純化后分別連接到表達載體pET24a構(gòu)建重組表達載體PK-pET24a,LDH-pET24a。分別轉(zhuǎn)化 E.coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,獲得ApPK和ApLDH的表達菌株。
1.3.2 ApPK和ApLDH的表達、純化 參照李鴻艷等[7]和賀飛燕等[19]的方法,將表達菌株在LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)至OD600=0.6,加0.5 mmol/L IPTG誘導(dǎo)表達(37℃,220 r/min,3 h);離心收集菌體進行裂解、破碎、高速離心后收集上清液。經(jīng)鎳柱咪唑梯度親和層析,再經(jīng)SDS-PAGE鑒定含有目的蛋白的組分,合并含高純度目的蛋白組分,進行透析(50 mmol/L Hepes,pH 值 8.0)。所得目的蛋白經(jīng) Bradford 法[20]測定蛋白濃度后,于-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.3 ApLDH活性測定 利用分光光度法(瓦里安UV4000,安捷倫)測定LDH酶活[12]?;钚詼y定原理為LDH催化NADH的氧化或者NADH的生成,根據(jù)NADH在339 nm光吸收的變化可計算出LDH的活性。為分析ApLDH的最適pH,測定條件為:0.1 mmol/L NADH,0.065 μmol/L ApLDH,50 mmol/L磷酸鹽緩沖液(pH 值分別為 5.2,5.4,5.6,5.8,6.2,6.4,6.6),用 0.9 mmol/L丙酮酸起始反應(yīng),反應(yīng)溫度為35℃。為分析ApLDH的溫度穩(wěn)定性,ApLDH經(jīng)不同溫度(30,40,50,52,54,55,56,58,60 ℃)處理45 min后,冷卻至室溫,進行活性測定。條件為:0.1 mmol/L NADH,0.065 μmol/L ApLDH,50 mmol/L磷酸鹽緩沖液(pH=6.0),反應(yīng)溫度為35℃。為分析其最適反應(yīng)溫度,利用0.1mmol/LNADH,0.065 μmol/L ApLDH和50 mmol/L磷酸鹽緩沖液(pH=6.0),不同的反應(yīng)溫度(30,32,34,36,38,40 ℃),進行ApLDH酶活測定。為測定ApLDH的動力學(xué)常數(shù),固定一個底物濃度為10倍Km,改變另一個底物濃度,在50 mmol/L磷酸鹽緩沖液(pH=6.0)和35℃條件下測定其反應(yīng)活性,所得數(shù)據(jù)利用米氏方程v=Vmax×[s]/(Km+[s])(其中,Vmax表示最大反應(yīng)速率;[s]表示底物濃度)進行擬合,得Vmax及Km。
1.3.4 ApPK活性測定 利用分光光度法和OcLDH為偶聯(lián)酶測定ApPK酶活[12]。PK活性測定原理為PK催化NDP的磷酸化生成NTP和丙酮酸,產(chǎn)物之一丙酮酸可被LDH還原為乳酸,同時NADH被氧化為NAD+。根據(jù)在339 nm光吸收變化可計算出PK活性產(chǎn)物之一丙酮酸的生成速度。為分析其最適pH值,活性測定條件為:50 mmol/LMgCl2,0.25 mmol/L NADH,6.5 mmol/LADP,0.047 3 μmol/L PK,20 U/mL OcLDH,50 mmol/L磷酸緩沖液(pH值分別為5,6,7,8,9),利用 1.5 mmol/LPEP 起始反應(yīng),反應(yīng)溫度為40℃。為分析其溫度穩(wěn)定性,ApPK經(jīng)不同溫度(30,40,50,55,60,65,70 ℃)處理 45 min,冷卻至室溫,進行活性測定。測定條件為:50 mmol/L MgCl2,0.25 mmol/L NADH,6.5 mmol/L ADP,0.047 3 μmol/L PK,20 U/mLOcLDH,50 mmol/L磷酸緩沖液(pH=8.0),利用1.5 mmol/L PEP起始反應(yīng),反應(yīng)溫度為40℃。為分析其最適反應(yīng)溫度,利用50mmol/LMgCl2,0.25 mmol/L NADH,6.5 mmol/L ADP,0.047 3 μmol/L PK,20 U/mL OcLDH,1.5 mmol/L PEP,50 mmol/L 磷酸緩沖液(pH=8.0),不同的反應(yīng)溫度(40,45,50,55,60℃),進行ApPK酶活測定。為測定ApPK對NDP的磷酸化,利用最適的pH,溫度為45℃,其他條件為測定最適pH時的條件,改變NDP濃度測定其酶活,所得數(shù)據(jù)利用米氏方程擬合,得Vmax及Km。
PCR法擴增Appk和Apldh,其產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測,可見擴增產(chǎn)物大小與預(yù)期結(jié)果相符(圖1,2)。經(jīng)酶切驗證及測序驗證表明載體構(gòu)建成功。經(jīng)表達菌株BL21(DE3)的誘導(dǎo)表達、鎳柱梯度親和層析,純化分別獲得分子量為65 ku的ApPK(圖3)和35 ku的 ApLDH(圖 4)。
pH對酶的活性有較大影響。利用不同pH緩沖液分析ApPK和ApLDH活性,結(jié)果表明,ApPK的最適pH值為8.0,高于8.0會導(dǎo)致活性急劇下降,且pH值低于6.0時酶活性降至最大活性的1%左右;ApLDH的最適pH值為5.8,且酸性條件更加容易導(dǎo)致其活性下降(圖5)。
溫度對酶的活性也有較大影響。利用不同反應(yīng)溫度分析ApPK和ApLDH活性,結(jié)果表明,其活性受溫度影響呈典型的鐘型曲線(圖6)。ApPK和ApLDH的最適溫度分別為 50,35℃,ApPK在ApLDH的最適溫度處的活性為最大活性的60%~70%,而ApLDH在ApPK最適溫度處的活性為最大活性的62%,相對來說,其活性還是很高的。
利用 2mmol/L的 Mn2+或 Mg2+,20mmol/L的 Li+,200mmol/L的K+或Na+的陽離子(一價陽離子的測定體系中Mg2+濃度為34mmol/L),分析了其對ApPK和ApLDH活性的影響。結(jié)果表明,Mn2+,Mg2+對ApLDH的活性影響較小,而極大的促進了ApPK的活性,且Mg2+促進作用強于Mn2+(除特別說明,本研究中ApPK活性測定體系均含有Mg2+)。Na+,K+和Li+對ApPK的活性具有抑制作用,Li+抑制效應(yīng)最大,K+抑制效應(yīng)最小。Na+抑制ApLDH的62%活性,Li+,K+抑制其 50%左右的活性(表 1)。
表1 陽離子對ApPK和ApLDH活性的影響
LDH在胞內(nèi)催化丙酮酸還原為乳酸。改變底物濃度測定其活性,經(jīng)米氏方程擬合,發(fā)現(xiàn)ApLDH的Km(lactate)高達26.2 mmol/L,而其最適底物為NADH(Km(NADH)為 34.3 μmol/L),最大反應(yīng)速度kcat為12.7 s-1(表2)。
表2 ApLDH的動力學(xué)常數(shù)
表3 ApPK對NDP磷酸化的動力學(xué)常數(shù)
PK在胞內(nèi)催化NDP磷酸化生成相應(yīng)的NTP。改變NDP濃度,測定ApPK動力學(xué)常數(shù),結(jié)果發(fā)現(xiàn),其最適底物為GDP,其Km為1.6 mmol/L。催化效率最高的為底物ADP(Kcat/Km為5×104mol/(L·s)),最低為CDP(4.0×103mol/(L·s))(表3),不同NDP的催化效率Kcat/Km比較結(jié)果為ADP>GDP>UDP>CDP,且均低于大腸桿菌和兔肌肉PK(表3)。
ApLDH經(jīng)30~50℃處理其活性穩(wěn)定,在50~52℃時酶活急劇下降,60℃時基本已失活。ApPK經(jīng)30~50℃處理其活性穩(wěn)定,基本不受溫度影響,超過58℃后,其活性急劇下降(圖7)。
偶聯(lián)酶法作為測定酶活的方法被廣泛運用。而丙酮酸激酶與乳酸脫氫酶通常作為偶聯(lián)酶,在20~37 ℃測定 NDP 的產(chǎn)生[2,3,7,12]。本研究從嗜熱菌中克隆表達ApPK和ApLDH,可以在高溫下應(yīng)用于NDP的生成酶的活性分析,以期分離鑒定能夠承受更高溫度的嗜熱酶,并分析酶的活性。
本研究成功表達、純化了ApPK和ApLDH,并分析了不同pH、溫度、陽離子對其活性的影響。結(jié)果表明,ApPK最適pH值為8.0,與植物和剛地弓形蟲PK最適pH類似;ApLDH最適pH值為5.8,與嗜熱脂肪土芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌和植物乳桿菌LDH最適pH類似[22-23]。2 mmol/L二價陽離子對ApLDH活性有輕微的抑制作用,而二價陽離子是ApPK活性必需的,此結(jié)果也說明核苷酸與二價陽離子形成的復(fù)合物是激酶的底物。高于60℃的溫度對ApPK和ApLDH具有強烈滅活作用。
本研究表明,ApPK和ApLDH活性的最適溫度分別為50,35℃,有意思的是,Aeribacillus pallidus JH-7的最適生長溫度為50℃,此溫度雖然不是ApLDH的最適溫度,但是活性還是自身最大活性的62%,kcat為16.4 s-1,因此,確定在此溫度下可以作為偶聯(lián)酶。