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        GRIA1、GRM3、TCF4基因單核苷酸多態(tài)性與精神分裂癥的關(guān)聯(lián)研究

        2019-03-16 11:22:24程宇琪姜紅燕羅雄劍陳嫻瑜沈宗霖許秀峰
        四川精神衛(wèi)生 2019年6期
        關(guān)鍵詞:谷氨酸等位基因多態(tài)性

        楊 靜,程宇琪,姜紅燕,羅雄劍,陳嫻瑜,沈宗霖,周 聰,許秀峰*

        (1.昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院,云南 昆明650000;2.中國科學(xué)院大學(xué)昆明動(dòng)物所,云南 昆明650000*通信作者:許秀峰,E-mail:xfxu2004@sina.com)

        近年來,家系、雙胞胎和寄養(yǎng)研究表明,精神分裂癥具有很強(qiáng)的遺傳傾向,其遺傳度高達(dá)80%~85%[1]。目前精神分裂癥病因?qū)W研究尚未得出一致結(jié)論,神經(jīng)發(fā)育障礙是最主要的機(jī)制,影響因素包括遺傳、表觀遺傳以及后天環(huán)境等。遺傳流行病學(xué)研究顯示,遺傳因素對(duì)精神分裂癥的發(fā)生影響較大[2-3]。隨著新型遺傳標(biāo)記的出現(xiàn),病例-對(duì)照相關(guān)分析被大量應(yīng)用于甄別精神分裂癥的易感基因,主要利用單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(Single nucleotide polymorphism,SNP)作為遺傳標(biāo)記,其分辨率可以達(dá)到一個(gè)堿基,可以進(jìn)行較為精準(zhǔn)的易感基因定位。近年來,隨著分子遺傳學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,疾病的易感基因發(fā)現(xiàn)與定位有了可能,大量的精神分裂癥全基因組關(guān)聯(lián)分析研究已經(jīng)甄別到了許多達(dá)到基因組范圍內(nèi)顯著相關(guān)的位點(diǎn)和基因,包括MHC、MIR137、TCF4、CACNA1C、GRM3、GRIA1、ZNF804A、VRK2、ITIH3/4、NDST3、NOTCH4和BCL9等[4-9]。本研究結(jié)合近年來精神分裂癥相關(guān)熱點(diǎn)基因陽性結(jié)果,選擇代謝型谷氨酸受體3基因(GRM3)、AMPA受 體1基因(GRIA1)和轉(zhuǎn)錄因子4基因(TCF4)部分多態(tài)性位點(diǎn),從分子水平上探索遺傳學(xué)因素與精神分裂癥的關(guān)系,為精神分裂癥的遺傳學(xué)研究提供參考。

        1 對(duì)象與方法

        1.1 對(duì)象

        于2011年9月-2013年12月在昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院精神科選取精神分裂癥患者為病例組。入組標(biāo)準(zhǔn):①符合《精神障礙診斷與統(tǒng)計(jì)手冊(cè)(第4版)》(Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders,fourth edition,DSM-IV)精神分裂癥診斷標(biāo)準(zhǔn),由兩名精神科副主任醫(yī)師職稱及以上的醫(yī)師做出一致診斷;②年齡12~48歲;③患者本人或其法定監(jiān)護(hù)人簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①精神發(fā)育遲滯;②有腦器質(zhì)性疾病、頭部外傷史、癲癇發(fā)作史;③當(dāng)前或既往有物質(zhì)濫用史;④既往患有嚴(yán)重軀體疾病,如神經(jīng)、內(nèi)分泌、心血管、肝、腎、血液系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)疾病等。符合入組標(biāo)準(zhǔn)且不符合排除標(biāo)準(zhǔn)共663例,其中男性296例,女性367例,年齡(30.9±11.2)歲。于2016年9月-11月在昆明市第一人民醫(yī)院體檢中心選取健康人為對(duì)照組。入組標(biāo)準(zhǔn):①當(dāng)前或既往無精神障礙史;②年齡12~48歲;③均簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①精神發(fā)育遲滯;②患有腦器質(zhì)性疾病、有頭部外傷史、癲癇發(fā)作史;③當(dāng)前或既往有物質(zhì)濫用史;④既往患有嚴(yán)重軀體疾病,如神經(jīng)、內(nèi)分泌、心血管、肝、腎、血液系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)疾病等;⑤精神病家族史陽性者。符合入組標(biāo)準(zhǔn)且不符合排除標(biāo)準(zhǔn)共690例。其中男性414例,女性276例,年齡(35.9±12.7)歲。本研究通過昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        采用酚/氯仿法提取基因組DNA,DNA樣本成品放置于-80℃冰箱中備用。利用primer 5.0進(jìn)行PCR引物設(shè)計(jì),采用SNaPshot基因分型技術(shù)對(duì)12個(gè)SNPs進(jìn)行基因型檢測(cè),12個(gè)SNPs的選擇主要基于以下標(biāo)準(zhǔn):①主要選擇以前研究中最顯著的位點(diǎn),這些位點(diǎn)很可能包含致病位點(diǎn)或與致病突變緊密相連,如rs9636107和rs12704290與精神分裂癥相關(guān);②考慮所選SNP是否有潛在的功能,如rs1428920和rs2926835位于GRIA1的內(nèi)含子中,可能會(huì)影響GRIA1的表達(dá),rs274622和rs12966547位于GRM3和TCF4啟動(dòng)子附近,因而也有可能會(huì)影響GRM3和TCF4表達(dá);③通過Ensemble數(shù)據(jù)庫(http://www.ensemble.org)確定上述位點(diǎn)在中國漢族人群中的最小等位基因頻率(Minor Allele Frequency,MAF)>0.05。

        1.3 統(tǒng)計(jì)方法

        運(yùn)用Plink 1.07對(duì)所選SNP進(jìn)行哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE)及相關(guān)分析;運(yùn)用Haploview 4.2對(duì)同一基因的多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行連鎖分析;單倍型分析使用SHEsis在線分析軟件(http://analysis.bio-x.cn);運(yùn)用在線軟件(http://www.genemania.org/)[10]分析GRIA1、GRM3、TCF4之間是否存在功能聯(lián)系;運(yùn)用Quanto 1.2.4對(duì)樣本的統(tǒng)計(jì)效能進(jìn)行分析。

        2 結(jié) 果

        2.1 兩組等位基因頻率

        病例組GRM3多態(tài)性位點(diǎn)rs6465084的A等位基因頻率與對(duì)照組相比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.027)。見表1。

        表1 兩組等位基因頻率

        續(xù)表1:

        2.2 等位基因頻率和性別特異性相關(guān)分析

        性別特異性相關(guān)分析結(jié)果表明,多態(tài)性位點(diǎn)rs6465084在男性中有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.02)。見表2。

        表2 等位基因頻率和性別特異性相關(guān)分析

        續(xù)表2:

        續(xù)表2:

        2.3 連鎖不平衡分析結(jié)果

        連鎖不平衡分析顯示,多態(tài)性位點(diǎn)rs6465084和rs12704290高度連鎖不平衡(D’=0.88)。見圖1。

        2.4 GRM3基因相關(guān)位點(diǎn)的單倍型頻率

        本研究對(duì)兩位點(diǎn)構(gòu)建了3種單倍型,其中A-G(P=0.004,OR=1.357)與G-G(P=0.018,OR=0.754)在病例組與對(duì)照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。見表3。

        圖1 GRM3基因上多態(tài)性位點(diǎn)間連鎖不平衡分析結(jié)果

        表3 GRM3基因相關(guān)位點(diǎn)的單倍型頻率

        3 討 論

        在本研究中,除了rs2958182位點(diǎn)在對(duì)照中不符合HWE,其余所有位點(diǎn)在病例對(duì)照中均符合HWE。本研究通過測(cè)序證實(shí)rs2958182位點(diǎn)基因分型的正確性,因此排除了其不符合HWE并不是由于基因分型誤差造成的。與對(duì)照組相比,GRM3 rs6465084位點(diǎn)在精神分裂癥患者中有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.027),Chang等[11]對(duì)中國漢族人群(包括1115例精神分裂癥患者和2289例健康對(duì)照者)的研究顯示,rs6465084位點(diǎn)與精神分裂癥相關(guān),與本研究結(jié)果一致。由于rs6465084位點(diǎn)位于GRM3內(nèi)含子上,該位點(diǎn)的變異不會(huì)造成谷氨酸受體的結(jié)構(gòu)和功能改變,但內(nèi)含子的變異可能會(huì)調(diào)控基因表達(dá),因此該位點(diǎn)的變異可能導(dǎo)致GRM3轉(zhuǎn)錄時(shí)的改變,使得GRM3表達(dá)異常,谷氨酸受體與游離谷氨酸結(jié)合力下降,降低腦內(nèi)谷氨酸水平,增加精神分裂癥的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。

        GRM3存在于人類染色體7q21.1,長度約為220 kb,主要與學(xué)習(xí)記憶中的突觸傳遞、可塑性改變、神經(jīng)遞質(zhì)的調(diào)節(jié)等生理過程以及腦缺血、神經(jīng)元變性疾病等病理過程密切相關(guān)。GRM3主要存在于大腦背外側(cè)前額葉皮層(PFC)的椎體細(xì)胞層內(nèi),N-乙酰天冬氨酸(N-acetylaspartat,NAA)是GRM3的激動(dòng)劑,正常情況下,NAA通過抑制突觸后cAMP-K+通道來增強(qiáng)突觸的連接性,從而增加細(xì)胞的放電頻率,維持正常的工作記憶,因此,PFC受損會(huì)影響cAMP信號(hào)通路的傳導(dǎo),導(dǎo)致細(xì)胞放電頻率降低,進(jìn)而影響工作記憶,產(chǎn)生認(rèn)知功能缺陷[12]。Egan等[13]研究表明,rs6465084位點(diǎn)與精神分裂癥相關(guān)(P=0.02),A/A基因型個(gè)體右背外側(cè)前額葉皮層NAA水平和語言流暢性均低于G等位基因攜帶者,A等位基因攜帶者的學(xué)習(xí)、記憶能力較低。A/A基因型個(gè)體的前額葉皮層的興奮性氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白2(excitatory amino acid transporter 2,EAAT2)的mRNA水平較低。膠質(zhì)谷氨酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的主要功能是清除突觸間隙的谷氨酸,神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞中的GRM3通過增加EAAT2受體的表達(dá),從而增加谷氨酸的攝取,使細(xì)胞內(nèi)外的谷氨酸水平達(dá)到穩(wěn)態(tài)[14-15]。Kerdsan等[16]研究表明,rs6465084位點(diǎn)的變異與EAAT2的水平無關(guān)。Xia等[17]的研究與Egan等的研究結(jié)果一致,發(fā)現(xiàn)rs6465084位點(diǎn)A/A基因型個(gè)體的右背外側(cè)前額葉皮層NAA水平比G等位基因攜帶者的NAA水平低。M?ssner等[18]研究顯示,A/A基因型患者的決策能力以及對(duì)數(shù)字、符號(hào)等的測(cè)試成績更差。以上結(jié)果均證實(shí)rs6465084位點(diǎn)的等位基因A是導(dǎo)致精神分裂癥發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)等位基因,其機(jī)制可能是通過影響GRM3的轉(zhuǎn)錄與翻譯過程從而降低大腦背外側(cè)前額葉皮層的EAAT2水平,使得突觸間隙谷氨酸水平升高、細(xì)胞內(nèi)外的谷氨酸水平失衡,導(dǎo)致谷氨酸受體與谷氨酸的結(jié)合率下降,中樞谷氨酸水平下降,從而影響認(rèn)知、學(xué)習(xí)、記憶等過程,產(chǎn)生一系列精神病性癥狀,增加精神分裂癥的易感性。

        本研究亦發(fā)現(xiàn)GRM3 rs6465084位點(diǎn)對(duì)精神分裂癥的發(fā)病機(jī)制與性別相關(guān),男性更易發(fā)病。有研究報(bào)道COMT對(duì)精神分裂癥的影響與性別相關(guān),且Reelin rs7341475位點(diǎn)的突變?cè)谂灾信c精神分裂癥顯著相關(guān)[19-20],該結(jié)果與本研究結(jié)果相反。動(dòng)物學(xué)研究顯示,NRG1是精神分裂癥的風(fēng)險(xiǎn)因素,可以使小鼠內(nèi)表型發(fā)生突變,并且與性別相關(guān),雄性精神分裂癥模型小鼠主要表現(xiàn)為記憶和情緒的缺陷,而雌性精神分裂癥模型小鼠并無任何缺陷[21]。

        本研究中,多態(tài)性位點(diǎn)rs6465084與rs12704290呈高度連鎖不平衡,但rs12704290位點(diǎn)與精神分裂癥無關(guān)聯(lián),rs12704290位點(diǎn)的OR值為1.265,其G等位基因攜帶者仍有一定的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),符合兩位點(diǎn)連鎖不平衡的遺傳特征。

        本研究局限性在于:①由于地域、種族的差異以及精神分裂癥的遺傳異質(zhì)性較高,本研究中的其余位點(diǎn)尚未能在云南地區(qū)人群中重復(fù)驗(yàn)證;②本研究樣本量較小,以致造成諸多局限,未來有必要在更大樣本中驗(yàn)證這種相關(guān)性并了解其分子機(jī)制。

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