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        DNA-Lipid探針用于細(xì)胞膜外pH值的原位成像

        2019-03-08 02:38:00周文玉湯娉婷楊榮華2
        分析測試學(xué)報 2019年2期
        關(guān)鍵詞:寡核苷酸細(xì)胞膜緩沖液

        周文玉,湯娉婷,楊榮華2,,鄭 晶*

        (1.邵陽市環(huán)境保護(hù)監(jiān)測站,湖南 邵陽 422000;2.長沙理工大學(xué) 化學(xué)與生物工程學(xué)院,湖南 長沙 410076;3.湖南大學(xué) 化學(xué)化工學(xué)院,湖南 長沙 410012)

        細(xì)胞外pH值(Extracellular pH,pHe)在各種人體生理過程和化學(xué)反應(yīng)中扮演著重要角色[1-2],因此,對pHe進(jìn)行檢測具有重要的生理與病理意義,發(fā)展一種能夠在缺氧環(huán)境下對細(xì)胞外pH值進(jìn)行原位成像分析的方法尤為重要。目前缺氧環(huán)境下細(xì)胞外微環(huán)境pH值的檢測鮮有報道。近年來,細(xì)胞膜表面固定化探針在再生醫(yī)學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)方面引起了人們的極大關(guān)注,但是這些固定化探針的構(gòu)建經(jīng)常涉及繁瑣的固定修飾過程[3]、復(fù)雜的基因調(diào)控[4],或需要特定的親和位點(diǎn)[5],極大地限制了其實(shí)際應(yīng)用范圍和有效性?;诖?,Tan課題組第一次合成了二?;|(zhì)體-DNA共軛物(DNA-lipid)[6-7]。二酰基脂質(zhì)體(Lipid)是由兩條分別含有18個碳的疏水烷烴組成的磷脂鏈,研究表明該共軛物可以二酰基脂質(zhì)體為“尾巴”與細(xì)胞膜的磷脂雙分子層之間發(fā)生強(qiáng)烈的疏水作用從而自發(fā)地組裝到細(xì)胞膜表面[8-9]。此外,該共軛物還具有簡單易行、生物相容性好以及細(xì)胞通用性等優(yōu)點(diǎn)。i-motif結(jié)構(gòu)是指胞嘧啶寡核苷酸鏈上的C∶C+堿基對在酸性環(huán)境下交替排列及互相嵌入而形成的四聚體結(jié)構(gòu)[10]。

        本文利用lipid可與細(xì)胞膜發(fā)生疏水相互作用,并結(jié)合i-motif結(jié)構(gòu)在酸性環(huán)境下可對pH值產(chǎn)生快速、可逆響應(yīng)的良好性質(zhì)[11-13],將兩端標(biāo)記Cy3和 Cy5的具有i-motif結(jié)構(gòu)的DNA鏈作為一種比例型探針插入細(xì)胞膜表面,實(shí)現(xiàn)了細(xì)胞外pH值的檢測。在常氧環(huán)境中,細(xì)胞膜外pH值處于中性,具有i-motif結(jié)構(gòu)的DNA鏈兩端的熒光基團(tuán)處于分離狀態(tài),Cy3和 Cy5之間不發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)效應(yīng)。缺氧時,由于細(xì)胞內(nèi)的糖酵解產(chǎn)生的大量乳酸改變了pH值的動態(tài)平衡,缺氧細(xì)胞上調(diào)細(xì)胞質(zhì)膜的鈉氫交換蛋白-1(NHE-1)等H+轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白將H+排出細(xì)胞外,造成細(xì)胞外環(huán)境pH值降低。此時酸性的環(huán)境使i-motif結(jié)構(gòu)發(fā)生變化形成四鏈體,序列兩端的兩個熒光基團(tuán)相互靠近,Cy3(熒光供體)和 Cy5(熒光受體)之間發(fā)生強(qiáng)的FRET效應(yīng),可通過測定序列兩端兩種熒光基團(tuán)熒光強(qiáng)度的比值實(shí)現(xiàn)常氧和缺氧環(huán)境中細(xì)胞膜外pH值的原位成像分析。

        1 實(shí)驗部分

        1.1 儀器與試劑

        流式細(xì)胞儀(貝克曼庫爾特有限公司,美國)、激光共聚焦顯微鏡(奧林巴斯,日本)、熒光分光光度計(株式會社日立制作所,日本);實(shí)驗用水為Milli-Q(18.2 MΩ·cm)超純水;所有試劑除特別說明外均為分析純。所用DNA序列見表1。

        表1 所用的DNA序列Table 1 DNA sequences used in this paper

        1.2 溶液的配制

        0.2 mol/L的磷酸(PB)緩沖液:分別配制0.2 mol/L Na2HPO4和0.2 mol/L NaH2PO4母液,高溫滅菌后再將兩者按不同比例混合,并調(diào)至所需pH值。

        0.01 mol/L的磷酸鹽(PBS)緩沖液(pH 7.4):分別稱取0.8 g NaCl,0.02 g KCl,0.362 g Na2HPO4·12H2O,0.024 g KH2PO4溶于80 mL水中,調(diào)節(jié)pH值為7.4,定容至100 mL,搖勻,靜置,高溫滅菌,冷卻至室溫,在4 ℃環(huán)境中保存。

        1.3 探針的制備與表征

        1.3.1探針的制備所用寡核苷酸序列均按照 1.0 μmol的規(guī)格在ABI 3 400 DNA合成儀上合成,合成的序列信息見表1。采用兩步合成法[6]合成lipid,并利用DNA 合成儀將其自動偶聯(lián)到寡核苷酸鏈的5’末端。序列合成后再按照指定程序?qū)ζ溥M(jìn)行脫保護(hù)處理,然后加入冷乙醇(相對DNA 2.5倍體積)和3 mol/L氯化鈉(相對DNA 1/10 體積)進(jìn)行沉淀,離心并收集DNA的沉淀物,再加入0.2 mol/L三乙基銨乙酸鹽溶液將其溶解,以乙腈和0.2 mol/L三乙基銨乙酸鹽溶液作為流動相,利用高效液相色譜儀進(jìn)行分離純化。分別用C4柱(200 mm×4.6 mm)和 C18柱(250 mm×4.6 mm)對常規(guī)寡核苷酸和標(biāo)記了lipid的寡核苷酸進(jìn)行純化。通過紫外-可見分光光度計對純化后的寡核苷酸產(chǎn)物進(jìn)行測量并定量。

        1.3.2細(xì)胞培養(yǎng)及細(xì)胞膜修飾實(shí)驗用人宮頸癌細(xì)胞(HeLa)來源于楊榮華課題組細(xì)胞中心,細(xì)胞實(shí)驗中所涉及的物品均經(jīng)過濾除菌或高壓滅菌處理。

        在DMEM培養(yǎng)基中添加10%經(jīng)熱失活的胎牛血清和 0.5 mg/mL 青霉素-鏈霉素,并以此為細(xì)胞培養(yǎng)液進(jìn)行HeLa細(xì)胞培養(yǎng)。在修飾細(xì)胞膜之前,先用4-羥乙基哌嗪乙磺酸(HEPES)緩沖液(50 mmol/L HEPES,pH 7.3,270 mmol/L 氯化鈉)將細(xì)胞(2.5×105個)沖洗3次,然后加入DNA-lipid探針(1 μmol/L)置于室溫(25 ℃)下孵育30 min。再把細(xì)胞清洗3次以除去未結(jié)合的探針,最后將細(xì)胞重新分散在180 μL HEPES 緩沖液中。

        圖1 DNA-lipid探針用于細(xì)胞外pH值檢測的原理圖

        2 結(jié)果與討論

        2.1 檢測原理

        基于“FRET”效應(yīng)的DNA-lipid探針對缺氧環(huán)境下細(xì)胞膜外pH值的傳感檢測原理如圖1所示。首先在一條具有i-motif結(jié)構(gòu)的DNA鏈兩端分別標(biāo)記Cy3和Cy5,再將這條序列的5’端連接疏水的lipid構(gòu)成核酸探針DNA-lipid。在pH>7.0的環(huán)境下,該探針處于剛性狀態(tài),兩端的熒光基團(tuán)分離,未發(fā)生FRET;在pH<7.0的環(huán)境下,探針形成四聚體結(jié)構(gòu),Cy3(供體)和Cy5(受體)彼此靠近,熒光從供體轉(zhuǎn)移至受體,發(fā)生FRET。利用lipid的性質(zhì)將探針修飾在細(xì)胞膜表面,可以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞膜外pH值的監(jiān)測。常氧環(huán)境下,細(xì)胞外的pH值處于中性,i-motif結(jié)構(gòu)不會發(fā)生彎曲;處于缺氧環(huán)境時,腫瘤細(xì)胞會通過上調(diào)細(xì)胞質(zhì)膜上的H+轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白將H+排出細(xì)胞外,從而造成細(xì)胞外環(huán)境呈酸性。酸性環(huán)境可使i-motif結(jié)構(gòu)發(fā)生變化形成四鏈體,兩個熒光基團(tuán)相互靠近,發(fā)生FRET,Cy3的熒光減弱,Cy5的熒光增強(qiáng),通過測定兩者的熒光比值,可實(shí)現(xiàn)缺氧環(huán)境pH值的傳感監(jiān)測,從而促進(jìn)腫瘤的早期診斷。

        2.2 探針序列體外篩選及表征

        本實(shí)驗設(shè)計了如表1所示的5種不同的探針序列,并對其進(jìn)行優(yōu)化和表征。

        2.2.1序列優(yōu)化將S1~S5序列分別置于pH 5.0和pH 7.0的PB緩沖液中,在548 nm激發(fā)波長下,收集565 nm和666 nm處的熒光,并計算出每種序列在兩種pH值環(huán)境下供體和受體的熒光比值,即RFA/FD(pH 7.0)/RFA/FD(pH 5.0)。結(jié)果顯示S3序列對pH值的響應(yīng)最好。因此,選定S3序列進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗。

        2.2.2序列表征用圓二色譜儀對S3序列的i-motif結(jié)構(gòu)進(jìn)行表征。結(jié)果顯示:pH 7.0時,DNA鏈的正峰在270 nm左右,負(fù)峰在250 nm左右;當(dāng)pH值降至5.0時,正峰紅移至285 nm左右,而負(fù)峰紅移至260 nm左右,該結(jié)果和文獻(xiàn)報道一致[14-15],進(jìn)一步證實(shí)S3序列在酸性環(huán)境下生成了i-motif結(jié)構(gòu)。

        圖2 DNA-lipid細(xì)胞表面固定前后流式細(xì)胞分析圖

        2.3 細(xì)胞膜表面?zhèn)鞲衅鞯臉?gòu)建及表征

        本文以Tan等[8]報道的修飾方法將探針固定到細(xì)胞表面,并考察了DNA-lipid在細(xì)胞膜上的組裝固定能力。以人的宮頸癌細(xì)胞(HeLa細(xì)胞)為模型細(xì)胞,在其上修飾lipid-S3-TAMAR(在S3的兩端標(biāo)記lipid和TAMAR),孵育1 h后用細(xì)胞溶酶體tracker染料LysoTracker Green進(jìn)行染色,然后用激光共聚焦顯微鏡進(jìn)行成像。結(jié)果顯示,LysoTracker Green的綠色熒光集中在溶酶體上,而羧基四甲基羅丹明(TAMAR)的紅色熒光均集中在細(xì)胞的輪廓周圍,表明探針已經(jīng)成功地固定至細(xì)胞表面。為了進(jìn)一步驗證細(xì)胞表面的固定化,使用流式細(xì)胞儀對修飾后的細(xì)胞進(jìn)行分析。結(jié)果如圖2所示,細(xì)胞未經(jīng)上述探針處理,只顯示微弱的TAMAR熒光,探針處理1 h 后,細(xì)胞熒光信號明顯增強(qiáng),表明探針已經(jīng)被很好地修飾到細(xì)胞膜表面。

        2.4 體外標(biāo)準(zhǔn)工作曲線的繪制

        本實(shí)驗將探針溶于不同pH值的PB緩沖液中(pH 5.0~7.0)并測定其熒光變化,以考察探針在不同pH值環(huán)境下的工作情況,結(jié)果如圖3所示。圖3A為探針在不同的pH值下的FRET熒光光譜,并由此得到該探針的體外標(biāo)準(zhǔn)工作曲線(圖3B)。從圖3B可以看出,在pH值從7.5變化到5.0的過程中,F(xiàn)RET效應(yīng)慢慢增強(qiáng),F(xiàn)A/FD值擴(kuò)大了近6倍(從0.3到1.8)。這一pH值檢測區(qū)間與生理范圍正好接近,由此說明該探針適用于細(xì)胞周圍環(huán)境pH值的檢測。pH值從5.0變化到7.0的過程中,F(xiàn)RET效應(yīng)逐漸減弱,多次循環(huán)重復(fù)該實(shí)驗,結(jié)果如圖3B內(nèi)插圖所示,表明該實(shí)驗重現(xiàn)性及可逆性好,可用于連續(xù)監(jiān)測。

        圖4 不同pH值環(huán)境下HeLa細(xì)胞的共聚焦成像圖

        圖5 不同氧氣濃度程度下HeLa細(xì)胞的共聚焦成像圖

        2.5 細(xì)胞標(biāo)準(zhǔn)工作曲線

        為了考察該探針在細(xì)胞膜表面對pH值的響應(yīng)情況,本實(shí)驗將修飾了探針的細(xì)胞先用PBS緩沖液清洗3次,除去游離的探針,然后置于不同的pHe環(huán)境中進(jìn)行成像,并繪制了該探針在細(xì)胞表面的標(biāo)準(zhǔn)工作曲線。結(jié)果如圖4所示,在pH值從7.0變化到5.0的過程中,隨著pH值的降低,細(xì)胞表面紅色熒光的強(qiáng)度逐漸增強(qiáng),而綠色熒光的強(qiáng)度逐漸降低,表明該探針對細(xì)胞外的pH值有著很好的響應(yīng)。同時,熒光比率成像的結(jié)果顯示,該探針對pH值具有明顯的依賴性。上述結(jié)果說明,本實(shí)驗設(shè)計的這種基于“FRET”效應(yīng)的比率型探針能有效地監(jiān)測細(xì)胞外pH值的變化,有望進(jìn)一步應(yīng)用于缺氧環(huán)境下細(xì)胞膜外微環(huán)境的pH值成像分析。

        2.6 不同氧氣濃度環(huán)境下的細(xì)胞膜外pH值原位成像分析

        將HeLa細(xì)胞和探針置于不同氧氣濃度環(huán)境,用PBS緩沖液孵育1 h后放入培養(yǎng)再孵育1 h,用激光共聚焦顯微鏡分別對其成像,結(jié)果如圖5所示。隨著氧氣濃度由20%(常氧)降至1%(全缺氧),Cy3的熒光降低,而Cy5的熒光升高,并且FA/FD的比值呈規(guī)律性變化,結(jié)合細(xì)胞外pH值的標(biāo)準(zhǔn)工作曲線,得到在氧氣濃度由20%將至1%時,細(xì)胞膜外的pH值由6.9降至6.2。

        3 結(jié) 論

        本研究首次發(fā)展了一種基于二?;|(zhì)的i-motif核酸探針用于原位成像分析不同氧氣濃度下的細(xì)胞外pH值。該探針用FRET作為比率信號模式,能夠降低復(fù)雜生物因素的影響,使細(xì)胞外pH值檢測更精確。此外利用i-motif結(jié)構(gòu)作為H+的識別單元,對pH值的響應(yīng)靈敏度高且具有可逆性。該探針合成、操作簡單,通用性良好。

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