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        三例散發(fā)I型神經(jīng)纖維瘤病患者NF1基因突變檢測

        2019-02-19 09:05:08郎小喬孫勇虎付希安孫樂樂張福仁
        中國麻風(fēng)皮膚病雜志 2019年1期
        關(guān)鍵詞:堿基外顯子基因突變

        郎小喬 孫勇虎 付希安 孫樂樂 劉 紅 張福仁

        I型神經(jīng)纖維瘤病(neurofibromatosis type 1,NF1, OMIM:162200)又稱Von Recklinghausen病,是一種常見的常染色體顯性遺傳病,其特征表現(xiàn)為皮膚牛奶咖啡斑、神經(jīng)纖維瘤、腋窩或腹股溝雀斑、Lisch結(jié)節(jié)、骨骼異常、學(xué)習(xí)障礙等。發(fā)病率約為1/3500[1],其中約50%是自發(fā)突變,成人外顯率接近100%。本研究對3例散發(fā)患者進(jìn)行基因檢測,現(xiàn)將結(jié)果報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 臨床資料 病例1,女,17歲。7歲時頸部出現(xiàn)咖啡斑,逐漸增大增多,并向軀干、四肢蔓延。17歲時軀干和上肢部位開始出現(xiàn)多個凸起皮膚表面的腫物。皮膚科檢查:全身遍布大小不一的咖啡斑、神經(jīng)纖維瘤,有腋窩、腹股溝雀斑(圖1a、b)。患者弟弟、妹妹、父母均正常,否認(rèn)家族史。病例2,男,44歲。14歲時軀干開始出現(xiàn)咖啡斑和突起皮膚表面的腫物,數(shù)量逐漸增多。皮膚科檢查:全身遍布米粒大咖啡斑和大小不一的神經(jīng)纖維瘤(圖1c、d)?;颊邇鹤?、父母均正常,否認(rèn)家族史。病例3,女,20歲。自出生起軀干部位發(fā)現(xiàn)多個咖啡斑,后逐漸增大增多。20歲時右大腿根處出現(xiàn)凸起皮膚表面的腫物。皮膚科檢查:全身遍布大小不一的咖啡斑,有腋窩、腹股溝雀斑,軀干散在分布米粒大神經(jīng)纖維瘤,右側(cè)腹股溝區(qū)有1 cm×2 cm大神經(jīng)纖維瘤(圖1e、f)?;颊吒改妇#裾J(rèn)家族史。3例患者均在外院行眼科檢查,未發(fā)現(xiàn)Lisch結(jié)節(jié)。本研究經(jīng)過山東省皮膚病與性病防治研究所倫理委員會批準(zhǔn),患者及其家屬均簽署知情同意書。

        1.2 外周血DNA提取 分別抽取3例患者及其5位家屬5 mL外周血,放置于5 mL EDTA抗凝管中,在-80℃保存。使用TGuide Large Volume Blood Genomic DNA Kit(北京天根生化科技有限公司)提取基因組DNA,質(zhì)控濃度為50 ng/μL,體積為80 μL,A260/A280比值在1.8~2.0之間。同時提取100名無NF1家族史的正常人外周血DNA作為對照組,質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)同上。

        1.3 引物設(shè)計與PCR擴增和測序 選用NF1基因cDNA參考序列(NM 001042492)作為轉(zhuǎn)錄本,利用網(wǎng)頁軟件(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/)對NF1基因的58個外顯子設(shè)計特異性引物。進(jìn)行常規(guī)PCR擴增,擴增產(chǎn)物經(jīng)過純化后在ABI 3500 xL Dx Genetic Analyzer測序儀(美國ABI公司)上進(jìn)行測序。測序結(jié)果使用Chromas 2.22軟件進(jìn)行分析,并與上述所使用的轉(zhuǎn)錄本序列進(jìn)行比對。

        2 結(jié)果

        病例1,第39號外顯子發(fā)生堿基G缺失(c.5635delG,圖2a),造成移碼突變,致使轉(zhuǎn)錄提前終止(p.Cys1878Leufs*1)。病例2,第47號外顯子大片段缺失(c.7041~7062+4del,圖2b),造成截斷蛋白產(chǎn)生。病例3,第21號外顯子發(fā)生堿基A、C缺失(c.2714-2715delAC,圖2c),造成移碼突變,致使轉(zhuǎn)錄提前終止(p.Asp905Thrfs*1)。上述突變在HGMD數(shù)據(jù)庫(http://www.hgmd.org)及近5年發(fā)表的NF1相關(guān)文獻(xiàn)中均未發(fā)現(xiàn)相同報道。在3例患者家屬及100名正常對照中均未發(fā)現(xiàn)上述突變。

        a、b:病例1軀干部布滿咖啡斑、凸起皮膚表面的神經(jīng)纖維瘤;c、d:病例2軀干部大量的咖啡斑、神經(jīng)纖維瘤;e、f:病例3腋窩雀斑和腹股溝1 cm×2 cm大的神經(jīng)纖維瘤

        圖1 患者臨床圖片

        a:病例1第39號外顯子發(fā)生堿基G缺失(c.5635delG,p.Cys1878Leufs*1);b:病例2第47號外顯子大片段缺失(c.7041~7062+4del);c:病例3第21號外顯子發(fā)生堿基A、C缺失(c.2714-2715delAC,p.Asp905Thrfs*1);d、e、f:正常對照序列

        圖2 患者突變檢測結(jié)果

        3 討論

        現(xiàn)采用的診斷標(biāo)準(zhǔn)為美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)在1988年制定,包括:(1)6個或以上的牛奶咖啡斑, 青春期前直徑大于5mm,青春期后直徑大于15mm。(2)2個及以上任何類型的神經(jīng)纖維瘤,或1個叢狀神經(jīng)纖維瘤。(3)腋窩或腹股溝雀斑。(4)視神經(jīng)膠質(zhì)瘤。(5)2個及以上虹膜錯構(gòu)瘤(Lisch結(jié)節(jié))。(6)骨損害,如蝶骨翼發(fā)育不良,長骨皮質(zhì)細(xì)線化,有或無假關(guān)節(jié)。(7)一級親屬關(guān)系中有符合上述標(biāo)準(zhǔn)的NF1。以上標(biāo)準(zhǔn)符合2條即可確診NF1。

        神經(jīng)纖維瘤蛋白1(neurofibromin 1,NFl)基因突變已被充分證明可引起NF1[2]。NF1基因位于17q11.2,是最大的基因之一,長度為350kb,包括至少60個外顯子。高度保守的GAP關(guān)聯(lián)結(jié)構(gòu)域(GRD)是NF1上的一個重要功能區(qū)域,已被證實由20~27a號外顯子編碼[3,4]。該基因編碼包含2818個氨基酸的神經(jīng)纖維瘤蛋白,此蛋白為原癌基因Ras的負(fù)性調(diào)控因子,有抑制腫瘤的作用。NF1基因體積龐大,測序難度增大,一項基于109例中國NF1患者研究的突變檢出率為89%[5]。因此診斷一般依靠NIH臨床診斷標(biāo)準(zhǔn),而不常規(guī)采用基因檢測的方法,但對于不符合NIH臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)的疑似患者,以及有遺傳咨詢、產(chǎn)前診斷等需求的患者,進(jìn)行NFI基因突變檢測是有必要的。到2018年2月為止,人類基因突變數(shù)據(jù)庫(http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php)已有超過2700種不同的NF1基因突變記錄在內(nèi),類型包括錯義突變、剪切位點突變以及插入或缺失導(dǎo)致的框移突變等。其中55%的類型為堿基插入、缺失導(dǎo)致的突變,28%的類型為錯義突變,16%的類型為剪切位點突變。本研究3例新發(fā)突變均為堿基缺失造成截斷蛋白的產(chǎn)生,推測由此影響了蛋白正常功能,導(dǎo)致疾病的發(fā)生。

        NF1基因具有高度可變性表達(dá),家族內(nèi)或不同家族之間都具有顯著表達(dá)差異。Sabbagh等[6]通過對來自275個家庭的750例NFl患者的研究發(fā)現(xiàn),臨床表現(xiàn)的相似度隨血緣關(guān)系越遠(yuǎn)而降低。即使同一個家庭具有相同突變的不同成員之間,臨床表現(xiàn)也可存有差異。有研究團(tuán)隊對8對有不同NFl癥狀的同卵雙生子進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)同卵雙生子之間NF1基因啟動子存在明顯差異,這可能是導(dǎo)致表現(xiàn)型不同的原因[7]。目前已確定的基因型-表現(xiàn)型關(guān)系有3種:(1)框內(nèi)3 bp大小的堿基缺失(c.2970-2972 delAAT)與臨床上無神經(jīng)纖維瘤的表現(xiàn)相關(guān)[8]。(2)大片段NF1基因缺失與大量神經(jīng)纖維瘤、骨骼畸形、認(rèn)知障礙以及發(fā)生惡性腫瘤等表現(xiàn)相關(guān)[9]。(3)包括整段NF1的基因微重復(fù)與無典型NFI臨床表現(xiàn)相關(guān),臨床表現(xiàn)有生長遲緩、面部畸形、智力低下、癲癇發(fā)作[10]。

        本病目前的治療方法包括手術(shù)、藥物、激光等,但均不是一勞永逸的方法,所以產(chǎn)前診斷顯得尤為重要。Merker等[11]報道目前的技術(shù)可以幫助超過95%的NFI患者找到突變位點,因此受該病困擾的夫婦可以借助著床前胚胎遺傳學(xué)診斷(PGD)來增加生育健康后代的幾率。DeBella等[12]研究發(fā)現(xiàn)有97%的患者在8歲之前符合NIH發(fā)布的NF1診斷標(biāo)準(zhǔn),烏云等[13]通過基因檢測手段診斷2例僅有多發(fā)咖啡斑表現(xiàn)的無家族史低齡患兒,說明對于學(xué)齡前不符合診斷標(biāo)準(zhǔn)的疑似兒童進(jìn)行基因檢測,在早診斷、早干預(yù)方面有重要意義。該病無論從外觀和健康方面對患者均是一種負(fù)擔(dān),本文中2例年輕女性患者有下一代產(chǎn)前診斷的需求,檢測突變位點對她們?nèi)蘸髢?yōu)生優(yōu)育有一定參考價值。

        綜上,本研究發(fā)現(xiàn)的3種新發(fā)突變豐富了中國人群NF1基因的突變譜,為NF1相關(guān)研究打下基礎(chǔ)。對于臨床表現(xiàn)未達(dá)診斷標(biāo)準(zhǔn)以及有遺傳咨詢需求的患者,可以考慮NF1基因突變分析,明確診斷并據(jù)病情發(fā)展行針對性隨訪觀察。

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