在植物基因編輯的過程中去除CRISPR/Cas9 表達(dá)元件非常重要,因?yàn)镃RISPR/Cas9 表達(dá)元件在植物中的存在會(huì)帶來多方面的問題:(1)取部分組織進(jìn)行基因型檢測時(shí)很難區(qū)分突變是遺傳自上一代還是當(dāng)代新產(chǎn)生的(當(dāng)代新產(chǎn)生的體細(xì)胞突變可能不能遺傳);(2)CRISPR/Cas9 元件的持續(xù)存在既增加了脫靶的風(fēng)險(xiǎn),又不利于開展后續(xù)的互補(bǔ)實(shí)驗(yàn);(3)攜帶CRISPR/Cas9元件的植物屬于轉(zhuǎn)基因植物,獲得商業(yè)應(yīng)用的難度大大增加。
近日,北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)學(xué)院與生命科學(xué)學(xué)院陳浩東研究組在aBIOTECH 期刊發(fā)表了題為“A novel CRISPR/Cas9 system for efficiently generating Cas9-free multiplex mutants inArabidopsis”的研究論文,報(bào)道了一種高效地在擬南芥中創(chuàng)制多基因編輯的不攜帶轉(zhuǎn)基因元件(Cas9-free)植株的方法,該方法也可能在其他植物中類似應(yīng)用。
研究者構(gòu)建了Cas9-P2A-GFP 融合蛋白,其中P2A 是可以發(fā)生自我斷裂的小肽,這樣GFP 不影響Cas9 的核酸內(nèi)切酶活性。結(jié)合同尾酶介導(dǎo)的串聯(lián)多個(gè)sgRNA 的技術(shù),該系統(tǒng)可實(shí)現(xiàn)多基因編輯。因GFP 與Cas9 的等量表達(dá),通過觀測GFP 的熒光,即可獲得Cas9 蛋白的存在與否及含量高低的信息,而Cas9 蛋白的含量高低與基因編輯的效率具有很好的正相關(guān)性。由此,使用者在T1 代中挑選GFP 熒光強(qiáng)的植株,這些植株有很高的概率發(fā)生基因編輯,對目標(biāo)序列鑒定確認(rèn)發(fā)生編輯后,收集這些植株的T2 代種子;在T2 植株中挑選沒有GFP 表達(dá)的植株,即為目標(biāo)Cas9-free 植株。因 T1 代熒光弱的植株可直接舍棄,T2 代直接挑選無熒光的植株,大大減少了基因型鑒定的工作量,提高了研究效率。