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        油菜及其近緣植物形態(tài)標(biāo)記性狀基因定位與克隆研究進(jìn)展

        2019-01-17 07:48:38劉忠松
        作物研究 2019年1期
        關(guān)鍵詞:矮稈紫葉芥菜

        楊 柳,康 雷,劉忠松

        (湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,長(zhǎng)沙 410128)

        油菜主要用作油料作物,近年來(lái)也作為觀賞作物、蔬菜作物、飼料作物等種植。從植物學(xué)角度看,油菜包括白菜型油菜、芥菜型油菜和甘藍(lán)型油菜三類。三類油菜在形態(tài)上存在明顯差別,如白菜型油菜較矮;甘藍(lán)型油菜、芥菜型油菜較高;白菜型油菜、芥菜型油菜有天然的紫葉、多室、黃籽特征等。這些性狀差異特異性強(qiáng)、易識(shí)別、受環(huán)境條件影響小,不僅可以作為標(biāo)記性狀直接應(yīng)用于遺傳研究、雜種鑒別、種子純度鑒定等諸多方面,而且有些還與作物的產(chǎn)量、品質(zhì)甚至抗逆性相關(guān)聯(lián)。近年形態(tài)標(biāo)記性狀作為重要的育種選擇參考越來(lái)越受到重視,如隨著觀賞油菜的興起,對(duì)油菜品種的葉型、葉色、株高和花色都提出了新的要求[1,2]。

        油菜的根、莖、葉、花、果、實(shí)的形態(tài)性狀研究由來(lái)已久,但以往研究大多停留在對(duì)表觀性狀遺傳分析方面。近年隨著油菜及近緣植物全基因組測(cè)序完成和序列公布,已將控制葉色、葉型、株高、花色、種子顏色等性狀的基因進(jìn)行了定位和克隆,從而為比較不同油菜類型間控制同一性狀的基因差異提供了條件。本文僅對(duì)油菜及其近緣種的形態(tài)標(biāo)記性狀基因定位和克隆進(jìn)展進(jìn)行評(píng)述。

        1 葉色

        油菜葉片一般為綠色,但有紫色、黃色、桔黃色等變異類型。紫葉白菜含有更多的蘆?。?],桔黃葉白菜積累更多的β-胡蘿卜素[4],這些物質(zhì)提高了白菜的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。在油菜(Brassica napus)、芥菜(B.juncea)、白菜(B.rapa)和甘藍(lán)(B.oleracea)等蕓薹屬植物中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了有天然的紫葉突變,屬于單基因顯性突變,并且紫葉性狀可通過(guò)種間雜交由芥菜、白菜轉(zhuǎn)移到油菜和甘藍(lán)中去[5,6]。油菜控制紫葉性狀的基因在A03染色體,編碼APR2基因[7],芥菜控制紫葉性狀的基因位于B02染色體(重新命名為B05[8]),編碼MYB轉(zhuǎn)錄因子基因[9],白菜控制紫葉性狀的基因定位到A03、A07和A09染色體[10],A03染色體的編碼基因?yàn)長(zhǎng)BD39[10],A09染色體有2個(gè)控制葉色的基因,分別為DFR和bHLH類轉(zhuǎn)錄因子EGL3[11,12],甘藍(lán)控制紫葉性狀的基因定位到C03、C06和C09染色體,C06染色體上的紫葉基因?yàn)镸YB2和MYBL2,而C09染色體的紫葉基因?yàn)镈FR[13~19]。紫葉的形成是由于過(guò)量積累花色素[20~23]?;ㄉ貙儆陬慄S酮類物質(zhì)。類黃酮的生物合成途徑研究成果頗豐,在蕓薹屬植物中有數(shù)十個(gè)基因參與這一途徑[23,24],還有許多基因沒(méi)有找到自然突變體。

        桔黃葉是大白菜的重要性狀,多個(gè)研究都把單基因隱性遺傳的桔黃葉指向A09染色體的影響胡蘿卜素合成的CRTISO基因[25~29]。蕓薹屬植物像水稻等植物一樣,有許多葉片黃化突變體,在葉綠體基因組[30]和C01、C07和C08染色體定位有黃化基因[31~34],但至今僅1個(gè)油菜黃化突變體和1個(gè)白菜黃化突變體基因被克隆,分別編碼血紅素加氧酶1(PHO1)基因和葉綠體rps4基因。白菜QTL定位及基因注釋分析認(rèn)為,SCO3、ABI3、FLU、HCF153、HEMB1和CAB3等基因與葉色和葉綠素合成有關(guān)[35]。

        2 光葉

        油菜葉片表面一般會(huì)合成、積累一層蠟粉,保護(hù)植株免受干旱、高溫等環(huán)境脅迫。蠟質(zhì)是鏈非常長(zhǎng)的脂肪酸(C20~C34)衍生物質(zhì),在油菜葉片中檢出有24種之多(C24~C31)[36]。如果葉片表皮細(xì)胞不合成蠟質(zhì),葉片表面就因不能積累蠟粉而變成光葉(glossy)。光葉白菜、甘藍(lán)口感更好,而且不利于蚜蟲等多種昆蟲取食[37]。光葉既有顯性遺傳的,也有隱性遺傳的。油菜中單基因顯性光葉性狀是由A09染色體CER1基因單堿基突變所致[38],白菜中克隆了A01和A09染色體上CER2和CER1基因[39,40],甘藍(lán)中克隆了C01和C08染色體上的CER4、CER1基因,其中CER1基因有3個(gè)等位突變[41~45],而C03染色體有涉及蠟質(zhì)合成的O-?;D(zhuǎn)移酶家族蛋白(WSD1-like)、3-酮酰CoA合成酶(KCS)和脂肪酰CoA還原酶(FAR)3個(gè)候選基因[37]。擬南芥中涉及蠟質(zhì)合成、分泌和調(diào)控的基因有20余個(gè)[46],通過(guò)生物信息手段分析其中10個(gè)基因的油菜同源基因,發(fā)現(xiàn)有44個(gè)拷貝,除了CER10外,每一個(gè)擬南芥基因在油菜中有4個(gè)或更多同源基因[47]。

        3 葉型

        花葉是由于葉片深度缺刻造成,在油菜、芥菜中均有花葉自然突變體。油菜花葉是單基因不完全顯性遺傳,由于A10染色體LMI1基因啟動(dòng)子區(qū)域插入突變所致[48,49]。白菜QTL定位及基因注釋分析認(rèn)為CYCD3;1、CYCB2;4、AN3、ULT1和ANT基因與葉片大小有關(guān)[35]。遺傳基因組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),白菜A03、A09和A10染色體分別攜帶有控制葉型的KRP2、ERECTA和LONGIFOLIA1等基因[50]。

        4 矮稈

        甘藍(lán)型冬油菜株高一般在180~200 cm,容易倒伏,不利于機(jī)械收獲。由于油菜收獲指數(shù)低(0.28~0.35),所以一些育種家認(rèn)為油菜植株應(yīng)高大。但矮稈是水稻、小麥等作物第一次“綠色革命”的目標(biāo)性狀,油菜能否培育出矮稈高產(chǎn)品種近年受到重視??刂浦参锇捫誀畹幕蛏婕暗匠嗝顾?、生長(zhǎng)素、油菜素內(nèi)酯和獨(dú)腳金內(nèi)酯的合成、轉(zhuǎn)運(yùn)和傳導(dǎo)。油菜中現(xiàn)有矮稈突變體多是化學(xué)誘變產(chǎn)生的堿基替換的結(jié)果,株高在70~100 cm,表現(xiàn)為單基因半顯性遺傳。已經(jīng)定位的矮稈基因位于油菜A03、A06、A09和C05、C07、C09染色體上,A03染色體的矮稈基因編碼控制生長(zhǎng)素合成的IAA7[51],C05染色體的矮稈基因編碼控制赤霉素合成的GID1[52],其他已克隆的油菜、白菜矮稈基因都編碼控制赤霉素傳導(dǎo)的RGA基因[53~59]。油菜是無(wú)限花序作物,如果變成有限花序,株高也會(huì)降低。決定油菜有限花序的基因定位在A10染色體,編碼TFL1基因[60,61]。通過(guò)株高QTL定位、整合和候選基因鑒定,發(fā)現(xiàn)油菜有287個(gè)控制株高的候選基因[62]。

        5 花色

        油菜種植面積大、花期長(zhǎng)、花色鮮艷,近年來(lái)以觀賞油菜花為主題的油菜花節(jié)助推了鄉(xiāng)村旅游的興起,需要培育紅色、紫色、彩色等不同花色的油菜品種。傳統(tǒng)的油菜花一般是黃色(鮮黃色、金黃色、桔黃色),通過(guò)遠(yuǎn)緣雜交已將甘藍(lán)(白花芥藍(lán))、蘿卜、諸葛菜等植物的白花、紫花和紅花等性狀導(dǎo)入到油菜中。影響花色的色素物質(zhì)主要有三類,即藍(lán)色到紅色的花青素、紅色的甜菜素和黃色到帶紅色的類胡蘿卜素,這些色素的組成和含量決定花色的變化[63]。油菜桔黃色花是由2個(gè)隱性基因位點(diǎn)控制,其中一個(gè)位點(diǎn)定位在C09染色體,編碼類胡蘿卜素代謝途徑玉米黃素環(huán)氧化酶ZEP基因[64]。由白花芥藍(lán)轉(zhuǎn)移到油菜的白花性狀是單基因顯性遺傳,基因定位在C03染色體,編碼類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因CCD4[65,66],白花是由于轉(zhuǎn)座子插入所致。芥菜乳白花性狀是由2個(gè)隱性基因控制,分別定位在A02和B04(B06[8])染色體,編碼硫酯酶家族蛋白PES2和PES1基因[67,68]。

        6 種子顏色

        油菜未成熟種子為綠色,成熟種子為黑色、褐色或黃色。在相同遺傳背景下,油菜黃色種子比黑色、褐色種子含油量更高,種皮更薄,不含原花色素。因此選育黃籽油菜品種是重要的育種目標(biāo)。在自然界還沒(méi)有發(fā)現(xiàn)甘藍(lán)型黃籽油菜,將白菜型油菜、芥菜型油菜、白芥(Sinapis alba)中發(fā)現(xiàn)的黃籽性狀通過(guò)種、屬間雜交轉(zhuǎn)移到油菜中,培育出了甘藍(lán)型油菜黃籽類型。白菜和白菜型油菜黃籽性狀基因分別定位在A06和A09染色體,A06染色體TTG1基因調(diào)控種子顏色[69,70],A09染色體有2個(gè)編碼轉(zhuǎn)錄因子的基因TT1和TT8被認(rèn)為調(diào)控種子顏色[71~73]。芥菜型油菜黃籽性狀基因定位在A09和B03(B08[8])染色體[74,75],同樣編碼TT8基因,但芥菜型油菜黃籽很可能不是來(lái)源于白菜型油菜黃籽,因?yàn)橥蛔兾稽c(diǎn)不同[71,75]。

        7 多室

        油菜一般由1個(gè)假隔膜將角果分為2室,但也發(fā)生了天然的3或4室突變,這種具有3或4室的油菜稱為多室油菜。多室油菜每角果種子數(shù)增加,有利于提高單產(chǎn)。白菜型黃籽油菜中突變形成的多室油菜是由于A04染色體CLV3基因單堿基替換所致[76,77],而芥菜型黃籽油菜中突變形成的多室油菜是由2個(gè)隱性基因控制,分別位于A07和B07(B03[8])染色體,均編碼CLV1基因[78~80]。

        8 總結(jié)

        油菜及其近緣植物已定位、克隆的形態(tài)標(biāo)記性狀基因列于表1。從表1可見:(1)控制同一性狀的基因往往不只1個(gè),而是多個(gè)。(2)這些控制同一性狀的多個(gè)基因可能位于不同代謝途徑(如矮稈),也可能位于同一代謝途徑(如紫葉)。如果通過(guò)基因編輯等手段創(chuàng)制新的種質(zhì),可以選擇不同途徑、不同靶標(biāo)基因進(jìn)行研究。(3)異源四倍體的油菜、芥菜控制性狀的基因數(shù)目一般是其祖先親本種白菜、甘藍(lán)的2倍,在相同的染色體或同源區(qū)段能找到同源基因,這為進(jìn)一步克隆油菜基因提供了借鑒。

        表1 油菜及其近緣植物已定位和克隆的形態(tài)標(biāo)記性狀基因

        續(xù)表1

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