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        老白干酒曲中酵母菌多樣性分析

        2019-01-07 02:38:16文淑婷
        食品科學(xué) 2018年24期
        關(guān)鍵詞:老白干酒曲電泳

        文淑婷,李 艷,2,*

        (1.河北科技大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院,河北 石家莊 050018;2.河北省發(fā)酵工程技術(shù)研究中心,河北 石家莊 050018)

        老白干香型是我國(guó)白酒第11類香型,代表酒為衡水老白干酒,該酒自然協(xié)調(diào)、清雅獨(dú)特的香氣與其所用的酒曲密不可分。在白酒生產(chǎn)過程中,一直有“曲為酒骨”的說法,酒曲對(duì)于白酒的生產(chǎn)至關(guān)重要。酒曲中微生物組成復(fù)雜,其中酵母菌、細(xì)菌和霉菌這3 類微生物占據(jù)很大的比重。傳統(tǒng)的酵母菌分離是通過將酵母菌進(jìn)行培養(yǎng),WL培養(yǎng)基鑒別,結(jié)合菌落和顯微形態(tài)特征可將其進(jìn)行初步形態(tài)聚類[1-6],再利用限制性片段多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析進(jìn)行分子水平的分類。26S rDNA D1/D2序列分析和5.8S-ITS RFLP[7]是廣泛應(yīng)用的兩種分析鑒定技術(shù)。Esteve-Zarzoso等[8]將5.8S-ITS RFLP指紋技術(shù)應(yīng)用于食品和發(fā)酵飲料中酵母菌的分類和鑒定;馬凱等[9]則以26S rDNA D1/D2區(qū)序列分析法對(duì)15 株菌進(jìn)行相關(guān)的分類研究;文獻(xiàn)[1,10-14]均用到此法對(duì)菌種進(jìn)行分析鑒定。

        如今,變性梯度凝膠電泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)因具有快速、準(zhǔn)確性高的優(yōu)點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于目標(biāo)樣品中微生物的多樣性分析[15-19],Durand[20]和Sha[21]等分別將DGGE技術(shù)應(yīng)用于赭曲霉毒素A產(chǎn)生相關(guān)的真菌群體和發(fā)酵劑中酵母菌群多樣性的研究。該技術(shù)的工作原理是使用聚丙烯酰胺凝膠對(duì)DNA進(jìn)行電泳,長(zhǎng)度相同而在堿基序列上存在差異的DNA雙鏈的解鏈需要不同的變性劑濃度,不同的酵母菌被分開,實(shí)現(xiàn)了基因組水平的分離、純化。該技術(shù)如今已經(jīng)普遍應(yīng)用于酒曲中微生物的群落結(jié)構(gòu)研究。程才瓔[22]和譚映月[23]等在對(duì)醬香型白酒酒曲中的微生物多樣性研究中采用的技術(shù)為DGGE;姚淑敏等[24]提取6 種甜酒酒曲的總DNA,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)聯(lián)合技術(shù)共鑒定得到3 種真菌和不可培養(yǎng)真菌;閆華文[25]利用DGGE針對(duì)不同地區(qū)的6 種甜酒曲進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn)其主要真菌為釀酒酵母、扣囊復(fù)膜酵母、米根霉以及不可培養(yǎng)真菌;李艷等[2]利用PCR-DGGE技術(shù)檢測(cè)到羊羔美酒大曲中6 種細(xì)菌和4 種不可培養(yǎng)的細(xì)菌種類;趙東[26]在對(duì)西藏青稞酒酒曲的研究中曾論述道:PCR-DGGE彌補(bǔ)了以往微生物培養(yǎng)分離時(shí)間長(zhǎng)、效率低下的缺陷,實(shí)現(xiàn)了對(duì)微生物較全面的分離鑒定。培養(yǎng)方法和非培養(yǎng)方法能夠很好地結(jié)合,非培養(yǎng)方法為培養(yǎng)方法提供基礎(chǔ)的菌群關(guān)系、培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件信息,而培養(yǎng)方法可以補(bǔ)充非培養(yǎng)方法沒有發(fā)現(xiàn)的菌群,得到菌株加以馴化和利用,兩種方法相互補(bǔ)充。目前鮮見老白干酒曲中微生物群落結(jié)構(gòu)的相關(guān)研究,本研究采用培養(yǎng)和非培養(yǎng)兩種方法對(duì)老白干酒曲中的酵母菌進(jìn)行分離鑒定,確定其屬、種。采用PCR-DGGE技術(shù)對(duì)老白干酒曲中酵母菌的多樣性進(jìn)行分析,為進(jìn)一步研究老白干酒曲的發(fā)酵能力提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        1.1.1 材料

        老白干香型酒曲 衡水老白干酒業(yè)股份有限公司。

        1.1.2 培養(yǎng)基

        酵母浸出粉胨葡萄糖(yeast extract peptone dextrose,YEPD)培養(yǎng)基:酵母浸粉10 g/L,蛋白胨20 g/L,葡萄糖20 g/L,瓊脂20 g/L;WL培養(yǎng)基[2-6]:胰蛋白胨5 g/L,酵母浸粉4 g/L,葡萄糖50 g/L,磷酸二氫鉀0.55 g/L,氯化鉀0.425 g/L,氯化鈣0.125 g/L,硫酸鎂0.125 g/L,氯化鐵0.002 5 g/L,硫酸錳0.002 5 g/L,氯化鈣0.125 g/L,溴甲酚綠0.022 g/L,瓊脂20 g/L,pH 5.5±0.2。

        1.1.3 分子試劑

        PCR引物:上游引物NL1(5’-GCATATC AATAAGCGGAGGAAAAG-3’),下游NL4(5’-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3’);DGGE專用引物:上游引物GC-NL1(5’-CGCCCGCCG CGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGCATATCA ATAAGCGGAGGAAAAG-3’),下游引物 LS2(5’-ATTCCCAAACAACTCGACTC-3’);Taq DNA聚合酶、dNTP、限制性內(nèi)切酶HinfI、HhalI和HaeIII均購自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司(以下簡(jiǎn)稱上海生工公司)。

        1.2 儀器與設(shè)備

        DP-200低溫培養(yǎng)箱 廣東省醫(yī)療器械廠;ZQTY-70振蕩培養(yǎng)箱 上海知楚儀器有限公司;AR1140分析天平美國(guó)Ohaus公司;ZQTY-70 PCR擴(kuò)增儀、凝膠成像分析儀、DGGE儀 美國(guó)Bio-Rad公司;DYY-8C型穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀北京市六一儀器廠;SW-CJ-1BU潔凈工作臺(tái) 蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司;XS-212-202雙目顯微鏡(配有單反相機(jī)D5100) 尼康映像儀器銷售有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 酵母菌形態(tài)學(xué)鑒定

        1.3.1.1 酒曲樣品預(yù)處理

        將塊狀酒曲研磨成粉,過40 目篩。準(zhǔn)確稱取1 g酒曲粉,倒入盛有9 mL無菌水的錐形瓶中,至搖床160 r/min振蕩培養(yǎng)0.5 h得到菌液。將菌液于10 mL無菌稀釋管中進(jìn)行梯度稀釋,取0.2 mL 10-2、10-3、10-4等合適稀釋度的菌液分別均勻涂布于YEPD培養(yǎng)基平板上,28 ℃進(jìn)行培養(yǎng)。

        1.3.1.2 酵母菌的分離

        培養(yǎng)12 h后,每2 h觀察一次,挑取疑似酵母菌的菌落,劃線接種在新的YEPD培養(yǎng)基上[27],同時(shí)作好實(shí)驗(yàn)觀察記錄。

        1.3.1.3 酵母菌的純化

        將篩選得到的酵母菌在YEPD培養(yǎng)基上重復(fù)純化2~3 次,直到菌落為單菌株形成的菌落,再將其保藏。

        1.3.1.4 酵母菌的形態(tài)聚類

        將純化菌劃線接種于WL培養(yǎng)基,28 ℃恒溫培養(yǎng)5 d,觀察菌落特征[2-6]。并進(jìn)行顯微形態(tài)觀察,記錄菌落的大小和形狀,對(duì)菌株進(jìn)行顯微形態(tài)聚類。

        1.3.2 26S rDNA D1/D2序列分析法鑒定酵母菌

        1.3.2.1 DNA的提取

        每種形態(tài)隨機(jī)選取1株保藏的酵母菌,反復(fù)活化培養(yǎng)2~3 次,28 ℃培養(yǎng)48 h,得到酵母菌單菌落。采用熱裂解法[1]提取酵母菌DNA:吸取30 μL 0.25%十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)溶液放在離心管中,挑取大小合適的單菌落于管中混勻,振蕩30~40 s,90℃水浴鍋中水浴4 min,冰浴5min,13 000 r/min離心3.5 min,吸取上清液于0.2 mL的離心管中。-20 ℃保藏備用。

        1.3.2.2 PCR擴(kuò)增

        PCR擴(kuò)增為50 μL體系:上、下游引物各1 μL,Buffer(10×)5 μL,dNTP 1 μL,Taq酶0.5 μL,雙蒸水40.5 μL,DNA 1 μL。PCR程序:95 ℃預(yù)變性7 min;94 ℃變性1 min,52 ℃退火1 min,72 ℃延伸80 s,循環(huán)36 次;再72 ℃延伸8 min。用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢驗(yàn)擴(kuò)增結(jié)果。

        1.3.2.3 26S rDNA D1/D2的RFLP分析

        利用限制性內(nèi)切酶HhalI、HinfI和HaeIII進(jìn)行酶切分析,根據(jù)酶切結(jié)果對(duì)酵母均進(jìn)行分子聚類[2,4-5]。20μL酶切體系:無菌雙蒸水9 μL,buffer 2 μL,酶1 μL,PCR得到的擴(kuò)增產(chǎn)物8 μL。酶切條件:37℃水浴2.5h。用2%的瓊脂糖凝膠檢驗(yàn)酶切的結(jié)果80~90 V電泳50~60min,在凝膠成像儀下拍照。

        1.3.2.4 測(cè)序與數(shù)據(jù)分析

        將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物委托上海生工公司進(jìn)行測(cè)序。登錄NCBI上的BLAST將測(cè)序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫中的序列進(jìn)行同源性分析[4],同時(shí)向NCBI提交序列獲得GenBank登錄號(hào)。

        1.3.3 PCR-DGGE法鑒定酒曲中的酵母菌

        1.3.3.1 原料的預(yù)處理

        酒曲樣品經(jīng)粉碎成粒狀并過濾,稱取4 g酒曲,加入36 mL磷酸鹽緩沖溶液(可以用去離子水代替)200 r/min搖床振蕩30 min,旋渦振蕩5 min之后用4 層紗布過濾,濾液200 r/min離心5 min,取上清液8 000 r/min離心3 min之后得到的沉淀加入5 mL磷酸鹽緩沖溶液,旋渦振蕩5 min,離心沉淀,重復(fù)2 次。最終將所得沉淀溶解于1 200 μL無菌水中,將樣品置于-20 ℃貯藏備用。

        1.3.3.2 DNA提取

        預(yù)先稱取玻璃珠0.3~0.5 g于1.5 mL的離心管中,依次加入處理的樣品250 μL,再加入250 μL TE緩沖液,最終在旋渦振蕩儀振蕩3~5 min。再加10% SDS 50 μL、氯化芐150 μL、蛋白酶K 10 μL在旋渦振蕩儀振蕩3~5 min。直至混合物呈現(xiàn)乳濁的狀態(tài),于50 ℃水浴10 min,混勻一次。重復(fù)上述操作5次。水浴結(jié)束之后加入3 mol/L NaAc溶液(pH 5.2)150 μL再混勻,-20 ℃放置持續(xù)15 min,12 000 r/min離心10 min之后得到上清液。小心取上清液放置于新1.5 mL已滅菌的離心管中,使用等體積的苯酚-氯仿-異戊醇(25∶24∶1,V/V)抽提2 次,最終用氯仿-異戊醇(24∶1,V/V)的溶液抽提1次。小心吸出上層液體于一新1.5 mL已滅菌的離心管中,拿出已經(jīng)預(yù)冷好的異丙醇,加入上清液2 倍體積的異丙醇和1/10體積的3 mol/L NaAc溶液(pH 5.2)慢慢混勻,之后置于-20 ℃放置沉降2 h。2 h之后取出樣品12 000 r/min離心10 min,再用70%的乙醇溶液洗滌2 次,自然晾干,加入30 μL TE緩沖液,-20 ℃貯藏備用。

        1.3.3.3 PCR儀擴(kuò)增片段

        在超凈臺(tái)中配制好PCR體系之后用PCR擴(kuò)增儀按照

        1.3.2.2 節(jié)中PCR擴(kuò)增的程序進(jìn)行擴(kuò)增,得到擴(kuò)增產(chǎn)物。

        1.3.3.4 變性膠溶液配制

        按表1配比配制變性膠溶液,4 ℃保存待用。

        表1 不同變性劑濃度膠溶液的配制Table 1 Preparation of gels with different denaturant concentrations

        1.3.3.5 灌膠

        先用滅菌水將玻璃板清洗干凈、晾干,再組裝玻璃板。分別向高、低濃度凝膠溶液中加入四甲基乙二胺(N,N,N’,N’-tetramethylethane-1,2-diamine,TEMED)和10%過硫酸銨溶液上下劇烈混勻(每16 mL的膠溶液加入TEMED 18 μL,10%過硫酸銨80 μL)。將高、低濃度膠溶液分別吸入標(biāo)有高濃度注射器(HI注射器)和低濃度注射器(LO注射器),之后穩(wěn)定固定在梯度灌膠器上。三通接頭的兩端連接HI注射器和LO注射器的灌膠管,另外一頭連接著通向膠板的軟管。手動(dòng)緩慢轉(zhuǎn)動(dòng)齒輪開始灌膠,盡可能保持勻速。灌膠結(jié)束,插入尺梳,等待下層膠凝固,約需1~2 h(時(shí)間隨室溫而變)。灌入不含變性劑的上層膠,凝固時(shí)間約20~30 min。待上層膠溶液凝聚完成后,稍稍拔去梳齒檢驗(yàn)?zāi)z是否擰好。

        1.3.3.6 電泳

        將制好的膠從制膠板上取下,將電泳液倒入電泳槽中并將玻璃板及夾具安裝好,放入電泳槽內(nèi)。 依次打開電泳儀的電源、回流泵及控溫裝置,設(shè)置需要的溫度(60 ℃),等待電泳緩沖液加熱至設(shè)置溫度,上、下層緩沖液形成電流通路進(jìn)行預(yù)電泳。200 V預(yù)電泳20 min。預(yù)電泳結(jié)束后開始點(diǎn)樣,樣品為PCR產(chǎn)物,與對(duì)應(yīng)量的loading buffer混合均勻,用移液針點(diǎn)入加樣孔中。重新打開各個(gè)開關(guān),設(shè)置電泳所需的電壓與時(shí)間,進(jìn)行電泳。電泳結(jié)束后,取出凝膠玻璃板,溴化乙錠染色電泳膠,時(shí)間為20~30 min。利用凝膠成像儀觀察DGGE凝膠的情況。

        1.3.3.7 切膠與回收

        準(zhǔn)備鋒利刀片,在凝膠儀的紫外燈照射下,切下目標(biāo)的條帶,置于1.5 mL離心管中。用適量滅菌雙蒸水清洗條帶,重新加入30 μL滅菌雙蒸水,同時(shí)搗碎凝膠使DNA盡量溶出。取適量的浸泡溶液作為下一步PCR擴(kuò)增模板,測(cè)序與數(shù)據(jù)分析同1.3.2.4節(jié)方法。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 酵母菌形態(tài)學(xué)鑒定

        從老白干酒曲中分離到57 株酵母菌。利用WL培養(yǎng)基實(shí)現(xiàn)對(duì)酵母菌的形態(tài)聚類,再在顯微鏡下觀察、記錄各個(gè)形態(tài)類型酵母菌的形態(tài)、大小,初步區(qū)分到6 種形態(tài),其中各個(gè)形態(tài)的菌落形態(tài)描述、所占比例、酵母菌個(gè)體大小等如表2所示。6 種酵母的菌落形態(tài)、細(xì)胞形態(tài)見圖1。

        表2 WL培養(yǎng)基上酵母菌的形態(tài)特征及數(shù)量Table 2 Morphological characteristics and size of yeast strains cultured on WL medium

        圖1 各菌株菌落形態(tài)和顯微形態(tài)Fig. 1 Colony morphology and micromorphology of various strains

        根據(jù)表2和圖1可以看出,形態(tài)3和形態(tài)6分別占總酵母菌株數(shù)量的35.1%和24.6%,兩者共占總酵母菌種的59.7%,這兩種酵母為老白干酒曲中的優(yōu)勢(shì)酵母,形態(tài)2和形態(tài)4的比例分別為21.0%、15.8%。比例最少的形態(tài)種類為形態(tài)1和形態(tài)5,均為1.75%。其中形態(tài)5的顏色呈現(xiàn)紅色,張紅霞[28]曾經(jīng)對(duì)清香大曲中的微生物結(jié)構(gòu)進(jìn)行探究,通過培養(yǎng)分類的手段得到一種正面呈現(xiàn)紅色,形態(tài)呈現(xiàn)球狀凸起,表面光滑的酵母菌,經(jīng)分子鑒定為膠紅酵母(Rhodotorula mucilaginosa),該酵母與本研究中得到的形態(tài)5極度相似。

        2.2 26S rDNA D1/D2 序列分析

        2.2.1 酵母菌形態(tài)的酶切分析

        本研究隨機(jī)選取各個(gè)形態(tài)的酵母菌各1株。用SDS熱裂解法提取其DNA,以酵母菌DNA為模板進(jìn)行PCR程序,結(jié)果見圖2A。由圖2A可知,擴(kuò)增出的形態(tài)1~6酵母菌的26S rDNA片段均在600 bp左右且條帶明亮清楚,其中比較明顯的是形態(tài)3擴(kuò)增產(chǎn)物在540 bp左右,形態(tài)1擴(kuò)增產(chǎn)物在640 bp左右,其他4 種形態(tài)基本都在610 bp左右,6 種形態(tài)的酵母菌擴(kuò)增出的片段長(zhǎng)度相當(dāng),但是其序列不同。進(jìn)行限制性內(nèi)切酶RFLP分析可以將酵母菌進(jìn)行進(jìn)一步聚類分析,不同的酵母菌序列經(jīng)過3 種酶的作用,其產(chǎn)物有所差異,實(shí)驗(yàn)用到的限制性內(nèi)切酶有HhalI、HinfI和HaeIII,3 種酶的酶切圖譜分別見圖2B、C、D。

        圖2 PCR產(chǎn)物及3 種內(nèi)切酶酶切分析圖譜Fig. 2 PCR electrophoretogram and restriction analysis patterns of PCR-amplified 26S rDNA D1/D2 region

        由圖2B、C、D中可以分析得到共5 個(gè)分子類型。形態(tài)2和形態(tài)6在3 種酶的酶切作用下得到的片段均相同,經(jīng)過HaeIII酶酶切為220 bp和240 bp 2 個(gè)片段,經(jīng)HhalI酶酶切為180 bp和230 bp 2個(gè)片段,經(jīng)過HinfI酶酶切后分為120 bp和400 bp 2 個(gè)片段,所以形態(tài)2和形態(tài)6為一種分子類型。其他的4 種形態(tài)分別被酶切成互不相同的片段,所以可以把6個(gè)形態(tài)類型歸為5 種分子類型,結(jié)果見表3。

        表3 6 種不同形態(tài)的26S rDNA PCR-RFLP結(jié)果Table 3 26S rDNA PCR-RFLP analysis of six kinds of yeast

        2.2.2 測(cè)序結(jié)果及同源性分析

        將擴(kuò)增后的產(chǎn)物送至上海生工公司測(cè)序獲得序列結(jié)果,登錄NCBI進(jìn)行BLAST比對(duì),并向NCBI提交序列,獲得GenBank的登錄號(hào),見表4。菌株序列的相似度比對(duì)結(jié)果均在98%~100%,在GenBank中下載與相應(yīng)物種分子類型相似度高的菌株序列,再利用MEGA4和鄰接法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹見圖3。

        表4 5種分子類型的26S rDNA D1/D2序列測(cè)定結(jié)果Table 4 Determination of 26S rDNA D1/D2 sequence of five molecular types

        圖3 基于26S rDNA D1/D2序列利用MEGA4和鄰接法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig. 3 Phylogenetic tree based on 26S rDNA D1/D2 sequence using MEGA4 and neighbor-joining methods

        由圖3可清楚判斷出酵母菌的同源關(guān)系遠(yuǎn)近,各個(gè)菌株分支獨(dú)立分別屬于不同的種屬。P. kudriavzevii和C. lusitaniae分別占總酵母數(shù)的45.6%和35.1%,為主勢(shì)菌;W. anomalus僅占15.8%;T. asahii和R. mucilaginosa均為1 株,所占比例為1.75%,為數(shù)量較少的酵母菌。Jeyaram等[29]對(duì)印度一種傳統(tǒng)的發(fā)酵劑(類似酒曲)中的酵母菌進(jìn)行研究,分離到的酵母菌有Saccharomyces cerevisiae、P. kudriavzevii、Hansenula anomala、T. asahii、熱帶假絲酵母(Candida tropicalis)等,P. kudriavzevii為其中主勢(shì)菌之一,這一點(diǎn)與本研究結(jié)果一致。P. kudriavzevii能夠同時(shí)發(fā)酵葡萄糖和木糖兩種糖,能最大限度實(shí)現(xiàn)乙醇的轉(zhuǎn)化。惠豐立等[30]從河南臥龍酒廠提供的中溫大曲中共分離得到92 株酵母菌,通過5.8S-ITS RFLP 指紋圖譜分析后,得到12 個(gè)不同的類群。從各個(gè)類群中隨機(jī)選取代表菌株進(jìn)行26S rDNA D1/D2區(qū)域序列分析和系統(tǒng)發(fā)育分析,大曲中酵母菌主要為Saccharomyces、Pichia、Zygosaccharomyces、Candida、Rhodotorula、Issatchenkia等9 個(gè)已知酵母菌屬。本研究中也同樣鑒定得到P. kudriavzevi、R. mucilaginosa兩種酵母屬的菌株。C. lusitaniae、R. mucilaginosa和T. asahii雖然屬非釀酒酵母,但卻是產(chǎn)β-葡萄糖苷酶的菌株,蔣文鴻[31]篩選了昌黎和濟(jì)源兩地產(chǎn)β-葡萄糖苷酶的菌株,其中就有C. lusitaniae、R. mucilaginosa和T. asahii。發(fā)酵過程中β-葡萄糖苷酶的出現(xiàn)可以使香氣物質(zhì)從結(jié)合態(tài)變成游離態(tài)[32],達(dá)到增香的效果。該菌株對(duì)老白干香型白酒特異性香氣的形成具有一定的促進(jìn)作用。王玉霞[33]在發(fā)酵過程中發(fā)現(xiàn)釀酒酵母出現(xiàn)的頻率較少,只在發(fā)酵后期出現(xiàn),發(fā)酵前期出現(xiàn)的大部分是非釀酒酵母。這一點(diǎn)可以為本研究未分離到釀酒酵母作出解釋,釀酒酵母的出現(xiàn)大多是在發(fā)酵后期。W. anomalus具有產(chǎn)苯乙醇能力[34],為白酒產(chǎn)香發(fā)揮正向作用,增添風(fēng)味屬于酒曲中不可缺少的一類酵母。非釀酒酵母的存在為老白干香型的白酒增添風(fēng)味,是酒曲中不可或缺的酵母菌。

        2.3 PCR-DGGE法鑒定酒曲中酵母菌

        圖4 酒曲中DGGE優(yōu)勢(shì)條帶Fig. 4 Dominant DGGE bands in Laobaigan liquor Daqu

        利用PCR-DGGE技術(shù)對(duì)酵母菌進(jìn)行鑒定得到DGGE圖譜條帶見圖4。通過對(duì)回收的條帶進(jìn)行重新PCR擴(kuò)增,再委托上海生工公司測(cè)序,獲得了片段序列和NCBI上的BLAST結(jié)果。

        表5 PCR-DGGE圖譜條帶的測(cè)序結(jié)果Table 5 Sequencing of PCR-DGGE bands

        PCR-DGGE非培養(yǎng)方式分離得到10 株條帶比較亮的優(yōu)勢(shì)菌見表5,其中H. burtonii 2 株,W. anomalus、Wickerhamomyces sp.、T. asahii、C. tropicalis和Candida sp.各1 株,還有3 株為未知的不可培養(yǎng)酵母uncultured Saccharomycopsis。根據(jù)DGGE圖,其他條帶較淺,不滿足切膠條件,通過PCR-DGGE方式從遺傳基因上證明了酒曲中酵母菌的多樣性。W. anomalus和T. asahii是兩類產(chǎn)生香氣物質(zhì)的酵母菌。高亦豹[35]利用26S rRNA D1區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,再經(jīng)過DGGE實(shí)驗(yàn)在大曲中鑒定得到T. asahii、W. anomalus、扣囊復(fù)膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)、漢遜德巴利酵母(Debaryomyces hansenii)等13 種酵母菌,本研究中也相應(yīng)檢測(cè)到T. asahii、W. anomalus和3 株不可培養(yǎng)酵母uncultured Saccharomycopsis,其結(jié)果與本研究基本一致。在酒曲中非釀酒酵母菌一般在發(fā)酵初期參與發(fā)酵代謝,產(chǎn)生一些非常重要的二級(jí)代謝產(chǎn)物,在一定程度上能提高白酒風(fēng)味的復(fù)雜性,同時(shí)能夠分泌酶的酵母對(duì)白酒的風(fēng)味物質(zhì)形成具有一定的催化作用。姚淑敏等[24]利用PCR-DGGE對(duì)甜酒曲中的真菌進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)在傳統(tǒng)的酒曲中的真菌除了酵母屬之外,不可培養(yǎng)真菌在甜酒曲中也起到非常重要的作用,這一點(diǎn)印證了本研究的檢測(cè)結(jié)果。

        2.4 培養(yǎng)和非培養(yǎng)方法鑒定結(jié)果比較

        培養(yǎng)方式和非培養(yǎng)方式分別鑒定得到5、10 種分子類型,其中培養(yǎng)方式得到的酵母均能夠采用傳統(tǒng)的培養(yǎng)技術(shù)培養(yǎng),而非培養(yǎng)PCR-DGGE技術(shù)分離得到可培養(yǎng)酵母7 種,不可培養(yǎng)的酵母3 種。一方面,由于PCR-DGGE技術(shù)為直接提取酒曲中總DNA,再進(jìn)行PCR擴(kuò)增、電泳,所以能夠?qū)魄袩o法通過培養(yǎng)手段分離得到的酵母菌進(jìn)行鑒定,本研究中鑒定得到了3 株uncultured Saccharomycopsis。彭?xiàng)畹萚36]基于PCR-DGGE技術(shù)對(duì)四川麩醋固態(tài)發(fā)酵過程中真菌進(jìn)行微生物群落分析,分離鑒定到12 株真菌,其中亦有3 株不可培養(yǎng)的真菌,姚淑敏等[24]在甜酒曲中利用DGGE技術(shù)分離得到不可培養(yǎng)真菌1 株,不可培養(yǎng)的真菌在酒曲中也占有一定比重。

        另一方面,兩種鑒定技術(shù)均得到W. anomalus和T. asahii,而C. lusitaniae、R. mucilaginosa、P. kudriavzevii則通過培養(yǎng)方式得到,PCR-DGGE技術(shù)并未鑒定到這3 種菌。傳統(tǒng)的菌株分離與菌株的活性以及培養(yǎng)基的適宜性密切相關(guān),故而分離得到的酵母菌與PCR-DGGE技術(shù)鑒定結(jié)果具有差異性。在DNA抽提過程中,群落中含量很少的一些菌株,用常規(guī)的DNA提取方法可能提不到或提到微量的DNA,這會(huì)影響其PCR擴(kuò)增,從而導(dǎo)致PCRDGGE技術(shù)無法檢測(cè)到[37]。同時(shí),針對(duì)非培養(yǎng)酵母,則只能利用PCR-DGGE技術(shù)鑒定得到。PCR-DGGE技術(shù)具有檢測(cè)限低、準(zhǔn)確、同時(shí)可檢測(cè)多個(gè)樣品的優(yōu)點(diǎn),但是也具有一定的局限性,繁雜的DNA提取、擴(kuò)增可能會(huì)引起分析誤差。培養(yǎng)與非培養(yǎng)鑒定技術(shù)具有差異性但卻相互補(bǔ)充,將兩者結(jié)合使用則能夠更加全面和清楚地探究老白干酒曲中的酵母菌多樣性。

        3 結(jié) 論

        本研究通過培養(yǎng)方式分離純化到57 株酵母菌,分為6 種形態(tài),5 種分子類型,分別為P. kudriavzevii、C. lusitaniae、W. anomalus、R. mucilaginosa、T. asahii。其中,P. kudriavzevii和C. lusitaniae分別占總菌株數(shù)的45.7%和35.1%,為優(yōu)勢(shì)菌群。PCR-DGGE法鑒定得到10 株酵母菌,分別為H. burtonii 2 株,W. anomalus、Wickerhamomyces sp.、T. asahii、C. tropicalis和Candida sp.各1 株,uncultured Saccharomycopsis 3 株,PCR-DGGE法分離純化酵母菌直接、快速,能夠更詳細(xì)準(zhǔn)確地鑒定出酒曲中的酵母菌。采用培養(yǎng)與非培養(yǎng)兩種方式探究老白干酒曲中的酵母菌,兩種方法各有特點(diǎn)且相互補(bǔ)充,共得到屬于8 個(gè)屬中的10 株酵母,包括P. kudriavzevii、C. lusitaniae、W. anomalus、R.mucilaginosa、T. asahii、H. burtonii、Wickerhamomyces sp.、 C. tropicalis、 Candida sp.、 uncultured Saccharomycopsis,為后續(xù)進(jìn)一步研究該香型白酒的風(fēng)味特征和酒曲發(fā)酵性能提供理論支持。

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