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        miR-222在藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)肌和腰大肌中的表達(dá)差異研究

        2018-11-22 03:41:30甘麥鄰鐘志君張順華
        豬業(yè)科學(xué) 2018年10期
        關(guān)鍵詞:豬種肌纖維骨骼肌

        鄭 婷,甘麥鄰,李 強(qiáng),鐘志君,張順華*,朱 礪*

        (1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,四川 成都 611130;2.四川省畜牧總站,四川 成都 610041;3. 四川省畜牧科學(xué)研究院,四川 成都 610066)

        動(dòng)物肌肉組織是人類(lèi)主要的蛋白質(zhì)來(lái)源之一,對(duì)于農(nóng)場(chǎng)動(dòng)物,尤其是肉用家畜來(lái)說(shuō),產(chǎn)肉是最重要的經(jīng)濟(jì)性狀之一,動(dòng)物骨骼肌的發(fā)育情況直接決定了其產(chǎn)肉能力和肉品質(zhì)。脊椎動(dòng)物的骨骼肌細(xì)胞是一種經(jīng)過(guò)復(fù)雜的分化過(guò)程形成的具有收縮功能的多核細(xì)胞。在動(dòng)物胚胎發(fā)育的過(guò)程中,來(lái)自中胚層的祖細(xì)胞首先進(jìn)行增殖,隨后退出細(xì)胞周期在生肌調(diào)節(jié)因子(myogenic regulatory factors, MRFs)的驅(qū)動(dòng)下分化、融合成肌管,最終形成肌纖維[1-2]。通常根據(jù)肌纖維表達(dá)的肌球蛋白重鏈(Muscle heavy chains, MyHC)亞型的差異可將骨骼肌分為慢速氧化型肌纖維(MyHCⅠ)、快速氧化型肌纖維(MyHCⅡa)、快速酵解型肌纖維(MyHCⅡb)和中間型肌纖維(MyHCⅡx),肌纖維類(lèi)型決定了肌肉的運(yùn)動(dòng)能力和代謝類(lèi)型,同時(shí)還與畜產(chǎn)品肉品質(zhì)密切相關(guān)[3]。在豬中背最長(zhǎng)肌是典型的快速酵解型肌肉(又稱(chēng)白?。蠹榈湫偷穆傺趸图∪猓ㄓ址Q(chēng)紅?。4]。microRNA是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的一種長(zhǎng)度約22nt的非編碼RNA,主要在其靶基因的轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮調(diào)控作用,近年來(lái)越來(lái)越多的microRNA被報(bào)道參與了骨骼肌的發(fā)育調(diào)控,如miR-1、miR-133、miR-206等[5]。miR-222在此前的研究報(bào)道中已被發(fā)現(xiàn)可以抑制骨骼肌細(xì)胞成肌細(xì)胞的分化[6-7]。但miR-222在豬骨骼肌中的表達(dá)及其是否調(diào)控豬不同骨骼肌肌纖維類(lèi)型的發(fā)育還未見(jiàn)報(bào)道。因此本試驗(yàn)以藏豬(地方品種豬)和DLY豬(外種豬)的背最長(zhǎng)?。ò准。┖脱蠹。t?。樵囼?yàn)材料,分析miR-222在背最長(zhǎng)肌和腰大肌的表達(dá)特性,以期為進(jìn)一步研究miR-222對(duì)豬骨骼肌發(fā)育和肌肉品質(zhì)的影響提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        雌性藏豬[體重:(54.60±5.5.56 )kg,樣品取自甘孜藏族自治州畜牧業(yè)科學(xué)研究所農(nóng)業(yè)養(yǎng)殖基地]和雌性DLY豬(樣品取自成都市某屠宰場(chǎng))各6頭,分別取背最長(zhǎng)肌(LDM)和腰大?。≒MM)。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 RNA提取

        稱(chēng)取40~50 mg肌肉組織研磨樣于1.5 ml離心管中,加入1 mL Trizol(Ambion) 充 分 裂 解 5 min, 隨后按照說(shuō)明書(shū)內(nèi)容進(jìn)行RNA提取。使用 Nanodrop2000核酸蛋白儀(Thermo Scientific)對(duì)RNA質(zhì)量和濃度進(jìn)行檢測(cè)。

        1.2.2 實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)

        分 別 使 用microRNA和mRNA 反 轉(zhuǎn) 試 劑 盒(TaKaRa)反 轉(zhuǎn)cDNA,qRT-PCR采 用SYBR Premix Ex Taq kit(TaKaRa)試劑在CFX96 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)系統(tǒng)(Bio-Rad)下使用 2_ΔΔCt法進(jìn)行檢測(cè)[8],microRNA和mRNA分別使用U6和GAPDH作內(nèi)參。相關(guān)引物序列見(jiàn)表1。

        1.2.3 靶基因預(yù)測(cè)

        miR-222靶基因預(yù)測(cè)使用TargetScan和miRDB軟件,同時(shí)結(jié)合序列分析比對(duì)的方式進(jìn)行預(yù)測(cè)。

        1.3 統(tǒng)計(jì)與分析

        所有數(shù)值采用平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,使用SPSS 20.0軟件進(jìn)行單因素方差分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 miR-222在藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)肌及腰大肌中的表達(dá)

        由圖1可知,miR-222在藏豬背最長(zhǎng)肌中的表達(dá)量顯著(P<0.05)高于腰大肌,miR-222在背最長(zhǎng)肌的表達(dá)量是腰大肌的 1.40倍(圖 1.A);miR-222在DLY豬背最長(zhǎng)肌中的表達(dá)量顯著(P<0.05)高于腰大肌,miR-222在背最長(zhǎng)肌的表達(dá)量是腰大肌的 1.51 倍(圖 1.B)。

        圖1 miR-222在藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)?。↙DM)和腰大肌(PMM)中的表達(dá)

        圖2 miR-222與PGC1α結(jié)合序列圖示

        表1 引物序列及反應(yīng)溫度

        2.2 miR-222靶基因PGC1α的序列分析

        如圖2所示,miR-222的種子序列與PGC1α的3’UTR區(qū)域2239-3245位序列互補(bǔ)配對(duì)。

        2.3 PGC1α在藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)肌和腰大肌中的表達(dá)

        PGC1α在藏豬背最長(zhǎng)肌中的表達(dá)量顯著(P<0.05)低于腰大肌,為腰 大 肌 的 45.4%( 圖 3.A);PGC1α在DLY豬背最長(zhǎng)肌中的表達(dá)量顯著(P<0.05)低于腰大肌,為腰大肌的53.7%(圖 3.B)。

        2.4 miR-222與PGC1α表達(dá)量的相關(guān)性分析

        進(jìn)一步對(duì)所有樣本miR-222和PGC1α的表達(dá)量進(jìn)行線(xiàn)性相關(guān)性分析,如圖4。得相關(guān)性方程為:Y=-5458.1X+2.5594(Y :PGC1α ;X :miR-222);R2=0.65;P< 0.05。

        3 討論

        骨骼肌的發(fā)育受到相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的嚴(yán)格調(diào)控,microRNA參與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控機(jī)制也影響著骨骼肌的發(fā)育。當(dāng)前研究表明一些肌源性microRNA(miR-1、miR-133和 miR-206)和非肌源性 microRNA(miR-378、miR-499、miR-152等)均在骨骼肌發(fā)育過(guò)程中扮演著重要角色[9-10]。此前已有研究發(fā)現(xiàn)miR-222可促進(jìn)成肌細(xì)胞增殖,同時(shí)抑制其成肌分化[11]。但目前還未見(jiàn)miR-222在豬骨骼肌發(fā)育的相關(guān)研究報(bào)道,本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)miR-222在成年豬骨骼肌中存在中等程度(U6表達(dá)量的0.2%~0.5%)的表達(dá),提示可進(jìn)一步對(duì)miR-222進(jìn)行功能性研究。本試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)在藏豬和DLY豬中背最長(zhǎng)肌miR-222表達(dá)水平均高于相同豬種的腰大肌,背最長(zhǎng)肌是典型的白肌,腰大肌是典型的紅肌,miR-222在兩個(gè)豬種中具有相同的表達(dá)模式,暗示miR-222可能參與了豬骨骼肌類(lèi)型的轉(zhuǎn)換和調(diào)控[12]。同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn)DLY豬背最長(zhǎng)肌和腰大肌中miR-222表達(dá)水平均低于藏豬,藏豬是典型的地方品種豬,生長(zhǎng)速度和骨骼肌發(fā)達(dá)程度均不如DLY豬[13]。miR-222在骨骼肌更發(fā)達(dá)的DLY豬種中具有更低的表達(dá)模式也暗示了其可能參與骨骼肌發(fā)育調(diào)控,與此前在小鼠上的研究吻合[7,11]。

        鑒于miR-222在兩個(gè)豬種的腰大肌中表達(dá)更低,我們猜測(cè)miR-222可能參與了骨骼肌肌纖維類(lèi)型和能量代謝的調(diào)控。而microRNA調(diào)控是一種經(jīng)典的表觀遺傳調(diào)控,其功能的發(fā)揮必須依靠其靶基因執(zhí)行。過(guò)氧化物酶體增殖激活受體γ輔助激活因子α(PGC1α)是一種轉(zhuǎn)錄輔助激活因子,在線(xiàn)粒體含量豐富和氧化代謝活躍的組織中高表達(dá)[14-15]。通過(guò)軟件預(yù)測(cè)和序列比對(duì)我們發(fā)現(xiàn)PGC1α的3’UTR區(qū)域存在miR-222種子序列的結(jié)合位點(diǎn),暗示PGC1α可能是miR-222的潛在靶基因。進(jìn)一步我們檢測(cè)了藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)肌和腰大肌PGC1α的表達(dá),發(fā)現(xiàn)在藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)肌中PGC1α的表達(dá)量均低于相同豬種腰大肌,與miR-222表達(dá)模式相反,且與此前相關(guān)研究結(jié)果相似[16]。進(jìn)一步對(duì)PGC1α和miR-222的表達(dá)量進(jìn)行相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)PGC1α與miR-222存在顯著強(qiáng)負(fù)相關(guān),進(jìn)一步提示PGC1α和miR-222的靶標(biāo)關(guān)系。

        圖3 PGC1α在藏豬和DLY豬背最長(zhǎng)?。↙DM)和腰大?。≒MM)中的表達(dá)

        圖4 miR-222與PGC1α表達(dá)量的相關(guān)性分析

        4 結(jié)論

        miR-222在藏豬和DLY豬的背最長(zhǎng)肌中表達(dá)量高于腰大肌,其潛在靶基因PGC1α在藏豬和DLY豬的背最長(zhǎng)肌中表達(dá)量則低于腰大肌。暗示miR-222可能通過(guò)PGC1α參與了豬不同骨骼肌肌纖維發(fā)育的調(diào)控,但其靶標(biāo)關(guān)系還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

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