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        利用知識(shí)圖譜優(yōu)化國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的構(gòu)建*

        2018-11-01 06:58:42常偉鵬
        圖書館研究 2018年5期
        關(guān)鍵詞:知識(shí)庫藥學(xué)成員

        周 陽,常偉鵬

        (中國藥科大學(xué)圖書與信息中心,江蘇 南京 211198)

        學(xué)科知識(shí)庫從“Subject Knowledge Repository”或“Disciplinary Knowledge Repository”翻譯而來,是基于學(xué)科的開放存取倉儲(chǔ),是對(duì)某一學(xué)科的各類資源進(jìn)行收集、保存,并通過互聯(lián)網(wǎng)實(shí)現(xiàn)開放存取的知識(shí)庫[1]。學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟是由同學(xué)科或某幾個(gè)學(xué)科內(nèi)多個(gè)成員構(gòu)成,專業(yè)性強(qiáng)且內(nèi)容豐富。構(gòu)建聯(lián)盟需要科研機(jī)構(gòu)之間展開合作,合作機(jī)構(gòu)如何尋找、選擇與優(yōu)化,是本文研究的主要問題。當(dāng)然,構(gòu)建國際聯(lián)盟需要考慮資金、技術(shù)、資源、運(yùn)營等諸多問題,但作為基于學(xué)科的開放存取倉儲(chǔ)聯(lián)盟,學(xué)科應(yīng)為首要考慮因素。因此,本文以藥學(xué)學(xué)科為例,通過知識(shí)圖譜的分析來甄選科研機(jī)構(gòu),并根據(jù)各機(jī)構(gòu)的實(shí)際情況選擇合適的構(gòu)建途徑與聯(lián)盟模式,從而達(dá)到優(yōu)化構(gòu)建國際學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的目的。

        1 研究方法

        本文利用文獻(xiàn)計(jì)量為基礎(chǔ)的知識(shí)圖譜分析方法,通過可視化圖譜直觀地展示出機(jī)構(gòu)、年代、著者、研究熱點(diǎn)及其之間產(chǎn)生的復(fù)雜關(guān)系。目前知識(shí)圖譜繪制的軟件主要有Citespace、UCINet、Pajek、Netdraw、Netminer、Bibexcel、Wordsmith Tools等。本文將使用Citespace5.2.R2版(2018年3月26日更新)[2]對(duì)國家(地區(qū))、機(jī)構(gòu)、著者、關(guān)鍵詞等情況進(jìn)行文獻(xiàn)計(jì)量及知識(shí)圖譜繪制。利用知識(shí)圖譜優(yōu)化選擇聯(lián)盟構(gòu)建的機(jī)構(gòu)之后,再對(duì)優(yōu)選的科研機(jī)構(gòu)是否已構(gòu)建學(xué)科知識(shí)庫或機(jī)構(gòu)知識(shí)庫,以及運(yùn)營、資金、技術(shù)、政策、資源、服務(wù)等方面進(jìn)行調(diào)查,從而確立聯(lián)盟模式,并從運(yùn)營方式、資金技術(shù)、存取政策、資源服務(wù)等方面詳細(xì)闡述國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟構(gòu)建策略。

        2 利用知識(shí)圖譜對(duì)全球藥學(xué)學(xué)科科研情況分析

        本文以“Web of Science核心合集”為檢索平臺(tái),以主題字段限定為“pharmacy”或“pharmaceutical”,年份字段限定為“2008-2017”,10年基本可以反映出一個(gè)時(shí)代藥學(xué)發(fā)展的概況,得到檢索結(jié)果99 084篇,由于樣本數(shù)量過大,本文僅篩選“領(lǐng)域中高被引論文”1 491篇作為有效樣本文獻(xiàn),數(shù)據(jù)采集日期為2018年6月6日。通過EndNote文件格式將1 491篇樣本文獻(xiàn)從文獻(xiàn)管理中心輸出。

        2.1 發(fā)文國家與機(jī)構(gòu)分析

        將樣本數(shù)據(jù)導(dǎo)入Citespace軟件進(jìn)行國家(地區(qū))合作網(wǎng)絡(luò)分析,時(shí)間跨度設(shè)置為2008-2017,單個(gè)時(shí)間分區(qū)長度為1,節(jié)點(diǎn)類型為“國家(地區(qū))”,調(diào)節(jié)相應(yīng)的閾值得到樣本文獻(xiàn)所在國家(地區(qū))的知識(shí)圖譜,見圖1。

        圖1 樣本文獻(xiàn)所在國家(地區(qū))分布的知識(shí)圖譜

        如圖1所示,高被引論文量最大的是美國,中國、德國、英國、法國、西班牙、加拿大、印度緊隨其后,韓國、瑞典、澳大利亞、比利時(shí)、荷蘭、瑞士也是高被引論文較為集中的國家。當(dāng)然,相較于高被引論文量,另一個(gè)學(xué)科衡量指標(biāo)“中心性”也很重要,中心性是測(cè)試節(jié)點(diǎn)在網(wǎng)絡(luò)中的重要指標(biāo),證明該國文獻(xiàn)的重要性。由圖1生成中心性的報(bào)告顯示荷蘭的中心性最高,為0.15;并列第二的是美國和瑞典,為0.12;并列第三的是瑞士和愛爾蘭,為0.11;第五到第十名分別是英國、意大利、西班牙、捷克和德國。因此在高被引數(shù)量和中心性共同參考下,美國、荷蘭、瑞典、瑞士、英國、西班牙、德國是藥學(xué)學(xué)科發(fā)展既活躍又具權(quán)威性的國家,也應(yīng)當(dāng)是國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的構(gòu)建機(jī)構(gòu)所在國。此外,由于本文的研究初衷是在優(yōu)化構(gòu)建國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的同時(shí),希望能夠給我國的藥學(xué)科研機(jī)構(gòu)參與國際聯(lián)盟提供一些參考,因此中國的科研機(jī)構(gòu)也會(huì)作為構(gòu)建國際聯(lián)盟的研究對(duì)象。

        通過WoS自帶篩選功能,筆者將發(fā)文機(jī)構(gòu)高被引論文量前50位的機(jī)構(gòu)與知識(shí)圖譜篩選出的國家進(jìn)行匹配,50個(gè)機(jī)構(gòu)中有38個(gè)來自篩選后的8個(gè)國家。其中22個(gè)來自美國:哈佛、加利福尼亞、密歇根、麻省、北卡羅來納、得克薩斯、華盛頓、麻州、約翰霍普金斯、賓夕法尼亞、杜克、耶魯、俄勒岡、斯坦福、佛羅里達(dá)州立大學(xué),以及國立衛(wèi)生研究院、波士頓醫(yī)療保健系統(tǒng)、輝瑞制藥、默克公司、強(qiáng)生公司、馬薩諸塞州總醫(yī)院、UTMD安德森癌癥中心;1個(gè)來自荷蘭:烏特列支大學(xué);1個(gè)來自瑞典:卡羅林斯卡研究所;3個(gè)來自瑞士:諾華公司、羅氏控股、瑞士聯(lián)邦水產(chǎn)科學(xué)研究所;6個(gè)來自英國:倫敦、牛津大學(xué),帝國理工、倫敦國王學(xué)院,葛蘭素史克公司、阿斯利康公司;3個(gè)來自西班牙:科學(xué)研究理事會(huì)(Consejo Superior de Investigaciones Cientificas)、巴塞羅那大學(xué)、愷撒醫(yī)療機(jī)構(gòu);1個(gè)來自德國:柏林自由大學(xué);1個(gè)來自中國:中國科學(xué)院。

        2.2 發(fā)文年代分析

        從年份上看,樣本中高被引論文量最少的是2008、2009年113篇,最多的是2017年184篇,每年變化不大,為進(jìn)一步篩選和確認(rèn)國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的構(gòu)建機(jī)構(gòu),筆者將2013-2017年近5年的833篇高被引論文發(fā)文機(jī)構(gòu),與前文篩選出的39個(gè)機(jī)構(gòu)相匹配,剔除掉匹配結(jié)果為0篇或1篇的機(jī)構(gòu),剩余28個(gè)機(jī)構(gòu),其中17個(gè)來自美國:哈佛、加利福尼亞、密歇根、麻省、北卡羅來納、得克薩斯、華盛頓、約翰霍普金斯、賓夕法尼亞、杜克、耶魯、斯坦福大學(xué),以及國立衛(wèi)生研究院、波士頓醫(yī)療保健系統(tǒng)、輝瑞制藥、馬薩諸塞州總醫(yī)院、UTMD安德森癌癥中心;3個(gè)來自瑞士:諾華公司、羅氏控股、瑞士聯(lián)邦水產(chǎn)科學(xué)研究所;4個(gè)來自英國:倫敦、牛津大學(xué),倫敦國王學(xué)院、阿斯利康公司;3個(gè)來自西班牙:科學(xué)研究理事會(huì)、巴塞羅那大學(xué)、愷撒醫(yī)療機(jī)構(gòu);1個(gè)來自中國:中國科學(xué)院。

        2.3 發(fā)文著者分析

        將樣本數(shù)據(jù)導(dǎo)入Citespace軟件進(jìn)行作者與機(jī)構(gòu)分析,時(shí)間跨度設(shè)置為2008-2017,單個(gè)時(shí)間分區(qū)長度為1,節(jié)點(diǎn)類型為“作者”與“機(jī)構(gòu)”,調(diào)節(jié)相應(yīng)的閾值得到樣本文獻(xiàn)作者所在機(jī)構(gòu)分布的知識(shí)圖譜,見圖2。

        圖2 樣本文獻(xiàn)作者所在科研機(jī)構(gòu)分布的知識(shí)圖譜

        由圖2所生成的中心性報(bào)告顯示,所有樣本文獻(xiàn)的撰寫作者的所在機(jī)構(gòu)發(fā)文的中心性前10名分別是:哈佛大學(xué)為0.15,華盛頓大學(xué)為0.10,多倫多大學(xué)為0.10,加利福尼亞大學(xué)為0.09,馬薩諸塞州總醫(yī)院為0.09;梅奧臨床研究中心為0.09;中國科學(xué)院為0.08;牛津大學(xué)為0.08;斯坦福大學(xué)為0.08;倫敦國王學(xué)院為0.08。與前文篩選出的28個(gè)藥學(xué)科研機(jī)構(gòu)相匹配之后,可進(jìn)一步優(yōu)選出8個(gè)機(jī)構(gòu)。加之圖2根據(jù)發(fā)文量顯示出的科研機(jī)構(gòu)與前文篩選出的28個(gè)藥學(xué)科研機(jī)構(gòu)相匹配之后,可進(jìn)一步優(yōu)選出4個(gè)機(jī)構(gòu)?,F(xiàn)優(yōu)選出的國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的構(gòu)建機(jī)構(gòu)有12個(gè),其中9個(gè)來自美國:麻省理工學(xué)院、密歇根大學(xué)、杜克大學(xué)、耶魯大學(xué)、哈佛大學(xué)、華盛頓大學(xué)、加利福尼亞大學(xué)、斯坦福大學(xué)、馬薩諸塞州總醫(yī)院;2個(gè)來自英國:牛津大學(xué)、倫敦國王學(xué)院;1個(gè)來自中國:中國科學(xué)院。

        再根據(jù)論文被引頻次對(duì)各機(jī)構(gòu)高被引通訊著者進(jìn)行分析,進(jìn)一步優(yōu)選構(gòu)建機(jī)構(gòu),由于杜克大學(xué)、馬薩諸塞州總醫(yī)院、倫敦國王學(xué)院高被引著者不足5個(gè),被篩掉,得出最終構(gòu)建國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的機(jī)構(gòu)9個(gè)。

        2.4 研究熱點(diǎn)分析

        將樣本數(shù)據(jù)導(dǎo)入Citespace軟件進(jìn)行研究熱點(diǎn)分析,時(shí)間跨度設(shè)置為2008-2017,單個(gè)時(shí)間分區(qū)長度為1,節(jié)點(diǎn)類型為“關(guān)鍵詞”,調(diào)節(jié)相應(yīng)的閾值得到樣本文獻(xiàn)關(guān)鍵詞分布的知識(shí)圖譜,見圖3。

        圖3 樣本文獻(xiàn)關(guān)鍵詞分布的知識(shí)圖譜

        由圖3可見從樣本文獻(xiàn)中析出的高頻關(guān)鍵詞有:隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)(randomized controlled trial)、活的有機(jī)體內(nèi)(in vivo)、固體萃取(solid phase extraction)、串聯(lián)質(zhì)量光譜分析(tandem mass spectrum)、藥物供給(drug delivery)、納米顆粒(nanoparticle)、廢水處理(waste water treatment)等。除此以外,由圖3生成的中心性報(bào)告中,從重要性角度提供的關(guān)鍵詞有:癌癥(cancer)、臨床試驗(yàn)(clinical trial)、化學(xué)(chemistry)、有機(jī)合成(organic synthesis)、毒性(toxicity)、生物利用度(bioavailability)、內(nèi)分泌干擾物(endocrine disrupting compound)、氧化作用(oxidation)、抗生素(antibiotics)、高效液相色譜法(performance liquid chromatography)、抗氧化活性(antioxidant activity)、水生環(huán)境(aquatic environment)等。分析研究熱點(diǎn)并不是為了篩選成員機(jī)構(gòu),而是聯(lián)盟構(gòu)建后優(yōu)化學(xué)科服務(wù)的方法之一,是為成員機(jī)構(gòu)之間開展專題科研合作、尋找科研熱點(diǎn)與創(chuàng)新點(diǎn)做鋪墊。

        3 國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟構(gòu)建策略探討

        利用知識(shí)圖譜優(yōu)選出國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的構(gòu)建機(jī)構(gòu)有9個(gè):麻省理工學(xué)院、密歇根大學(xué)、耶魯大學(xué)、哈佛大學(xué)、華盛頓大學(xué)、加利福尼亞大學(xué)、斯坦福大學(xué)、牛津大學(xué)、中國科學(xué)院。

        本文首先對(duì)優(yōu)選出的聯(lián)盟構(gòu)建機(jī)構(gòu)是否已構(gòu)建機(jī)構(gòu)/學(xué)科知識(shí)庫進(jìn)行調(diào)查,除了耶魯大學(xué)、哈佛大學(xué)(雖構(gòu)建了The Harvard Depository,但僅限于內(nèi)部存儲(chǔ)使用,不對(duì)外開放獲取)以外,其他均已構(gòu)建機(jī)構(gòu)知識(shí)庫,特別是由華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院創(chuàng)建的Digital Commons@Becker更接近于學(xué)科知識(shí)庫。這些機(jī)構(gòu)知識(shí)庫的運(yùn)營機(jī)構(gòu)基本都是圖書情報(bào)機(jī)構(gòu),在系統(tǒng)軟件、存取政策方面也都較為完善,因此這9個(gè)機(jī)構(gòu)完全具備構(gòu)建國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的能力與經(jīng)驗(yàn)。從學(xué)科資源上,雖然不是每個(gè)機(jī)構(gòu)知識(shí)庫都可以準(zhǔn)確的查詢到醫(yī)藥類學(xué)科的資源數(shù)量,但根據(jù)估算大概在幾千到幾萬級(jí)的水平,為國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟構(gòu)建提供了豐富的學(xué)科資源。在學(xué)科服務(wù)上,每個(gè)機(jī)構(gòu)知識(shí)庫提供學(xué)科服務(wù)的水平略顯參差,因此構(gòu)建聯(lián)盟正是互補(bǔ)學(xué)科服務(wù)的好途徑。

        3.1 聯(lián)盟模式及運(yùn)營方式

        學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的構(gòu)建模式一般有三種:集中存儲(chǔ)模式、分布采集模式、層級(jí)構(gòu)建模式[3]。集中存儲(chǔ)模式是由一個(gè)大型學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)統(tǒng)一構(gòu)建、運(yùn)行及維護(hù)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟系統(tǒng),其他成員機(jī)構(gòu)將學(xué)科資源和對(duì)應(yīng)的元數(shù)據(jù)上傳到這個(gè)系統(tǒng)中,不需要承擔(dān)構(gòu)建及維護(hù)系統(tǒng)的任務(wù),該模式適合學(xué)科內(nèi)旗艦型學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)帶領(lǐng)中小型學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)共同建設(shè);分布采集模式是成員機(jī)構(gòu)分別構(gòu)建和維護(hù)各自獨(dú)立的學(xué)科知識(shí)庫,元數(shù)據(jù)再被整合到一個(gè)集中的搜索數(shù)據(jù)庫中,聯(lián)盟構(gòu)建統(tǒng)一的檢索平臺(tái),該平臺(tái)內(nèi)可搜索所有成員機(jī)構(gòu)的學(xué)科資源。根據(jù)本文對(duì)各成員機(jī)構(gòu)構(gòu)建的機(jī)構(gòu)知識(shí)庫調(diào)查,及對(duì)各機(jī)構(gòu)醫(yī)藥學(xué)院的情況調(diào)查,這9個(gè)成員機(jī)構(gòu)并沒有哪個(gè)機(jī)構(gòu)在國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟構(gòu)建上具備完全主導(dǎo)的能力,因此不適合集中存儲(chǔ)模式;其次,9個(gè)成員機(jī)構(gòu)8個(gè)有構(gòu)建機(jī)構(gòu)知識(shí)庫的經(jīng)驗(yàn),但只有1個(gè)機(jī)構(gòu)構(gòu)建的是近似藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫,因此分布采集的模式也不適合。

        層級(jí)構(gòu)建模式是一種分工明確的聯(lián)盟模式,由學(xué)術(shù)能力強(qiáng)、科研成果多、具備較高的管理水平的機(jī)構(gòu)組成“管理級(jí)”,負(fù)責(zé)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟建設(shè)工作的整體安排、政策支持、資金來源、日常運(yùn)營,并負(fù)責(zé)制定學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的發(fā)展規(guī)劃、存取政策以及各成員機(jī)構(gòu)的具體分工;由成員機(jī)構(gòu)中技術(shù)實(shí)力較強(qiáng)的兩三個(gè)學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)組成“支撐級(jí)”,負(fù)責(zé)聯(lián)盟平臺(tái)的技術(shù)開發(fā)與維護(hù)、數(shù)據(jù)管理與質(zhì)量控制;其他成員機(jī)構(gòu)為“資源級(jí)”,主要負(fù)責(zé)聯(lián)盟學(xué)術(shù)資源的建設(shè)。這種“管理級(jí)+支撐級(jí)+資源級(jí)”的組織模式,分工明確、執(zhí)行力強(qiáng),也是最適合這9個(gè)成員機(jī)構(gòu)實(shí)際情況的構(gòu)建模式。9個(gè)成員機(jī)構(gòu)中,加利福尼亞大學(xué)、斯坦福大學(xué)和中國科學(xué)院可以成為“管理級(jí)”。加利福尼亞大學(xué)構(gòu)建的OAC,其資源由200多個(gè)機(jī)構(gòu)捐助包括各種圖書館、檔案館等,并由加利福尼亞大學(xué)伯克利、洛杉磯等10個(gè)校區(qū)負(fù)責(zé)典藏和維護(hù),可以說從資源和資金層面,OAC已經(jīng)是一個(gè)聯(lián)盟,加之OAC是由加利福尼亞大學(xué)數(shù)字圖書館數(shù)字特別館藏項(xiàng)目專項(xiàng)管理運(yùn)營,其管理運(yùn)營的經(jīng)驗(yàn)豐富;中國科學(xué)院下設(shè)很多醫(yī)藥類相關(guān)的研究所,這些科研院所幾乎都有自己的機(jī)構(gòu)知識(shí)庫和特色數(shù)據(jù)庫,這些機(jī)構(gòu)知識(shí)庫學(xué)科特色鮮明,近似學(xué)科知識(shí)庫,因此中科院的學(xué)科資源豐富,再由文獻(xiàn)情報(bào)中心將這些學(xué)科資源分類篩選,就能整合出很好的藥學(xué)學(xué)科資源,且文獻(xiàn)情報(bào)中心已構(gòu)建機(jī)構(gòu)知識(shí)庫,在聯(lián)盟管理上既具備專業(yè)素養(yǎng),又具備豐富經(jīng)驗(yàn);斯坦福大學(xué)圖書館對(duì)Stanford Digital Repository的運(yùn)營管理分工細(xì)致,明確設(shè)置了服務(wù)經(jīng)理、保存專家、軟件工程師、系統(tǒng)管理員等職務(wù),因此斯坦福大學(xué)也適合加入“管理級(jí)”。“支撐級(jí)”可由麻省理工學(xué)院、密歇根大學(xué)和牛津大學(xué)來完成,調(diào)研中機(jī)構(gòu)知識(shí)庫構(gòu)建系統(tǒng)使用最多的是DSpace,因此聯(lián)盟構(gòu)建可以采用構(gòu)建機(jī)構(gòu)中使用的較為熟悉和廣泛的系統(tǒng)軟件DSpace,功能軟件則是牛津大學(xué)機(jī)構(gòu)庫使用較為詳細(xì),如提交軟件、免費(fèi)下載網(wǎng)頁擴(kuò)展軟件、版本工具包等,因此由這三所大學(xué)構(gòu)建聯(lián)盟的“支撐級(jí)”較為合適。其他的機(jī)構(gòu),以及構(gòu)建“管理級(jí)”與“支撐級(jí)”的機(jī)構(gòu)都需要參與資源級(jí)的構(gòu)建,其中“資源級(jí)”的主導(dǎo)構(gòu)建機(jī)構(gòu)可由華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院擔(dān)任,它具備構(gòu)建學(xué)科知識(shí)庫的經(jīng)驗(yàn),對(duì)于學(xué)科資源的篩選整合更擅長。

        運(yùn)營方式上,“管理級(jí)”機(jī)構(gòu)可組建管理委員會(huì)負(fù)責(zé)聯(lián)盟的發(fā)展規(guī)劃、獲取主管部門的政策支持、多渠道獲取資助資金,并安排成員機(jī)構(gòu)的具體分工。日常運(yùn)營工作還需要組建一些具體事務(wù)部門,安排一些專職人員處理專業(yè)工作。此外還需組建學(xué)科委員會(huì),主要從“管理級(jí)”機(jī)構(gòu)甄選一些學(xué)科專家對(duì)聯(lián)盟平臺(tái)的學(xué)科資源做收集整理與質(zhì)量控制工作。當(dāng)然,隨著聯(lián)盟的發(fā)展擴(kuò)大,還可以進(jìn)一步吸納新的成員,當(dāng)新成員機(jī)構(gòu)達(dá)到一定之后,可以效仿arXiv構(gòu)建成員咨詢委員會(huì),更多地聽取成員機(jī)構(gòu)的建議。同時(shí)學(xué)科咨詢委員會(huì)也可以吸納更多成員機(jī)構(gòu)的學(xué)科專家來完成日漸增多的學(xué)科資源整合分析與質(zhì)量控制工作。

        “管理級(jí)”機(jī)構(gòu)還需要解決聯(lián)盟資金來源的問題,資金來源主要有三個(gè)渠道:首先是來自成員機(jī)構(gòu),當(dāng)成員機(jī)構(gòu)達(dá)到一定之后,可效仿arXiv推出的根據(jù)成員機(jī)構(gòu)下載資源量分級(jí)支付會(huì)員費(fèi)的方法;其次與成員機(jī)構(gòu)有項(xiàng)目合作的基金也可以為藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟提供資金支持,例如與斯坦福大學(xué)合作的Pivot基金[4];還可以與一些藥學(xué)學(xué)科知名資助基金或制藥企業(yè)合作,例如Wellcome基金、NOVO-NORDISK公司等。

        3.2 平臺(tái)架構(gòu)及系統(tǒng)軟件

        可以作為聯(lián)盟系統(tǒng)架構(gòu)的軟件很多,調(diào)研中涉及的系統(tǒng)軟件主要有DSpace、Samvera、CSpace,考慮到聯(lián)盟“支撐級(jí)”選擇了麻省理工學(xué)院、密歇根大學(xué)、牛津大學(xué),所以選擇DSpace系統(tǒng)來架構(gòu)聯(lián)盟系統(tǒng)平臺(tái)。DSpace是以內(nèi)容管理發(fā)布為設(shè)計(jì)目標(biāo),遵循BSD協(xié)議的開放源代碼數(shù)字存儲(chǔ)系統(tǒng),系統(tǒng)可以收集、存儲(chǔ)、索引、保存和重新發(fā)布任何數(shù)字格式、層次結(jié)構(gòu)的永久標(biāo)識(shí)符研究數(shù)據(jù),其特點(diǎn)是基于存儲(chǔ)的資產(chǎn)管理、以事件觸發(fā)構(gòu)建的工作流機(jī)制、以分級(jí)權(quán)限控制的管理體系。從DSpace5.0版開始,通過修改參數(shù)變量,開啟jena-fuseki服務(wù),支持系統(tǒng)數(shù)據(jù)發(fā)布為RDF關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù),使其在支持OAI-PMH的基礎(chǔ)上,又增加一條分享內(nèi)容的途徑,最新版本是DSpace6.2[5]。

        除了系統(tǒng)平臺(tái)軟件之外,還有一些具體功能性軟件需要“支撐級(jí)”機(jī)構(gòu)提供,例如搜索軟件Basic Local Alignment Search Tool,圖像存儲(chǔ)、編輯軟件如Blacklight,數(shù)字歸檔軟件如Think Check Submit,發(fā)送接收軟件如Frequency-weighted Link,閱讀軟件如Open Reading Frame Finder,知識(shí)管理與協(xié)同軟件如Atlassian Confluence 5.10.8,版本工具包軟件如Versions Tookit等。

        3.3 存儲(chǔ)政策及共享政策

        根據(jù)調(diào)研中機(jī)構(gòu)知識(shí)庫的存儲(chǔ)政策及國際其他學(xué)科知識(shí)庫或聯(lián)盟的存儲(chǔ)政策,綜合考慮,國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟存儲(chǔ)政策可以主要從以下幾個(gè)方面設(shè)定:(1)提交方式,可以是本人或版權(quán)持有者提交,也可以在版權(quán)持有者同意下由第三方提交,如科研論文可以由機(jī)構(gòu)科研管理部門統(tǒng)一整理提交;(2)學(xué)科要求,既然是藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫,提交的學(xué)科內(nèi)容必須與藥學(xué)相關(guān);(3)內(nèi)容要求,內(nèi)容必須完整、正確,研究數(shù)據(jù)需要隨文檔一并上傳,隨文的圖表需要單獨(dú)提供,如果提交內(nèi)容屬于一個(gè)研究合集,為確保用戶能夠全面了解提交內(nèi)容的完整研究情況,需要提交整個(gè)合集;(4)格式要求,一般會(huì)根據(jù)系統(tǒng)平臺(tái)的實(shí)際情況注明提交文檔的支持格式,筆者比較認(rèn)同密歇根大學(xué)機(jī)構(gòu)知識(shí)庫提交格式的做法,密歇根大學(xué)機(jī)構(gòu)知識(shí)庫對(duì)于提交內(nèi)容的格式給予分級(jí)支持,例如TIFF(.TIFF,.TIF)是“1級(jí)”格式,系統(tǒng)可以完全支持,MS Word(.doc)是“2級(jí)”,由于宏這樣的特性可能無法在版本之間進(jìn)行轉(zhuǎn)換,系統(tǒng)只能盡力支持,Windows Media Audio(.WMA)是“3級(jí)”,由于它與特定平臺(tái)的緊密聯(lián)系,系統(tǒng)建議使用mp3或wav格式,這種分級(jí)支持的方式清楚明晰地讓用戶知道哪些格式更容易與系統(tǒng)兼容,并且知道緣由;(5)空間要求,一般存儲(chǔ)空間值可由聯(lián)盟系統(tǒng)構(gòu)建部門確定,根據(jù)調(diào)研,可在250MB到10GB之間,超過一般存儲(chǔ)空間,可與管理員聯(lián)系,可能需要繳納一些過量存儲(chǔ)費(fèi);(6)元數(shù)據(jù)要求,系統(tǒng)可以自動(dòng)分配一些元數(shù)據(jù),例如URL、存儲(chǔ)日期、存儲(chǔ)人姓名、文件格式等,還可以由存儲(chǔ)人提供存儲(chǔ)資源的其他元數(shù)據(jù),如語種、標(biāo)題、摘要等。

        調(diào)研中共享政策主要涉及兩個(gè)許可證Non-Exclusive License[6]和Creative Commons license[7],即非排他性許可證與創(chuàng)作共用許可證。除此以外使用較多的還有創(chuàng)作共用署名許可證(CC BY)[8],以及該許可證下包含的次級(jí)許可,例如國際創(chuàng)作共用署名-相同方式共享許可證(CC BY-SA)[9]、國際創(chuàng)作共用署名-非商業(yè)許可證(CC BY-NC)[10]、國際創(chuàng)作共用署名-沒有衍生品許可證(CC BY-ND)[11]、國際創(chuàng)作共用署名-非商業(yè)沒有衍生品許可證(CC BY-NC-ND)[12]、國際創(chuàng)作共用署名-相同方式共享-非商業(yè)性授權(quán)許可證(CC BY-NC-SA)[13]等??墒褂玫脑S可協(xié)議還有Apache許可[14]、開放數(shù)據(jù)共享公共領(lǐng)域貢獻(xiàn)與許可協(xié)議(ODC PDDL)[15]、開放數(shù)據(jù)共享開放數(shù)據(jù)庫許可協(xié)議(ODC ODbL)[16]、BSD許可[17]、MIT許可[18]、GNU通用公共許可協(xié)議[19][20]等。每一種存儲(chǔ)的資源都要根據(jù)其具體版權(quán)狀態(tài),與資源的提供機(jī)構(gòu)或個(gè)人進(jìn)行協(xié)商,在充分尊重版權(quán)的前提下,使用合適的許可協(xié)議,最大限度地對(duì)外開放。

        3.4 資源建設(shè)及學(xué)科服務(wù)

        藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的資源建設(shè)主要限于藥學(xué)相關(guān)學(xué)科,建設(shè)途徑主要由聯(lián)盟學(xué)科委員會(huì)收集與學(xué)科用戶自存儲(chǔ):收集的途徑例如從機(jī)構(gòu)知識(shí)庫中整理出藥學(xué)相關(guān)資源如會(huì)議論文等,從醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院教學(xué)秘書或科研管理部門搜集本機(jī)構(gòu)科研產(chǎn)出的藥學(xué)學(xué)科資源如技術(shù)報(bào)告、工作文檔、學(xué)位論文、專利等,與出版社、期刊洽談發(fā)表后的學(xué)術(shù)資源的存儲(chǔ)與開放的方案;用戶自存儲(chǔ)途徑主要是依靠廣大師生、科研人員將自己的藥學(xué)學(xué)科相關(guān)資料,特別是一些灰色資源,例如課件、科研數(shù)據(jù)、手稿、圖像、視頻、音頻等存入聯(lián)盟平臺(tái),當(dāng)然對(duì)于用戶自存儲(chǔ)資源,聯(lián)盟的學(xué)科委員會(huì)需要對(duì)其學(xué)術(shù)質(zhì)量做好把控,以確保學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟中存儲(chǔ)與開放的學(xué)科資源的學(xué)術(shù)價(jià)值。此外,還可以將成員機(jī)構(gòu)的一些特色自建數(shù)據(jù)庫納入聯(lián)盟,例如中科院武漢病毒研究所的中國病毒資源基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫等,可大大提升學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟資源的學(xué)術(shù)水平。

        一般性學(xué)科服務(wù)主要體現(xiàn)在點(diǎn)擊、下載等使用量的統(tǒng)計(jì),科研數(shù)據(jù)保存與管理,郵件訂閱服務(wù)等個(gè)性化服務(wù),以及有關(guān)學(xué)科的參考咨詢服務(wù)等。但藥學(xué)是一個(gè)動(dòng)態(tài)的和跨學(xué)科的領(lǐng)域,既然構(gòu)建了藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟,就要充分的利用聯(lián)盟來推出更具學(xué)術(shù)價(jià)值、更能體現(xiàn)學(xué)科特性的學(xué)科服務(wù)。聯(lián)盟在促進(jìn)成員機(jī)構(gòu)間科研合作上有很大的施展空間,如跨機(jī)構(gòu)課題組的組建、課題組人員的招募、實(shí)驗(yàn)室等各部門的人員招聘都可以利用聯(lián)盟平臺(tái)發(fā)布,以及科研項(xiàng)目周期內(nèi)產(chǎn)生的科研數(shù)據(jù)、科研成果也可以在聯(lián)盟平臺(tái)實(shí)現(xiàn)共享,既可以節(jié)約科研成本,提高科研效率,又可以大大促進(jìn)聯(lián)盟機(jī)構(gòu)間的科研交流與人才置換。

        除此以外,聯(lián)盟還可以對(duì)成員機(jī)構(gòu)中主要科研人員的科研方向做分析,如麻省理工學(xué)院的Buchwald, Stephen L.和Trout, Bernhardt L.在有機(jī)化學(xué)、物理化學(xué)、藥理學(xué)、藥劑學(xué)等方面的研究較為擅長;密歇根大學(xué)的Schwendeman, Steven P.對(duì)藥理學(xué)、化學(xué)、制藥工程等方面的研究較為擅長;耶魯大學(xué)的Strittmatter, Stephen M.對(duì)細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)與分子生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)都有研究。因此利用聯(lián)盟平臺(tái),科研人員可以根據(jù)各自的研究方向和科研需求,組建跨機(jī)構(gòu)的科研團(tuán)隊(duì),還可以根據(jù)前文2.4中提到的利用Citespace軟件篩選出的論文高頻關(guān)鍵詞探索新的研究熱點(diǎn)與創(chuàng)新點(diǎn)。同時(shí)也有利于想要跟隨這些導(dǎo)師做碩、博士的學(xué)生了解導(dǎo)師的研究方向與研究主題,或根據(jù)自己喜好的研究方向與研究主題選擇合適的導(dǎo)師,逐步將聯(lián)盟打造成一個(gè)藥學(xué)學(xué)科內(nèi)學(xué)科交流的理想平臺(tái)。

        4 結(jié)語

        本文以藥學(xué)學(xué)科為例,利用Citespace軟件構(gòu)建知識(shí)圖譜,從發(fā)文國家、機(jī)構(gòu)、年份、科研人員、研究熱點(diǎn)等方面進(jìn)行知識(shí)挖掘,從而優(yōu)選出構(gòu)建國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的機(jī)構(gòu)。再根據(jù)軟件分析的結(jié)果,對(duì)優(yōu)選出的機(jī)構(gòu)是否已構(gòu)建機(jī)構(gòu)知識(shí)庫或?qū)W科知識(shí)庫的情況進(jìn)行調(diào)研,并根據(jù)優(yōu)選成員機(jī)構(gòu)的實(shí)際情況確定國際藥學(xué)學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的聯(lián)盟模式、運(yùn)營方式、資金來源、存儲(chǔ)政策、共享政策、資源建設(shè)與學(xué)科服務(wù)等具體構(gòu)建策略。這種方法不僅適用于藥學(xué)學(xué)科,其他學(xué)科也可以借鑒使用。當(dāng)然,本論文只是提供了一種優(yōu)化學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟構(gòu)建的研究方法的初步探索,可能還存在一些缺陷與問題,本團(tuán)隊(duì)也會(huì)對(duì)這些成員機(jī)構(gòu)構(gòu)建學(xué)科知識(shí)庫聯(lián)盟的實(shí)踐進(jìn)行調(diào)研,探究聯(lián)盟構(gòu)建過程中實(shí)際存在的阻滯因素和問題,不斷修正研究方法。

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