高 云 謝小兵
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD),是一種嚴(yán)重危害人類(lèi)健康的常見(jiàn)的以持續(xù)性氣流受限為特征的呼吸系統(tǒng)疾病之一,具有較高的致殘率和致死率。隨著環(huán)境污染日益加重,人口老齡化的加速和吸煙人數(shù)的增多,COPD的發(fā)病率和病死率正逐年增高。目前認(rèn)為COPD的發(fā)生發(fā)展可能與環(huán)境因素、遺傳因素和個(gè)體易感因素相關(guān),且發(fā)病機(jī)制在不同的基因和不同的環(huán)境因素及不同種族人群的COPD患者中不同[1-2],流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn)COPD具有家族聚集傾向和種族地域差異性[3]。有關(guān)其發(fā)病的確切機(jī)制目前尚未完全明了,公認(rèn)的機(jī)制包括炎癥反應(yīng)機(jī)制、氧化/抗氧化失衡,蛋白酶/抗蛋白酶失衡機(jī)制等,其中炎癥過(guò)程是目前公認(rèn)的主要致病機(jī)制[4]。
近年來(lái)有研究發(fā)現(xiàn)腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor,TNF-α)在COPD患者的痰液及血液中均能檢測(cè)出其水平增高[5],是導(dǎo)致COPD、肺實(shí)質(zhì)受損及慢性炎癥損傷的細(xì)胞因子在COPD的發(fā)病過(guò)程中起著重要作用[6]。TNF-α的基因序列分析顯示,在啟動(dòng)子-308位點(diǎn)存在多態(tài)性,該位點(diǎn)多態(tài)性對(duì)TNF基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)有一定的影響[7]。目前對(duì)COPD與TNF-α-308基因多態(tài)性的相關(guān)性研究結(jié)論不一,有研究發(fā)現(xiàn)[8-9],TNF-α-308與亞洲患COPD的人群存在相關(guān)性,但與高加索地區(qū)患COPD的人群無(wú)相關(guān)性。這些研究提示COPD的易感性與TNF-α-308基因的多態(tài)性在不同人群中的作用機(jī)制可能不同。因此,本研究通過(guò)分析新疆維吾爾族、哈薩克族COPD組與對(duì)照組TNF-α-308位點(diǎn)基因型的分布特點(diǎn),來(lái)探討該基因的多態(tài)性與新疆維吾爾族、哈薩克族人群COPD易感性的關(guān)系。
1.研究對(duì)象 選擇2014年1月至2016年1月,在我院老年醫(yī)學(xué)中心一病區(qū)住院治療的維吾爾族及哈薩克族COPD患者各80例為病例組,診斷均符合《慢性阻塞性肺疾病診治指南(2013年修訂版)》的標(biāo)準(zhǔn)[10],同時(shí)選擇于我院體檢的維吾爾族及哈薩克族健康體檢者各80例為對(duì)照組,其中維吾爾族健康對(duì)照組中男性48例;女性32例,哈薩克族男性51例,女性29例;平均年齡分別為(55.2±6.7)歲、(54.3±8.1)歲。病例組:維吾爾族COPD患者平均年齡(52.3±6.4)歲;男性43例,女性37例;哈薩克族COPD患者平均年齡(53.7±5.8)歲;男性39例,女性41例。以上四組在年齡、性別,BMI及吸煙指數(shù)等一般資料的比較,均差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性,且入選對(duì)象均為無(wú)血緣關(guān)系的人群。所有入選患者及健康志愿者均知情同意,并簽署知情同意書(shū)。
(1)納入標(biāo)準(zhǔn) 病例組:診斷均符合中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)會(huì)2013年制定的《慢性阻塞性肺病診治指南》修訂版[10]中COPD的診斷標(biāo)準(zhǔn):即規(guī)定吸入支氣管擴(kuò)張劑后第一秒用力呼氣容積(FEV1)/用力肺活量(FVC)<70%,且FEV1小于預(yù)計(jì)值的80%,F(xiàn)EV1預(yù)計(jì)值增加≤12%,同時(shí)伴有COPD的臨床癥狀如氣促、氣喘、慢性氣道阻塞。對(duì)照組:均符合以下條件:胸X線片或胸部CT正常;且肺功能符合以下指標(biāo):FEV1/FVC>70%,且FEV1大于預(yù)計(jì)值的80%。病例組及對(duì)照組各研究對(duì)象均為長(zhǎng)期居住在新疆地區(qū)且無(wú)血緣關(guān)系及無(wú)無(wú)異族通婚史的人群。
(2)排除標(biāo)準(zhǔn) ①合并有嚴(yán)重支氣管哮喘、支氣管擴(kuò)張疾病及其他部位感染等全身炎癥反應(yīng)性疾??;②合并有嚴(yán)重的糖尿病、心、肝、腎、血管疾??;③合并有肺間質(zhì)纖維化、肺結(jié)核、肺癌等其他影響肺功能的疾??;④腫瘤、神經(jīng)系統(tǒng)疾病以及自身免疫性疾病;⑤精神病患者;⑥近期使用免疫抑制劑、糖皮質(zhì)激素、非甾體類(lèi)抗炎藥物者;⑦近期外科手術(shù)史。
2.標(biāo)本的采集與保存 對(duì)所有參與此次研究的病例組及健康對(duì)照組成員在清晨空腹使用真空負(fù)壓EDTA-K2抗凝管采集肘靜脈血標(biāo)本5mL,將抗凝管上下輕輕顛倒使血液與抗凝劑充分混勻,標(biāo)寫(xiě)編號(hào),-20℃低溫冰箱保存?zhèn)溆茫NA。
3.主要試劑 人外周血基因組DNA提取試劑盒(大連寶生物有限公司);DNA Marker(北京百泰克生物技術(shù)有限公司);瓊脂糖(西班牙Sigma公司);5×TBE電泳緩沖液(上海生工生物工程有限公司);2×TapPCR Master Mix(北京天根生化科技有限公司);DNA快速純化/回收試劑盒(北京天根生化科技有限公司);限制性?xún)?nèi)切酶Ear1(北京天根生化科技有限公司);無(wú)水乙醇(西安浦化學(xué)試劑有限公司),6×Loading Buffer緩沖液(北京百泰克生物技術(shù)有限公司)。
圖1 TNF-α-308位點(diǎn)酶切結(jié)果 A:AA 基因型:134bp;B:GA基因型:134bp、87bp、 20bp;C:GG 基因型:87bp和20bp,注:M:Marker帶
圖2 TNF-α-308位點(diǎn)測(cè)序結(jié)果 A:野生型純合子GG型;B:突變 型雜合子GA型;C:突變型純合子AA型
4.主要儀器 低溫高速離心機(jī)(Heraeus公司,德國(guó)),1000型PCR擴(kuò)增儀和GelDoc2000凝膠成像儀(Bio-Rad公司,美國(guó)),F(xiàn)R-250型電泳儀(上海復(fù)日科技有限公司),KDB-80型水浴箱(重慶實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司),Eppendorf移液器(德國(guó))。
5. 引物的設(shè)計(jì)與合成 參照Sakao S[11]等設(shè)計(jì)的TNF-α-308位點(diǎn)的引物,引物由大連寶生物工程有限公司合成。上游引物序列為5′-AGGCAATAGGTTTTGAGGGCCAT-3′,下游引物序列為5′-GAGCGT CTGCTGGCTGGGTG -3′。
6.基因組DNA提取 按照說(shuō)明書(shū)應(yīng)用血液基因組DNA提取試劑盒提取,將血液樣本取出,室溫下解凍,然后將全血顛倒混勻后,用移液器吸取3mL全血至無(wú)菌離心管內(nèi)加入細(xì)胞裂解液,使其充分與血液混勻后10 000r/min離心5min,棄上清液重復(fù)上述步驟1~2次后向每個(gè)離心管內(nèi)加入異丙醇進(jìn)行充分顛倒混勻直至出現(xiàn)白色絮狀物(即DNA)。
7.采用PCR法檢測(cè)樣本DNA PCR總反應(yīng)體系30μL,DNA模板3μL,10×Buffer 5μL,上游下游引物各3μL, Taq DNA聚合酶10μL,無(wú)菌去離子水補(bǔ)足至總反應(yīng)體系30μL。PCR反應(yīng)的擴(kuò)增條件為:95℃,5min,預(yù)變性5min,共35個(gè)循環(huán),其中95℃,變性30s,63℃,退火40s,72℃,延伸60s,末次延伸72℃,10min終止反應(yīng),4℃保存。用2%的瓊脂糖凝膠對(duì)PCR產(chǎn)物擴(kuò)增片段進(jìn)行電泳檢測(cè),在凝膠電泳成像儀下觀察樣品擴(kuò)增的情況。
為進(jìn)一步驗(yàn)證PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的基因型,隨機(jī)選取純化后的三種基因型PCR擴(kuò)增產(chǎn)物送往北京六合華大基因科技股份有限公司進(jìn)行基因序列分析,。
8.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPASS17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析。對(duì)各組間基因型和基因頻率數(shù)進(jìn)行采用χ2檢驗(yàn); Hardy- Weinberg遺傳平衡定律的吻合度檢驗(yàn)采用χ2檢驗(yàn);計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,各組間數(shù)據(jù)的比較采用t檢驗(yàn);采用多因素Logistic回歸分析,計(jì)算OR和95%可信區(qū)間用來(lái)檢測(cè)TNF-α-308位點(diǎn)基因多態(tài)性和COPD的相關(guān)性。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
1.TNF-α-308位點(diǎn)限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性聚合酶鏈反應(yīng)基因分型 基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物被限制性?xún)?nèi)切酶處理后,經(jīng)檢驗(yàn)擴(kuò)增良好,無(wú)非特異性擴(kuò)增,擴(kuò)增片段大小與實(shí)際相符,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)發(fā)現(xiàn)TNF-α-308存在以下3種基因型:GG、GA、AA,其中GG為野生型純合子,片段長(zhǎng)度為87bp和20bp,GA為突變型雜合子,片段長(zhǎng)度為134bp、87bp和20bp,AA為突變型純合子,片段長(zhǎng)度為134bp。見(jiàn)圖1。
2.TNF-α-308測(cè)序結(jié)果及基因型的判定 采用反向測(cè)序法進(jìn)行檢測(cè),通過(guò)對(duì)測(cè)序圖進(jìn)行分析,測(cè)序結(jié)果顯示,TNF-α-308位點(diǎn)存在3種基因型:GG、GA和AA,測(cè)序結(jié)果見(jiàn)圖2。
3.哈迪-溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡吻合度檢驗(yàn) 根據(jù)基因測(cè)序結(jié)果,通過(guò)卡方檢驗(yàn)分別統(tǒng)計(jì)實(shí)驗(yàn)個(gè)體中TNF-α-308位點(diǎn)的3種基因型:GG、GA和AA,結(jié)果顯示各組TNF-α -308位點(diǎn)的基因型符合Hardy- Weinberg基因型遺傳平衡定律(P>0.05),說(shuō)明樣本具有群體代表性,可以反映兩民族人群基因的整體分布情況。
表1 兩民族間TNF-α-308位點(diǎn)基因型和等位基因頻率分布的比較[n(%)]
表2 兩民族間TNF-α-308位點(diǎn)的基因型及等位基因與COPD易感性的關(guān)系[n(%)]
4.兩個(gè)民族TNF-α-308位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率分布的比較 新疆維吾爾族和哈薩克族的COPD組和對(duì)照組中,TNF-α-308位點(diǎn)均以GG基因型及G等位基因多見(jiàn),兩組比較COPD組的AG基因型、AA基因型和A等位基因均高于對(duì)照組,且兩組間的基因型及等位基因頻率的分布,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)表1。
5.TNF-α-308位點(diǎn)的基因型及等位基因與COPD易感性的關(guān)系 通過(guò)Logistic 回歸分析,以研究對(duì)象是否患COPD為因變量,以年齡、性別、三種基因型為協(xié)變量,調(diào)整年齡、性別后進(jìn)一步分析結(jié)果顯示:維吾爾族和哈薩克族COPD組AG基因型(46.3%,35%)、AA基因型(10%,6.3%)及A等位基因頻率(30%,25.6%)均高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.001,OR=0.149,95%CI=0.041~0.375;P=0.001,OR=0.158,95%CI=0.079~0.389;P=0.001,OR=0.107,95%CI=0.012~0.821;P=0.013,OR=0.357,95%CI=0.054~2.121;P=0.015,OR=0.323,95%CI=0.132~0.807;P=0.015,OR=0.343,95%CI=0.189~0.821),提示攜帶AG和AA基因型的患者COPD發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加,A等位基因可能是COPD發(fā)病的危險(xiǎn)因素,見(jiàn)表2。
COPD 是一種由多個(gè)易感基因參與的復(fù)雜疾病,氣流受限不完全可逆且呈進(jìn)行性的發(fā)展,受外部環(huán)境、宿主自身等因素的聯(lián)合作用在肺的不同部位,激活中性粒細(xì)胞、肺泡巨噬細(xì)胞和T 細(xì)胞等產(chǎn)生炎癥反應(yīng),從而加重COPD 的發(fā)生[10],且不同的基因以及不同的環(huán)境因素,在不同COPD 患者人群中的發(fā)病機(jī)制不同[12]。研究發(fā)現(xiàn)其遺傳方式是每個(gè)基因只發(fā)揮一部分作用,并不是單個(gè)主基因發(fā)揮作用這不符合單基因遺傳方式,這提示COPD 的發(fā)病具有一定的遺傳性,目前已發(fā)現(xiàn)有多種基因與COPD 的易感性有關(guān),并且在地域及種族方面存在著差異,因此有必要進(jìn)一步了解多種遺傳因素的作用機(jī)制及其在COPD發(fā)展中的作用,為COPD的預(yù)防和診療工作提供理論依據(jù)。
COPD 是以氣道、肺血管和肺實(shí)質(zhì)的慢性炎癥為其主要的病理特點(diǎn),炎癥反應(yīng)導(dǎo)致小氣道、肺泡壁及肺結(jié)締組織損傷,最終導(dǎo)致COPD 的發(fā)生。COPD 患者肺內(nèi)被激活的炎癥細(xì)胞可釋放多種炎癥因子,包括TNF-α、白三烯、白介素等,這些炎癥因子可增強(qiáng)炎癥細(xì)胞的炎癥反應(yīng),從而使肺組織結(jié)構(gòu)進(jìn)一步破壞,因此COPD 發(fā)病中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)是氣道炎癥[3]。TNF-α 是一個(gè)多功能的細(xì)胞因子,具有多種功能和廣泛的生物學(xué)特性,由巨噬細(xì)胞和單核細(xì)胞產(chǎn)生,它能夠改變平滑肌細(xì)胞的功能,從而促進(jìn)氣道重構(gòu),參與調(diào)節(jié)肺部炎癥,因此被認(rèn)為在慢性肺疾病發(fā)病過(guò)程中起重要作用。TNF-α影響肺功能的可能機(jī)制如下:①TNF-α可增強(qiáng)炎癥細(xì)胞的黏著、趨化及侵潤(rùn)過(guò)程,使脂類(lèi)介質(zhì)、活性氧自由基及細(xì)胞因子等釋放增多,是重要的炎癥反應(yīng)介質(zhì);②可能使血管內(nèi)皮細(xì)胞的通透性增加,使毛細(xì)血管滲漏,使肺嚴(yán)重?fù)p傷,從而使肺功能下降;③TNF-α還能誘導(dǎo)黏附因子的合成與釋放,造成組織纖維增生,進(jìn)而使氣道重塑肺功能受損加重。TNF-α的基因多態(tài)性與它的功能相關(guān),基因啟動(dòng)子區(qū)的多態(tài)性可能會(huì)影響其轉(zhuǎn)錄水平[13]。由于TNF-α基因啟動(dòng)子區(qū)-308 位點(diǎn)G/A 突變能顯著影響TNF-α基因的表達(dá)水平,提示TNF -α基因-308多態(tài)性在COPD 的發(fā)病過(guò)程中起重要作用。
相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)[14],TNF-α基因的腺嘌呤(A)/鳥(niǎo)嘌呤(G)在-308 位點(diǎn)上有轉(zhuǎn)換,當(dāng)脂多糖刺激時(shí)A 等位基因的雜合子個(gè)體,產(chǎn)生的TNF-α較GG 基因型多。Sakao等[11]用PCR 技術(shù)檢測(cè)日本群體中對(duì)照組和COPD 組的血淋巴細(xì)胞基因DNA,發(fā)現(xiàn)TNF-α基因型在兩者間有明顯不同,且-308位點(diǎn)AA 純合子和GA 雜合子基因型都使COPD 的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加。而在白種人群中的研究沒(méi)有發(fā)現(xiàn)兩組之間的基因型有差異[15]。國(guó)內(nèi)對(duì)TNF-α-308與COPD的相關(guān)性研究發(fā)現(xiàn)[16-17],TNF-α-308位點(diǎn)的多態(tài)性與亞洲人群COPD的發(fā)病相關(guān),漢族人群在排除了年齡、性別、吸煙等因素對(duì)實(shí)驗(yàn)的影響外,TNF-α-308等位基因與COPD患者的易感性存在相關(guān)性。而龔燕等[18]在漢族人中的研究結(jié)果顯示,該基因位點(diǎn)的多態(tài)性與COPD的易感性無(wú)關(guān)。王妨娥、吳水淼等[19-20],在對(duì)新疆維吾爾族和哈薩克族TNF-α-308位點(diǎn)基因多態(tài)性與COPD易感性的研究中發(fā)現(xiàn),TNF-α-308位點(diǎn)的基因型和等位基因的頻率在COPD組和對(duì)照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,TNF-α-A等位基因可能是COPD的危險(xiǎn)因素。目前有關(guān)COPD 與TNF-α基因-308 多態(tài)性的相關(guān)性研究中,其分析結(jié)果在不同的種族并不一致,因此有必要繼續(xù)對(duì)其他種族 TNF-α-308位點(diǎn)的基因多態(tài)性與COPD的相關(guān)性做進(jìn)一步的研究,以確定該位點(diǎn)的基因多態(tài)性在COPD 發(fā)生發(fā)展中的作用。
本研究中各組基因型的分布,根據(jù)基因測(cè)序的結(jié)果分別統(tǒng)計(jì)TNF-α-308位點(diǎn)的3種基因型:GG、GA和AA結(jié)果顯示,各組TNF-α -308位點(diǎn)的基因型符合Hardy- Weinberg基因型遺傳平衡定律(P>0.05),說(shuō)明樣本具有群體代表性,可以反映維、哈兩民族人群基因的整體分布情況。我們通過(guò)對(duì)新疆維、哈兩民族TNF-α-308位點(diǎn)基因型和等位基因頻率的分布進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),兩組均以G等位基因及野生純合GG基因型多見(jiàn),研究結(jié)果顯示COPD組的AG基因型、AA基因型和A等位基因均高于對(duì)照組,且兩組間的基因型及等位基因頻率的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),TNF-α -308位點(diǎn)的A等位基因可能是新疆維吾爾族和哈薩克族COPD發(fā)病的高危因素,而攜帶A等位基因及AG和AA基因型的患者發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相應(yīng)增加,提示TNF-α-308位點(diǎn)基因的多態(tài)性與新疆維、哈兩民族COPD的易感性相關(guān)。本研究結(jié)果與文獻(xiàn)[21-22]相似,進(jìn)一步說(shuō)明TNF-α- 308位點(diǎn)基因多態(tài)性與COPD發(fā)病存在明顯的相關(guān)性。
綜上所述,TNF-α-308位點(diǎn)相關(guān)的基因型及等位基因頻率可以作為遺傳性標(biāo)記在臨床上進(jìn)行檢測(cè),用于早期發(fā)現(xiàn)維吾爾族及哈薩克族COPD易感的高危人群,對(duì)于預(yù)防COPD的發(fā)展有著重要的意義,由于COPD在不同的種族及人群中的易感性,可能存在一定的差異,而且COPD是一種比較復(fù)雜的多基因遺傳性疾病,因此我們需要進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量在后續(xù)的研究中,為最終揭示遺傳因素如何影響COPD 發(fā)生、發(fā)展的具體作用機(jī)制的進(jìn)一步深入研究提供理論依據(jù)。