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        新型熒光納米材料在核酸和蛋白質(zhì)檢測(cè)中的應(yīng)用

        2018-10-26 12:05:38陳朝會(huì)張正濤蘇魯方
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        陳朝會(huì),張正濤,蘇魯方

        (江漢大學(xué) 交叉學(xué)科研究院,湖北 武漢 430056)

        0 引言

        21世紀(jì),隨著人們生活水平的進(jìn)一步提高,對(duì)疾病的早期診斷提出了更高的要求,而核酸、蛋白質(zhì)和微量元素的變化在一定程度上可以反映某些疾病的早期病變,例如:癌胚抗原超過20 μg∕L時(shí)往往提示有消化道腫瘤,70%~95%的原發(fā)性肝癌患者血清中AFP高達(dá)250 μg∕mL~6 mg∕mL,因此,分子生物水平上的早期診斷成為疾病檢測(cè)的趨勢(shì)。分子生物水平上的診斷包括核酸和蛋白質(zhì)檢測(cè)。核酸是生物體內(nèi)重要的遺傳信息載體,在生命活動(dòng)中起著存儲(chǔ)和傳遞遺傳信息的作用,決定著生物體的生長(zhǎng)、遺傳和變異等一系列重大的生命現(xiàn)象。核酸突變或缺失等都將導(dǎo)致疾病的發(fā)生。如鐮刀形紅細(xì)胞貧血癥是珠蛋白β基因的點(diǎn)突變引起的;白化病是酪氨酸酶基因缺失引起的黑色素缺乏或合成障礙所導(dǎo)致的。蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的基礎(chǔ),許多重要的生命現(xiàn)象和生理活動(dòng)都是通過蛋白質(zhì)實(shí)現(xiàn)。蛋白質(zhì)含量的變化與疾病息息相關(guān),因此許多疾病相關(guān)蛋白的檢測(cè)在病理學(xué)、基因組學(xué)等方面有重要的參考價(jià)值。如葉酸受體是一種與腫瘤相關(guān)的跨膜單鏈糖蛋白,該蛋白在人體的很多腫瘤細(xì)胞,如卵巢癌、脈絡(luò)叢癌、室管膜癌等中過度表達(dá),但是在正常細(xì)胞中卻很少表達(dá),甚至不表達(dá)。葉酸受體的檢測(cè)可以為疾病診斷提供許多有價(jià)值的信息。

        目前常用檢測(cè)核酸和蛋白質(zhì)的方法有循環(huán)伏安法、電致化學(xué)發(fā)光法、紫外-可見分光光度法(比色法)、質(zhì)譜法、熒光分光光度法等。電分析法簡(jiǎn)單快速,但是電極修飾過程繁瑣,并且需要一定的電化學(xué)基礎(chǔ);化學(xué)發(fā)光法線性范圍寬,反應(yīng)快且不需要光源,但是應(yīng)用對(duì)象受限、不容易建立均相體系;比色法儀器簡(jiǎn)單、直觀性強(qiáng),但是其靈敏度有待進(jìn)一步提高;質(zhì)譜法則需要借助昂貴的儀器。熒光分光光度法因其靈敏度高,適用范圍廣,操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn)被廣泛應(yīng)用于核酸、蛋白質(zhì)和細(xì)胞等的檢測(cè)。同時(shí),納米科技的快速發(fā)展,為熒光分析法提供了更廣闊的發(fā)展空間。本文主要介紹新型納米熒光材料在核酸及蛋白質(zhì)檢測(cè)中的應(yīng)用。

        1 量子點(diǎn)在核酸及蛋白檢測(cè)中的應(yīng)用

        1.1 傳統(tǒng)量子點(diǎn)

        量子點(diǎn)(quantum dot,QD)是一種三維受限的準(zhǔn)零維納米材料,其直徑范圍為1~100 nm,當(dāng)其尺寸小于或等于其玻爾半徑時(shí),在外界激發(fā)下可以發(fā)射熒光。量子點(diǎn)一般由II-VI族元素(如CdS、CdSe、CdTe、ZnSe、ZnS等)[1]、III-V族元素(如InP、InAs等)或IV-VI族元素(如PbS、PbSe)[2]的半導(dǎo)體材料構(gòu)成,也可由兩種或兩種以上的半導(dǎo)體材料構(gòu)成核∕殼結(jié)構(gòu)(如CdSe∕ZnS核∕殼結(jié)構(gòu)量子點(diǎn)等),廣義上的量子點(diǎn)還包括硅點(diǎn)和碳點(diǎn)。與傳統(tǒng)有機(jī)熒光染料相比,量子點(diǎn)具有量子產(chǎn)率高、Stockes位移大、抗光漂、一元激發(fā)、多元發(fā)射等優(yōu)點(diǎn),這使其在核酸和蛋白檢測(cè)中具有廣泛的應(yīng)用前景[3-4]。

        ZHANG等[5]合成硫代磷酸功能化的DNA量子點(diǎn),利用合成序列中的識(shí)別部分與特定的乙肝病毒序列形成雙鏈前后的熒光強(qiáng)度變化,構(gòu)建了基于DNA功能化量子點(diǎn)的核酸傳感器。ENKIN等[6]利用BHQ與DNA功能化納米銀簇之間的熒光共振能量轉(zhuǎn)移效應(yīng)(fluorescence resonance energy transfer,FRET),結(jié)合鏈置換反應(yīng),構(gòu)建了多個(gè)目標(biāo)序列的同時(shí)檢測(cè)平臺(tái)。為拓展量子點(diǎn)的應(yīng)用,CHEN等[7]基于N-乙酰半胱氨酸包裹的CdTe量子點(diǎn)和釕的配合物之間的光誘導(dǎo)電子轉(zhuǎn)移效應(yīng),建立雙色檢測(cè)蛋白質(zhì)的分析方法。ZHANG等[8]利用一步法合成的DNA功能化無鎘量子點(diǎn)與二硫化鎢之間的共振能量轉(zhuǎn)移作用,結(jié)合小分子末端保護(hù)技術(shù),建立了高靈敏、高選擇性的蛋白質(zhì)檢測(cè)法。MA等[9]利用不同蛋白質(zhì)對(duì)雙色巰基乙酸(TGA)封端的CdTe量子點(diǎn)的光誘導(dǎo)自組裝及量子點(diǎn)的熒光信號(hào)(顏色和強(qiáng)度)的影響,建立雙通道熒光傳感器以同時(shí)區(qū)分多種蛋白質(zhì)。

        在過去20年中,量子點(diǎn)可調(diào)諧的熒光性質(zhì)讓其成為熒光傳感研究中的明星材料。但是隨著研究的繼續(xù)深入,其潛在毒性也不可避免地暴露出來,因此需要尋求新型無毒納米材料。

        1.2 硅點(diǎn)

        熒光硅量子點(diǎn)(silica nanoparticles,SiNPs)作為一種典型的間接帶隙半導(dǎo)體納米材料,具有獨(dú)特的發(fā)光性能,當(dāng)其半徑小于或接近激子波爾半徑(硅的波爾半徑小于5 nm)時(shí)會(huì)產(chǎn)生量子限域效應(yīng)。硅量子點(diǎn)的量子限域效應(yīng)增加了其直接帶隙躍遷的輻射復(fù)合,進(jìn)而增加發(fā)光效率且使發(fā)光峰位置移向高能區(qū),表現(xiàn)出其發(fā)光波長(zhǎng)受核尺寸控制的特性,而且隨著量子點(diǎn)尺寸的減小,其發(fā)射波長(zhǎng)藍(lán)移。此外,與傳統(tǒng)含重金屬Cd量子點(diǎn)相比,硅量子點(diǎn)具有獨(dú)特的光學(xué)性能、良好的生物相容性及無毒的特性,這些優(yōu)勢(shì)使得其在生物醫(yī)學(xué)方面呈現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景[10-12]。

        SU等[13]利用硅量子點(diǎn)作載體,將硫醇功能化且修飾有熒光染料的DNA與帶有烯烴鏈端的硅量子點(diǎn)進(jìn)行偶聯(lián),制備了DNA功能化的硅量子點(diǎn),加入目標(biāo)MicroRNA-21后,MicroRNA-21與偶聯(lián)的DNA可形成更穩(wěn)定的DNA∕RNA復(fù)合物,使猝滅劑鏈被置換出來,體系熒光回升。通過監(jiān)測(cè)熒光強(qiáng)度,可實(shí)現(xiàn)目標(biāo)核酸的定量檢測(cè)(圖1)。在熒光共振能量轉(zhuǎn)移過程中,硅量子點(diǎn)常被用作供體,如KIM等[12]利用量子點(diǎn)作供體,金納米棒作受體,結(jié)合抗原抗體特異性作用,建立結(jié)核分枝桿菌Ag85B抗原的高選擇性測(cè)定法;CHENG等[14]基于硅量子點(diǎn)與有機(jī)染料之間的熒光共振能量轉(zhuǎn)移,利用蛋白酶切割肽鏈阻斷共振能量轉(zhuǎn)移的發(fā)生構(gòu)建了蛋白酶?jìng)鞲衅鳌?/p>

        圖1 硅點(diǎn)合成及檢測(cè)MicroRNA-21示意圖Fig.1 Two-step synthesis of SiNP ODN conjugates and derection of MicroRNA-21

        1.3 碳點(diǎn)

        碳點(diǎn)(Carbon nanodots,C-dots)是由分散的類球狀碳顆粒組成,是一種新型的碳基零維納米材料。碳點(diǎn)具有水溶性好、低毒、原料來源廣、成本低、生物相容性好等諸多優(yōu)點(diǎn),因此它的出現(xiàn)引起了研究者廣泛的關(guān)注,常被用來構(gòu)建核酸和蛋白質(zhì)的生物傳感器[15-17]。LOO等[18]基于單雙鏈DNA與羧基化碳點(diǎn)之間作用力不同及羧基化碳點(diǎn)對(duì)染料的猝滅,建立了均相檢測(cè)核酸的方法。XU等[19]以適配體功能化的碳點(diǎn)為熒光信號(hào),利用目標(biāo)蛋白質(zhì)與適配體特異性作用,構(gòu)建了檢測(cè)凝血酶的傳感器。該方法需要通過離心除去沒結(jié)合目標(biāo)蛋白的DNA,使檢測(cè)步驟復(fù)雜化。為此,ZHANG等[20]基于Mn摻雜ZnS量子點(diǎn)與碳點(diǎn)之間的磷光能量轉(zhuǎn)移效應(yīng),建立了簡(jiǎn)單、快速檢測(cè)凝血酶的方法(圖2)。基本原理如下:設(shè)計(jì)適配子修飾的量子點(diǎn),沒有目標(biāo)蛋白存在時(shí),碳點(diǎn)與適配子之間的π-π相互作用使之靠近Mn摻雜ZnS量子點(diǎn)并發(fā)生磷光能量轉(zhuǎn)移,此時(shí)體系沒有熒光;加入目標(biāo)蛋白后,蛋白與適配子結(jié)合,π-π堆積相互作用的消失,碳點(diǎn)遠(yuǎn)離ZnS量子點(diǎn),磷光能量轉(zhuǎn)移過程被抑制,ZnS量子點(diǎn)的磷光恢復(fù)。

        圖2 基于Mn摻雜ZnS量子點(diǎn)與碳點(diǎn)之間的磷光能量轉(zhuǎn)移效應(yīng)檢測(cè)凝血酶示意圖Fig.2 Thrombin detection based on phosphorescence energy transfer effect between Mn doping ZnS quantum dot and carbon dot

        半導(dǎo)體量子點(diǎn)熒光量子產(chǎn)率高、生物相容性好,但是其表面改性及功能化操作復(fù)雜,這在一定程度上限制了其應(yīng)用。

        2 金屬納米簇在核酸和蛋白質(zhì)檢測(cè)中的應(yīng)用

        2.1 金簇

        金屬納米簇是由幾個(gè)至幾百個(gè)金屬原子組成的新型熒光納米材料,其直徑一般小于3 nm。與半導(dǎo)體量子點(diǎn)和有機(jī)染料相比,金屬納米簇具有尺寸小、無毒、良好的生物相容性以及在鹽溶液中穩(wěn)定性高等優(yōu)點(diǎn)[21]。常見的金屬納米簇有金簇、銀簇、銅簇等[22-23]。其中,金納米簇(Au nanoclusters,AuNCs)由于合成簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)在生物醫(yī)學(xué)檢測(cè)中有著廣泛的應(yīng)用[24-25]。

        XIE等[21]以牛血清白蛋白為穩(wěn)定劑和還原劑,利用堿性條件下牛血清白蛋白上的酪氨酸殘基還原氯金酸,制備牛血清白蛋白包裹的熒光金簇。在此基礎(chǔ)上,LI等[26]利用變性牛血清白蛋白(denatured bovine serum albumin,dBSA)合成的水溶性金簇為熒光信號(hào),基于S-乙酰硫代膽堿碘化物水解產(chǎn)物硫代膽堿對(duì)dBSA-AuNCs的猝滅作用,建立了無需染料標(biāo)記的乙酰膽堿酯酶活性檢測(cè)方法(圖3)。該方法原理如下:在乙酰膽堿酯酶存在的條件下,其底物S-乙酰硫代膽堿碘化物水解產(chǎn)生硫代膽堿,硫代膽堿分子中硫醇基與dBSA-AuNCs結(jié)合,使金簇的熒光發(fā)生猝滅;沒有目標(biāo)物存在時(shí),S-乙酰硫代膽堿碘化物水解反應(yīng)不能發(fā)生,dBSA-AuNCs熒光強(qiáng)度不變。但是由于難于在金簇上修飾核酸和蛋白質(zhì),這使得金簇的應(yīng)用大大受限。

        圖3 變性牛血清白蛋白指導(dǎo)的熒光金簇的合成及乙酰膽堿酯酶活性檢測(cè)示意圖Fig.3 Schematic of dBSA-directed synthesis of fluorescent Au clusters and detection of AChE activity

        2.2 銀簇

        DNA功能化的銀納米簇因其易于合成及功能化、較小的粒徑和毒性[27-30]、好的生物相容性等優(yōu)點(diǎn)受到了研究者的青睞。2004年,DICKSON等[27]首次發(fā)現(xiàn)富含胞嘧啶的DNA序列可用于納米熒光銀簇的合成,該發(fā)現(xiàn)建立了納米團(tuán)簇和DNA分子之間的連接,為后期DNA功能化銀簇的生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。在此基礎(chǔ)上,通過對(duì)比不同序列合成的銀團(tuán)簇的發(fā)射波長(zhǎng),實(shí)現(xiàn)了堿基序列對(duì)銀團(tuán)簇的發(fā)射波長(zhǎng)調(diào)控[31]。基于銀簇的熒光性質(zhì)及依賴序列合成的特點(diǎn),研究者們構(gòu)建了一系列檢測(cè)蛋白質(zhì)[32-35]、細(xì)胞[36-38]等的傳感器。2013年,WANG等[39]首次發(fā)現(xiàn),DNA功能化納米銀簇和嵌入Hemin的G四聯(lián)體之間存在光致電荷轉(zhuǎn)移效應(yīng)。該效應(yīng)的強(qiáng)弱與銀簇和G四鏈體結(jié)構(gòu)間距離有關(guān),當(dāng)距離超過15個(gè)堿基時(shí),熒光猝滅效率只有50%。基于這一發(fā)現(xiàn),并通過將適配子序列引入到探針中,構(gòu)建了檢測(cè)蛋白質(zhì)的傳感器。但是由于G四鏈體的猝滅效率不高,使得該方法具有高的背景信號(hào)。為了解決這一問題,LIU等[40]利用石墨烯做猝滅劑,構(gòu)建了檢測(cè)目標(biāo)核酸和蛋白質(zhì)的傳感器(圖4)。沒有目標(biāo)核酸∕蛋白質(zhì)存在時(shí),DNA功能化的納米銀簇吸附在石墨烯表面,銀簇?zé)晒獗皇┾?;加入目?biāo)核酸∕蛋白后,目標(biāo)核酸∕蛋白與探針DNA結(jié)合,形成雙鏈DNA或使DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,并脫離石墨烯表面,納米銀簇的熒光得到恢復(fù)。

        圖4 基于DNA功能化銀簇/氧化石墨烯檢測(cè)目標(biāo)核酸和蛋白Fig.4 Detection of target DNA and thrombin with DNA-templated AgNCs/GO hybrids as sensing matrices

        銀簇合成原料廉價(jià)、易得且其表面易于修飾核酸,這使得銀簇在核酸及蛋白檢測(cè)中應(yīng)用廣泛[41-42],但是,銀簇的合成需要依賴特定序列的DNA模板,相對(duì)耗時(shí)且成本較高。為了系統(tǒng)地研究不同序列與所合成的納米顆粒之間的相互關(guān)系,需要建立一種易于操控的DNA模板納米顆粒合成方法。

        2.3 銅簇

        DNA功能化的銅納米簇(Copper nanoclusters,CuNCs)是近年來新報(bào)道的一類熒光納米顆粒。2010年ROTARU等[43]發(fā)現(xiàn),銅離子在抗壞血酸存在的條件下可以被還原成銅納米顆粒,這些銅納米顆粒聚集在雙鏈DNA的大溝中形成穩(wěn)定的銅納米簇;并且隨著雙鏈DNA序列增長(zhǎng),合成的銅納米簇粒徑變大、熒光增強(qiáng)。SONG等[44]進(jìn)一步研究了雙鏈DNA堿基對(duì)組成對(duì)銅納米簇形成的影響,發(fā)現(xiàn)含有A-T堿基對(duì)的雙鏈更易于形成熒光銅簇,而G-C堿基對(duì)則不會(huì)形成。通過透射電鏡、熒光壽命等表征手段證明,銅納米顆粒的粒徑和熒光壽命可以通過雙鏈DNA的長(zhǎng)度進(jìn)行調(diào)控。QING等[45]通過考察不同堿基對(duì)銅納米顆粒合成的影響,發(fā)現(xiàn)銅納米簇能夠選擇性地在單鏈多聚T堿基序列中形成,并以該聚T堿基模板化的熒光CuNPs作為熒光探針,建立了新型的無需標(biāo)記檢測(cè)S1核酸酶的方法。作為非標(biāo)記探針,DNA功能化銅簇用于生化檢測(cè)的靈敏度有待進(jìn)一步提高,為此,研究者們將信號(hào)放大技術(shù)與DNA功能化銅簇結(jié)合,建立了多種高靈敏檢測(cè)核酸和蛋白質(zhì)的方法[46]。YE等[47]通過TdT的酶促聚合反應(yīng)得到聚T堿基的DNA序列,利用銅離子和T堿基之間的相互作用,原位合成了紅色熒光的銅納米顆粒,并以此為熒光信號(hào)實(shí)現(xiàn)了多聚核酸激酶的定量檢測(cè)。

        3 結(jié)語

        與傳統(tǒng)有機(jī)染料相比,新型熒光納米材料易于合成,原料廉價(jià)易得且自身具有熒光,這些優(yōu)勢(shì)使得其在核酸和蛋白檢測(cè)中有著廣泛的應(yīng)用。然而,現(xiàn)有新型熒光納米材料仍存在一些需要改進(jìn)的地方,如穩(wěn)定性、毒性、靈敏度等。對(duì)這些性質(zhì)以及表面改性路線的研究會(huì)進(jìn)一步拓寬這些材料的生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用,為生物傳感、生物成像、藥物輸送和高級(jí)治療等提供重要的參考。

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