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        羊口瘡病毒B2L基因密碼子優(yōu)化及截短表達(dá)

        2018-10-16 07:42:02范峻豪劉春羽溫永俊張七斤
        中國(guó)動(dòng)物檢疫 2018年10期
        關(guān)鍵詞:優(yōu)化

        張 靜,范峻豪,劉春羽,趙 一,溫永俊,張七斤

        (內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018)

        羊口瘡(ORF)是由羊口瘡病毒(ORFV)感染山羊和綿羊引起的一種急性、接觸性傳染病,人偶有感染。本病以羊口唇、乳房等處的皮膚和粘膜形成紅斑、丘疹、膿瘡、潰瘍和結(jié)痂等為主要特征[1-2]。ORFV全基因組大小為135~139 kb,為雙鏈線性DNA病毒,基因組包含131個(gè)基因,其中B2L基因位于基因組的左末端。病毒在宿主細(xì)胞內(nèi)增值時(shí),B2L基因在病毒DNA尚未開始復(fù)制時(shí)便大量轉(zhuǎn)錄翻譯42 ku大小的蛋白。該蛋白是ORFV外囊膜的主要成分,可強(qiáng)烈刺激宿主免疫系統(tǒng)產(chǎn)生免疫應(yīng)答[3-4]。

        本研究截短表達(dá)了ORFV B2L基因,并依照大腸桿菌密碼子偏好進(jìn)行密碼子優(yōu)化,使其在原核表達(dá)系統(tǒng)中進(jìn)行融合表達(dá),純化出高濃度重組蛋白,為后續(xù)建立ORFV血清學(xué)檢測(cè)方法提供了重要的抗原物質(zhì),尤其是為建立ORFV間接ELISA方法奠定了物質(zhì)基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 主要試劑

        Ni-NTA Agarose親和純化柱、Binding Buffer和Elution Buffer:購(gòu)自生工生物工程(上海)有限公司;180 ku蛋白預(yù)染 Marker:購(gòu)自Thermo公 司;Anti-His Mouse mAb、100 ku蛋 白 預(yù) 染Marker:購(gòu)自全式金生物技術(shù)有限公司;Anti-Mouse IgG:購(gòu)自SIGMA;PVDF膜:購(gòu)自Bio-Rad;蛋白上樣緩沖液、SDS-PAGE凝膠配制試劑盒、BeyoECL Plus:購(gòu)自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞:購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。其他試劑均為標(biāo)準(zhǔn)化學(xué)分析純?cè)噭?/p>

        1.2 主要儀器

        Trans-Blot SD半干轉(zhuǎn)印槽:美國(guó)Bio-Rad公司;Alph Imager HPr凝膠成像系統(tǒng):美國(guó)Protein Simple公司;雙垂直蛋白電泳儀:中國(guó)百晶生物公司;脫色搖床:中國(guó)五相儀器儀表公司。

        1.3 B2L蛋白截短及密碼子優(yōu)化

        運(yùn)用DNA Star中的Protean軟件,分析B2L蛋白的親水性、可塑性、蛋白表面可及性、抗原指數(shù);根據(jù)分析結(jié)果截取抗原指數(shù)高、親水性好、可塑性好的片段進(jìn)行截短表達(dá)和密碼子優(yōu)化;將優(yōu)化好的片段送吉林庫(kù)美生物有限公司進(jìn)行合成,然后連接到pET32a(+)表達(dá)載體上,再轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞中。

        1.4 重組蛋白表達(dá)

        將重組菌劃線接種于含Amp+的LB固體培養(yǎng)基37 ℃過(guò)夜培養(yǎng),將過(guò)夜菌挑單菌落接種于3 mL含氨芐抗性的新鮮 LB液體培養(yǎng)基,搖菌培養(yǎng)12 h;按1%的比例將純化培養(yǎng)的菌液接種于200 mL含Amp+的新鮮LB液體培養(yǎng)基,37 ℃ 200 r/min震蕩培養(yǎng);用分光光度計(jì)測(cè)A到0.6時(shí),加入IPTG誘導(dǎo);將菌液12 000 r/min離心10 min,棄上清,用Binding buffer洗滌2次,然后重懸,于冰浴中進(jìn)行超聲破碎(具體以超聲菌液清亮為止);將超聲裂解菌液4 ℃ 12 000 r/min離心10 min,分離上清和沉淀;將沉淀用尿素溶解,經(jīng)過(guò)SDS-PAGE電泳測(cè)定,并且以未誘導(dǎo)菌為陰性對(duì)照。

        1.5 重組蛋白純化

        將Ni-NTA Agarose親和純化柱加入5 mL Binding Buffer平衡10次,將蛋白加入平衡好的Ni-NTA鎳柱填料中,在冰上結(jié)合30 min;收集流穿液,加5 mL Binding Buffer洗滌1次,收集洗滌液,加Elution Buffer 5 mL洗1次,收集洗脫液。

        1.6 重組蛋白Western-blot鑒定

        將經(jīng)SDS-PAGE電泳的蛋白條帶轉(zhuǎn)印到PVDF膜上,電壓14 V 1 h;用5%脫脂乳室溫封閉2 h,然后用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;在膜上加入Anti-His Mouse mAb為一抗(1∶4 000稀釋),4 ℃過(guò)夜孵育,第2天用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;再將膜放入1∶5 000稀釋的Anti-Mouse IgG中孵育1 h,取出膜后用10 mmol/L PBST洗3次,每次10 min;在PVDF膜上加ECL顯影液,放于熒光顯色儀中顯色。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 B2L蛋白截短及密碼子優(yōu)化

        2.1.1 B2L蛋白截短 利用DNA Star中的Protean軟件,分析B2L蛋白的親水性、可塑性、蛋白表面可及性、抗原指數(shù)等,選取抗原指數(shù)高、親水性好、可塑性好的片段進(jìn)行截短表達(dá)。分析結(jié)果見(jiàn)圖1-A,截取的目的蛋白氨基酸序列見(jiàn)圖1-B。

        圖1 B2L蛋白的生物信息學(xué)分析

        2.1.2 B2L蛋白截短基因的密碼子優(yōu)化 根據(jù)大腸桿菌的密碼子偏好進(jìn)行密碼子優(yōu)化,用E.coli Codon Usage Analyzer 2.1在線軟件分析優(yōu)化結(jié)果。結(jié)果顯示(圖2),優(yōu)化后的密碼子適應(yīng)指數(shù)(CAI)為1,且無(wú)稀有密碼子。CAI是反映編碼區(qū)同義密碼子與密碼子最佳使用相符合的程度,取值范圍在0~1之間,越高表明該基因的密碼子使用偏好性越強(qiáng)[7-8]。

        圖2 密碼子優(yōu)化分析結(jié)果(CAI為1)

        2.3 重組蛋白SDS-PAGE分析

        將重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)入大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)中,經(jīng)條件優(yōu)化,最終確定37 ℃ IPTG終濃度為1 mmol/L誘導(dǎo)培養(yǎng)3 h后表達(dá)的效果最佳。SDS-PAGE檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)圖3。從結(jié)果中可以看出,誘導(dǎo)的pET32a(+)-B2L重組菌超聲后上清及沉淀中的30 ku附近出現(xiàn)清晰條帶,而未誘導(dǎo)的PET-32a-B2L重組菌在這一位置沒(méi)有這一條帶,因此認(rèn)為B2L重組蛋白得到了成功表達(dá)。

        圖3 SDS-PAGE檢測(cè)結(jié)果

        2.4 重組蛋白純化

        將誘導(dǎo)表達(dá)得到的B2L蛋白經(jīng)鎳柱親和層析后收集到的流穿液、洗滌液和洗脫液,分別取20 μL進(jìn)行SDS-PAGE電泳,可以看出流穿液和洗滌液中也有 重組蛋白存在,但洗脫液中的重組蛋白單一,因而認(rèn)為重組蛋白得到較好的純化(圖4)。

        圖4 SDS-PAGE電泳結(jié)果

        2.5 重組蛋白Western-blot檢測(cè)

        Western blot結(jié)果見(jiàn)圖5。純化的蛋白在30 ku附近出現(xiàn)1條清晰條帶,而未誘導(dǎo)的重組菌和誘導(dǎo)的空表達(dá)載體菌沒(méi)有出現(xiàn)目的條帶,表明重組蛋白在大腸桿菌中成功表達(dá)。

        圖5 Western-blot結(jié)果

        3 討論

        目前,羊口疫廣泛流行于全球各羊養(yǎng)殖國(guó)家或地區(qū),且發(fā)生頻率逐年上升,流行范圍逐漸擴(kuò)大,特別是我國(guó)黑龍江、新疆、內(nèi)蒙古、西藏、青海、吉林等養(yǎng)殖地區(qū),近年頻頻暴發(fā)羊口疫疫情[5],給養(yǎng)羊業(yè)造成了一定的經(jīng)濟(jì)損失,同時(shí)鑒于國(guó)內(nèi)缺乏相關(guān)檢測(cè)試劑盒,故應(yīng)給予羊口疫更高的關(guān)注。本試驗(yàn)通過(guò)PET-32a(+)表達(dá)載體構(gòu)建截短B2L重組表達(dá)質(zhì)粒,獲得了可溶性O(shè)RFV B2L蛋白,為將來(lái)建立間接ELISA檢測(cè)ORFV抗體提供了物質(zhì)基礎(chǔ),更為準(zhǔn)確診斷ORF和流行病學(xué)調(diào)查提供了簡(jiǎn)便快捷的方法[6-7]。

        為了提高B2L重組蛋白的產(chǎn)量,在試驗(yàn)中通過(guò)對(duì)B2L基因優(yōu)化及截短,可以使蛋白得到更好的表達(dá),且不失B2L蛋白的免疫原性。又通過(guò)表達(dá)條件的摸索和優(yōu)化,使用最佳條件,37 ℃ IPTG終濃度1 mmol/L,誘導(dǎo)表達(dá)3 h,最終蛋白得到了大量表達(dá)。

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