石建兵,王 寧,周 紅,許慶華,喬文青,嚴(yán)根土
( 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所,棉花生物學(xué)國家重點實驗室,河南安陽455000)
赤霉素(Gibberellins,GAs)作為一種重要的植物激素,由日本學(xué)者于1938 年從赤霉菌中分離到而得名[1],其在植物的整個生長發(fā)育周期中起調(diào)節(jié)作用,參與控制多種多樣的植物發(fā)育過程。并且植物對環(huán)境的適應(yīng)性也與GA生物合成的調(diào)控有著或多或少的關(guān)系,目前,通過GA矮化突變體的研究已經(jīng)基本闡明了高等植物赤霉素代謝途徑[2]。赤霉素合成過程較為復(fù)雜,其中古巴焦磷酸合成酶(Copalyl pyrophosphate synthase,CPS)、內(nèi)根-貝殼杉烯合成酶(Ent-kaurene synthase,KS)、內(nèi)根-貝殼杉烯氧化酶(Ent-kaurene oxidase,KO)、GA-20氧化酶(GA-20 oxidase)、GA-2氧化酶(GA-2 oxidase)和GA-3氧化酶(GA-3 oxidase)是GA合成途徑中起關(guān)鍵作用的酶[3]。
CPS位于前質(zhì)體,牻牛兒基牻牛兒焦磷酸(Geranylpyrophosphate,GGPP)在其催化作用下生成古巴焦磷酸(Copalyl pyrophosphate,CPP),進一步在KS的催化作用下形成GA前身,即內(nèi)根-貝殼杉烯,CPS與KS的催化反應(yīng)均發(fā)生在原生質(zhì)體內(nèi)。在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi),內(nèi)根-貝殼杉烯經(jīng)由KO的三步氧化反應(yīng),形成內(nèi)根-貝殼杉烯酸。在GA合成的最后階段,GA-20 oxidase、GA-3 oxidase和GA-2 oxidase起著重要的調(diào)控作用,也是目前研究最多的赤霉素合成酶基因[4]。GA-20 oxidase是一個多基因家族,是植株體內(nèi)GA合成過程中重要的限速酶,不僅受反饋調(diào)節(jié),又受光周期調(diào)控,其參與一系列的氧化反應(yīng)過程,包括從GA12到GA9以及從GA53到GA20等過程,最后形成具有生物活性的GAs[5]。GA-3 oxidase同GA-20 oxidase一樣,可以將非生物活性的GAs轉(zhuǎn)變?yōu)橛猩锘钚缘腉As。GA-2 oxidase主要起鈍化GAs的作用,通過使有生物活性的GA1和GA4羥基化轉(zhuǎn)變成無活性的GA8和GA34,從而降低植株內(nèi)活性GAs的含量[6]。赤霉素受體GID1(Gibberellin insensitive dwarf 1)可感知并結(jié)合游離的GAs,通過誘導(dǎo)下游DELLA蛋白,從而釋放下游基因的表達,在植物體上產(chǎn)生赤霉素效應(yīng)[7]。由于GAs對農(nóng)作物生長發(fā)育的調(diào)控作用,其直接或間接地影響著農(nóng)作物的產(chǎn)量和質(zhì)量,水稻和小麥育種進程的快速發(fā)展均與GAs密切相關(guān)[8-9]。目前,對于植物激素的研究已由生理水平轉(zhuǎn)向了分子水平[10-11]。
本研究選用陸地棉品種中棉所49為研究材料,利用實時熒光定量PCR方法,對赤霉素合成途徑關(guān)鍵酶基因在棉花植株生長發(fā)育的關(guān)鍵時期及各組織內(nèi)的表達模式進行了檢測與分析,為合理利用赤霉素調(diào)控棉花生長發(fā)育提供了理論基礎(chǔ)。
中棉所49(CCRI49)由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所提供,為遺傳育種室抗逆育種課題培育的常規(guī)品種。
主要儀器包括超凈工作臺、微量移液槍(Eppendorf)、低溫離心機、實時熒光定量PCR儀(Bio-Rad)、蛋白核酸測定儀。主要試劑包括植物總RNA提取試劑盒、96孔PCR板(TaKaRa)、cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒、熒光染料2×SYBR Green I Mix(TaKaRa)。
1.2.1 材料準(zhǔn)備 取CCRI49種子,在播種期種植于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所東場九區(qū)試驗田。分別于2017年5月31日(苗期)、7月12日(開花期)、8月20日(吐絮期)取植株的根、莖、葉部位組織,-80 ℃保存。
1.2.2 棉花總RNA提取與質(zhì)量檢測 取保存的各樣品,在液氮中研磨,RNA的提取按提取試劑盒說明書操作,用蛋白核酸測定儀對提取的棉花總RNA的濃度和質(zhì)量進行檢測,計算并用ddH2O調(diào)整各樣品RNA到合適的濃度,-80 ℃保存。
1.2.3 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA鏈 以提取的RNA為模板,進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),體系為20 μL,包含Total RNA 30 ng、5×gDNA Buffer 2 μL,最后用RNase-Free ddH2O補足后振蕩并離心,在PCR儀中進行42 ℃ 3 min,4 ℃ 2 min。之后在體系中加入FQ-RT Primer Mix 2 μL、10×Fast RT Buffer 2 μL、RT Enzyme Mix 1 μL和RNase-Free ddH2O 5 μL,混勻后置于PCR儀中進行42 ℃ 15 min,95 ℃ 3 min,4 ℃保存。
1.2.4 設(shè)計引物 在NCBI查找CPS1、KS、KO、GA20ox、GA3ox、GA2ox和GID1的EST序列并參考水稻、葡萄、番茄等植物赤霉素代謝關(guān)鍵酶基因序列[12-14],利用Primer Premier 5引物設(shè)計軟件設(shè)計用于熒光定量PCR的特異性引物,內(nèi)參基因選用棉花內(nèi)源持家基因UBQ7(GenBank:DQ116441)[15],引物序列見表1。
表1 引物序列Tab.1 Primers used in Real-time PCR assays
1.2.5 熒光定量PCR(Real-time PCR)分析 以cDNA為模板進行Real-time PCR擴增。反應(yīng)中,分別擴增不同生長階段各材料樣品中根、莖、葉組織內(nèi)的GA相關(guān)基因和UBQ7基因,設(shè)3次重復(fù)。反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)熱10 min;95 ℃ 變性10 s,60 ℃ 退火30 s,40個循環(huán),從65~95 ℃收集熔解曲線。數(shù)據(jù)由IQ5熒光定量PCR儀全程采集、分析,用2-(ΔΔCT)法計算目的基因表達量。
在田間分別于幼苗期、 開花期和吐絮期采集棉花植株的根、莖、葉組織,用蒸餾水沖洗干凈,經(jīng)吸水紙吸干多余水分后,-80 ℃保存??俁NA的提取參照RNA提取試劑盒說明書操作進行,經(jīng)1.2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA,條帶清晰無降解,可用于下一步的反轉(zhuǎn)錄試驗和熒光定量試驗(圖1)。
第一鏈cDNA的合成參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒操作進行,并以合成的cDNA為模板,利用特異性引物對CRRI49材料的根、莖、葉組織內(nèi)赤霉素合成途徑各關(guān)鍵酶基因進行實時熒光檢測,如圖2所示,各目的基因及內(nèi)參基因的擴增曲線表現(xiàn)較好,由于目的基因不同,熔解曲線為多峰,但同一目的基因的熔解曲線表現(xiàn)為單峰,表明引物的特異性較好,擴增曲線中的熒光值能夠準(zhǔn)確反映各目的基因的表達變化,可以進行基因相對表達量的計算。
棉花材料CCRI49在不同生長階段內(nèi)的CPS1、KS、KO、GA2ox1、GA3ox1、GA20ox1和GID1B基因的表達量采用2-ΔΔCT法,以棉花內(nèi)源基因UBQ7為參考基因,以苗期CCRI49根組織為對照樣品進行計算,結(jié)果如表2所示。
A.幼苗期;B.開花期;C.吐絮期;M.Marker;1~3.幼苗期根莖葉組織RNA;4~5.開花期根莖葉組織RNA;6~9.吐絮期根莖葉組織RNA。A.Seedling;B.Full-blooming;C.Boll opening;M.Marker;1-3.RNA of root,stem,leaf in seedling stage;4-5.RNA of root,stem,leaf in fullblooming stage;6-9.RNA of root,stem,leaf in boll opening stage.
從圖3可以看出,以幼苗期CCRI49根組織內(nèi)各目的基因的表達為對照(表達量為1.00),赤霉素合成途徑各關(guān)鍵酶基因在CCRI49莖、葉組織內(nèi)的表達量均有不同。在CCRI49莖中,CPS1、KS、KO、GA3ox1、GA20ox1的表達量較高,表達量分別為16.92,4.64,3.37,14.52,10.63,GA2ox1表達量則低于對照水平,表達量為0.36;在CCRI49葉中,GA3ox1表達量升高,為12.82,其他基因表達量均低于對照。綜合來看,CPS1、KS、KO、GA3ox1、GA20ox1在莖中表達量較高(P<0.05);在葉組織中表達量較低(GA3ox1除外,其表達量達顯著差異水平,P<0.05)。GA2ox1在各組織內(nèi)表達量均低于對照水平(P<0.05)。苗期棉花植株生長速率較快,需要充足的養(yǎng)分與激素來滿足與調(diào)節(jié)植株的生長發(fā)育,該期間主要以根的生長與莖的伸長為主。
A.目的基因擴增曲線;B.內(nèi)參基因(UBQ7)擴增曲線;C.目的基因熔解曲線;D.內(nèi)參基因(UBQ7)熔解曲線。A.Amplification curve of target gene;B.Amplification curve of UBQ7;C.Melt curve of target gene;D.Melt curve of UBQ7.
表2 棉花材料GAs合成途徑關(guān)鍵酶基因的表達情況Tab.2 Key enzyme genes expression of GAs synthesis pathway in cotton material
注:ΔCT=CT(Target)-CT(UBQ7);-ΔΔCT=ΔCT(Root)-ΔCT。
不同的小寫字母表示相對于幼苗期根組織差異顯著(P<0.05)。圖4-8同。Different lowercase mean significant difference at 0.05level compared to root of seedling. The same as Fig.4-8.
與幼苗期根組織內(nèi)各目的基因表達量(各基因表達量為1.00)相比,開花期內(nèi)棉花植株各組織中的GAs基因表達量發(fā)生較大變化(圖4),根組織中,CPS1、KS、GA20ox1的表達量分別為0.36,0.47,0.78,均低于對照水平(1.00),且差異達顯著水平(P<0.05);KO基因表達量為1.19,與苗期對照差異不顯著;GA2ox1、GA3ox1、GID1B基因表達量分別為7.65,18.46,6.01,較苗期水平(1.00)有較大幅度上調(diào),差異達顯著水平(P<0.05)。莖組織中,KS、KO基因表達量分別為0.68和0.80,較對照(1.00)下調(diào)0.32和0.20;其他基因表達量均表現(xiàn)為上調(diào),其中以GA20ox1和GA3ox1上調(diào)幅度較大,表達量達44.57和32.90,差異達顯著水平(P<0.05)。葉組織中,KS、GA2ox1、GA20ox1基因表達量較對照水平(1.00)有所降低,分別為0.16,0.23,0.72,CPS1、KO、GID1B表達量上調(diào)幅度不大,GA3ox1基因表達量則上調(diào)為對照水平(1.00)的87.48倍(P<0.05)。該階段內(nèi),莖中GA20ox1基因的高表達為植株莖的伸長及果枝發(fā)育提供必要的活性赤霉素水平,GA3ox1基因在根莖葉中均表現(xiàn)為上調(diào),可能與開花成鈴有關(guān)。
圖4 開花期GAs合成途徑各關(guān)鍵酶基因在棉花各組織內(nèi)的表達情況Fig.4 The expression of GAs metabolism key enzymegenes in cotton tissues in full-blooming stage
棉花植株生長發(fā)育后期,各組織內(nèi)GAs相關(guān)基因表達如圖5所示,此時期根組織中GA2ox1和GA3ox1基因表達量分別為7.68,4.81,與對照(1.00)相比表現(xiàn)為上調(diào),差異達顯著水平(P<0.05),其余基因均表現(xiàn)為下調(diào)。莖組織中各目的基因的表達量均高于根組織(KO、GID1B差異不顯著),但與苗期對照水平(1.00)相比,KS、GID1B基因表達量為0.54和0.59,表現(xiàn)為下調(diào),其余基因表達量均上調(diào),其中以GA2ox1上調(diào)幅度最大,為8.64,其次為GA3ox1和GA20ox1,表達量分別為5.37,5.71,與對照相比差異達顯著水平(P<0.05)。葉組織中除GA2ox1基因表達量較對照(1.00)降低外,其余基因表達量均表現(xiàn)為上調(diào),最高為GA20ox1(17.67),其次為GA3ox1(10.02),均達顯著水平(P<0.05)。該生長階段內(nèi),植株的營養(yǎng)生長逐漸降低,表現(xiàn)為根莖GA2ox1基因表達量升高;此時棉桃生長發(fā)育至脫水成熟,需要內(nèi)源GAs的促進與調(diào)控,表現(xiàn)為植株葉組織中GA3ox1和GA20ox1基因表達量上調(diào)。
圖5 吐絮期GAs合成途徑各關(guān)鍵酶基因在棉花各組織內(nèi)的表達情況Fig.5 The expression of GAs metabolism key enzymegenes in cotton tissues in boll opening stage
GAs調(diào)控植株生長發(fā)育是一個復(fù)雜的過程,其相關(guān)基因的表達不僅在不同組織內(nèi)表現(xiàn)不同,在不同的生長階段也各不相同。根組織內(nèi)各基因的表達變化趨勢如圖6所示,以幼苗期根組織為對照,CPS1、KS、GA20ox1基因表達量在開花期和吐絮期均低于對照水平,KO基因在3個時期表達量變化不大,與對照相比,開花期為1.19,吐絮期為0.89,基本趨于穩(wěn)定。GA2ox1基因的表達量在開花期上調(diào)到7.65水平,并維持不變到吐絮期的7.68水平。GA3ox1和GID1B基因表現(xiàn)出先升高后降低的表達趨勢,其中,GA3ox1在根的生長過程中逐漸升高到開花期時的18.46,再逐漸降低,但在吐絮期的表達量仍高于幼苗期,為4.81;GID1B在開花期上調(diào)為6.01,至吐絮期又表現(xiàn)為下調(diào),且低于對照水平。
圖6 CCRI49根組織GAs合成途徑各關(guān)鍵酶基因的表達情況Fig.6 The expression of GAs metabolism keyenzyme genes in cotton root
莖組織內(nèi)各基因的表達變化趨勢如圖7所示,CPS1、KS基因在幼苗期表達量較高,到開花期和吐絮期呈逐漸下降趨勢,且KS基因在開花期和吐絮期的表達水平均低于對照。KO基因在幼苗期表達量為3.37,高于對照,到開花期降低到對照水平以下(0.80),吐絮期又上調(diào)至對照水平以上(1.48)。隨著植株的生長發(fā)育,GA2ox1基因的表達量呈逐漸升高的趨勢,到吐絮期,植株由以營養(yǎng)生長為主轉(zhuǎn)為以生殖生長為主,此時莖中活性GAs含量逐漸降低。GA-20氧化酶和GA-3氧化酶是嚴(yán)格調(diào)控的酶,在赤霉素合成的后期階段起重要作用,在幼苗期GA3ox1和GA20ox1基因表達量維持在較高水平,并在開花期達到最大表達量水平,后逐漸降低到吐絮期的5.37,5.71水平,仍高于對照,表明GA3ox1和GA20ox1與植株的開花吐絮有關(guān)。
圖7 CCRI49莖組織生長發(fā)育階段GAs合成途徑各關(guān)鍵酶基因的表達情況Fig.7 The expression of GAs metabolism key stagesof growth and development enzyme genes in cotton stem
葉組織內(nèi)各基因的表達變化趨勢如圖8所示,GA3ox1基因表達量變化趨勢最為明顯,在幼苗期表達量為12.82,到開花期上升為87.48,至吐絮期又降低為10.02。CPS1和KO基因表達量在開花期得到上調(diào),至吐絮期基本穩(wěn)定。KS基因表達量在幼苗期表達量極低,后逐漸升高。GA2ox1基因在葉片中表達量變化不大。GA20ox1和GID1B基因的表達量呈逐漸升高的趨勢,可能與后期棉桃的成熟吐絮有關(guān)。
圖8 CCRI49葉組織GAs合成途徑各關(guān)鍵酶基因的表達情況Fig.8 The expression of GAs metabolism keyenzyme genes in cotton leaf
GAs對植物根系的生長、莖的伸長、葉的展開、種子萌發(fā)和花的發(fā)育等起著重要的調(diào)控作用,近年來,人們對GA合成途徑的研究較為完善,在其合成途徑起關(guān)鍵作用的酶基因已在許多植物中克隆出來[16-17]。在這些關(guān)鍵酶基因中,CPS、KS和KO在GA的合成早期起作用,被認(rèn)為是在總體水平上調(diào)控GA合成的關(guān)鍵位點[18]。GA20ox、GA3ox和GA2ox在GA合成途徑的后期起作用,且參與多步反應(yīng),催化具有生物活性赤霉素的合成[19]。李晨晨等[20]認(rèn)為,若CPS完全突變,植物將不能產(chǎn)生赤霉素,從而嚴(yán)重影響植物的發(fā)育。CPS和KS的催化作用在水稻中阻礙KO的催化步驟則會影響活性赤霉素的合成,最終導(dǎo)致植物矮化[21]。GA20ox和GA3ox在GA合成途徑中起促進活性GAs合成的作用,過量表達GA20ox會促進植株生長。GA2ox則相反,起著分解活性GA1和GA4變成無生物活性GA8和GA34的作用,而活性GAs的減少必然影響植物的生長發(fā)育[22-23]。水稻和玉米中,由于GA3ox基因的突變,導(dǎo)致了植株矮化的發(fā)生[24]。赤霉素受體(GID)是赤霉素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的重要成員,直接影響著赤霉素對植物體效應(yīng)的發(fā)揮,研究表明,在外源GA3誘導(dǎo)下,MsGID1B基因的表達量較高,可能參與紫花苜蓿的抗逆調(diào)控[8]。
本研究相對定量結(jié)果表明,不同組織內(nèi)赤霉素合成途徑相關(guān)基因的表達量各不相同,且隨著植株的生長發(fā)育,不同組織內(nèi)各目的基因的表達變化也各不相同。幼苗期,棉花植株生長速率較快,需要充足的養(yǎng)分與激素來滿足與調(diào)節(jié)植株的生長發(fā)育,該期間主要以根的生長與莖的伸長為主,表現(xiàn)為莖中起正向調(diào)控的相關(guān)酶基因表達量較高,以促進活性GAs的合成。開花期,GAs相關(guān)基因表達量發(fā)生較大變化,莖中GA20ox1基因的高表達為植株莖的伸長及果枝發(fā)育提供必要的活性赤霉素水平,這與Huang等[25]研究結(jié)果相一致。另外發(fā)現(xiàn),GA3ox1基因在根莖葉中均表現(xiàn)為上調(diào),GA-3ox同GA-20ox類似,在GAs合成途徑中起正向調(diào)控作用[26-28],推測可能與開花成鈴有關(guān)。吐絮期,棉花植株逐漸由營養(yǎng)生長轉(zhuǎn)向生殖生長,根莖組織逐漸衰老,此時根莖組織GA2ox1基因表達量升高,活性GAs合成降低,葉組織中GA3ox1和GA20ox1基因表達量上調(diào),為棉桃生長發(fā)育與脫水成熟提供必要的激素水平,與前人研究一致[29]。Yamaguchi等[30]發(fā)現(xiàn),在南瓜生長發(fā)育的不同階段,CPS基因的表達量會發(fā)生一定的變化,表現(xiàn)為在幼嫩的組織中表達水平最高,之后隨著衰老程度增加而降低,與本研究結(jié)果相一致。
本研究通過對陸地棉材料,中棉所49植株體內(nèi)赤霉素合成相關(guān)酶基因的表達量進行檢測,發(fā)現(xiàn)各目的基因在不同組織內(nèi)的表達量有所差異。且隨著生長發(fā)育的進行,棉花植株根莖葉組織內(nèi)赤霉素合成相關(guān)基因的表達量變化趨勢存在一定差異。幼苗期莖組織內(nèi)除GA2ox1基因外,其余各基因表達量相對較高,為植株的生長發(fā)育提供了充足的激素水平;開花期GA20ox1基因的高表達為植株莖的伸長及果枝發(fā)育提供必要的活性赤霉素水平,GA3ox1基因可能與開花成鈴有關(guān);吐絮期,根莖組織GA2ox1基因表達量升高,活性GAs合成降低,葉組織中GA3ox1和GA20ox1基因表達量上調(diào),為棉桃生長發(fā)育與脫水成熟提供必要的激素水平。該研究為進一步了解赤霉素調(diào)控棉花的生長發(fā)育提供了基礎(chǔ),為棉花株型育種工作提供了新思路、新方向。