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        寧前胡內(nèi)生真菌的培養(yǎng)分離與鑒定

        2018-08-29 01:37:42劉海濤梁益敏王國(guó)凱
        關(guān)鍵詞:分生孢子內(nèi)生菌絲

        劉海濤,邵 杰,王 剛,梁益敏,楊 陵,王國(guó)凱

        (1.安徽中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院 安徽道地中藥材品質(zhì)提升協(xié)同創(chuàng)新中心,安徽 合肥 230012; 2.安徽邦寧制藥有限公司,安徽 寧國(guó) 242300)

        植物內(nèi)生菌是指其生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期生活在健康植物組織內(nèi)部,并不引起宿主植物出現(xiàn)明顯病害癥狀的微生物,包括內(nèi)生細(xì)菌和內(nèi)生真菌[1]。內(nèi)生真菌廣泛存在于植物各個(gè)器官、組織的細(xì)胞內(nèi)及細(xì)胞間隙之中,由于它們和其寄主植物長(zhǎng)期共生,內(nèi)生真菌除了產(chǎn)生一些獨(dú)特的代謝產(chǎn)物外,還往往可以產(chǎn)生與寄主植物代謝產(chǎn)物相近甚至相同的具有生物活性的次生代謝產(chǎn)物,研究表明這些活性成分具有顯著的抗菌、抗氧化、抗腫瘤等作用[2-4]。

        中藥前胡為傘形科植物白花前胡(P.praeruptorumDunn.)的干燥根,始載于《名醫(yī)別錄》,具有宣散風(fēng)熱、降氣祛痰的功效,可用于風(fēng)熱感冒、咳嗽痰多、痰熱喘滿等癥[5]。安徽省寧國(guó)市地處皖南山區(qū)天目山北麓,素以盛產(chǎn)道地藥材白花前胡而著稱。該地所產(chǎn)前胡以個(gè)大、皮黑、肉白、條長(zhǎng)、柔軟、香味濃等特點(diǎn)著稱,商品市場(chǎng)俗稱“寧前胡”[6]。目前國(guó)內(nèi)外研究者對(duì)白花前胡化學(xué)成分和藥理活性等進(jìn)行了廣泛的研究[7-9],但尚未見有關(guān)于寧前胡內(nèi)生真菌的研究報(bào)道。本研究首次從寧前胡中分離鑒定出多種內(nèi)生真菌,豐富了寧前胡內(nèi)生真菌的種質(zhì)資源,并為進(jìn)一步尋找內(nèi)生真菌的次生代謝產(chǎn)物提供依據(jù)。

        1 材料

        1.1 試藥 寧前胡藥材于2017年6月采自安徽省寧國(guó)市港口鎮(zhèn)株木店村,經(jīng)安徽中醫(yī)藥大學(xué)梁益敏副教授鑒定為傘形科前胡屬白花前胡(P.praeruptorumDunn.)。培養(yǎng)基:馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(potato dextrose agar,PDA),購于北京奧博星生物技術(shù)有限責(zé)任公司。

        1.2 儀器 SPT-P250C智能生化培養(yǎng)箱:合肥華德利科學(xué)器材有限公司;TGL-16G臺(tái)式離心機(jī):上海安亭科學(xué)儀器廠;SW-CJ-2FD雙人單面潔凈工作臺(tái):蘇州蘇潔凈化設(shè)備有限公司;LDZX-50KBS立式壓力蒸汽滅菌鍋:上海申安醫(yī)療器械廠;植物/真菌基因組DNA小量提取試劑盒:天根生化科技(北京)有限公司;T-Gradient Thermoblock PCR儀:德國(guó)Biometra公司;G-BOX凝膠成像系統(tǒng)Gene-Snap:英國(guó)Syngene公司;DYY-8C電泳儀:北京六一儀器廠;通用引物:內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)ITS1(5′-TC-CGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS4(5′-TC-CTCCGCTTATTGATATGC-3′)均由上海生工生物工程股份有限公司定制。

        2 方法

        2.1 內(nèi)生真菌的培養(yǎng)分離與純化 采用組織塊法分離內(nèi)生真菌。保存完好的寧前胡根部,去除須根和葉子,用蒸餾水把根部沖洗干凈,用濾紙吸干表面水分,晾干。按照常規(guī)表面無菌操作法:依次用75%乙醇漂洗1~2 min,3%次氯酸鈉漂洗3~5 min,75%乙醇漂洗30 s,無菌水沖洗5次。設(shè)置空白對(duì)照,用移液槍移取最后一次沖洗的無菌水200 μL,用涂布棒均勻涂布于PDA培養(yǎng)基的表面,倒置于恒溫28 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~4 d,平行3份以驗(yàn)證滅菌效果是否徹底。然后用無菌濾紙充分吸干寧前胡表面水分,再用無菌手術(shù)刀將材料切成0.2 cm×0.2 cm長(zhǎng)段(片),將上述組織塊分別接種于PDA培養(yǎng)基中,每皿4塊,置28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)5~15 d。觀察組織塊斷面處向PDA培養(yǎng)基周圍長(zhǎng)出形態(tài)特征、顏色差異的菌落時(shí),用無菌接種環(huán)挑取形態(tài)各異的菌絲或孢子接種于新的培養(yǎng)基上,培養(yǎng)2~4代,待純化后轉(zhuǎn)移到PDA斜面試管中編號(hào)備用。

        2.2 菌株的形態(tài)學(xué)初步鑒定 將保存完好的菌株復(fù)壯到PDA培養(yǎng)基平板上,恒溫28 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5~10 d。內(nèi)生真菌主要的形態(tài)特征包括所分得的菌落大小、表面特征、菌絲形態(tài)、產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)類型以及孢子的形態(tài),參照《真菌鑒定手冊(cè)》[10]進(jìn)行初步鑒定分類。

        2.3 菌株的分子鑒定

        2.3.1 內(nèi)生真菌DNA提取 將純化的內(nèi)生真菌用無菌藥匙刮取表面,放入無菌研缽中,加入2~3次液氮冷凍菌絲體,然后用研杵充分研磨冷凍的菌絲體,應(yīng)隨時(shí)補(bǔ)充液氮以保持低溫,參照試劑盒步驟進(jìn)行操作,得到DNA溶液,置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        2.3.2 rDNA-ITS的PCR擴(kuò)增 擴(kuò)增真菌rDNA-ITS的上游引物ITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′;下游引物 ITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′。PCR反應(yīng)體系50 μL,見表1。

        表1 PCR擴(kuò)增rDNA-ITS的反應(yīng)體系

        2.3.3 PCR擴(kuò)增程序和內(nèi)生真菌rDNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析 PCR擴(kuò)增程序:參照文獻(xiàn)[11]中的方法,委托生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到擴(kuò)增產(chǎn)物,后將擴(kuò)增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測(cè),由凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行觀察、拍照。檢測(cè)后置于-20 ℃冰箱中保存,備用。將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果提交至GeneBank數(shù)據(jù)庫,與相關(guān)種屬序列進(jìn)行同源性比較,并進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹分析。利用美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)數(shù)據(jù)庫BLAST對(duì)序列進(jìn)行相似性分析,對(duì)菌株進(jìn)行鑒定,從而得到真菌的分類地位,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        2.4 分析方法 定植率(colonization rate,CR)=受內(nèi)生真菌侵染的組織塊數(shù)/全部供試樣本組織塊數(shù)×100%。內(nèi)生真菌的CR可以反映宿主植物受內(nèi)生真菌侵染的程度[12]。分離頻率(separation frequency,SF)=分到內(nèi)生真菌各屬的分離數(shù)/分到內(nèi)生真菌分離總數(shù)×100%。SF>10%的屬定義為某樣區(qū)的優(yōu)勢(shì)屬,5%≤SF≤10%定義為常見屬,SF<5%定義為稀有屬。相對(duì)分離頻率(relative separation frequency,RSF)=分離的某種內(nèi)生真菌的菌株數(shù)/分離的總菌株數(shù)×100%。RSF可以用來計(jì)算植物組織中某種真菌的優(yōu)勢(shì)度[13]。

        3 結(jié)果

        3.1 寧前胡內(nèi)生真菌的分離 兩個(gè)批次共120個(gè)組織塊來源于6株白花前胡植株樣本,有96個(gè)組織塊不同程度上侵染有內(nèi)生真菌,CR為80%。通過組織塊法從寧前胡中共計(jì)分離得到41株內(nèi)生真菌,分屬于10屬21種。Fusarium12株,Penicillium8株,Aspergillus4株,Alternaria8株,Tricladium1株,Phoma1株,Collariella1株,Rhizoctonia2株,Colletotrichum1株,Trichoderma3株。

        3.2 形態(tài)學(xué)鑒定 內(nèi)生真菌通過菌落特征比對(duì)和顯微觀察,LH03、LH06、LH10、LHT16、LHT19表面菌絲相對(duì)密集,棉絮狀,有大量分生孢子,分生孢子梗集結(jié)成分生孢子座,細(xì)長(zhǎng),分枝,大孢子彎曲呈不明顯的鐮刀形,小型孢子為長(zhǎng)卵圓形。LH02、LH04、LH07、LHT15菌落生長(zhǎng)初期為白色,逐漸變?yōu)榫G色或墨綠色,粉狀,孢子梗直立,頂端一至多次分枝,形成掃帚狀,分枝頂端生瓶狀小梗,頂端生成串的分生孢子。LHT17、LHT20、LHT21菌絲密集,由白色漸變?yōu)槟G色,氣生菌絲不發(fā)達(dá),菌絲有隔膜,分生孢子倒棍棒形,橢圓形或卵圓形,頂端有噱狀細(xì)胞和磚隔狀的分生孢子。LH09、LH11菌落表面初期為白色,逐漸變?yōu)樯詈稚?,生成眾多的小顆粒狀孢子團(tuán),產(chǎn)大量黑色或褐色孢子粉,分生孢子串生、無色,有球形或卵圓形的。LH01、LHT14菌落初為白色,生長(zhǎng)迅速,菌絲多為基內(nèi)生菌絲,漸變?yōu)榫G色,具有透明的瓶梗,分生孢子一般光滑,典型形狀為橢圓形至近似長(zhǎng)方形,很少為球形,大多數(shù)為綠色或者透明。根據(jù)魏景超[10]編著的《真菌鑒定手冊(cè)》,將LH03、LH06、LH10、LHT16、LHT19初步鑒定為鐮孢霉屬(Fusarium);LH02、LH04、LH07、LHT15初步鑒定為青霉屬(Penicillium);LHT17、LHT20、LHT21初步鑒定為鏈格孢屬(Alternaria);LH09、LH11初步鑒定為曲霉屬(Aspergillus);LH01、LHT14初步鑒定為木霉屬(Trichoderma);菌株LHT12因不產(chǎn)孢子,形態(tài)和顯微鑒定沒有意義,故通過分子生物學(xué)鑒定。初步鑒定為鐮孢霉屬、青霉屬、鏈格孢屬、曲霉屬和木霉屬,5個(gè)屬的形態(tài)與顯微形態(tài)特征見圖1。

        3.3 分子生物學(xué)鑒定

        3.3.1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果 對(duì)分離得到的21種內(nèi)生真菌進(jìn)行DNA提取,得到DNA提取液,進(jìn)行rDNA-ITS序列擴(kuò)增,550 bp左右處出現(xiàn)一條單一明亮的條帶,見圖2。

        圖1 內(nèi)生真菌菌落及顯微結(jié)構(gòu)

        注:M.marker;1. LH1;2. LH2;3. LH3;4. LH4;5. LH5;6. LH6;7. LH7;8. LH8;9. LH9;10. LH10;11. LH11;12. LHT12;13. LHT13;14. LHT14;15. LHT15;16. LHT16;17. LHT17;18. LHT18;19. LHT19;20. LHT20;21. LHT21

        圖2內(nèi)生真菌16 S rDNA的PCR產(chǎn)物凝膠電泳圖

        3.3.2 rDNA-ITS序列比對(duì)以及系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建 登陸NCBI網(wǎng)站(www.ncbi.nlm.nih.gov),將測(cè)序結(jié)果與Genbank數(shù)據(jù)庫中已知序列進(jìn)行比對(duì)分析,結(jié)果見表2。

        表2 分離純化得到白花前胡內(nèi)生真菌及鑒定結(jié)果

        利用MEGA 4.0和Clustal X軟件對(duì)表2中21種rDNA-ITS分子序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果見圖3。

        由表2和圖3可知,寧前胡內(nèi)生真菌分布于10個(gè)屬中,其種類資源非常廣泛。主要分布于Fusarium、Penicillium和Alternaria屬中,占其總數(shù)的68.29%。分布最廣的為Fusarium,共有12株,其RSF為29.27%。而Fusarium中的F.tricinctum和F.verticillioides為其優(yōu)勢(shì)種,其RSF分別為9.76%和7.32%。菌株LHT12通過分子生物學(xué)鑒定為Rhizoctoniabataticola,共有2株,其RSF為4.88%。

        圖3 寧前胡內(nèi)生真菌ITS序列系統(tǒng)發(fā)育樹

        4 討論

        藥用植物內(nèi)生真菌長(zhǎng)期生活在植物體內(nèi)的特殊環(huán)境,其在演化過程中兩者形成了互惠共生關(guān)系,已有研究結(jié)果顯示,內(nèi)生真菌的多樣性受生境的影響顯著,不同產(chǎn)地的同一種藥用植物中內(nèi)生真菌的群落結(jié)構(gòu)存在較大的區(qū)別[14]。查閱文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn),對(duì)傘形科植物內(nèi)生真菌研究較少,本研究對(duì)安徽道地藥材寧前胡內(nèi)生真菌進(jìn)行培養(yǎng)分離與鑒定,結(jié)果顯示分布最廣的類群是鐮孢霉屬Fusariumsp.,SF為29.27%,為其優(yōu)勢(shì)種屬。鐮孢霉屬廣泛存在于自然界中,在霍山石斛[15]、亳芍[16]、海南粗榧[17]等植物中廣泛存在,能產(chǎn)生重要的活性成分。本研究共分離鑒定5種鐮孢霉屬真菌,分別為unculturedFusarium、F.oxysporum、F.tricinctum、F.verticillioides和F.proliferatum。本研究后期將對(duì)寧前胡內(nèi)生真菌優(yōu)勢(shì)種屬的次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行研究,以期從中尋找到具有生物活性的先導(dǎo)化合物。

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