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        新孢子蟲NcGRA7基因酵母雙雜交誘餌載體的構(gòu)建與鑒定

        2018-08-20 07:24:04吳保義陳正鵬李紅旺金春梅梁晚?xiàng)?/span>于龍政

        吳保義, 陳正鵬, 李紅旺, 金春梅, 梁晚?xiàng)鳎?于龍政

        (延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院,吉林 延吉 133002)

        犬新孢子蟲(Neosporacaninum)是一種專性細(xì)胞內(nèi)寄生的頂復(fù)門原生動(dòng)物寄生蟲,主要寄生于犬、牛、羊等多種哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)[1]。犬新孢子蟲侵入過程復(fù)雜,是多個(gè)蛋白質(zhì)分子參與調(diào)控機(jī)制以及宿主細(xì)胞內(nèi)多個(gè)因子相互作用而完成的。該過程包括蟲體對(duì)宿主細(xì)胞的識(shí)別和依附,入侵宿主細(xì)胞,在細(xì)胞內(nèi)建立納蟲空泡并分裂增殖,納蟲空泡破裂蟲體釋放,再次入侵新的細(xì)胞。

        酵母雙雜交技術(shù)主要是基于對(duì)酵母菌轉(zhuǎn)錄因子GAL4性質(zhì)的研究設(shè)計(jì)而成,1989年由Fields等提出并初步建立[2]。該技術(shù)靈敏度非常高,目前在很多蛋白間關(guān)系鑒定試驗(yàn)中已經(jīng)廣泛應(yīng)用[3]。Liu Q等[4]以TgGRA15為誘餌,將TgGRA15克隆到pGBKT7載體中并在Y2HGold酵母菌株中表達(dá),篩選酵母雙雜交cDNA文庫(kù),首次揭示了與TgGRA15相互作用的新的宿主細(xì)胞蛋白。新孢子蟲致密顆粒蛋白(dense granules proteins, GRAs)對(duì)納蟲空泡的形成及其功能的發(fā)揮具有重要作用。

        本研究為了篩選出與新孢子蟲致密顆粒NcGRA7蛋白相互作用的宿主細(xì)胞蛋白質(zhì),構(gòu)建并鑒定了誘餌載體pGBKT7-NcGRA7。

        1 材料與方法

        1.1 試劑

        新孢子蟲Nc-1株,pGBKT7,pMD-19T(Simple),DH5α保存于延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室,DNA提取試劑盒,質(zhì)粒DNA提取試劑盒,瓊脂糖凝膠回收試劑盒以及EcoRⅠ、SalⅠ均購(gòu)買于TaKaRa公司。2×Taq Master Mix購(gòu)自北京佳蘭生物科技有限公司

        1.2 引物設(shè)計(jì)與合成

        依據(jù)GenBank中已經(jīng)發(fā)表的新孢子蟲GRA7的基因序列,應(yīng)用Oligo 6.0軟件設(shè)計(jì)引物NcGRA7-ES-fullR和NcGRA7-EN-commonF,在華大基因科技股份有限公司合成。

        1.3 新孢子蟲基因組DNA提取

        將保存的蟲株復(fù)蘇并接種于Vero細(xì)胞,培養(yǎng)2~3 d,觀察到速殖子后根據(jù)TaKaRa公司DNA提取試劑盒提取新孢子蟲株的基因組DNA。

        1.4 PCR擴(kuò)增NcGRA7基因

        以提取的新孢子蟲株的DNA為模板,PCR體系為20 μL:NcGRA7-ES-fullR,NcGRA7-EN-commonF各1 μL,2×Taq Master Mix 10 μL,ddH2O 6 μL,DNA模板 2 μL。

        反應(yīng)條件:95 ℃ 5 min;95 ℃ 1 min,55 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min;35個(gè)循環(huán);72 ℃ 7 min。

        1.5 pMD-19T(simple)-NcGRA7構(gòu)建

        將擴(kuò)增出的目的片段用膠回收試劑盒進(jìn)行回收后與pMD-19T(simple)連接,連接體系:NcGRA7 PCR產(chǎn)物 4.5 μL,pMD-19T (Simple)0.5 μL,Ligation SolutionⅠ5 μL。16 ℃連接12 h,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞后涂布于Amp抗性的LB固體培養(yǎng)基,挑取單個(gè)菌落接種到Amp抗性的LB液體培養(yǎng)基中,使用質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,經(jīng)過酶切鑒定后,陽(yáng)性質(zhì)粒送往生物公司測(cè)序,測(cè)序正確將其命名為pMD-19T(simple)-NcGRA7。

        1.6 酵母雙雜交誘餌載體pGBKT7-NcGRA7的構(gòu)建

        將測(cè)序成功的pMD-19T(simple)-NcGRA7質(zhì)粒以及pGBKT7載體用EcoRⅠ和SalⅠ進(jìn)行雙酶切,膠回收后,使用T4連接酶16 ℃連接12 h,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,涂布于Kan抗性的LB固體培養(yǎng)基,經(jīng)過挑菌,搖菌及酶切鑒定后將陽(yáng)性質(zhì)粒送往生物公司測(cè)序。

        1.7 NcGRA7基因的序列比對(duì)

        應(yīng)用分子生物學(xué)軟件GENETYX對(duì)測(cè)序后的NcGRA7基因序列與GenBank中(登錄號(hào):U82229)NcGRA7基因進(jìn)行比對(duì)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PCR結(jié)果

        以新孢子蟲Nc-1株的DNA為模板,以NcGRA7-ES-fullR和NcGRA7-EN-commonF為引物擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)過1.5%瓊脂糖凝膠電泳得到約570 bp片段,與預(yù)期大小一致(圖1)。

        M:DL 2 000 Marker;1:擴(kuò)增產(chǎn)物;2:空白對(duì)照

        2.2 pMD-19T(simple)-NcGRA7酶切鑒定

        將NcGRA7的PCR產(chǎn)物與pMD-19T(simple)連接后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞中,構(gòu)建的重組質(zhì)粒經(jīng)過PCR初步鑒定后,用EcoRⅠ和SalⅠ進(jìn)行雙酶切鑒定,質(zhì)粒切出目的條帶約為570 bp,與預(yù)期大小一致(圖2)。

        圖2 pMD19T-NcGRA7質(zhì)粒酶切鑒定

        2.3 酵母雙雜交誘餌載體pGBKT7-NcGRA7的酶切鑒定

        用EcoRⅠ和SalⅠ分別對(duì)pMD-19T-NcGRA7以及pGBKT7進(jìn)行雙酶切,膠回收后進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化。經(jīng)過PCR初步鑒定后得到陽(yáng)性質(zhì)粒,再進(jìn)一步酶切鑒定,對(duì)陽(yáng)性進(jìn)行雙酶切,得到與之前一致的約570 bp大小片段(圖3)。

        圖3 pGBKT7-NcGRA7質(zhì)粒酶切鑒定

        2.4 NcGRA7基因的序列比對(duì)分析

        將去掉信號(hào)肽和疏水區(qū)的NcGRA7基因測(cè)序后,和GenBank中(登錄號(hào):U82229)NcGRA7基因進(jìn)行序列比對(duì)分析,結(jié)果表明,試驗(yàn)所獲得的NcGRA7基因與GenBank中(登錄號(hào):U82229)NcGRA7基因同源性100%(圖4),可用于后續(xù)研究。

        3 討論與結(jié)論

        利用酵母雙雜交系統(tǒng)可以從cDNA文庫(kù)和基因文庫(kù)中篩選出與構(gòu)建的誘餌載體所表達(dá)蛋白相互作用的蛋白,以此來(lái)得到相關(guān)的受體,并進(jìn)一步繪制出蛋白質(zhì)相互作用圖譜,可以增加對(duì)入侵機(jī)理的了解[5]。該試驗(yàn)研究的NcGRA7基因序列中無(wú)內(nèi)含子,其含有1個(gè)信號(hào)肽序列和1個(gè)跨膜區(qū)[6],NcGRA7蛋白是一種新孢子蟲速殖子,其特異性表達(dá)的致密顆粒抗原[7],相對(duì)分子質(zhì)量約為33 ku,該蛋白中包括3個(gè)疏水區(qū),其中,第3個(gè)疏水區(qū)是跨膜區(qū),表明了NcGRA7對(duì)空泡的形成和膜的表面修飾起到一定的作用。NcGRA7蛋白在1998年由Jacobs等篩選得到[8]。Huang等通過ELISA鑒定得出NcGRA7可能在寄生蟲誘導(dǎo)的流產(chǎn)中起作用[9]。Jenkins等通過質(zhì)粒DNA免疫研究證實(shí)了NcGRA7可以作為免疫原[10]。但目前對(duì)NcGRA7蛋白的具體功能缺乏了解。

        為篩選出與NcGRA7相互作用的蛋白,進(jìn)一步探索新孢子蟲入侵機(jī)理和制備疫苗,該試驗(yàn)構(gòu)建了酵母雙雜交誘餌載體。鑒于pMD19T(Simple)載體連接條件簡(jiǎn)便、連接效率高,試驗(yàn)將NcGRA7基因先與pMD19T(Simple)連接,獲得兩端有EcoRⅠ、SalⅠ黏性末端的NcGRA7基因后,再連接到pGBKT7載體上。

        本試驗(yàn)通過提取新孢子蟲Nc-1株的DNA,經(jīng)過PCR擴(kuò)增得到NcGRA7基因,并將其克隆到pMD19T(simple)載體。經(jīng)過測(cè)序以及序列分析鑒定,與NCBI基因庫(kù)中的NcGRA7基因序列比對(duì)結(jié)果一致。再將得到的目的基因克隆到pGBKT7載體上,成功構(gòu)建酵母雙雜交誘餌載體pGBKT7-NcGRA7,為后續(xù)試驗(yàn)酵母雙雜交鑒定奠定基礎(chǔ)。

        圖4 NcGRA7基因的核苷酸序列比對(duì)

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