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        維生素D受體基因啟動(dòng)子甲基化異常與嬰兒尿路感染相關(guān)性研究

        2018-06-28 09:13:32楊建環(huán)王德選陳敏廣胡小涵
        浙江醫(yī)學(xué) 2018年12期
        關(guān)鍵詞:亞硫酸氫鈉尿路感染甲基化

        楊建環(huán) 王德選 陳敏廣 胡小涵

        尿路感染是嬰幼兒時(shí)期最常見的發(fā)熱性疾病之一,約2%的男孩和8%的女孩在6歲內(nèi)曾患過急性尿路感染,反復(fù)的尿路感染可引起腎瘢痕形成、高血壓、腎功能不全等[1]。維生素D受體(vitamin D receptor,VDR)是核受體超家族成員之一,在哺乳動(dòng)物中幾乎所有組織均表達(dá)VDR[2]。維生素D3/VDR信號(hào)涉及機(jī)體的礦物質(zhì)代謝和骨穩(wěn)態(tài),調(diào)節(jié)機(jī)體的生長發(fā)育,并在癌癥預(yù)防及調(diào)節(jié)免疫功能等方面發(fā)揮重要作用[3-4]。

        DNA甲基化是最早發(fā)現(xiàn)的表觀遺傳修飾途徑之一,而DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase,DNMTs)參與了DNA甲基化過程[5]?;騿?dòng)子區(qū)域和增強(qiáng)子區(qū)域CpG島的甲基化可以使一些轉(zhuǎn)錄因子無法與DNA相結(jié)合,從而抑制基因的轉(zhuǎn)錄;而特定基因的低甲基化可導(dǎo)致該基因呈過度表達(dá)狀態(tài),從而參與疾病的發(fā)生和發(fā)展過程[6]。研究表明VDR基因啟動(dòng)子甲基化異??赡芘c某些疾病的發(fā)生相關(guān),如乳腺癌患者的VDR基因啟動(dòng)子甲基化異??赡芘c化療耐藥相關(guān)[7]。然而目前國內(nèi)外有關(guān)VDR基因啟動(dòng)子甲基化異常與嬰兒尿路感染的相關(guān)性研究尚少,因此本研究旨在探討尿路感染嬰兒VDR基因表達(dá)變化,同時(shí)研究DNA甲基化異常對VDR基因表達(dá)的影響。

        1 對象和方法

        1.1 對象 選擇2015年8月至2016年2月在本院兒童腎內(nèi)科住院的急性尿路感染患兒32例(尿路感染組),年齡1~12個(gè)月。入選標(biāo)準(zhǔn):(1)初發(fā)的發(fā)熱性尿路感染;(2)主要臨床癥狀為發(fā)熱、喂養(yǎng)困難、嘔吐、尿液渾濁、尿臭、排尿哭吵不安、精神萎靡等;(3)白細(xì)胞尿或膿尿;(4)腎靜態(tài)核素顯像提示腎盂腎炎。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)合并腎臟或泌尿道先天性畸形的嬰兒;(2)合并尿路結(jié)石。選擇同期本院門診健康體檢嬰兒30例作為健康對照組,年齡1~12個(gè)月。本研究獲得醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)和患兒家屬知情同意。

        1.2 VDR、DNMTs mRNA表達(dá)水平檢測 采用熒光定量PCR法。先用Trizol法提取外周血單個(gè)核細(xì)胞的總mRNA,逆轉(zhuǎn)錄成 cDNA(PrimeScript RT reagent Kit,大連寶生物工程有限公司)。再用SYBR Green熒光定量PCR法檢測mRNA的表達(dá)水平[FastStart Universal SYBR Green Master(ROX),羅氏(Roche)生物公司],反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5min,然后95℃變性 10s,60℃退火 20s、72℃延伸 20s,共 40 個(gè)循環(huán)。結(jié)果以 2-ΔCT相對定量表示,所有樣本均設(shè)置復(fù)孔。引物合成由上海生工生物有限公司完成,引物序列見表1。

        表1 PCR引物序列

        1.3 重亞硫酸氫鈉測序技術(shù)(BSP)檢測VDR基因啟動(dòng)子的甲基化水平 提取樣本的全血基因組DNA 1ng~2μg,血液基因組DNA提取試劑盒購置天根生化科技(北京)有限公司,操作過程參考說明書。經(jīng)亞硫酸氫鈉處理后[EpiTect bisulfite kit試劑盒,凱杰生物技術(shù)(上海)有限公司,操作過程參考說明書],DNA序列中非甲基化的脫氧胞嘧啶(C)均被亞硫酸氫鈉轉(zhuǎn)變?yōu)槊撗跄蜞奏ぃ║),而甲基化狀態(tài)下脫氧胞嘧啶(C)不會(huì)被亞硫酸氫鈉轉(zhuǎn)變。將亞硫酸氫鈉處理后的基因組DNA送檢上海生工生物有限公司進(jìn)行BSP分析。尿路感染組和健康對照組各送檢12例樣本,每例樣本檢測5個(gè)克隆。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)量資料以表示,組間比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩組VDR mRNA表達(dá)水平比較 尿路感染組患兒VDR mRNA表達(dá)水平為0.096±0.015,高于健康對照組嬰兒的0.046±0.009,兩組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖 1。

        圖1 兩組VDR mRNA表達(dá)水平比較

        2.2 兩組DNMTs mRNA表達(dá)水平比較 尿路感染組患兒DNMT1 mRNA表達(dá)水平為0.034±0.006,低于健康對照組嬰兒的0.057±0.009,兩組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見圖2。尿路感染組患兒 DNMT3a mRNA表達(dá)水平為0.056±0.009,健康對照組嬰兒為0.072±0.010,兩組比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見圖3。尿路感染組患兒DNMT3b mRNA表達(dá)水平為0.038±0.005,低于健康對照組嬰兒的 0.045±0.007,兩組比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見圖4。

        2.3 兩組VDR基因甲基化水平比較 BSP檢測結(jié)果顯示,VDR基因片段中共含有13個(gè)CpG位點(diǎn)。12例尿路感染組患兒VDR基因啟動(dòng)子的甲基化水平為(0.00±0.00)%,而健康對照組嬰兒VDR基因啟動(dòng)子的甲基化水平為(5.31±8.19)%,兩組比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),提示尿路感染患兒的VDR基因啟動(dòng)子呈低甲基化狀態(tài),見圖5。

        圖2 兩組DNMT1 mRNA表達(dá)水平比較

        圖3 兩組DNMT3a mRNA表達(dá)水平比較

        圖4 兩組DNMT3b mRNA表達(dá)水平比較

        圖5 兩組VDR基因甲基化水平比較

        3 討論

        VDR是介導(dǎo)維生素D發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)的細(xì)胞內(nèi)生物大分子,屬于甲狀腺激素受體和類固醇激素受體的超家族成員。既往研究發(fā)現(xiàn)維生素D缺乏與嬰兒尿路感染相關(guān)[8],本研究探討了VDR與嬰兒尿路感染的關(guān)系,結(jié)果提示尿路感染患兒VDR mRNA表達(dá)水平升高。這可能與機(jī)體通過提高VDR的表達(dá)水平,來增強(qiáng)維生素D與VDR的結(jié)合,從而彌補(bǔ)尿路感染患兒維生素D不足所帶來的效應(yīng)。

        為進(jìn)一步探討尿路感染患兒VDR mRNA表達(dá)增高的機(jī)制,筆者進(jìn)一步研究了DNA甲基化對VDR基因啟動(dòng)子的調(diào)控作用。筆者采用BSP檢測VDR啟動(dòng)子的甲基化水平,發(fā)現(xiàn)12例尿路感染組患兒VDR基因啟動(dòng)子為完全低甲基化,甲基化水平為(0.00±0.00)%;而健康對照組嬰兒VDR基因啟動(dòng)子甲基化水平為(5.31±8.19)%。因此尿路感染患兒VDR基因啟動(dòng)子呈低甲基化狀態(tài),導(dǎo)致VDR mRNA表達(dá)水平增高,從而影響維生素D與VDR的結(jié)合。由此推測尿路感染患兒的VDR基因表達(dá)受DNA甲基化水平的影響,DNA低甲基化水平促進(jìn)VDR基因的表達(dá)。

        DNA甲基化通常發(fā)生在CpG二核苷酸的5′側(cè)胞嘧啶上,而絕大多數(shù)CpG位點(diǎn)在細(xì)胞的整個(gè)生命周期中保持著甲基化狀態(tài)[9]。CpG島的位置主要處于基因啟動(dòng)子區(qū)域,且CpG島的甲基化可直接導(dǎo)致相關(guān)基因發(fā)生轉(zhuǎn)錄沉默[10]。既往研究表明VDR基因甲基化異??赡芘c某些疾病的發(fā)生相關(guān),例如乳腺癌患者的VDR基因甲基化異??赡芘c化療耐藥相關(guān)[7]。本研究發(fā)現(xiàn)VDR基因甲基化異常與嬰兒尿路感染相關(guān)。

        DNMTs是催化DNA甲基化的主要反應(yīng)酶,包括DNMT1、DNMT3a、DNMT3b 和 DNMT3L,它們之間相互協(xié)調(diào),共同維持基因組DNA的甲基化穩(wěn)定[11]。在正常成人組織中,DNMT1呈持續(xù)性低表達(dá)狀態(tài),DNMT3a與DNMT3b呈失表達(dá)或低表達(dá)狀態(tài);而在癌細(xì)胞中DNMTs呈過度表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn)在子宮內(nèi)膜樣腺癌中,DNMT1、DNMT3b的表達(dá)水平比正常組織升高2~4倍[12]。本研究對DNMT1、DNMT3a、DNMT3b mRNA表達(dá)水平進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)尿路感染患兒的DNMT1 mRNA表達(dá)水平降低,而DNMT3a、DNMT3b mRNA表達(dá)水平無明顯差異,提示DNMT1表達(dá)水平降低可能與尿路感染患兒VDR基因啟動(dòng)子的低甲基化水平相關(guān)。

        綜上所述,筆者推測尿路感染患兒DNMT1表達(dá)水平降低導(dǎo)致VDR基因啟動(dòng)子的低甲基化水平,從而引起VDR mRNA表達(dá)水平升高。本研究從表觀遺傳學(xué)水平上探討了VDR基因表達(dá)調(diào)控的可能機(jī)制,為今后深入研究表觀遺傳學(xué)與VDR基因表達(dá)的關(guān)系提供理論基礎(chǔ)。由于本研究是基于臨床的病例對照分析,可能存在樣本偏差,今后需要更大的臨床樣本數(shù)及分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)來驗(yàn)證。

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