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        兒童腸球菌耐萬古霉素表型和耐藥基因檢測分型的研究*

        2018-05-25 00:44:15張彩虹張學忠
        西部醫(yī)學 2018年5期
        關(guān)鍵詞:拉寧萬古霉素球菌

        張彩虹 張學忠

        (淄博市中心醫(yī)院,山東 淄博 255036)

        腸球菌已成為導致醫(yī)院感染的重要病原菌,隨著抗菌藥物選擇壓力的不斷提高,目前腸球菌獲得耐藥性明顯增強,且呈多重耐藥,耐萬古霉素腸球菌(Vancomycin-Resistant Enterococcus,VRE)所致的醫(yī)院感染呈逐年上升趨勢[1-3]。近些年兒童腸球菌導致敗血癥的發(fā)病率增加了6倍[2]。目前兒童感染VRE的臨床治療相當棘手,可用于治療VRE感染的抗菌藥物非常有限,包括價格昂貴的利奈唑胺、達托霉素及毒副作用較大的氯霉素[4-5]。本研究共采集患兒170個肛門拭子進行腸球菌培養(yǎng)及鑒定,篩選出VRE菌株并進行表型及基因型檢測,對VRE定植菌菌種構(gòu)成、耐藥基因型及表型進行檢測分析,探討是否存在新的耐藥基因簇,為兒童VRE醫(yī)院感染防控提供初步實驗研究依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 臨床實驗菌株 2016年1月~12月期間,每月1次于我院兒科采集10~20位住院患兒肛門拭子,分離經(jīng)耐萬古霉素腸球菌篩選鑒定培養(yǎng)基培養(yǎng)陽性,革蘭染色符合腸球菌形態(tài)的細菌。質(zhì)控菌株:由衛(wèi)生部臨床檢驗中心提供, 糞腸球菌ATCC29212。儀器設(shè)備采用梅里埃VITEK 2 Compact 全自動細菌鑒定及藥敏分析系統(tǒng),PCR儀 Deltier Thermal Gradient Cycler PTC-200抗菌藥物粉劑為慶大霉素、氨芐西林、米諾環(huán)素、環(huán)丙沙星、利奈唑胺由中國藥品生物制品檢定所提供,萬古霉素、青霉素、替考拉寧購自國藥集團藥業(yè)有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 藥敏實驗 采用瓊脂對倍稀釋法測定萬古霉素、替考拉寧、青霉素、慶大霉素、氨芐西林、米諾環(huán)素、環(huán)丙沙星、利奈唑胺對21株耐萬古霉素腸球菌的最低抑菌濃度。MIC值為抑制細菌生長的最低藥物稀釋度??咕幬锝Y(jié)果解釋和判讀均按2015版美國國家臨床實驗室標準化協(xié)會(CLSI)的標準執(zhí)行[6],根據(jù)所測得的MIC值判讀細菌藥敏結(jié)果為敏感(S)、中介(I)、耐藥(R),見表1。

        1.2.2 PCR引物 vanA、vanB、vanC1、vanC2/C3、E. faecalis、E. faecium、rrs (16S rRNA)引物參照文獻設(shè)計[7],由廣州華大基因生物技術(shù)有限公司合成,見表2。

        表1 抗菌藥物對腸球菌的MIC結(jié)果判讀標準Table 1 Criteria for judging MIC results of enterococci by antibiotics

        表2 用于擴增van基因的引物Table 2 Primers for amplification of van gene

        1.2.3 PCR法確認菌種 反應(yīng)體系:12.5μl的2xEasyTaq SuperMix,9.5μl雙蒸水,1.0μl引物1-F,1.0μl引物1-R,1.0μlDNA模板。PCR反應(yīng)條件:94℃預變性5min,94℃變性1min,54℃退火1min,72℃ 延伸1min,重復30個循環(huán),最后72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳成像和測序。

        1.2.4 PCR法檢測耐藥基因型 反應(yīng)體系:12.5μl的2xEasyTaq SuperMix,9.5μl雙蒸水,1.0μl引物2-F,1.0μl引物2-R,1.0μlDNA模板。PCR反應(yīng)條件:94℃預變性5min,94℃變性1min,54℃退火1min,72℃ 延伸1min,重復30個循環(huán),最后72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳成像和測序。

        2 結(jié)果

        2.1 基本情況 本研究中納入170例兒童肛門拭子中篩選出21株VRE,其陽性率12.4%。在分離的21株VRE中屎腸球菌最常見為14株(66.7%),糞腸球菌為4株,鶉雞腸球菌1株,鉛黃腸球菌1株和不明菌株1株。

        2.2 分離的21株VRE對8種抗生素MIC的測定 本研究中VRE對大部分納入測定的抗菌藥物的耐藥率超過50%,包括對環(huán)丙沙星的耐藥率為90.5%,對青霉素者為81%,對氨芐西林者為76.2%,對慶大霉素高度耐藥(High level aminoglycosides resistance, HLAR)為61.9%。而對米諾環(huán)素敏感率為95.2%,對利奈唑胺的敏感率為100%,見表3。

        表3 8種抗菌藥物對21株VRE的MIC值(mg/L)Table 3 MIC value of 8 antibiotics against 21 strains of VRE

        2.3 分離的21株VRE對糖肽類抗菌藥物耐藥情況測定 本研究分離的21株VRE均對糖肽類抗菌藥物耐藥,見表4、表5。

        表4 萬古霉素對21株耐VRE的MIC值(mg/L)分布Table 4 MIC value distribution of vancomycin against 21 VRE resistant strains

        表5 替考拉寧對21株耐VRE的MIC值(mg/L)Table 5 Teicoplanin against 21 strains of VRE resistant MIC value

        2.4 耐藥基因的PCR檢測及測序

        2.4.1 經(jīng)PCR檢測21株耐萬古霉素腸球菌耐藥基因型,18株含vanA型耐藥基因,1株含vanC1型耐藥基因,1株vanC2/3型耐藥基因,1株耐藥基因不明確。vanA基因型是本研究中VRE最常見的耐藥基因型。以陰性對照,行PCR,分別選取1株vanA, vanC1、vanC2基因產(chǎn)物電泳成像,見圖1。

        圖1 2%瓊脂糖凝膠電泳耐萬古霉素腸球菌PCR產(chǎn)物結(jié)果

        Figure12%agarosegelelectrophoresisresultsofvancomycinresistantEnterococcusPCRproducts

        注:M.molecular size marker(1kb ladder) Lanes; 1.陰性對照; 2.vanA基因陽性對照; 3.vanA基因; 4. vanC1基因;5.vanC2/C3基因; 6.屎腸球菌;7.糞腸球菌

        2.4.2 將PCR擴增獲得的耐藥基因片段進行測序(含vanA、vanC1 、vanC2/C3基因菌株各1株), 所得結(jié)果與GenBank 上已知序列進行比較, 發(fā)現(xiàn)vanA、vanC1 、vanC2/C3基因均未發(fā)生突變,見圖2。

        2.5 追蹤VRE定植陽性者 追蹤分析VRE定植陽性患者,根據(jù)臨床醫(yī)生診斷及有感染癥狀患者的痰培養(yǎng)、血培養(yǎng)、尿培養(yǎng)等檢查,21例VRE定植患者沒有繼發(fā)VRE感染。

        3 討論

        研究已證實VRE對大部分抗菌藥物耐藥[3,5]。VanA與VanB是耐萬古霉素腸球菌6個表型中最常見的表型[8-10]。VanA 表型呈萬古霉素和替考拉寧均高水平耐藥,VanB 表型呈萬古霉素高水平耐藥, 替考拉寧低水平耐藥,VanC 表型呈萬古霉素和替考拉寧均低水平耐藥,天然耐藥[11]。VRE基因型與表型可不一致,據(jù)報道,有VanB表型-vanA基因型,VanD 表型-vanA基因型,VanB表型-vanC1+vanB基因型等[12-14]。VRE常常顯示多重耐藥(如屎腸球菌通常耐氨基糖苷類和青霉素類),鉛黃腸球菌和鶉雞腸球菌對萬古霉素呈低水平耐藥。屎腸球菌大多對萬古霉素呈高度耐藥,而糞腸球菌較少見。

        圖2耐藥基因測序
        Figure2Resistancegenesequencing

        注:a. vanA(89)-FOR;b. vanA(89)-REW;c. vanC1(116)-FOR;d. vanC1(116)-EWR;e. VanC2/3(53)-FOR;f. VanC2/C3(53)-REW

        文獻報道[15],韓國醫(yī)院15%VRE為VanD表型-vanA基因型,即含vanA基因,卻對替考拉寧敏感或中介。通過體內(nèi)外一系列實驗證明,替考拉寧治療VanD-vanA的VRE菌株感染將會失敗。研究提示,盡管VanD-vanA的VRE菌株對替考拉寧敏感,但體內(nèi)外實驗證明替考拉寧對治療VanD-vanA 型VRE菌株感染無效。通過體外藥敏檢測VRE菌的表型,不能作為臨床治療中選擇抗菌藥物唯一的依據(jù),因此在治療耐萬古霉素腸球菌時耐藥基因型測定更有參考價值。

        糞便、肛門拭子是篩查分離VRE的最常用標本[16]。本研究所取170個肛門拭子中,耐萬古霉素腸球菌分離陽性率12.4%(21/170)。耐萬古霉素運動腸球菌(鉛黃腸球菌、鶉雞腸球菌)陽性1.2%(2/170),1株腸球菌不明菌種。21株耐萬古霉素腸球菌中菌種分布情況:屎腸球菌66.7%(14/21),糞腸球菌19%(4/21),鉛黃腸球菌4.8%(1/21), 鶉雞腸球菌4.8%(1/21),不明菌種4.8%(1/21)。耐萬古霉素腸球菌在屎腸球菌中最常見,與多篇文獻報道一致。

        本研究中,VRE對大部分檢測抗菌藥物耐藥率超過50%,包括環(huán)丙沙星(90.5%)、青霉素(81%)、 氨芐西林(76.2%)、慶大霉素(HLAR 61.9%)。但仍對米諾環(huán)素(95.2%)與利奈唑胺 (100%)敏感。21株VRE的萬古霉素、替考拉寧MIC范圍分別為8μg/mL->512μg/mL、 0.25μg/mL->512μg/mL ,對萬古霉素高水平耐藥的VRE(MIC,64μg/mL-≥1000μg/mL)18 株,對替考拉寧高水平耐藥的VRE(MIC,16-512 μg/mL)14 株。對萬古霉素與替考拉寧菌高水平耐藥的VRE株14株,萬古霉素高水平耐藥但對替考拉寧敏感(MIC≤8μg/mL)的VRE 4 株。本研究中,鉛黃腸球菌對萬古霉素高水平耐藥,但對替考拉寧敏感; 鶉雞腸球菌對萬古霉素為中介,但對替考拉寧敏感。

        經(jīng)PCR檢測,21株耐萬古霉素腸球菌,18株含vanA型耐藥基因,1株含vanC1型耐藥基因,1株vanC2/C3型耐藥基因,1株耐藥基因不明確。無vanB型耐藥基因。根據(jù)PCR結(jié)果與藥敏結(jié)果分析,9株vanA基因型與表型相符,2株vanA基因簇表型為萬古霉素中介,替考拉寧敏感,7株VanD 表型-vanA基因型;鉛黃腸球菌對萬古霉素高水平耐藥(MIC=512mg/L),但對替考拉寧敏感(MIC=4mg/L),與VanC表型不符; 鶉雞腸球菌對萬古霉素為中介( MIC=8mg/L ),但對替考拉寧(MIC=0.25mg/L)敏感,與VanC表型相符。

        本研究中,1株不明菌種且不明耐藥基因型,由于本研究中PCR引物只有屎腸球菌、糞腸球菌及vanC1、vanC2、vanC3對應(yīng)特異性菌株,耐藥基因型引物僅有vanA、vanB、vanC1、vanC2/C3,需進一步測定該菌株16S rRNA及其他6種耐藥基因型是否相符,如不相符還應(yīng)對耐藥型進行進一步明確,該菌株表型呈VanA表型。進行了體外藥敏實驗及PCR檢測耐藥基因型,僅判斷出VRE的表型及基因型, VanD表型-vanA基因型VRE感染是否能使用替考拉寧治療,仍需要進行體內(nèi)外實驗加以證明。

        追蹤VRE定植陽性患者,無VRE感染。我院萬古霉素的使用合理,手衛(wèi)生規(guī)范,適當隔離與VRE陽性患者密切接觸者。因此雖然肛門拭子VRE陽性率12.4%,但VRE定植陽性患者,VRE感染率為0,尚沒有出現(xiàn)VRE。國內(nèi)許多研究報道多家醫(yī)院已出現(xiàn)了成人VRE,且對VRE同源性及流行性進行了分析報道[9,17,18]。近些年,隨著萬古霉素的大量應(yīng)用,VRE的不斷出現(xiàn),兒童中也將會出現(xiàn)VRE[20,21],因此對腸球菌的耐藥監(jiān)測是勢在必行的。

        4 結(jié)論

        本文資料顯示,VRE對利奈唑胺、米諾環(huán)素較敏感,臨床可作為治療兒童VRE感染的選擇藥物。本研究中VanA基因型最常見,臨床在使用抗菌藥物治療中應(yīng)予重視。

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