任有良, 劉道廣, 張 悅, 溫 恒, 喬成芳, 劉 萍*
(1.商洛學院化學工程與現(xiàn)代材料學院,陜西商洛 726000;2.陜西省尾礦資源綜合利用重點實驗室,陜西商洛 726000)
端粒DNA(GDNA)是富含G堿基的高度保守的重復核苷酸序列,在K+、Na+等陽離子以及一些藥物小分子的存在下,通過Hoogsteen氫鍵形成穩(wěn)定的G -四鏈體結(jié)構(gòu)[1-4]。研究表明,能夠誘導端粒DNA形成G -四鏈體結(jié)構(gòu)的小分子化合物具有重大的抗腫瘤意義,而以G -四鏈體為抗腫瘤藥物作用靶點篩選配體的方法是目前研究的熱點。
尋找以端粒DNA為作用靶點,毒性低的抗腫瘤藥物引起了科研工作者的極大的興趣。目前人們采用紫外吸收光譜、熒光光譜、電化學、圓二色光譜、核磁共振波譜、X-射線衍射、表面等離子體共振等多種方法[5-10],從不同角度來研究GDNA與小分子配體的相互作用。熒光光譜法具有操作簡單、靈敏度高、響應速度快,尤其是已經(jīng)被廣泛應用的基于構(gòu)型轉(zhuǎn)換的熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)方法是研究GDNA與配體之間作用機理的一個重要方法。Simonsson和Sj?back研究小組[6]在單鏈GDNA的兩端分別標記熒光基團和猝滅基團,在一些金屬離子或者四鏈體配體的作用下,GDNA自身折疊形成G -四鏈體,引起熒光共振能量轉(zhuǎn)移導致熒光強度減低,可以通過熒光強度的變化來檢測G -四鏈體的形成。Jin等[11]基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移,用納米金作為猝滅劑,5′標記熒光素(FAM)的人端粒DNA(F-GDNA)作為探針,設計了一端標記的、簡單快速地篩選G -四鏈體配體的方法。雖然GDNA與小分子配體的熒光分析方法有很多,但是這些方法大多需要熒光標記,操作復雜,儀器昂貴,成本較高。因此非常有必要建立一些簡單、快速并且能夠被廣泛應用的方法來篩選與G -四鏈體作用的配體。
中藥單體是天然化合物的提取物,研究發(fā)現(xiàn)一些中藥單體像槲皮素、蘆丁、白楊素、大豆苷元等黃酮類化合物[12-15]對腫瘤治療有一定的化學預防作用。本文以天然抗腫瘤中藥單體槲皮素作為研究對象,基于GDNA結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變,構(gòu)建了一種無標記熒光方法考察GDNA與槲皮素的相互作用,根據(jù)N-甲基卟啉二丙酸Ⅸ(NMM)/GDNA體系中加入槲皮素前后熒光強度的變化,快速有效地篩選能夠誘導GDNA形成G -四鏈體結(jié)構(gòu)的藥物,為抗腫瘤藥物的開發(fā)和研究以及腫瘤的臨床治療等提供重要的。
F-4600型日立熒光分光光度計(日本,日立公司);UV-1600PC型紫外-可見分光光度計(上海美譜達儀器有限公司);pHS-3C型pH計(上海精密科學儀器有限公司);TGL-18C離心機(上海安亭科學儀器廠)。
人端粒DNA(F-GDNA):(5′-TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGG-3′),RDNA:(5′-GTTCATGCCGCCCATGCTCG-3′)由上海生物工程有限公司合成,用TE緩沖溶液(10 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA,pH=7.2)配制成100 μmol/L的儲備液;槲皮素、蘆丁、大豆苷元、黃連素、木犀草素、山奈酚、苦參堿、綠原酸、黃連素、熊果酸等(上海金穗生物科技有限公司)均用無水乙醇溶解,用超純水配制成濃度為100 μmol/L的母液;NMM(北京百靈威科技有限公司)、EDTA、無水乙醇等所用試劑均為分析純。實驗緩沖體系為pH=7.2的10 mmol/L Tris-HCl;用水均為Milli-Q(18.2 MΩ·cm)超純水。
1.2.1熒光光譜法取100 μL 5 μmol/L NMM溶液于微量比色皿中,測量其熒光光譜。向NMM溶液中加入1 μL 100 μmol/L GDNA,混合均勻后放置15 min,測定其熒光強度(F0);然后向體系中加入2 μL濃度為100 μmol/L槲皮素溶液,混合均勻后放置30 min,測定其熒光強度(F)。
激發(fā)光源采用氙燈激發(fā),激發(fā)波長λex為610 nm,發(fā)射波長λem為600~700 nm,激發(fā)與發(fā)射光狹縫均為10 nm,光電倍增管電壓950 V。
1.2.2紫外-可見吸光光譜法移取2 mL 8 μmol/L NMM溶液于1 cm為石英比色皿中,測量其紫外光譜。向NMM溶液中加入5 μmol/L GDNA,混合均勻后放置15 min,測量其紫外光譜,然后再分別加入濃度為2 μmol/L和10 μmol/L的槲皮素溶液,混合均勻后放置30 min,進行紫外檢測。
NMM是一種特殊的陰離子卟啉化合物,能夠與G -四鏈體特異性結(jié)合,而對單鏈、二鏈體、三鏈體都無特異性結(jié)合[16-17]。NMM游離狀態(tài)時,熒光強度微弱,但NMM與G -四鏈體結(jié)合后,熒光強度顯著增強[18-19]。NMM已經(jīng)廣泛應用于DNA[20]、核酸酶[18]和一些生物小分子檢測。本文基于NMM與G -四鏈體的特異性結(jié)合,通過考察槲皮素與NMM/GDNA 作用前后體系熒光強度的變化,實現(xiàn)篩選 G -四鏈體小分子配體的目的。實驗原理見圖1。
圖1 無標記篩選G -四鏈體小分子配體的實驗原理Fig.1 Schematic illustration of label-free screening small molecule ligands of G-quadruplex
2.2.1熒光光譜為驗證方法的可行性,我們選取槲皮素作為研究對象,分別測量了NMM、NMM/GDNA、NMM/GDNA+槲皮素體系的熒光強度。結(jié)果如圖2所示,NMM溶液熒光強度很低,當與 GDNA結(jié)合后,NMM的熒光強度有所增加,可能是NMM的環(huán)境改變引起,加入槲皮素配體后,體系的熒光強度明顯增強??赡苁情纹に卣T導GDNA形成G -四鏈體結(jié)構(gòu),NMM嵌入G -四鏈體結(jié)構(gòu)中后使體系熒光強度大大增強。
為驗證實驗體系熒光強度的增加是因為槲皮素與GDNA相互作用形成了G -四鏈體,選擇了一條對照鏈RDNA,這條鏈含有少量鳥嘌呤G堿基,在其它條件不變的情況下,將GDNA換成RDNA,研究不同濃度槲皮素對NMM/RDNA的熒光強度的影響。結(jié)果表明,不同濃度的槲皮素不能使NMM/RDNA體系熒光強度增加。只有在NMM/GDNA體系里加入槲皮素,熒光強度才有明顯的增加,這與實驗原理相符合,即槲皮素能夠誘導單鏈的端粒DNA折疊形成G -四鏈體,從而使體系的熒光強度大大增強。
為進一步驗證實驗原理,還考察了一種生物堿類小分子苦參堿(Matrine)與NMM/GDNA體系的作用,在其它條件不變的情況下,研究不同濃度苦參堿對NMM/GDNA的熒光強度的影響,實驗所取條件與槲皮素相同,結(jié)果如圖3所示。從圖中可以看出,在NMM/GDNA體系中加入2、4、6、8和10 μmol/L的苦參堿以后,體系的熒光強度幾乎沒有改變,說明苦參堿不能誘導GDNA形成G -四鏈體結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明,苦參堿也不能使體系熒光強度增加,只有在NMM/GDNA體系中加入槲皮素,才能使體系的熒光強度得到增強,進一步說明槲皮素能夠誘導GDNA形成G -四鏈體。
圖2 NMM/GDNA體系與槲皮素作用的熒光光譜Fig.2 Fluorescence emission spectra of NMM/GDNA+Quercetina:5 μmol/L NMM;b:5 μmol/L NMM+1 μmol/L GDNA;c:b+2 μmol/L Quercetin.
圖3 NMM/GDNA體系與苦參堿作用的熒光光譜Fig.3 Fluorescence emission spectra of NMM/GDNA+Matrinea:NMM;b:NMM/RDNA;c - g:2,4,6,8,10 μmol/L Matrine.
2.2.2紫外-可見吸收光譜實驗還采用紫外-可見吸光光譜法來考察槲皮素與GDNA之間的相互作用。實驗結(jié)果如圖4所示,可以看出在NMM/GDNA體系中加入槲皮素后體系的吸收光譜發(fā)生了減色現(xiàn)象,可能是配體與G -四鏈體的氫鍵對發(fā)生π電子堆積,配體嵌插到G -四鏈體結(jié)構(gòu)中,插入的配體π*空軌道與堿基的π電子軌道發(fā)生耦合,耦合后π*軌道因部分填充電子,使π-π*躍遷幾率減小,產(chǎn)生了減色效應[5]。吸收光譜變化越大減色效應越明顯,表明嵌入程度越強。實驗結(jié)果也說明了槲皮素能誘導GDNA形成了G -四鏈體結(jié)構(gòu),并嵌插入G -四鏈體中從而引起減色效應。
圖4 不同濃度的槲皮素與GDNA/NMM體系的紫外-可見(UV-Vis)吸收光譜Fig.4 UV-Vis absorption spectra of GDNA/NMM with different concentrations of Quercetina:8 μmol/L NMM;b:5 μmol/L GDNA;c:2 μmol/L Quercetin;d:8 μmol/L NMM+5 μmol/L GDNA;e:d+2 μmol/L Quercetin;f:d+10 μmol/L Quercetin.
2.3.1穩(wěn)定時間的選擇實驗考察了槲皮素與NMM/GDNA體系熒光強度隨時間的變化關(guān)系。5 μmol/L NMM+1 μmol/L GDNA,混勻放置15 min,向該體系中加入2 μmol/L槲皮素后,每隔5 min測量該體系的熒光強度。結(jié)果顯示隨著作用時間的增加,體系熒光強度逐漸增加,但到30 min時,熒光強度變化趨于穩(wěn)定,說明槲皮素與NMM/GDNA已經(jīng)充分作用,實驗選擇混合30 min后測定。
2.3.2NMM濃度的選擇NMM的濃度對傳感器的熒光信背比產(chǎn)生顯著的影響。為了優(yōu)化實驗條件,考察了不同濃度NMM對體系熒光強度變化的影響。結(jié)果可以看出隨著熒光染料的濃度逐漸增加,傳感器的熒光變化值逐漸增加,當濃度增加為5 μmol/L后,傳感器的熒光強度變化達到最大。若繼續(xù)增加的濃度,傳感器的背景信號也會增大,熒光強度變化反而減小,實驗選擇NMM的濃度為5 μmol/L。
實驗考察了槲皮素濃度與NMM/GDNA體系熒光強度變化之間的關(guān)系。結(jié)果如圖5(A)、5(B)所示。從5(A)可以看出:隨著槲皮素濃度逐漸增加,體系的熒光強度也在增強,這說明槲皮素的增加使得越來越多的GDNA形成了G -四鏈體,使得體系的熒光強度增大,同時也說明槲皮素是一種能夠誘導GDNA形成G -四鏈體的小分子配體。圖5(B)表示不同濃度槲皮素與體系熒光強度變化的點線圖及線性關(guān)系。結(jié)果顯示槲皮素濃度在2~10 nmol/L時與體系熒光強度變化呈良好的線性,檢出限0.7 nmol/L,線性方程[(F-F0)/F0]=0.0473c+0.0157(c的單位為nmol/L),R=0.9972。
圖5 (A)不同濃度槲皮素與GDNA/NMM體系作用熒光光譜;(B)槲皮素濃度與GDNA/NMM體系熒光強度變化的點線圖和校準曲線Fig.5 (A) Fluorescence emission spectra of GDNA/NMM in presence of Quercetin with different concentration;(B)Point plots of change rate of fluorescence intensity GDNA/NMM with the increasing of Quercetin concentration and the calibration plots for QuercetinNMM:5 μmol/L;GDNA:1 μmol/L;Quercetin:b-f:0,2,4,6,8,10,100,200,1 000 nmol/L.
應用本方法考察了黃酮類化合物、生物堿、蒽醌類化合物和有機酸(表1)等小分子化合物,這些小分子化合物是從中藥中提取出來的天然抗腫瘤藥物小分子。通過考察加入藥物前后NMM/GDNA體系熒光強度的變化來反映不同藥物對體系的影響,從而來識別G -四鏈體的配體。表中ΔF=F-F0,其中F和F0分別表示不存在和存在藥物的情況下NMM/GDNA體系的熒光強度。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在相同實驗條件下黃酮類化合物都能使NMM/GDNA體系的熒光強度有一定程度的增加,而生物堿類、蒽醌類化合物(大黃素)及有機酸卻變化不大。說明黃酮類化合物能促使GDNA形成G -四鏈體,而生物堿類、蒽醌類和有機酸等化合物難以誘導GDNA形成G -四鏈體結(jié)構(gòu)。
表1 加入不同藥物引起NMM/GDNA體系熒光強度變化
*The concentration of NMM,GDNA and ligands are 5 μmol/L,1 μmol/L and 2 μmol/L,respectively.
本文以槲皮素為研究對象,熒光染料NMM為指示劑,利用其與G -四鏈體結(jié)構(gòu)特異性結(jié)合的特點,構(gòu)建了一種在均相溶液中篩選 G -四鏈體小分子配體的熒光新方法。研究發(fā)現(xiàn)黃酮類化合物能促使GDNA形成G -四鏈體,而生物堿類和有機酸等化合物難以誘導GDNA形成G -四鏈體結(jié)構(gòu)。該方法不僅用于考察槲皮素與 GDNA 的作用,還可以用于篩選與 G -四鏈體作用的離子、蛋白質(zhì)、合成的藥物等小分子配體,對抗腫瘤藥物的開發(fā)和研究,腫瘤的臨床治療等有重要的理論和實際意義。
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