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        耐碳青霉烯類腸桿菌科細(xì)菌耐藥基因分析

        2018-04-16 03:11:14劉宇豪次仁曲珍周俊英武漢大學(xué)武漢43007
        關(guān)鍵詞:耐藥

        劉宇豪,陳 晨,次仁曲珍,周俊英,3 (.武漢大學(xué),武漢 43007;

        2.西藏山南婦幼保健院,西藏山南 856000;3.武漢大學(xué)中南醫(yī)院,武漢 430071)

        由于抗生素的不合理使用,細(xì)菌對抗生素的耐藥率越來越高,耐碳青霉烯類腸桿菌科細(xì)菌(CRE)檢出率也逐年遞增,CRE耐藥機(jī)制非常復(fù)雜,已在世界范圍內(nèi)引起廣泛關(guān)注[1,2]。本研究通過對中南醫(yī)院CRE耐藥菌株分布及耐藥基因的分析,為CRE的感染控制提供依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1菌株來源收集2015~2017年武漢大學(xué)中南醫(yī)院檢驗(yàn)科保存的53株CRE。

        1.2主要試劑Taq酶(美國Fermentas公司),dNTP(湖北晶茂生物技術(shù)公司),DNA Marker 100bp(廣州東盛生物科技),6×Loading Buffer(大連TaKaRa公司),細(xì)菌基因組DNA小量提取試劑盒(北京莊盟公司),Goldview核酸染料(北京賽百盛生物工程公司)。

        1.3PCR引物合成KPC,IMP,OXA-48,VIM和NDM 5種引物由北京擎科公司合成,引物系列見表1。

        表1

        檢測碳青霉烯酶基因所用的PCR引物

        注:*Y=C or T。

        1.4PCR反應(yīng)條件blaKPC及blaIMP的反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性10 min,94℃變性30 s,55℃ 退火40 s,72℃延伸50 s,共36個(gè)循環(huán),最后72℃5 min。blaOXA,blaVIM及blaNDM的反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性10 min;94℃30 s,58℃40 s,72℃50 s,36個(gè)循環(huán),72℃延伸5 min。

        1.5藥敏試驗(yàn)按梅里埃藥敏卡AST-13說明書進(jìn)行。

        1.6CRE表型刪選實(shí)驗(yàn)采用改良Hodge試驗(yàn)。

        1.7CRE菌株基因組DNA提取按照試劑說明書進(jìn)行。

        1.8PCR擴(kuò)增體系總體積為25 μl,包含DNA模板2 μl,MgCl225 mmol/L 2.5 μl,dNTP(10 mmol/L)0.5 μl,上、下引物各為1 μl,10×PCR緩沖液2.5 μl,DNA聚合酶(5 U/μl)1 μl,雙蒸水14.5 μl。

        1.9耐藥性分析采用WHONET5.6軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。

        2 結(jié)果

        2.1CRE菌株的分布53株CRE菌株中,肺炎克雷伯菌34株占64.15%,大腸埃希菌12株占22.64%,陰溝腸桿菌7株占13.21%;科室分布為重癥監(jiān)護(hù)病房15株CRE占28.30%,呼吸內(nèi)科病房9株占16.98%,干部病房6株占11.32%,其余科室23株占43.40%;標(biāo)本類型為尿液標(biāo)本20株CRE占37.74%,痰液16株占30.19%,引流液9株占16.98%,傷口分泌物4株占7.55%,血液2株占3.77%,腦脊液2株占3.77%。

        2.2CRE的耐藥率2016年送檢標(biāo)本中,檢出肺炎克雷伯菌811株,CRE 69株,檢出率為8.51%;大腸埃希菌1 581株,CRE 33株,檢出率為2.09%;陰溝腸桿菌225株,CRE 15株,檢出率為6.67%。耐碳青霉烯類的肺炎克雷伯菌和大腸埃希菌耐藥情況見圖1,圖2。

        圖1 肺炎克雷伯菌耐藥率(%)

        圖2 大腸埃希菌耐藥率(%)

        2.3亞胺培南、美羅培南和厄他培南3種藥敏紙片的改良Hodge試驗(yàn)53株CRE菌株中,改良Hodge試驗(yàn)陽性株有31株,占58.49%。其中亞胺培南、美羅培南和厄他培南3種藥敏紙片的Hodge試驗(yàn)結(jié)果一致,見圖3。

        2.4CRE菌株耐藥相關(guān)基因擴(kuò)增結(jié)果31株CRE中,攜帶blaKPC(798bp)基因有29株,檢出率96.67%,攜帶blaNDM (621bp)基因有9株,檢出率29.03%,同時(shí)擴(kuò)增出blaKPC和blaNDM基因有8株,檢出率25.81%,未擴(kuò)增出blaIMP,blaOXA,blaVIM基因,見圖4,圖5。

        圖3 改良Hodge試驗(yàn)結(jié)果示意圖

        圖4 blaKPC電泳結(jié)果示意圖

        圖5 blaNDM基因型電泳結(jié)果示意圖

        3討論藥敏結(jié)果顯示,CRE對碳青霉烯類、頭孢菌素類、氨曲南和氟喹諾酮類等抗菌藥物耐藥率較高,對慶大霉素、妥布霉素、阿米卡星、復(fù)方新諾明、替加環(huán)素等抗菌藥物耐藥率較低。治療CRE感染時(shí),建議臨床優(yōu)先考慮替加環(huán)素,或替加環(huán)素與氨基糖苷類抗生素聯(lián)合使用。

        改良Hodge試驗(yàn)是CLSI推薦檢測碳青霉烯酶表型的篩查方法,本實(shí)驗(yàn)53株CRE中,Hodge試驗(yàn)陽性31株,其陽性菌株少的原因可能與某些菌株產(chǎn)碳青霉烯酶量較低有關(guān)[3]。Hodge試驗(yàn)采用亞胺培南、美羅培南和厄他培南3種藥敏紙片,其試驗(yàn)結(jié)果一致,但觀察結(jié)果發(fā)現(xiàn):厄他培南和美羅培南矢狀箭頭較為明顯,亞胺培南不及它們明顯,因此建議Hodge試驗(yàn)時(shí),首選厄他培南或美羅培南紙片。

        在藥物選擇壓力下,CRE攜帶耐藥基因的質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子等可發(fā)生水平傳播[4],抗菌藥物選擇壓力不僅能使耐藥基因廣泛傳播,而且會(huì)促進(jìn)耐藥基因通過突變、插入序列等方式,使自身基因發(fā)生變化,進(jìn)而使耐藥性發(fā)生改變,引起耐藥基因的傳播[5]。本研究中發(fā)現(xiàn)1株不常見耐藥基因型,推測該菌株可能攜帶一種新的耐碳青霉烯酶基因,因此建議擴(kuò)大耐藥基因檢測范圍,或者測序進(jìn)一步確認(rèn)該菌株的基因型。31株耐藥基因分析中,CRE基因型主要是KPC,其次是NDM,這與目前國內(nèi)及世界范圍內(nèi),腸桿菌科細(xì)菌攜帶碳青霉烯酶基因?yàn)镵PC-2和NDM-1一致[6]。重癥醫(yī)學(xué)科和呼吸內(nèi)科病房檢出的CRE主要是肺炎克雷伯菌,耐藥基因型主要是KPC型,干部病房CRE主要是大腸埃希菌,耐藥基因型主要是KPC和NDM的混合型。醫(yī)院應(yīng)重點(diǎn)加強(qiáng)對這些科室CRE的監(jiān)管力度,嚴(yán)格控制臨床醫(yī)生合理使用抗生素,特別是碳青霉烯類藥物的用藥指征,防止CRE區(qū)域性傳播。

        參考文獻(xiàn):

        [1]Yong D,Toleman MA,Giske CG,et al.Characterization of a new Metallo-beta-lactamase gene,bla(NDM-1),and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure inKlebsiellapneumoniaesequence type 14 from India[J].Antimicrob Agents Chemother,2009,53(12):5046-5054.

        [2]張芳芳,王曉麗,瞿洪平,等.腸桿菌科細(xì)菌產(chǎn)碳青霉烯酶的主要類型和流行病學(xué)分析[J],中國感染與化療雜志,2014,14(6):521-525.

        Zhang FF,Wang XL,Qu HP,et al.Prevalence and genotypes of carbapenemase-producingEnterobacteriaceae[J].Chinese Journal of Infection and Chemotherapy,2014,14(6):521-525.

        [3]Amjad A,Mirza I,Abbasis,et al.Modified hodge te-st:A simple and effective test for detection of carbapenemase production[J].Iran J Microbiol,2011,3(4):189-193.

        [4]Schuurmans JM,Van Hijum SA,Piet JR,et al.Effect of growth rate and selection pressure on rates of transfer of an antibiotic resistance plasmid betweenE.colistrains[J].Plasmid,2014,72:1-8.

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