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        牙齦卟啉單胞菌菌毛質(zhì)粒構(gòu)建和蛋白純化

        2018-04-12 22:12:28陳江曼李永剛李新
        關(guān)鍵詞:雙酶瓊脂糖牙周病

        陳江曼 李永剛 李新

        牙周病是一種牙周組織慢性感染的炎癥性疾病,由革蘭氏陰性厭氧菌引起,其可導(dǎo)致牙齒支持組織的破壞。牙齦卟啉單胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)被認(rèn)為是牙周病發(fā)生和疾病進(jìn)展中的主要病原體[1],可釋放多種致病毒力因子[2],其中菌毛(Fimbriae,F(xiàn)imA)在粘附到宿主細(xì)胞,促進(jìn)細(xì)菌的入侵和感染中發(fā)揮著關(guān)鍵作用[3]。本研究擬通過基因克隆及重組技術(shù)構(gòu)建P.gingivalisFimA可原核表達(dá)質(zhì)粒,純化FimA融合蛋白,為臨床進(jìn)一步研究P.gingivalis,制備牙周病亞單位疫苗提供部分實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 主要試劑

        標(biāo)準(zhǔn)株P(guān).gingivalisATCC33277(由中國醫(yī)科大學(xué)饋贈(zèng));載體 PGEX-6P-1、(E.coil)DH5α感受態(tài)細(xì)胞、限制性內(nèi)切酶XhoⅠ和BamHⅠ、LA Tap酶及PMD19-T載體(TaKaRa公司,日本);細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒、質(zhì)粒DNA小提試劑盒和瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒(Axygen公司,美國);蛋白親和層析GST-SefinoseTMKit(上海生工生物工程有限公司);異丙基-β-D硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)等(北京索來寶科技有限公司)。

        1.2 方法

        1.2.1 牙齦卟啉單胞菌培養(yǎng)及基因組提取 將-80℃凍存的P.gingivalisATCC33277菌株在室溫解凍,接種于改良的腦心浸出液肉湯(BHI)固體培養(yǎng)基(加入1 mg/L維生素K,1 g/L酵母提取物及5mg/L氯化血紅素)平皿中,37℃厭氧條件下培養(yǎng)4 d,在無菌超凈臺(tái)中刮取表面菌落,接種于BHI液體培養(yǎng)基中,約24 h待細(xì)菌長至對數(shù)期,離心棄上清收集菌體,采用細(xì)菌基因組 DNA提取試劑盒提取P.gingivalis基因組DNA。

        1.2.2 PCR擴(kuò)增目的基因 根據(jù)GenBank提供的P.gingivalisATCC 33277 FimA序列,運(yùn)用 Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,上游引物 F:5′-3′ATTAGGATCCATGGTGGTATTGAAGACCAGC,下 游 引 物 R:5′-3′ATATCTCGAGCCAAGTAGCATTCTGACCAACGAG。采用LA Tap酶進(jìn)行FimA基因擴(kuò)增,反應(yīng)條件為:94℃變性5 min,94℃30 s、58℃30 s、72℃2 min,共25個(gè)循環(huán),72℃延伸5 min,逐漸降至4℃。PCR產(chǎn)物由瓊脂糖凝膠電泳檢測。

        1.2.3 PGEX-6P-FimA可原核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定 凝膠電泳分析,擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物與FimA片段大小一致,切取目的條帶回收純化。將純化的PCR產(chǎn)物與PMD19-T載體連接過夜,取10μl體系加入200μl DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,冰浴30 min,42℃熱擊1 min,再冰浴2 min,加入400μl無抗生素的LB培養(yǎng)基,37℃輕搖60 min,取適量混合液涂于含氨芐青霉素(Ampicilin)的LB固體培養(yǎng)基平皿中,37℃過夜。次日,挑取單個(gè)白色菌落,接種于5 ml LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖至對數(shù)期,離心棄上清小量提取質(zhì)粒DNA并命名為PMD19-T-FimA。XhoⅠ/BamHⅠ雙酶切重組質(zhì)粒,瓊脂糖凝膠電泳檢測后送至公司測序。分別用XhoⅠ/BamHⅠ雙酶切測序正確的PMD19-T-FimA質(zhì)粒和空載體PGEX-6P-1質(zhì)粒,回收目的片段。按照片段:載體=7∶3(質(zhì)量比)對酶切產(chǎn)物進(jìn)行連接,將體系與DH5α感受態(tài)細(xì)胞混勻,按上述方法轉(zhuǎn)化并小量提取質(zhì)粒DNA,通過瓊脂糖凝膠電泳檢驗(yàn),將重組質(zhì)粒命名為PGEX-6P-FimA。

        1.2.4 FimA融合蛋白表達(dá)條件 挑取PGEX-6P-FimA單個(gè)白色菌落接種于30 ml含Ampicilin的LB培養(yǎng)基中,37℃ 180 r/min震蕩,待菌液A值在0.6~0.8之間,分別設(shè)置不同 IPTG誘導(dǎo)濃度(0、0.1、0.3、0.5、0.7、1 mmol/L),不同誘導(dǎo)時(shí)間(4、6、8、12、16 h),在不同溫度下(16、20、25、30、37℃)收集2 ml菌液,4℃8 000 r/min離心10 min,棄上清。用200 μl磷酸緩沖鹽溶液(PBS)充分重懸菌體,冰浴超聲破碎,直至清亮,4℃離心10 min,分別收集上清及沉淀,經(jīng)SDS-PAGE電泳和考馬斯亮藍(lán)染色檢測最適誘導(dǎo)條件。

        1.2.5 FimA融合蛋白大量表達(dá)及純化 通過上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果對比,在16℃,IPTG濃度為1 mmol/L條件下,誘導(dǎo)600 ml A600為0.74的菌液12 h,4℃離心棄上清,用20 ml PBS重懸菌體,按1∶100的比例加入200 μl苯甲基磺酰氟(PMSF),冰浴超聲直至清亮,4℃8 000 r/min離心30 min,棄上清,用 20 ml GuMCAC-0(20 mmol/L Na3PO3·12H2O,0.5 mmol/L NaCl,6 mmol/L鹽酸胍,pH7.9)充分溶解,4℃過夜。次日,4℃4 000 r/min離心30 min,收集油性上清加入至超濾離心管中,4℃4 000 r/min離心,并逐漸用不含咪唑的 MCAC-0緩沖液(20 mmol/L Na3PO3·12H2O,0.5 mmol/L NaCl,pH7.9)置換,待液體清亮后,將液體加入到GST凝膠層析柱中,控制流速緩慢過柱,抽提/平衡緩沖液(140 mmol/L NaCl,10 mmol/L Na2HPO4,1.8 mmol/L K2HPO4,pH7.5)流洗凝膠,直至無蛋白流出。最后用5~10倍凝膠體積的洗脫緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl,33 mmol/L Glutathione,pH8.0)進(jìn)行洗脫并收集液體,-80℃保存。

        1.2.6 FimA融合蛋白鑒定 取少量洗脫液制樣行SDS-PAGE電泳,切取凝膠15 V,20 min半干轉(zhuǎn)至聚偏二氟乙烯膜(PDVF膜),于室溫用5%脫脂奶粉封閉2 h,TBST緩沖液稍加浸洗后將膜放入1∶2 500稀釋的GST抗體中,搖床4℃過夜。次日,TBST洗膜3次,每次10 min,辣根過氧化物酶標(biāo)記的羊抗鼠抗體為二抗,室溫孵育1 h,ECL顯色液檢測。

        2 結(jié) 果

        2.1 PCR擴(kuò)增FimA基因

        小量提取的細(xì)菌 DAN濃度為0.125μg/μl,A260nm/A280nm=1.85,說明DAN純度較好,無RNA酶污染。用提取的DNA為模板,LA Tap酶擴(kuò)增目的基因,電泳顯示在1 000 bp處有一特異性條帶與FimA大?。? 044 bp)一致(圖 1)。

        圖1 LA Tap酶擴(kuò)增FimA基因Fig 1 LA Taq enzyme amplified FimA gene

        2.2 重組質(zhì)粒構(gòu)建

        將PMD19-T-FimA質(zhì)粒和空載體PGEX-6P-1進(jìn)行XhoⅠ/BamHⅠ雙酶切,回收目的片段并連接,雙酶切驗(yàn)證。電泳顯示有和預(yù)期大小一致的酶切片段,證明質(zhì)粒構(gòu)建成功,命名為PGEX-6P-FimA(圖2~4)。

        2.3 FimA融合蛋白誘導(dǎo)表達(dá)

        將重組質(zhì)粒PGEX-6P-FimA在大腸桿菌中少量表達(dá),經(jīng)過不同誘導(dǎo)條件,超聲裂解各菌體,收集上清及沉淀,SDS-PAGE電泳及考馬斯亮藍(lán)檢測各條件下是否釋放蛋白及蛋白存在形式。結(jié)果顯示,在16℃,IPTG濃度為1 mmol/L,誘導(dǎo)12 h時(shí)蛋白量最多,且主要以包涵體形式存在(圖5)。

        圖2 XhoⅠ/BamHⅠ雙酶切PMD19-T-FimA質(zhì)粒Fig 2 The XhoⅠ/BamHⅠ digested plasmid PMD19-T-FimA

        圖3 XhoⅠ/BamHⅠ雙酶切載體PGEX-6P-1質(zhì)粒Fig 3 The XhoⅠ/BamHⅠ digested plasmid PGEX-6P-1

        圖4 XhoⅠ/Bam4HⅠ雙酶切PGEX-6P-FimA質(zhì)粒Fig 4 The XhoⅠ/BamHⅠ digested plasmid PGEX-6P-FimA

        2.4 FimA融合蛋白純化及鑒定

        在最適條件下大量誘導(dǎo)FimA融合蛋白,通過對包涵體變性和梯度復(fù)性,4℃條件下與谷胱甘肽-瓊脂糖介質(zhì)結(jié)合,經(jīng)過流洗雜蛋白、洗脫等步驟,收集純化的FimA融合蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳和考馬斯亮藍(lán)染色。如圖6得到了純度較好的FimA融合蛋白,在約60 000處有一明顯特異性條帶,與融合蛋白大小預(yù)期相符(圖7)。

        圖5 最適誘導(dǎo)條件Fig 5 Optimum inducing condition

        圖6 洗脫蛋白Fig 6 Elution protein

        3 討 論

        口腔內(nèi)特有的環(huán)境利于細(xì)菌的生長和繁殖,細(xì)菌的存在易刺激牙菌斑的形成,牙菌斑長期累積在硬組織和軟組織上則形成牙結(jié)石。雖然細(xì)菌的定居與侵入?yún)^(qū)域受到牙菌斑細(xì)菌和宿主先天防御機(jī)制之間的共同控制[4],大多處于動(dòng)態(tài)平衡,但是當(dāng)菌塊延伸至齦下時(shí)可觸發(fā)免疫系統(tǒng)失衡[5]。目前,我國慢性牙周病發(fā)病率高達(dá)85%以上,是導(dǎo)致成年人牙齒喪失最主要的原因[6-8],同時(shí)牙周病也可對其它全身疾病起到促進(jìn)作用,甚至對個(gè)人生活質(zhì)量及社會(huì)工作造成很大的影響[9-12]。

        雖然臨床治療可以將受損的牙周組織恢復(fù)到原始形態(tài),但其病變區(qū)域極易受到細(xì)菌的連續(xù)侵襲,可再次誘發(fā)牙周病的發(fā)生,因此應(yīng)該針對疾病預(yù)防建立有效的牙周保健系統(tǒng)[13]。研究開發(fā)針對牙周病細(xì)菌的疫苗一直是牙周病治療的輔助方向之一。在動(dòng)物牙周病實(shí)驗(yàn)?zāi)P椭?,用滅活的P.gingivalis全細(xì)胞免疫發(fā)現(xiàn)可以減少該菌在齦下的數(shù)量并可減輕牙槽骨的吸收程度[14],這提示疫苗可能成為預(yù)防和治療牙周病的有效措施。

        本實(shí)驗(yàn)旨通過目的基因克隆及構(gòu)建可原核表達(dá)質(zhì)粒,純化帶有GST標(biāo)簽的FimA融合蛋白。GST標(biāo)簽為谷胱甘肽巰基轉(zhuǎn)移酶標(biāo)簽,其轉(zhuǎn)移酶可與底物特異性結(jié)合,同時(shí)GST標(biāo)簽有高特異性,能較好的保留蛋白的抗原性和生物活性。在實(shí)驗(yàn)過程中IPTG濃度、時(shí)間及溫度的變化都會(huì)影響融合蛋白的表達(dá),本實(shí)驗(yàn)經(jīng)過多次誘導(dǎo)表達(dá)顯示,融合蛋白主要以包涵體形式存在,在16℃,IPTG濃度為1 mmol/L,誘導(dǎo)12 h時(shí)蛋白表達(dá)量最多,值得注意的是,GST標(biāo)簽包涵體蛋白需要經(jīng)過變性及梯度復(fù)性才能較好的與谷胱甘肽結(jié)合。經(jīng)過SDS-PAGE和Western blot檢測,在約60 000 bp處顯示出特異性條帶,與預(yù)期蛋白大小相符。上述實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,本實(shí)驗(yàn)純化出了特異性較高的FimA融合蛋白,為后續(xù)制備多克隆抗體,進(jìn)一步研究FimA特性和在牙周病發(fā)生發(fā)展中的作用及臨床牙周病亞單位疫苗的研制提供了部分實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

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