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        白介素-32基因多態(tài)性及血清水平與多發(fā)性硬化遺傳易感性的關(guān)聯(lián)性①

        2018-03-23 09:42:58許朝卿戴遲兵汪應(yīng)瑞
        中國(guó)免疫學(xué)雜志 2018年3期
        關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

        許朝卿 戴遲兵 汪應(yīng)瑞

        (三峽大學(xué)附屬仁和醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科,宜昌 443001)

        多發(fā)性硬化(Multiple sclerosis,MS)是一種累及中樞神經(jīng)系統(tǒng)的炎性脫髓鞘病。以往的研究證實(shí),MS可能是遺傳因素和環(huán)境因素共同作用所引起的中樞神經(jīng)系統(tǒng)自身免疫性疾病,其發(fā)病機(jī)制不完全清楚[1]。有研究表明,炎癥在神經(jīng)系統(tǒng)脫髓鞘病變的形成和發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用[2]。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞因子在神經(jīng)系統(tǒng)脫髓鞘病變中占有重要地位,炎癥因子的水平與MS患者的疾病嚴(yán)重程度有關(guān)[3],白介素-32(Interleukin-3,IL-32)作為一種內(nèi)源性的炎癥調(diào)控因子,在炎癥中起著關(guān)鍵作用[4]。最近研究發(fā)現(xiàn),IL-32基因多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡、急性肺損傷及癌癥等多種炎癥性疾病密切相關(guān)[5-7]。因此,本研究探討 IL-32基因多態(tài)性與MS遺傳易感性的關(guān)系,擬尋找一種新的炎癥因子為臨床MS的治療提供潛在的靶點(diǎn),同時(shí),為MS高危人群的篩查提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1材料

        1.1.1研究對(duì)象 選取2012年~2016年于我院就診的MS患者 580 例,所有病例的診斷均符合2005年McDonald的MS診斷標(biāo)準(zhǔn)及1999年Wingerchuck NMO的診斷標(biāo)準(zhǔn)[8]。所有入選患者均為新確診的患者,其中男性 360 例,女性220 例,年齡(32.7±10.26)歲。 同時(shí),選取650例同期同地區(qū)健康無(wú)血緣關(guān)系的個(gè)體作為對(duì)照,其中男性400 例,女性 250例,年齡(33.2±9.18)歲。所有入選對(duì)象排除心血管疾病、高血壓、糖尿病、腎功能不全、感染性疾病、免疫性疾病及其他惡性腫瘤性疾病。本次研究經(jīng)過(guò)我院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。

        1.1.2主要試劑和儀器 PCR產(chǎn)物(德國(guó)Qiagen公司),蝦堿酶和外切酶Ⅰ分別購(gòu)自美國(guó)Promega公司和Epieentre公司,SNaPshot Multiplex試劑盒購(gòu)自美國(guó)ABI公司,IL-32試劑盒(上海江萊生物科技有限公司) 。

        1.2方法

        1.2.1DNA 的提取和基因型檢測(cè) 采集靜脈血2 ml 于EDTA 抗凝管-20℃保存。DNA的提取采用改良碘化鈉法,經(jīng)純度鑒定后-20℃保存?zhèn)溆?。上海天昊生物科技有限公司根?jù)IL-32基因rs28372698,rs12934561及rs11861531位點(diǎn)多態(tài)性和已知的DNA序列設(shè)計(jì)PCR引物。rs28372698位點(diǎn)的上下游引物序列分別為:5′-CCATGGGTGTGGAGGTTCATAAAG-3′,5′-GAATGGAAGGTCTTGAT-GGGAGAG-3′。 rs12934561位點(diǎn)的上下游引物序列分別為5′-AGGCCCGAATGGTAAGCT-3′,5′-CCACAGTGTCCTCAGTGTCAC-3′。 rs11861531位點(diǎn)的上下游引物序列分別為5′-ATGAGTATGCCTGC-CGTGTG-3′,5′-AATGCGGCATCTTCAAAC-3′。IL-32的PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為 5 μl,其中包含2.5 μl緩沖液,0.25 μl反應(yīng)物,1.75 μl去離子水。若擴(kuò)增反應(yīng)體系不足,則用滅菌雙蒸水補(bǔ)足至5 μl。擴(kuò)增程序主要包括:95℃ 10 min變性,92℃ 15 s和60℃ 1 min 共69個(gè)循環(huán)。PCR產(chǎn)物 4℃保存。采用GeneMapper4.1分析SNP分型。

        1.2.2血清IL-32水平的檢測(cè) 采用酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA)法測(cè)定IL-32血清水平,實(shí)驗(yàn)操作嚴(yán)格按照說(shuō)明書進(jìn)行。

        1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS16.0軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。等位基因和基因型分布頻率采用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算,各分布頻率比較采用卡方檢驗(yàn)。 IL-32血清水平的組間比較采用t檢驗(yàn),遺傳平衡檢驗(yàn)采用Hardy-Weinberg,采用SHEsis分析軟件行連鎖不平衡分析。P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1MS患者臨床特點(diǎn) 在所有入選的MS患者中,復(fù)發(fā)緩解型占77.9%(452/580),繼發(fā)進(jìn)展型占20%(116/580)以及進(jìn)展型占2.1%(12/580)。MS患者的年齡和性別與對(duì)照組比較,無(wú)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,表1)。

        2.2MS患者組和健康對(duì)照組IL-32基因型頻率比較結(jié)果 檢測(cè)結(jié)果表明,rs28372698位點(diǎn)存在AA、AT、TT 3種基因型。rs12934561位點(diǎn)存在TT、CT、CC三種基因型。rs11861531位點(diǎn)存在CC、CT、TT 3種基因型。兩組三個(gè)位點(diǎn)的頻率均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡(P>0.05),表明該基因型在所研究人群中分布已達(dá)到了遺傳平衡。基因測(cè)序進(jìn)一步驗(yàn)證了檢測(cè)結(jié)果。IL-32基因rs28372698 A/T位點(diǎn)的基因型頻率存在顯著差異(χ2=9.814,P=0.007),其等位基因頻率在兩組間分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.561,P=0.033)。rs12934561C/T與 rs11861531 C/T的各基因型及等位基因頻率在兩組間差異無(wú)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,表2)。

        表1MS患者和健康對(duì)照基線資料的比較

        Tab.1ComparisonofbasicinformationbetweenMSpatientsandhealthycontrols

        ItemMSpatients(n=580)Controls(n=650)StatisticsPGenderMale360(62 1%)400(61 5%)0 0370 848Female220(37 9%)250(38 5%)Age(year)32 7±10 2633 2±9 180 0420 967ClinicaltypesRelapsing?remitting452(77 9%)-Seconday?progressive116(20%)-Progressivity12(2 1%)-

        2.3配對(duì)連鎖分析及單倍基因型分析結(jié)果 采用SHEsis在線分析軟件對(duì)rs28372698 A/T、rs12934561 C/T以及 rs11861531 C/T三個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行兩兩配對(duì)連鎖不平衡分析,結(jié)果顯示:三位點(diǎn)兩兩之間均存在連鎖不平衡(rs28372698 vs rs12934561,D′=0.874;rs28372698 vs rs11861531,D′=0.795;rs12934561 vs rs11861531,D′=0.931)。進(jìn)一步的單倍型分析結(jié)果顯示,T-T-T單倍型在MS中的分布頻率顯著高于對(duì)照組(P=0.012),T-T-T單倍型與MS的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)(OR=1.968,95%CI:1.352-2.574,表3)。

        表2IL-32基因rs28372698A/T、rs12934561C/T及rs11861531C/T基因型在兩組間的分布頻率

        Tab.2GenotypefrequencydistributionofIL-32genesrs28372698A/T,andrs11861531rs12934561C/TC/TbetweenMSpatientsandcontrols

        SNPgenotypingMSpatients(n=580)Controls(n=650)StatisticsPrs28372698A/TGenotypeAA240(41 4%)285(49 1%)9 8140 0071)AT255(44 0%)307(47 2%)TT85(14 7%)58(8 9%)AlleleA735(63 4%)877(67 5&)4 5610 0332)T425(36 6%)423(32 5%)rs12934561C/TGenotypeCC138(23 8%)141(21 7%)1 6430 440CT312(53 8%)345(53 1%)TT130(22 4%)164(25 2%)AlleleC588(50 7%)627(48 2%)1 4830 223T572(49 3%)673(51 8%)rs11861531C/TGenotypeCC192(33 1%)214(32 9%)0 1220 941CT302(52 1%)335(51 5%)TT86(14 8%)101(15 5%)AlleleC686(59 1%)783(60 2%)0 0080 927T474(40 9%)537(41 3%)

        Note:1)Gnotype frequency was statistically differences in AA,AT and TT;2)Allele was statistically difference between A and T.

        2.4IL-32血清水平在兩組的比較結(jié)果 MS患者組血清IL-32水平明顯高于對(duì)照組[(399.08±156.85)pg/ml vs (239.99±88.35)pg/ml,P=0.001]。進(jìn)一步,在所有MS患者中,按照rs28372698 A/T位點(diǎn)的AA、AT、TT基因型分為三組,AT和TT基因型的MS患者IL-32血清水平明顯高于AA基因型MS患者,差異存在顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[(465.53±172.40)pg/ml vs (295.86±103.96)pg/ml,P<0.001;(491.15±133.65)pg/ml vs (295.86±103.96)pg/ml,P<0.001]。而AT型與TT型間的IL-32血清水平無(wú)顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異[(465.53±172.40)pg/ml vs (491.15±133.65)pg/ml,P=0.612]。

        3 討論

        隨著人類基因掃描計(jì)劃的推進(jìn),完成了人類基因組DNA序列測(cè)序和分析工作,基因多態(tài)性在疾病中的影響逐漸受到重視。有研究表明,抗炎和促炎因素的失衡在MS患者的發(fā)病中扮演了重要的角色[9]。本研究發(fā)現(xiàn),IL-32基因位點(diǎn)rs28372698與MS相關(guān)。IL-32基因rs28372698的三種基因型(AA、AT及TT)與等位基因(A、T)的分布頻率在MS患者和健康人群中存在比較較大的差異,MS患者的T等位基因攜帶明顯高于對(duì)照組,攜帶T等位基因的MS患者血清IL-32的表達(dá)水平明顯高于非攜帶者,提示rs28372698基因的變異促進(jìn)IL-32的高表達(dá)。

        表3IL-32單倍基因型在MS患者與對(duì)照組之間的分布情況及風(fēng)險(xiǎn)分析

        Tab.3RiskanalysisandhaploidgenotypedistributionbetweenMSpatientsandcontrols

        IL?32haplotypeMSpatients(n=1160)Controls(n=1300)OR(95%CI)PA?C?C540(46 6)598(46 0)0 952(0 763-1 327)0 863A?T?T40(3 4)53(4 1)0 869(0 557-1 372)0 652A?C?T12(1 0)15(1 2)0 832(0 451-1 672)0 556T?C?C435(37 5)503(38 7)0 613(0 238-1 021)0 358T?T?T38(3 3)14(1 1)1 968(1 352-2 574)0 012A?T?C95(8 2)117(9 0)1 966(0 853-3 782)0 184

        研究發(fā)現(xiàn)IL-32基因位點(diǎn)rs28372698與MS相關(guān)。有報(bào)道表明,IL-32的高表達(dá)與一些炎癥性疾病和感染性疾病相關(guān)[10,11],進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),IL-32牽涉到一些癌癥相關(guān)疾病的發(fā)病機(jī)制[12]。以往的研究證實(shí),IL-32可以促進(jìn)一些炎癥因子的高表達(dá),如TNF-α、IL-6及IL-8,同時(shí),IL-32也涉及到各種趨化因子的分泌和合成[13,14]。最近的研究表明,IL-32 rs28372698A/T,rs129345-61C/T及rs11861531 C/T三個(gè)位點(diǎn)的基因多態(tài)性與子宮內(nèi)膜癌、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎及肺纖維化存在密切關(guān)系,這些研究證實(shí)了炎癥機(jī)制可能與IL-32的基因位點(diǎn)突變存在聯(lián)系[15-17]。炎癥在神經(jīng)系統(tǒng)脫髓鞘病變的形成和發(fā)展是一個(gè)重要的因素。有研究證實(shí),在MS患者外周血和腦脊液中,T淋巴細(xì)胞腫瘤壞死因子的 mRNA表達(dá)明顯增加,表達(dá)水平與疾病嚴(yán)重程度相關(guān),同時(shí),IL-6在MS患者血清中顯著升高,顯然,這些炎癥的調(diào)控過(guò)程與MS的發(fā)病密切相關(guān)[18-20]。重要的是,氧化應(yīng)激參與了MS的病理生理過(guò)程[21,22],這個(gè)過(guò)程通過(guò)影響機(jī)體活性氧-炎癥平衡損傷神經(jīng)系統(tǒng)的髓鞘[23-25]。因此,IL-32可能作為一種炎癥調(diào)控因子參與了MS患者 IL-32基因位點(diǎn)rs28372698的基因變異過(guò)程。

        MS的確切病因與發(fā)病機(jī)制至今不明,炎癥因素在許多發(fā)病環(huán)節(jié)中起著重要作用。本研究首次單堿基延伸和DNA測(cè)序?qū)L-32基因位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,證實(shí)了IL-32基因和MS易感等位基因的關(guān)系。在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步研究了IL-32相關(guān)的單倍型與MS的關(guān)系,這個(gè)發(fā)現(xiàn)將有助于闡明MS患者獨(dú)特的免疫和炎癥遺傳學(xué)機(jī)制,我們的研究結(jié)果可能為MS的分子分型、風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)、輔助診斷和治療方案提供重要的參考依據(jù)。

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