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        慢性心力衰竭患者尿液雙向凝膠電泳技術(shù)的優(yōu)化

        2017-09-19 02:20:06侯麗娜劉煒燁賈小平李小溪
        關(guān)鍵詞:伏特樣量凝膠電泳

        侯麗娜,劉煒燁,賈小平,李 亮,李小溪

        (南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院健康管理中心,廣東廣州510515)

        慢性心力衰竭患者尿液雙向凝膠電泳技術(shù)的優(yōu)化

        侯麗娜,劉煒燁,賈小平,李 亮,李小溪

        (南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院健康管理中心,廣東廣州510515)

        目的:分析慢性心力衰竭患者尿液雙向電泳技術(shù)的影響因素以提高其分辨率及穩(wěn)定性.方法:采用超濾法富集并濃縮尿液蛋白,Bradford法測(cè)濃度后進(jìn)行雙向電泳,凝膠經(jīng)銀染顯色后,用Melanie 4軟件分析雙向電泳圖譜.分別對(duì)蛋白上樣量,聚焦參數(shù)等步驟進(jìn)行優(yōu)化.結(jié)果:超濾濃縮法,150 μg的上樣量,60 KVh的聚焦總伏特?cái)?shù),進(jìn)行的雙向電泳圖譜分辨率高,穩(wěn)定性好.結(jié)論:對(duì)上樣量和聚焦總伏特?cái)?shù)優(yōu)化后可獲得穩(wěn)定性高和重復(fù)性好的慢性心力衰竭患者尿液雙向電泳圖譜,以便開展后續(xù)研究.

        慢性心力衰竭;尿液;雙向凝膠電泳;蛋白質(zhì)組

        0 引言

        慢性心力衰竭是一種復(fù)雜的臨床綜合征,其特點(diǎn)是心室充盈和/或射血能力受損從而導(dǎo)致心臟不能泵出足量的血液滿足機(jī)體的代謝需要.慢性心力衰竭發(fā)病率及死亡率逐年上升意味著沉重的公共衛(wèi)生和社會(huì)經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[1].在臨床中清楚地查明所有的致病因素常常是困難的.目前,在日常診療中運(yùn)用的臨床、實(shí)驗(yàn)室檢查和影像學(xué)標(biāo)記物方法來(lái)診斷、預(yù)測(cè)和隨訪慢性心力衰竭患者常常是復(fù)雜的[2].從尿液蛋白質(zhì)組學(xué)整體水平出發(fā),可能為慢性心力衰竭的診斷和預(yù)后提供了額外的預(yù)測(cè)價(jià)值,并有助于指導(dǎo)治療和發(fā)現(xiàn)治療新靶點(diǎn),具有重要的意義.

        尿液相比其他體液的蛋白質(zhì)組學(xué)分析的臨床應(yīng)用是一個(gè)新興的和有希望的研究領(lǐng)域,可以直接反映機(jī)體的狀態(tài),尿液樣本容易獲取,而且獲取方式為非侵襲性,患者的配合度更高[3].本研究運(yùn)用雙向凝膠電泳技術(shù)對(duì)慢性心力衰竭患者與正常對(duì)照人群的尿液差異表達(dá)蛋白進(jìn)行比較分析,以獲得慢性心力衰竭差異表達(dá)的蛋白質(zhì),可以更好地了解慢性心力衰竭的病理機(jī)制,具有重要的學(xué)術(shù)科研及臨床運(yùn)用價(jià)值.然而,在雙向電泳過(guò)程中,影響等電聚焦和凝膠電泳的因素多種多樣,如樣品的處理、上樣量和聚焦參數(shù)的設(shè)定等.因此,本研究對(duì)其中的某些關(guān)鍵環(huán)節(jié)進(jìn)行了反復(fù)對(duì)比優(yōu)化處理,以獲得理想的雙向電泳圖譜.

        1 材料和方法

        1.1 材料

        1.1.1 樣品采集 40例健康對(duì)照人群來(lái)源于南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院健康管理中心.40例患者為南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院心內(nèi)科住院患者,明確診斷為慢性心力衰竭.診斷標(biāo)準(zhǔn)參考最新中國(guó)心血管疾病診斷治療指南.本研究經(jīng)該單位倫理委員會(huì)批準(zhǔn),研究對(duì)象均已知情并同意捐獻(xiàn),簽訂知情同意書.兩組人群的基線資料(年齡、肌酐等)比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05).尿液標(biāo)本要求清潔中段尿,2 h內(nèi)轉(zhuǎn)移至-80℃冰箱并保存.

        1.1.2 試劑 固相pH梯度干膠條(pH 3-10 L和NL,24 cm)、膠條緩沖液(pH 3-10)均為GE公司產(chǎn)品;15 mL超濾管購(gòu)自Millipore公司;尿素、DTT、3-[3-(膽酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸內(nèi)鹽、十二烷基硫酸鈉、三羥甲基氨基甲烷、Acrylamide、礦物油、甘油、Glycine、Methylene double acrylamide和 Thiourea均為美國(guó) Bio-Rad公司產(chǎn)品;Na2S2O3、AgNO3、C2H5OH、C2H4O2、Na2CO3、甲醛醋酸鈉均為國(guó)產(chǎn)分析純.1.1.3 儀器 YM-3超濾離心管(美國(guó)Millipore公司)、圖像分析軟件為Melanie 4試用版本、Milli-Q超純水儀購(gòu)自Millipore公司、等電聚焦儀、垂直電泳系統(tǒng)均購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司、透射掃描儀為UMAX owerLook 100(美國(guó)Bio-Rad公司).

        1.2 方法

        1.2.1 尿液蛋白樣品制備 從-80℃冰箱取出樣品混合,放置于冰上解凍后進(jìn)行低溫超濾離心,超濾離心使用YM-3超濾離心管截留分子質(zhì)量大于10 KD的各組尿液蛋白,采用Bradford方法測(cè)定蛋白濃度后,取離心管內(nèi)液凍存.

        1.2.2 雙向凝膠電泳分離總蛋白 按照如下分成四組進(jìn)行實(shí)驗(yàn):150 μg蛋白樣品聚焦60 KVh組(IPG pH 3-10 NL,24 cm),250 μg蛋白樣品聚焦60 KVh組(IPG pH 3-10NL,24 cm);150 μg蛋白樣品聚焦60 KVh組(IPG pH 3-10 NL,24 cm),150 μg蛋白樣品聚焦50 KVh組(IPG pH 3-10 NL,24 cm)分別置于450 μL上樣緩沖液中充分混合,采取被動(dòng)泡漲12 h,等電聚焦參數(shù)為100V 1 h,500V 1 h,1000 V 1 h,8 000 V 3 h,8 000 V 50/60 KVh,500 V 3 h.聚焦完畢后進(jìn)行兩次平衡,隨后進(jìn)行第二向凝膠電泳.

        1.2.3 銀染 經(jīng)過(guò)固定、敏化、染色、顯影等過(guò)程[4].

        1.2.4 圖譜分析 凝膠銀染結(jié)束后,用UMAX PowerLook 1100投射掃描儀對(duì)凝膠進(jìn)行圖像掃描,并對(duì)其呈現(xiàn)的蛋白點(diǎn)進(jìn)行分析.

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次以上,數(shù)據(jù)以x ±s表示,計(jì)量資料兩組間均數(shù)的比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料則采用χ2檢驗(yàn),由統(tǒng)計(jì)軟件 STATA16.0完成.P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.

        2 結(jié)果

        2.1 研究對(duì)象一般資料比較 慢性心力衰竭患者和健康對(duì)照人群各40例樣本的尿液分別各自混合后,提取總蛋白,經(jīng)過(guò)測(cè)定后進(jìn)行雙向凝膠電泳.結(jié)果表明,慢性心力衰竭患者和正常對(duì)照人群基線資料(年齡、性別、尿液肌酐水平等)的差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,表1).

        表1 雙向凝膠電泳研究的尿液標(biāo)本 (n=40,x ±s)

        2.2 不同上樣量對(duì)雙向凝膠電泳圖譜的影響 為了探索合理的上樣量,在參考相關(guān)尿液蛋白質(zhì)組學(xué)文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上[4-6],本研究分別比較了150 μg和250 μg兩組上樣量雙向凝膠電泳圖譜.圖1A上樣量為250 μg,圖譜上有些蛋白點(diǎn)過(guò)飽和,許多蛋白質(zhì)點(diǎn)融合在一起;掩蓋附近一些低豐度蛋白的表達(dá),使其分辨率降低,且其圖染色背景較深.圖1B上樣量為150 μg,盡管蛋白上樣量較圖1A少,但整個(gè)圖譜效果明顯優(yōu)于圖1A.雖然出現(xiàn)的蛋白點(diǎn)要少于圖1A,但大部分蛋白質(zhì)點(diǎn)能夠清晰辨認(rèn),背景較為干潔,以便進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn).因此,后續(xù)實(shí)驗(yàn)上樣量一般為150 μg.

        圖1 不同上樣量的雙向電泳圖譜比較

        2.3 不同聚焦參數(shù)總伏特?cái)?shù)對(duì)雙向凝膠電泳圖譜的影響 聚焦的程序及總伏特?cái)?shù)直接影響圖譜的質(zhì)量.為了獲取理想的蛋白圖譜,本研究比較了聚焦總伏特?cái)?shù)分別為50 KVh/60 KVh兩組實(shí)驗(yàn),即聚焦程序:100 V 1 h,500 V 1 h,1000 V 1 h,8 000 V 3 h,8 000 V 50/60 KVh,500 V 3 h.結(jié)果發(fā)現(xiàn),聚焦總伏特?cái)?shù)50 KVh組相應(yīng)的蛋白圖譜的蛋白點(diǎn)少,橫條紋較多(圖2A);而聚焦總伏特?cái)?shù)60 KVh組的雙向凝膠電泳圖譜上不僅蛋白點(diǎn)較多,而且橫條紋也大大減少(圖2B),分離效果較好,有利于開展后續(xù)實(shí)驗(yàn).因此,60 KVh的聚焦總伏特?cái)?shù)是合理的.

        圖2 不同聚焦總伏特?cái)?shù)的雙向電泳圖譜比較

        3 討論

        慢性心力衰竭是一種心血管疾病常見的臨床綜合征,伴有心肌結(jié)構(gòu)和功能發(fā)生改變、心室泵血功能降低,是多種心臟病潛在的終末期表現(xiàn).慢性心力衰竭的病因復(fù)雜,病理機(jī)制尚無(wú)統(tǒng)一的認(rèn)識(shí),不同的病因?qū)W說(shuō)解釋了心臟疾病如何進(jìn)展到慢性心力衰竭,包括心肌缺血、高血壓、糖尿病、心臟瓣膜病、心律失常和遺傳性心肌?。?-9].然而,在臨床中清楚地查明所有的致病因素常常是困難的.

        現(xiàn)在使用的許多生物標(biāo)記物只能描述一部分病理特點(diǎn),不能夠全面整體地闡述疾?。鞍踪|(zhì)組學(xué)可以從整個(gè)蛋白質(zhì)動(dòng)態(tài)變化的水平研究疾病的變化,是當(dāng)前篩選疾病差異表達(dá)蛋白,尋找疾病標(biāo)志物及發(fā)現(xiàn)藥物治療新靶標(biāo)有力工具.尿液相比血液、唾液等其他體液的蛋白質(zhì)組學(xué)分析的臨床應(yīng)用是一個(gè)新興的和有希望的研究領(lǐng)域,可在一定程度上反映血液和整個(gè)機(jī)體的狀態(tài).運(yùn)用尿液蛋白質(zhì)組學(xué)分析法識(shí)別蛋白質(zhì)/多肽生物標(biāo)記物可能為診斷、預(yù)測(cè)、指導(dǎo)治療和新療法的發(fā)展提供了一種新的形式;同時(shí)尿液樣本易于收集,且對(duì)人體無(wú)創(chuàng),這可能具有利于診斷和預(yù)后預(yù)測(cè)的價(jià)值,并有助于指導(dǎo)治療和發(fā)現(xiàn)治療新靶點(diǎn)[10-12].以前的研究運(yùn)用尿液蛋白質(zhì)組學(xué)分析法來(lái)識(shí)別針對(duì)冠心病和亞臨床期左心室舒張功能不全的尿液多肽生物標(biāo)記物.這些生物標(biāo)記物被用來(lái)建立特定疾病的分類[13].但此方法尚未廣泛應(yīng)用于慢性心力衰竭.Lemesle等[14]報(bào)道了將蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用于射血分?jǐn)?shù)相關(guān)型患者管理的潛在獲益,即血漿多種標(biāo)記物蛋白質(zhì)表達(dá)譜可預(yù)測(cè)慢性心衰患者的心血管事件死亡率.基于尿液蛋白質(zhì)組分析可用來(lái)篩選慢性心力衰竭相關(guān)性尿液多肽標(biāo)記物的一種敏感工具,這些多肽標(biāo)記物有可能幫助我們進(jìn)一步理解和診斷心力衰竭.本研究正是從慢性心力衰竭的尿液蛋白組學(xué)的立足點(diǎn)出發(fā),以期篩選出慢性心力衰竭密切相關(guān)的差異表達(dá)蛋白,希望可直接了解慢性心力衰竭的發(fā)病機(jī)制及探索臨床診療的新思路.蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)鍵目的是分離并篩選出盡可能多的蛋白質(zhì),以便后續(xù)質(zhì)譜鑒定出盡可能多的不同種蛋白質(zhì).因此,研究影響等電聚焦和雙向電泳的關(guān)鍵因素是重要內(nèi)容,可為后續(xù)的實(shí)驗(yàn)研究奠定殷實(shí)的基礎(chǔ).

        實(shí)驗(yàn)過(guò)程中加入蛋白抑制劑抑制蛋白酶的活性,盡量保證蛋白的完整性.為了提高分辨率和相對(duì)分子質(zhì)量較高蛋白質(zhì)的分離,對(duì)比150 μg和250 μg兩組上樣量,結(jié)果顯示150 μg的上樣量可以明顯地檢測(cè)出低豐度蛋白,同時(shí)還可以避免低豐度蛋白被高豐度蛋白掩蓋.此外,本研究還觀察了不同聚焦總伏特?cái)?shù)對(duì)雙向電泳圖譜的影響,對(duì)比發(fā)現(xiàn)當(dāng)聚焦總伏特?cái)?shù)不夠時(shí),尿液中的蛋白到達(dá)不了相應(yīng)的等電點(diǎn)部位,電泳圖譜上的蛋白點(diǎn)較少,還會(huì)在雙向電泳圖譜上出現(xiàn)顏色較深的橫條紋.通過(guò)對(duì)比發(fā)現(xiàn)60 KVh的聚焦總伏特?cái)?shù)是適度的,圖譜上可以看到不僅蛋白點(diǎn)較多,而且橫條紋也大大減少[15].值得引起注意的是,因尿液PH值偏酸性(6.0~7.0),在2-DE的實(shí)驗(yàn)過(guò)程中本研究使用了pH 3-10非線性(NL)的膠條,因?yàn)樵撃z條不僅相對(duì)增大pH 4-7段的長(zhǎng)度以更好分離此區(qū)間的蛋白點(diǎn),還能夠兼顧檢測(cè)標(biāo)本蛋白總體情況,包括堿性段的蛋白[16].

        綜上所述,為更好地開展慢性心力衰竭的尿液蛋白質(zhì)組學(xué)研究,我們認(rèn)為采用超濾的方法,150 μg的上樣量,60 KVh的聚焦參數(shù),使用非線性的IPG膠條可以得到理想的雙向電泳圖譜,有助于分離、篩選出相關(guān)差異表達(dá)蛋白質(zhì).

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        Optimization of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis on urine samples from patients with chronic heart failure

        HOU Li-Na,LIU Wei-Ye,JIA Xiao-Ping,LI Liang,LI Xiao-Xi
        Department of Healthy Mangement,Nanfang Hospital,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China

        AIM:To analyze the influence factors of two-dimensional electrophoresis(2-DE)on urine samples from the patients with chronic heartfailure and improve the resolution and stability of 2-DE map.METHODS:After using the method of ultrafiltration,the 2-DE was conducted after measuring the concentration of the total protein by Bradford method.The gel was scanned and analyzed by Melanie 4 following silver staining.We improved the sample volume of proteins,focus parameters and other related steps to optimize the 2-DE.RESULTS:We could successfully obtain a higher resolution and reproducible 2-DE image with ultrafiltration,protein loaded with 150 μg and focus voltage with a total of 60 KVh.CONCLUSION:The well-established 2-DE map on urine samples of chronic heart failure patients made by 2-DE is useful in studying the mechanism and treatments of chronic heart failure.

        chronic heart failure;urine;two-dimensional gel electrophoresis(2-DE);proteome

        R541.6+1

        A

        2095-6894(2017)08-41-03

        2017-02-10;接受日期:2017-02-26

        廣東省科技廳科技計(jì)劃項(xiàng)目(2016zc0078)

        侯麗娜.博士,主治醫(yī)師.研究方向:心血管及泌尿系統(tǒng)疾病健康管理.E-mail:1175024441@qq.com

        李小溪.博士,主治醫(yī)師.E-mail:ursin7872@fmmu.com

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