徐建國

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基因芯片高通量對ALDH2基因多態(tài)性檢驗及生活習(xí)慣與胃癌易感性的關(guān)系

徐建國

目的 通過基因芯片高通量研究ALDH2基因多態(tài)性的檢驗以及以ALDH2基因多態(tài)性研究結(jié)果與生活習(xí)慣和胃癌易感性的相關(guān)性研究。方法 隨機(jī)選161例胃癌患者相關(guān)資料作為研究組資料，以及150例正常人群體檢資料作為對照組資料，通過DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態(tài)性檢驗以及患者生活習(xí)慣一般資料。結(jié)果 檢測結(jié)果表明，吸煙和飲酒、熱食速食暴食、喜好腌制與辛辣食物等都可能是消化道癌癥的危險因素，所有患者對比結(jié)果顯示：男性吸煙更多，飲酒熱食速食暴食生活習(xí)慣方面男女比例相差不多，喜好腌制與辛辣食物以女性比例多于男性；所有患者ALDH2基因多態(tài)性分為3種，3種基因多態(tài)性組間比較，差異顯著，P<0.05；男女患者ALDH2基因多態(tài)性遺傳平衡性檢驗結(jié)果分析，差異顯著，P<0.05。DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態(tài)性檢驗結(jié)果表示，ALDH2基因多態(tài)性中基因分布差異與胃癌易感以及不良生活習(xí)慣評分均呈正相關(guān)性。結(jié)論 通過DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態(tài)性檢驗，對胃癌早期診斷有臨床效用價值，并且生活習(xí)慣與ALDH2基因多態(tài)性檢驗存在相關(guān)性，且與胃癌易感性存在相關(guān)性因素。

基因芯片；ALDH2基因；多態(tài)性檢驗；易感性；生活習(xí)慣；胃癌

(ThePracticalJournalofCancer,2017,32:435～437)

惡性腫瘤的臨床研究過程中發(fā)現(xiàn)，胃癌在所有惡性腫瘤中位居首位，并且其患病機(jī)制存在地域性區(qū)別，并且呈現(xiàn)地域集中性發(fā)病趨勢[1]。本研究通過使用DNA芯片的高通量測序?qū)LDH2基因多態(tài)性進(jìn)行檢驗分析，以及通過ALDH2基因多態(tài)性檢驗評估ALDH2的失活情況以及對生活習(xí)慣對胃癌易感性的相關(guān)性進(jìn)行了研究，現(xiàn)報告如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料

隨即選取于2013年8月至2014年10月期間本院收治的161例胃癌患者(研究組)，所有患者均依照2010年版胃癌診斷標(biāo)準(zhǔn)(WS 316-2010) 為依據(jù)，使用數(shù)字化X線胃腸造影技術(shù)確診為胃癌。男性87例，女性74例，患者年齡在57～62歲，平均年齡(60.13±2.19)歲，且所有患者一般資料比較無特殊差別，具有研究分析意義。同時選取同一時期在本院進(jìn)行體檢的健康人150例作為對照，以該150例健康人資料作為對照組。

1.2 研究方法

隨機(jī)選取金華地區(qū)的161例胃癌患者，利用基因芯片技術(shù)高通量、高效率的研究ALDH2基因多態(tài)性和生活習(xí)慣與胃癌易感性的關(guān)聯(lián)，同時對基因與環(huán)境在胃癌發(fā)生中的交互作用進(jìn)行探索，從而為分析對環(huán)境致癌因素敏感的個體、進(jìn)行食管癌高危人群風(fēng)險判斷、制定金華地區(qū)乃至我國胃癌預(yù)防干預(yù)措施等提供科學(xué)依據(jù)，以降低胃癌的發(fā)病率和死亡率。

1.3 檢測指標(biāo)

對患者入院前5年內(nèi)可能導(dǎo)致消化道癌癥的不良生活習(xí)慣資料進(jìn)行統(tǒng)計對比。ALDH2基因檢測指標(biāo)主要選取芯片上核苷酸微陣列，檢測待測供試品中的互補(bǔ)序列，并且檢測過程中以短寡聚核苷酸作為靶標(biāo)。其中生活習(xí)慣資料對比健康人的生活習(xí)慣[2]。

1.4 統(tǒng)計學(xué)方法

應(yīng)用SPSS 12.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析，先進(jìn)行χ2檢驗，對比組間差異性后，再進(jìn)行l(wèi)ogistic回歸分析的多因素分析，以P<0.05，差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 兩組入院前5年內(nèi)消化道癌癥的危險因素生活習(xí)慣資料比較

結(jié)果顯示：男性吸煙比例更高，飲酒熱食速食暴食生活習(xí)慣方面男女比例相差不多，喜好腌制與辛辣食物女性比例高于男性，且在吸煙和飲酒以及喜好腌制與辛辣食物方面，男女間比例也存在差異顯著性，但研究組不良生活習(xí)慣比例明顯高于對照組，見表1。

表1 兩組患者入院前5年內(nèi)可能是消化道癌癥的危險因素生活習(xí)慣比較(例，%)

2.2 研究組ALDH2基因多態(tài)性遺傳平衡性檢驗結(jié)果分析

所有患者ALDH2基因多態(tài)性分為3種，3種基因多態(tài)性對比，差異顯著；男女患者ALDH2基因多態(tài)性遺傳平衡性檢驗結(jié)果比較，P<0.05，見表2。

表2 ALDH2基因多態(tài)性遺傳平衡性檢驗結(jié)果分析(例，%)

2.3 ALDH2等位基因在兩組中分布

研究組與對照組ALDH2*1頻數(shù)分別為262與226，頻率分別為75.4%與81.4%；ALDH2*2頻數(shù)分別為63與83，頻率分別為24.6%和18.6%。等位基因在2組中的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=14.96，P=0.01)。

2.4 胃癌易感的多因素分析

ALDH2基因多態(tài)性檢驗結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)：基因型、等位基因的分布差異以及不良生活習(xí)慣為胃癌易感因素(P<0.05)，見表3。

表3 胃癌易感多因素分析

3 討論

在胃癌的臨床相關(guān)性研究中發(fā)現(xiàn)，胃癌的致病因素中，不僅僅只存在于基因方面的病變[3]。而且因為其地域性性質(zhì)存在分析表明，地域性存在的不良生活習(xí)慣問題會對胃癌發(fā)病有一定的促進(jìn)作用和相關(guān)性，但具體縣慣性影響在以往的研究過程中，并無確切的病理學(xué)證據(jù)，因為無對應(yīng)的檢測方法證明不良的生活習(xí)慣會直接導(dǎo)致胃癌的發(fā)生[4-5]。本實驗中采取分析ALDH2基因多態(tài)性，在胃癌患者的基因相關(guān)性研究中發(fā)現(xiàn)，ALDH2基因是肝臟中酒精氧化代謝過程的關(guān)鍵酶，而且存在眾多的同工酶[6]。所以在研究過程中可以將ALDH2基因多態(tài)性作為胃癌的標(biāo)志性物質(zhì)進(jìn)行檢驗和分析。而檢驗和分析ALDH2基因多態(tài)性本研究主要采用DNA芯片作為檢測方法，DNA芯片(DNA芯片)作為1種快速、高效、高通量的檢測方法，已經(jīng)成為基因組計劃時代最重要的技術(shù)[7]。

本研究過程的研究結(jié)果表明ALDH2基因多態(tài)性在胃癌患者中確實存在，其中檢驗結(jié)果分析以基因型為GG的基因異常分布最多，并且與其他類型的基因組間比對存在差異顯著性，而等位基因分布差異以G等位基因分布差異明顯，與等位基因A組間比對存在差異顯著性，并且在基因型以及等位基因差異分析過程中發(fā)現(xiàn)，男女間比較，差異顯著。綜合分析結(jié)果表明吸煙和飲酒、熱食速食暴食、喜好腌制與辛辣食物等都可能是消化道癌癥的危險因素，所有患者對比結(jié)果顯示男性在吸煙的生活習(xí)慣更多，飲酒熱食速食暴食生活習(xí)慣方面男女比例相差不多，喜好腌制與辛辣食物以女性比例多于男性，且在吸煙和飲酒以及喜好腌制與辛辣食物方面； 所有患者ALDH2基因多態(tài)性分為3種，3種基因多態(tài)性組間比對，差異顯著性，男女患者ALDH2基因多態(tài)性遺傳平衡性檢驗結(jié)果分析結(jié)果組間比對，差異顯著。DNA芯片的高通量測序研究ALDH2基因多態(tài)性檢驗結(jié)果表示，ALDH2基因多態(tài)性中基因分布差異與胃癌癥狀評分以及不良生活習(xí)慣評分均呈正相關(guān)性。所以，易感性可能由于不良的生活習(xí)慣以及ALDH2基因多態(tài)性改變共同作用導(dǎo)致[8]。細(xì)胞中的DNA損傷的生物學(xué)后果，取決于DNA損傷的程度和細(xì)胞的修復(fù)能力。如果損傷得不到正確修復(fù)，就可能導(dǎo)致細(xì)胞功能的異常。DNA堿基的損傷可導(dǎo)致遺傳密碼子的變化，經(jīng)轉(zhuǎn)錄和翻譯產(chǎn)生功能異常的蛋白，引起細(xì)胞功能的衰退、凋亡或發(fā)生惡性轉(zhuǎn)化；DNA交聯(lián)影響染色體的高級結(jié)構(gòu)，妨礙基因的正常表達(dá)和調(diào)控，對細(xì)胞功能產(chǎn)生多種影響。因此，DNA損傷導(dǎo)致的基因組不穩(wěn)定與腫瘤、衰老等多種疾病的發(fā)生有著密切關(guān)聯(lián)。眾多研究表明：DNA損傷一DNA修復(fù)異常一基因突變一腫瘤發(fā)生是貫穿腫瘤發(fā)生過程中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。DNA損傷修復(fù)體系相當(dāng)復(fù)雜,目前己經(jīng)發(fā)現(xiàn)某些惡性腫瘤的發(fā)生的與其易感性基因的多態(tài)性相關(guān)。

綜上所述，ALDH2基因多態(tài)性可以作為胃癌疾病的病理學(xué)標(biāo)志物，所以理論上可以應(yīng)用于胃癌的早期診斷并且通過ALDH2基因多態(tài)性的分析結(jié)果可以了解到，胃癌的易感性可能由于不良的生活習(xí)慣以及ALDH2基因多態(tài)性突變共同導(dǎo)致的結(jié)果[9]。本研究結(jié)果項目的實施將對人民身體健康、國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展、社會和諧穩(wěn)定具有重大意義。

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(編輯：吳小紅)

Genetic Polymorphisms of ALDH2 Gene and Susceptibility to Gastric Cancer by High Throughput Studies

XU Jianguo.

Qinghai People's Hospital,Xining,810001

Objective The ALDH2 gene polymorphism was studied by the high throughput of the gene chip,and the correlation between ALDH2 gene polymorphism and living habits and gastric cancer susceptibility were studied.Methods 161 patients with gastric cancer were selected as the study group,and 150 case of healthy patients was the control group.The DNA gene polymorphism and the correlation between ALDH2 gene polymorphism and susceptibility to gastric cancer were studied by high throughput sequencing of ALDH2 gene and ALDH2 gene polymorphism in the early diagnosis of gastric cancer.Results Test results showed that smoking and drinking,hot food fast food gluttony,preference of pickled and spicy food and so may be risk factors for cancer of the digestive tract,all comparative results of male patients showed more severe smoking habits,drinking hot fast food gluttony living habits almost the same proportion in men and women,preference of pickled and spicy food in the proportion of women than men,and smoking and drinking as well as pickled and spicy taste to food;ALDH2 polymorphism in all patients divided into 3 kinds,the 3 genes polymorphism groups had significant differences,P<0.05;ALDH2 gene polymorphism genetic balance of male and female patients test results analysis,the difference was significant,P<0.05.High-throughput sequencing studies ALDH2 polymorphism DNA chip test results genes expressed,ALDH2 gene polymorphism distribution between gene and gastric symptom score and bad habits rates were positively correlated.ALDH2 gene in gastric cancer patients compared with the control group,P<0.05.Conclusion The DNA chip high-throughput sequencing of ALDH2 Gene Test in the early diagnosis of gastric cancer in the process has very good clinical utility value and life habits and the ALDH2 Gene polymorphisms test correlation exists,and and susceptibility to gastric cancer exist correlation factors.

Gene chip;ALDH2 gene;Polymorphism;Susceptibility;Life habit;Gastric cancer

810001 青海省人民醫(yī)院

10.3969/j.issn.1001-5930.2017.03.026

R735.2

A

1001-5930(2017)03-0435-03

2016-05-04

2017-02-07)