楊丹丹
(江蘇省海門市人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,江蘇 海門 226100)
利用GeneXpert檢測(cè)結(jié)核分支桿菌及其利福平耐藥性的研究
楊丹丹
(江蘇省海門市人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,江蘇 海門 226100)
目的研究GeneXpert檢測(cè)在結(jié)核分支桿菌及其利福平耐藥性檢測(cè)中的應(yīng)用。方法選取2014年7月至2015年11月我院所收治的116例涂片陽(yáng)性的肺結(jié)核患者的痰液標(biāo)本。對(duì)痰液標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿菌及福平耐藥性行GeneXpert檢測(cè),均與傳統(tǒng)的羅氏培養(yǎng)結(jié)果和藥敏試驗(yàn)結(jié)果比較。結(jié)果GeneXpert檢測(cè)對(duì)結(jié)核分支桿菌的診斷符合率為93.1%,對(duì)利福平耐藥性的診斷符合率為97.2%。結(jié)論GeneXpert檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌及其利福平耐藥性,具有快速而準(zhǔn)確的特點(diǎn),為結(jié)核病的診斷和治療提供可靠的依據(jù)。
結(jié)核分支桿菌;利福平;耐藥;基因芯片
結(jié)核病是一種世界性的慢性傳染疾病,它由結(jié)核分支桿菌感染而引起。結(jié)核分枝桿菌的耐藥性會(huì)嚴(yán)重影響結(jié)核病的治療效果,因此結(jié)核分枝桿菌的耐藥性檢測(cè)顯得尤為重要[1]。傳統(tǒng)的結(jié)核分枝桿菌耐藥性檢測(cè)方法主要采用以培養(yǎng)為基礎(chǔ)的絕對(duì)濃度法,需要花費(fèi)較長(zhǎng)時(shí)間得到實(shí)驗(yàn)結(jié)果,導(dǎo)致諸多不便,不能滿足臨床的需要[2]。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,基因芯片被應(yīng)用于結(jié)核分枝桿菌耐藥性檢測(cè)中,可以快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)耐藥性,得到臨床醫(yī)學(xué)的驗(yàn)證和支持。本文利用基因芯片檢測(cè)結(jié)核分支桿菌及其利福平耐藥性,以期為臨床應(yīng)用提供科學(xué)依據(jù)。
1.1 標(biāo)本與菌株:選取2014年7月至2015年11月我院所收治的116例涂片陽(yáng)性的肺結(jié)核患者的痰液標(biāo)本。
1.2 試劑與儀器:天津儀美科技有限公司Cepheid檢測(cè)儀,結(jié)核分枝桿菌rpoB基因和突變檢測(cè)試劑盒(實(shí)時(shí)熒光PCR法),商品名稱:Xpert MTB/RIF。珠海貝索生物技術(shù)有限公司羅氏培養(yǎng)管,自行配置4%氫氧化鈉溶液,孵箱,安全柜,振蕩器。
1.3 GeneXpert檢測(cè)試驗(yàn):①標(biāo)本處理:準(zhǔn)備所需試劑耗材,在前處理管和Cartridge反應(yīng)盒上標(biāo)記患者姓名及病例序號(hào)。取1 mL痰標(biāo)本置有螺旋蓋的前處理管中,接著加入相當(dāng)于痰標(biāo)本2倍體積的痰標(biāo)本處理液,將前處理管在震蕩器上渦旋震蕩30 s左右,直至無(wú)可見(jiàn)塊狀痰標(biāo)本存在。②加樣:將前處理管在室溫靜置15 min后,打開Cartridge反應(yīng)盒,用一次性無(wú)菌移樣管取出2 mL處理后樣品由加樣孔緩慢加入反應(yīng)盒內(nèi)。③測(cè)試:打開電腦和Gene-Xpert檢測(cè)儀的電源開關(guān),運(yùn)行Gene-Xpert操作軟件開始測(cè)試。④在電腦上閱讀結(jié)核分枝桿菌及耐藥結(jié)果。
1.4 結(jié)核分枝桿菌羅氏培養(yǎng)實(shí)驗(yàn):①實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備及標(biāo)本處理:將培養(yǎng)管室溫放置5~10 min,拭去管外壁的凝集水,在培養(yǎng)基斜面背面標(biāo)記序號(hào),患者姓名,日期。取無(wú)菌的前處理管標(biāo)記患者姓名。用無(wú)菌吸管吸取痰標(biāo)本1~3 mL至前處理管中,視標(biāo)本性狀加1~2倍體積4%氫氧化鈉溶液,渦旋震蕩30~60 s后開始計(jì)時(shí)15 min,室溫靜置。②接種:棄掉凝固水,用無(wú)菌管吸取前處理的痰標(biāo)本,接種0.1 mL至培養(yǎng)基斜面,擰緊管蓋,放在斜面架上,保持斜面水平向上,37 ℃孵箱,24 h后,將培養(yǎng)管直立,繼續(xù)培養(yǎng)。③定期觀察生長(zhǎng)情況。
2.1 GeneXpert檢測(cè)實(shí)驗(yàn)與傳統(tǒng)羅氏培養(yǎng)結(jié)果的比較:116份痰液標(biāo)本,結(jié)果有108份結(jié)果相符,符合率為93.1%?;蛐酒瑢?shí)驗(yàn)未檢出的標(biāo)本跟傳統(tǒng)培養(yǎng)的快速生長(zhǎng)菌株相吻合(后經(jīng)南通疾控確診為非結(jié)核分枝桿菌)??梢?jiàn)準(zhǔn)確率很高。見(jiàn)表1。
表1 GeneXpert檢測(cè)實(shí)驗(yàn)與傳統(tǒng)羅氏培養(yǎng)結(jié)果的比較
2.2 GeneXpert檢測(cè)與藥敏試驗(yàn)對(duì)利福平耐藥檢測(cè)結(jié)果(數(shù)據(jù)來(lái)自南通疾控中心)的比較:108株結(jié)核分枝桿菌分離株,采用GeneXpert檢測(cè)和藥敏試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌對(duì)利福平的耐藥性,其中前者有8例耐藥例,后者有7例耐藥,其他都為敏感,符合率為97.2%。見(jiàn)表2。
表2 GeneXpert檢測(cè)與藥敏試驗(yàn)對(duì)利福平耐藥檢測(cè)結(jié)果
結(jié)核病傳統(tǒng)的檢測(cè)方式是藥敏試驗(yàn),通過(guò)細(xì)菌培養(yǎng)試驗(yàn)的方式對(duì)結(jié)核分枝桿菌進(jìn)行檢測(cè)[3]。藥敏試驗(yàn)檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的最大問(wèn)題在于,需要過(guò)長(zhǎng)的時(shí)間導(dǎo)致在臨床實(shí)踐中的應(yīng)用價(jià)值較低[4]?;蛐酒夹g(shù)被用于檢測(cè)基因的突變,可以快速檢測(cè)多個(gè)基因的突變位點(diǎn)及其類型,是檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的有效檢測(cè)方[5]。
隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展和分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,基金芯片被越來(lái)越多的應(yīng)用于結(jié)核分枝桿菌的檢測(cè)中。吳國(guó)蘭[6]等探討基因芯片對(duì)結(jié)核分枝桿菌的診斷價(jià)值和耐藥性分析,結(jié)果顯示基因芯片對(duì)結(jié)核分枝桿菌的診斷結(jié)果與藥敏試驗(yàn)結(jié)果完全相符,對(duì)利福平耐藥性的診斷符合率為93.7%,表明基因芯片技術(shù)對(duì)結(jié)核分枝桿菌及其利福平耐藥性的檢測(cè)具有極高的準(zhǔn)確性。耿紅[7]等探討基因芯片檢測(cè)結(jié)核分支桿菌對(duì)利福平耐藥性的診斷效果,結(jié)果顯示基因芯片與藥敏試驗(yàn)相比,對(duì)利福平的總靈敏度為91%,特異度為96%,表明基因芯片技術(shù)檢測(cè)利福平耐藥性具有良好的診斷效果。李曉非[8]等評(píng)價(jià)基因芯片對(duì)結(jié)核分枝桿菌的診斷價(jià)值,結(jié)果顯示基因芯片技術(shù)與培養(yǎng)法比較,對(duì)結(jié)核分枝桿菌的診斷符合率為100%,對(duì)利福平耐藥性的診斷符合率為94.5%,表明基因芯片可以準(zhǔn)確診斷結(jié)核分枝桿菌,并能快速檢測(cè)利福平的耐藥性,具有巨大的發(fā)展空間。本研究顯示,基因芯片技術(shù)與藥敏試驗(yàn)比較,對(duì)結(jié)核分枝桿菌的診斷符合率為91.8%,對(duì)利福平耐藥性的診斷符合率為90.5%,與以上研究結(jié)果相符。
基因芯片是通過(guò)將探針固定在基片上,將樣本核酸進(jìn)行雜交,通過(guò)探針?lè)肿拥碾s交信號(hào)強(qiáng)度來(lái)獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。這一檢測(cè)方法可以對(duì)樣品進(jìn)行大量序列的檢測(cè)分析,與傳統(tǒng)的低效率檢測(cè)方式相比,大大提高了檢測(cè)的效率。尤其是在檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌的耐藥性方面,耗費(fèi)的時(shí)間不超過(guò)3 d,卻可以進(jìn)行大量樣本的試驗(yàn),且準(zhǔn)確率較高,具有廣闊的應(yīng)用前景。但基因芯片技術(shù)也存在一定的缺陷,不能檢測(cè)所有的基因突變位點(diǎn),可能對(duì)耐藥檢出率造成一定的影響,因此在目前尚不能完全取代藥敏試驗(yàn),但隨著科學(xué)的發(fā)展和技術(shù)的改進(jìn),基因芯片技術(shù)將更加完善,檢出結(jié)果將更為可靠。
綜上,GeneXpert檢測(cè)可以快速準(zhǔn)確的鑒定結(jié)核分枝桿菌,同時(shí)對(duì)利福平耐藥性檢測(cè)具有良好的敏感性和特異性,值得臨床應(yīng)用和推廣。
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1671-8194(2017)12-0175-02