徐永明,徐宏光,張曉玲,高智,肖良
(1.皖南醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院弋磯山醫(yī)院脊柱外科,安徽蕪湖241001;2.中國科學院上海生命科學院骨科細胞與分子生物學實驗室,上海200025)
miR-125a-5p在大鼠終板軟骨細胞自然退變中的表達及其靶基因預測
徐永明1,徐宏光1,張曉玲2,高智1,肖良1
(1.皖南醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院弋磯山醫(yī)院脊柱外科,安徽蕪湖241001;2.中國科學院上海生命科學院骨科細胞與分子生物學實驗室,上海200025)
目的:通過建立體外大鼠終板軟骨細胞自然退變模型,探討miR-125a-5p在自然傳代誘導大鼠終板軟骨細胞退變中的表達,通過生物信息學軟件預測相關靶基因.方法:取大鼠原代終板軟骨細胞,應用胰酶消化法和自然傳代法培養(yǎng)終板軟骨細胞,分別選取P2、P5、P8代細胞進行甲苯胺藍及阿辛藍染色觀察細胞形態(tài)改變.qRT-PCR檢測終板軟骨細胞中miR-125a-5p表達情況,通過生物信息學軟件預測相關靶基因.結果:細胞傳到P5代時細胞由多角形變成長梭形,外基質(zhì)分泌減少,細胞形態(tài)發(fā)生退變改變,qRT-PCR檢測結果顯示miR-125a-5p表達含量隨細胞代數(shù)增加逐漸減少.結論:大鼠終板軟骨細胞自然傳代至P5代出現(xiàn)退變改變,miR-125a-5p與終板軟骨退變有密切聯(lián)系.
miR-125a-5p;終板軟骨細胞;軟骨退變
隨著人口結構老齡化,脊柱退行性疾病發(fā)病率不斷上升,越來越多人們長期被頸腰痛所折磨,在引起頸腰痛諸多因素中椎間盤退變被視為最為重要因素之一[1].盡管目前在臨床中可采取藥物、理療、手術等多種治療手段,但是臨床療效往往無法令患者達到滿意的效果,也無法從根本上去預防和阻止椎間盤退變進一步發(fā)展.終板軟骨是構成椎間盤一重要結構,是椎間盤營養(yǎng)獲得主要途徑,終板軟骨退變進一步導致椎間盤退變,相反通過保護終板軟骨可以有效延緩椎間盤退變的發(fā)生[2,3],因此對終板軟骨相關病理生理研究意義十分重要.
MicroRNA(miRNA)是一類內(nèi)源性表達,非編碼小RNA,能通過靶向轉錄抑制或切割進而起到對mRNA基因表達抑制作用.盡管估計miRNAs在人類基因組只占1%–3%,但是它們?nèi)∧軌蛟谌祟愔姓{(diào)節(jié)大約30%的蛋白編碼基因[4].miR-125a-5p作為miRNA家族中一員,目前在腦血管內(nèi)皮細胞、免疫調(diào)節(jié)、胰腺腫瘤等方面研究廣泛受到人們的關注[5-7],然而目前其在骨科領域尤其涉及到終板軟骨有關研究中報道甚少,本研究旨在揭示miR-125a-5p在終板軟骨退變中表達及相關意義.
1.1 材料
10只Sprague Dawley(SD)大鼠(160±15g,雌雄不限)購買于上海斯萊克實驗動物有限公司[SCXK(滬)2012-0002].二型膠原酶(Sigma;美國);0.25%Trypsin-EDTA溶液、胎牛血清、青-鏈霉素雙抗溶液100×(Gibico;美國);DMEM/F12培養(yǎng)液(Hyclone;美國);甲苯胺藍染色試劑盒、阿辛藍染色試劑盒(碧云天生物技術研究所;中國);細胞計數(shù)儀、Trizol試劑(Invitrogen;美國);Realtime PCR試劑盒(takara;大連);實時逆轉錄聚合酶鏈反應儀(RocheLightCycler480;德國);倒置熒光顯微鏡(Leica;德國).
1.2 方法
1.2.1 大鼠原代終板軟骨細胞的獲取和培養(yǎng)
10只SD級大鼠按500mg/kg藥物量腹腔注射濃度為4%水合氯醛處死,常規(guī)消毒后在超凈臺內(nèi)取出整段腰椎,用組織剪剔除腰椎附屬的肌肉、韌帶、軟組織,尖刀片分別切取各個節(jié)段腰椎間盤組織并用含1%雙抗(青霉素-鏈霉素混合液)的磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌2-3次,眼科剪再將獲得的終板軟骨組織剪碎成大小接近1mm3,0.25%Trypsin-EDTA溶液消化30min后加入0.2%II型膠原酶消化6h,將所得懸液過濾2-3次后離心懸液5mi(1000r/min)去除消化液,加入含有10%胎牛血清的DMEM/F12培養(yǎng)液吹打均勻并種植于10cm培養(yǎng)皿后放入無菌細胞培養(yǎng)箱內(nèi)進行培養(yǎng)(37℃含5%CO2),培養(yǎng)液每3天更換一次,細胞融合至大約90%時按1:2傳代.
1.2.2 甲苯胺藍染色
分別將P2、P5、P8代細胞種植在12孔培養(yǎng)皿中,待細胞融合至90%時收集細胞后用PBS洗滌2次,用4%多聚甲醛固定15min后PBS再次洗滌2次,每孔加入1ml甲苯胺藍染色60min去除染液后PBS洗滌3次,自然晾干后分別用倒置顯微鏡下拍照觀察細胞改變.
1.2.3 阿辛藍染色
如1.2.2所述,收集細胞后向12孔培養(yǎng)皿中每孔分別加阿辛藍染液1ml染色30分鐘,PBS洗滌3次,每次5分鐘,自然晾干后分別用倒置顯微鏡下拍照觀察細胞鏡改變.
1.2.4 RNA提取及RT-PCR
分別將不同代數(shù)的大鼠終板軟骨細胞接種至6孔培養(yǎng)皿中,待細胞融合至90%時,用0.25%Trypsin-EDTA溶液消化細胞并離心后分別吸取至1.5ml EP管中,每管中加入0.5ml Trizol在冰上裂解提取RNA,按20μl反轉體系反轉成cDNA后進行RT-PCR,每個樣品均設三個重復孔.設U6為內(nèi)部參照.反應條件:95℃預變30s;95℃變性5s;60℃退火延伸25s,擴增50個循環(huán).使用Roche LightCycler480軟件自動分析結果,計算2-△△Ct值,rno-miR-125a-5p引物由廣州銳博生物公司合成.
1.2.5 靶基因預測及Gene Ontology(Go)分析
對miR-125a-5p進行靶基因預測分析時,為了增加靶基因預測結果的可靠性,選取了miranda、mirbase、mirdb等3個數(shù)據(jù)庫進行分析,將3個數(shù)據(jù)庫有關交集的靶基因作為最終預測結果.通過應用David軟件對所得到的靶基因進行Go分析,將靶基因按照參與有相關生物學過程進行分類.
1.2.6 統(tǒng)計學處理
實驗數(shù)據(jù)均由SPSS18.0統(tǒng)計軟件處理,以均數(shù)±標準差表示,兩組間比較采用兩獨立樣本間t檢驗,設檢驗水準為α=0.05,P<0.05具有統(tǒng)計學意義.
2.1 大鼠終板軟骨細胞通過體外自然傳代發(fā)生退變改變
大鼠終板軟骨細胞進行體外自然傳代至P5代時,細胞形態(tài)發(fā)生明顯改變,由多角形逐漸變成長梭形,細胞排列較紊亂,生長速度減慢,甲苯胺藍及阿辛藍染色見細胞外基質(zhì)分泌減少,細胞發(fā)生退變改變(見圖1).
圖1 P2、P5、P8代大鼠終板軟骨細胞阿辛藍和甲苯胺藍染色(×100倍)
2.2 miR-125a-5p在大鼠終板軟骨細胞中表達
qRT-PCR結果顯示miR-125a-5p表達在大鼠終板軟骨細胞中隨著細胞代數(shù)增大呈逐漸減少趨勢,miR-125a-5p與軟骨細胞退變存在密切聯(lián)系(見圖2).
圖2 大鼠不同代數(shù)終板軟骨細胞與原代比較miR-125a-5p表達情況(*表示P<0.05;**表示P<0.01)
2.3 miR-125a-5p相關靶基因預測
通過3種不同生物軟件預測miR-125a-5p靶基因有1334個,其中3種軟件共同涉及到的靶基因有8個,有2種軟件共同涉及到的靶基因有112個,部分靶基因列出見表1、圖3.
表1 分別通過miranda、mirbase、mirdb3種生物信息軟件預測rno-miR-125a-5p可能結合的靶基因
圖3 miranda、mirbase、mirdb 3個生物信息軟件預測miR-125a-5p有關靶基因韋恩圖
2.4 miR-125a-5p相關Go(Gene Ontology)分析
通過Go分析結果發(fā)現(xiàn)miR-125a-5p主要通過參生物學過程、細胞組成及分子功能3大方面進行相應靶基因的調(diào)控(見圖4).
圖4 David軟件進行miR-125a-5p有關Go分析
當今社會中腰腿痛不斷的影響著人類健康,椎間盤退變是引起腰痛的諸多病因中最常見原因之一.終板軟骨是構成椎間盤重要組成部分,其主要由終板軟骨細胞、細胞外基質(zhì)、二型膠原組成.對人日?;顒舆^程中所產(chǎn)生的不同力學刺激具有重要調(diào)節(jié)功能,椎間盤獲取營養(yǎng)途徑主要來源終板軟骨,終板軟骨的退變進而引起椎間盤退變.研究通過保護終板軟骨可有效緩解椎間盤退變[2].通過對終板軟骨的研究對明確椎間盤退變有著重要意義.
MicroRNA(miRNA)是一類由內(nèi)源基因編碼的長度約為22個核苷酸的非編碼單鏈RNA分子,在1993年第一個miRNA被Lee等人發(fā)現(xiàn)[8].在不同物種中miRNA具有高度保守性,越來越多的miRNA被鑒定和研究在人類、動物、植物以及病毒中,到目前大約超過2000多個miRNAs在人類中被發(fā)現(xiàn).目前發(fā)現(xiàn)的microRNA主要依賴與靶基因mRNA3’-UTR不完全互補及完全互補進而影響靶基因mRNA的穩(wěn)定性.對維系組織或器官系統(tǒng)的正常發(fā)育等方面有著重要作用.
目前miRNA與椎間盤退變相關研究漸有報道,胡凱等[9]發(fā)現(xiàn)在人退變椎間盤髓核組織中miR-663b表達水平明顯降低.miR-663b通過負向調(diào)控matrix metallopeptidase2(MMP-2)最終導致MMP-2在退變椎間盤組織中明顯增多.同時陳宇飛等[10]發(fā)現(xiàn)miR-129-5p表達在退變椎間盤髓核組織中顯著下調(diào),并且通過生物信息學方法預測miR-129-5p的靶基因為Ⅰ型膠原基因和整合素α1基因,從而引起細胞功能學的改變.并在小鼠體內(nèi)通過過表達miR-129-5p可明顯抑制Ⅰ型膠原基因和整合素α1基因,從而抑制椎間盤中蛋白Ⅰ型膠原和整合素α1的合成,相反抑制miR-129-5p可上調(diào)Ⅰ型膠原基因和整合素α1基因,進而對椎間盤退變起調(diào)控作用.
前期我們通過生物學芯片發(fā)現(xiàn)miR-125a-5p在腰椎退變的人終板軟骨中明顯比正常人椎間盤表達量低,并在人終板軟骨細胞體外得以驗證.本實驗中通過自然傳代誘導大鼠終板軟骨細胞退變,qRT-PCR結果表明miR-125a-5p在自然傳代誘導終板軟骨細胞退變隨細胞代數(shù)增多表達量逐漸減低,間接證實miR-125a-5p可能參與軟骨退變過程,并通過多種靶基因預測軟件發(fā)現(xiàn)Galnt14、Gcnt1、Itga7、Pipox、Prim2、Rhot2、Slc35a4、Sstr3最為有可能的靶基因,同時Go分析提示其參與多個生物學過程中的調(diào)控.因此我們希望通過進一步研究明確miR-125a-5p在椎間盤退變中調(diào)控的相關靶基因,闡明其在椎間盤退變中有關作用,目前miRNA作為椎間盤退變新的治療靶點,望今后在治療椎間盤退變等相關疾病帶來了新的曙光.
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R-332
:A
:1673-260X(2017)03-0039-03
2016-11-10
國家自然科學基金(81572185)
徐宏光,男,博士研究生,教授,博士生導師,研究方向:脊柱外科與老年骨病