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        親子鑒定中STR基因座可疑多步突變2例

        2017-04-04 09:16:43張陳明
        法醫(yī)學(xué)雜志 2017年4期
        關(guān)鍵詞:親子鑒定基因座胡某

        張陳明,陶 勝

        (安徽百友司法鑒定中心,安徽 合肥230031)

        親子鑒定中STR基因座可疑多步突變2例

        張陳明,陶 勝

        (安徽百友司法鑒定中心,安徽 合肥230031)

        法醫(yī)遺傳學(xué);親子關(guān)系;短串聯(lián)重復(fù)序列;DNA突變分析;多步突變

        1 案 例

        兩位母親(胡某與楊某)均因為自己女兒(劉某與李某)辦理出生醫(yī)學(xué)證明所需,委托我中心進(jìn)行親子關(guān)系鑒定。本中心采集四位被鑒定人指尖血備檢。用Chelex-100法提取基因組DNA,分別采用AGCU EX22、AGCU 21+1試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)對常染色體上39個STR基因座進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增,并用PowerPlex?16 HS試劑盒(美國Promega公司)對常染色體上15個STR基因座進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增,對上述檢驗結(jié)果進(jìn)行復(fù)核驗證。同時,采用AGCU X12試劑盒(無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司)對X染色體上12個STR基因座進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增。以上擴(kuò)增均在9700型PCR儀(美國AB公司)上完成,擴(kuò)增體系和擴(kuò)增條件均依照試劑盒使用說明書,PCR產(chǎn)物在3130xl基因分析儀(美國Thermo Fisher Scientific公司)上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,用GeneMapper?ID v3.2軟件進(jìn)行STR分型。

        先用AGCU EX22試劑盒對常染色體21個STR基因座進(jìn)行檢驗,發(fā)現(xiàn)兩對母女(胡某-劉某、楊某-李某)均在FGA基因座存在多步突變的可能。在第一對母女的FGA基因座,母親胡某的表型為“22”,女兒劉某的表型為“27”;在第二對母女的FGA基因座,母親楊某的表型為“21”,女兒李某的表型為“24”。采用PowerPlex?16 HS試劑盒進(jìn)行復(fù)核驗證,發(fā)現(xiàn)FGA基因座的分型與上述結(jié)果一致,且這兩種STR試劑盒檢出的FGA基因座的等位基因峰(胡某女兒的“27”、楊某的“21”以及楊某女兒的“24”)在信號強(qiáng)度、峰高與峰面積等方面均比其他基因座的雜合子高。

        采用AGCU 21+1試劑盒進(jìn)一步檢測18個多態(tài)性STR基因座,第一對母女又出現(xiàn)一個STR基因座不符合遺傳規(guī)律:在D4S2408基因座,母親胡某的表型為“9”,女兒劉某的表型為“10”;在第二對母女中,母親楊某均能提供女兒李某必需的等位基因。對12個X-STR基因座進(jìn)行分型檢驗,發(fā)現(xiàn)兩對母女在每個X-STR基因座均有一個相同的等位基因。按照SF/Z JD0105001—2016《親權(quán)鑒定技術(shù)規(guī)范》,在考慮第一對母女FGA和D4S2408基因座存在突變可能、第二對母女FGA基因座存在突變可能的前提下,累積親權(quán)指數(shù)分別為1.020 1×104、1.525 1×105。

        2 討 論

        在親子鑒定實踐中,STR基因座發(fā)生突變的現(xiàn)象是普遍存在的,且其發(fā)生突變的主要機(jī)制是復(fù)制滑動突變,只涉及一個基序的加或減稱為一步突變,約占STR基因座的90%,少數(shù)突變基因會涉及幾個基序,稱多步突變[1]。多步突變是通過逐步突變形成的,突變的步數(shù)越多,其發(fā)生的機(jī)會越小,最多突變步數(shù)為四步[2]。通常STR基因座核心序列重復(fù)次數(shù)越多,基因突變率越高,F(xiàn)GA基因座等位基因范圍在12.2~51.2,目前觀察到的等位基因數(shù)目多達(dá)80個,共有69種變異,在常見突變的基因座中,F(xiàn)GA基因座的突變率最高(0.29%)[3,4]。

        在本文的兩個案例中,F(xiàn)GA基因座的可疑突變分別達(dá)到了五步及三步,這在日常鑒定實踐中極為罕見,甚至第一對母女還同時有另一個STR基因座(D4S2408)存在一步突變的可能。查閱文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn),親子鑒定中同時存在2個及以上STR基因座突變的現(xiàn)象已有報道[5-7]。

        關(guān)于親子鑒定實踐中遇到這種突變的應(yīng)對策略,筆者認(rèn)為,若只有1個或2個STR基因座不符合孟德爾遺傳規(guī)律,為了避免因STR基因座發(fā)生突變而錯判,應(yīng)增加突變率低、穩(wěn)定性好的STR基因座進(jìn)行復(fù)核驗證,以便能更有效地排除近親關(guān)系。在二聯(lián)體親子鑒定中,遇到突變時若能使雙親的另一方也參與檢驗,更有利于結(jié)果的準(zhǔn)確判斷。有文獻(xiàn)[8]報道,F(xiàn)GA基因座存在等位基因丟失導(dǎo)致假突變現(xiàn)象,因此,若發(fā)生突變的基因座檢測為純合子,最好換用其他廠家生產(chǎn)、引物序列不同的試劑盒或重新設(shè)計引物進(jìn)行驗證,以防出現(xiàn)等位基因漏檢,即雜合子擴(kuò)增丟失現(xiàn)象。如出現(xiàn)類似突變,也可以考慮應(yīng)用高通量二代測序儀分型檢測判斷,有條件的還可進(jìn)一步增加紅細(xì)胞血型、SNP等遺傳標(biāo)記系統(tǒng)、性染色體STR分型、mtDNA測序、插入缺失(InDel)位點(diǎn)檢驗等技術(shù),以確保鑒定意見的準(zhǔn)確性與嚴(yán)謹(jǐn)性。

        [1]侯一平.法醫(yī)物證司法鑒定實務(wù)[M].北京:法律出版社,2012:136-137.

        [2]李海霞,馬曉燕,張晉湘,等.24個常用STR基因座的突變觀察與分析[J].中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版),2010,31(1):13-16.

        [3]李成濤,郭宏,趙珍敏,等.親權(quán)鑒定中常用STR基因座的基因組學(xué)和遺傳學(xué)分析[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2008,24(3):214-220.

        [4]鄧志輝,吳國光,程良紅,等.13個STR基因座在親子鑒定案例中的基因突變觀察[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2013,18(3):150-153.

        [5]常云峰,蔡繼峰,楊立,等.2個STR基因座變異親子鑒定1例[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2011,27(3):192.

        [6]任賀,郭劍章,陳星,等.3個STR基因座變異親子鑒定1例[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2010,26(6):479-480.

        [7]李海霞,孫宏鈺,張何,等.3個STR基因座同時突變的親子鑒定案1例[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2009,25(4):319-320.

        [8]蔡金洪,湯美云,黃健.親子鑒定中常用10個STR基因座突變的觀察和分析[J].湖南中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報,2013,33(4):8-9.

        DF795.2

        B

        10.3969/j.issn.1004-5619.2017.04.035

        1004-5619(2017)04-0451-02

        2016-04-05)

        (本文編輯:李 莉)

        張陳明(1985—),男,碩士研究生,助理研究員,主要從事法醫(yī)物證學(xué)鑒定;E-mail:448531970@qq.com

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