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        碳青霉烯類非敏感腸桿菌的耐藥性與基因型研究

        2016-09-14 08:58:40杜任生庾永基肖偉明
        關(guān)鍵詞:烯酶烯類環(huán)素

        杜任生,庾永基,肖偉明

        (廣州市花都區(qū)第二人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 510850)

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        碳青霉烯類非敏感腸桿菌的耐藥性與基因型研究

        杜任生,庾永基,肖偉明

        (廣州市花都區(qū)第二人民醫(yī)院檢驗(yàn)科510850)

        目的研究碳青霉烯類非敏感腸桿菌的耐藥性與基因型。方法自2013年6月至2014年6月采集碳青霉烯類非敏感腸桿菌共計(jì)110株,選用K-B紙片分析細(xì)菌對(duì)藥物有無敏感性,采用改良后的Hodge試驗(yàn)分析碳青霉烯細(xì)菌在臨床上的使用反應(yīng)。測(cè)試菌株耐藥基因?qū)LAST對(duì)比(局部序列比對(duì))與PCR、DNA進(jìn)行分析測(cè)試。結(jié)果測(cè)試出替加環(huán)素中介11株和耐藥4株(黏質(zhì)沙雷菌、產(chǎn)氣腸桿菌2株)。110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌對(duì)頭孢噻肟和阿莫西林/克拉維酸耐藥率最高,頭孢他啶、四環(huán)素、復(fù)方磺胺甲噁唑、亞胺培南、厄他培南、環(huán)丙沙星、氨曲南等耐藥率均為64.9%~88.4%;而妥布霉素、阿米卡星、呋喃妥因、頭孢吡肟耐藥率較低,為16.6%~40.1%;敏感率增高的為替加環(huán)素、米諾環(huán)素,分別為82.0%和86.6%。研究發(fā)現(xiàn)110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌當(dāng)中,檢測(cè)出blaSHV-12、blaCTX-M-15、ESBLs、blaCTX-M-33等基因。在110株碳青霉烯細(xì)菌當(dāng)中還檢測(cè)出1株黏質(zhì)沙雷菌,基因型號(hào)為blaKPC-2;改良后的Hodge試驗(yàn)77株陽性,檢出率為70%。36株(32.7%)ESBLs呈陽性,5株陰溝腸桿菌(blaIMP-26)與1株產(chǎn)氣腸桿菌(blaVIM-2)基因、31株大腸埃希菌。結(jié)論碳青霉烯腸桿菌的基因型主要有blaKPC-2基因、blaIMP-26基因、blaVIM-2基因。藥敏結(jié)果顯示碳青霉烯類腸桿菌科細(xì)菌對(duì)米諾環(huán)素和替加環(huán)素敏感率增高,臨床用藥時(shí)可根據(jù)患者病情進(jìn)行合理選擇,以達(dá)到控制感染的效果。

        碳青霉烯類抗菌藥物;耐藥性;基因型;腸桿菌

        近幾年隨著科技不斷發(fā)展,臨床上應(yīng)用廣譜β-內(nèi)酰胺酶與Amp C酶的腸桿菌科細(xì)菌越來越廣泛,對(duì)廣譜β-內(nèi)酰胺酶使用率也是不斷增加。由于臨床上經(jīng)常使用碳青霉烯類抗菌藥物進(jìn)行抗菌治療,隨著時(shí)間推移,造成臨床使用抗感染藥物的困難逐年上升。目前。碳青霉烯類腸桿菌被國內(nèi)外學(xué)者廣泛關(guān)注[1-4]。為進(jìn)一步研究碳青霉烯類腸桿菌基因型情況,采集本院感染菌株110株,分析碳青霉烯類腸桿菌抗耐藥性與基因型。

        1 材料與方法

        1.1菌株自2013年6月至2014年6月收集本院臨床標(biāo)本當(dāng)中分離的碳青霉烯類非敏感腸桿菌共110株,其中黏質(zhì)沙雷菌10株、布氏檸檬酸桿菌1株、陰溝腸桿菌20株、大腸埃希菌62株、氣腸桿菌14株、奇異變形桿菌1株、摩根摩根菌2株,實(shí)驗(yàn)過程中亞胺培南與厄他培南只要出現(xiàn)上述兩種或兩種以上細(xì)菌耐藥即為非敏感菌株。產(chǎn)IMP-4型酶、KPC-2型酶肺炎克雷伯菌、TEM-5型、肺炎克雷伯菌ATCC700603酶肺炎克雷伯菌、IMI-1型酶陰溝腸桿菌、SHV-3型酶。

        1.2試劑與儀器血瓊脂平板、M-H肉湯、血液增菌培養(yǎng)基、M-H瓊脂均為杭州天微生物公司生產(chǎn)。PCR檢測(cè)試劑盒為北京天根公司生產(chǎn)。阿米卡星、環(huán)丙沙星、頭孢西丁、頭孢噻肟、頭孢他啶/克拉維酸、阿莫西林/克拉維酸、妥布霉素、四環(huán)素、頭孢噻肟/克拉、維酸頭孢他啶、氨曲南、亞胺培南、米諾環(huán)素、藥敏紙片頭孢吡肟、呋喃妥因、替加環(huán)素、復(fù)方磺胺甲噁唑,以上產(chǎn)品均為上海生工公司生產(chǎn)。本次使用的VITEK-33全自動(dòng)微生物分析儀為SP1000 PCR擴(kuò)增儀,Tanon1600凝膠成像系統(tǒng)以及DYY-Ⅲ電泳儀。三羥甲基氨基甲烷(Tris) 、溴化乙錠和瓊脂糖、乙二胺四乙酸(EDTA)使用試劑盒均由上海天能公司生產(chǎn)。

        1.3方法

        1.3.1鑒定細(xì)菌及藥敏試驗(yàn)本次采用菌株經(jīng)VITEK-32全自動(dòng)微生物分析儀進(jìn)行鑒定,根據(jù)美國臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)使用K-B紙片檢測(cè)菌株的藥物敏感性[5]。

        1.3.2檢測(cè)碳青霉烯本次檢測(cè)KPC-2型酶肺炎克雷伯菌顯示為陽性對(duì)照株,按照GLSI標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行改良的Hodge試驗(yàn)。

        1.3.3擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序及 DNA 序列分析本文的擴(kuò)增引物根據(jù)文獻(xiàn)[6-8]設(shè)計(jì),委托上海生工公司合成。本次檢測(cè)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物使用ABI-PRISM3730儀器進(jìn)行測(cè)試,對(duì)檢測(cè)出的GenBank與BLAST數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,試劑使用配套試劑,操作過程完全按照儀器和試劑的說明書進(jìn)行。

        1.3.4ESBLs檢測(cè)使用2013年版CLSI推薦的紙片法表型確證試驗(yàn)[5]。

        2 結(jié)  果

        2.1藥敏試驗(yàn)結(jié)果實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,本次測(cè)試出替加環(huán)素中介11株和耐藥4株(黏質(zhì)沙雷菌、產(chǎn)氣腸桿菌2株)。本次試驗(yàn)?zāi)退幝蕿?3.9%,顯示110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌對(duì)與頭孢噻肟和阿莫西林/克拉維酸耐藥率最高,頭孢他啶、四環(huán)素、復(fù)方磺胺甲噁唑、亞胺培南、厄他培南、環(huán)丙沙星、氨曲南等耐藥率均為64.9%~88.4%;而妥布霉素、阿米卡星、呋喃妥因、頭孢吡肟耐藥率較低,為16.6%~40.1%;敏感率增高的為替加環(huán)素、米諾環(huán)素,分別為82.0% 和 86.6%。

        2.2ESBLs與MHT檢測(cè)結(jié)果本次從110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌細(xì)菌當(dāng)中測(cè)出產(chǎn)碳青霉烯酶細(xì)菌77株(70%)、陰溝腸桿菌15株(19.5%)、黏質(zhì)沙雷菌6株(7.8%)。77株產(chǎn)碳青霉烯酶細(xì)菌中大腸埃希菌49株(63.6%)、產(chǎn)氣腸桿菌5株(6.5%)。36株ESBLs細(xì)菌。數(shù)據(jù)顯示同時(shí)產(chǎn)ESBLs和碳青霉烯酶兩種酶的細(xì)菌為18株,占16.6%。見表1。

        表1  數(shù)據(jù)分析110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌科細(xì)菌碳青霉烯酶與ESBLs的檢出率[n(%)]

        2.3耐藥酶基因檢測(cè)及序列測(cè)定結(jié)果110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌中,分別有33株(30%)、1株(0.9%)、5株(4.5%)檢出blaVIM-2、blaKPC-2、blaIMP-26等碳青霉烯酶基因;分別有9株(8.6%)、5株(4.5%)、1株(0.9%)檢測(cè)出blaCTX-M-3、blaSHV-12、blaCTX-M-15等ESBLs基因。62株大腸埃希菌中有31株(50.0%)檢出blaKPC-2基因,檢測(cè)出有8株攜帶blaSHV-12基因、1株攜帶blaCTX-M-15基因。20株陰溝腸桿菌中,有5株攜帶blaIMP-26基因、1株攜帶blaVIM-2基因、1株攜帶blaCTX-M-3基因、3株攜帶blaSHV-1基因。14株產(chǎn)氣腸桿菌檢出含blaKPC-2與blaSHV-12基因各1株。未從檸檬酸桿菌中檢測(cè)出GIM、SIM、GES、NDM-1、IMI、OXA、SPM等基因。除以上檢出基因還檢出10株黏質(zhì)沙雷菌、1株布氏檸檬酸桿菌、2株摩根摩根菌、1株奇異變形桿菌、1株blaKPC-2陽性、blaCTX-M-15基因,以上檢測(cè)未檢出碳青霉烯酶以及ESBLs基因。詳見圖1。

        注:M為DNA marker;1~5分別為blaKPC-2、blaIMP-26、blaVIM-2、blaSHV-12、blaCTX-M-15;6為陰性菌株。

        3 討  論

        本次研究數(shù)據(jù)顯示110株碳青霉烯類非敏感腸桿菌中含有blaVIM-2、blaIMP-26、blaKPC-2這3種碳青霉烯酶耐藥基因,陰溝腸桿菌基因主要有blaVIM-2、blaIMP-26,實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)碳青霉烯類非敏感腸桿菌可產(chǎn)ESBLs,本次實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)110株菌當(dāng)中有16.6%的菌株同時(shí)生產(chǎn)碳青霉烯酶與ESBLs,研究發(fā)現(xiàn)ESBLs,主要以blaCTX-M-15為主,blaSHV-12、blaCTX-M-3兩種基因?yàn)檩o,主要分布于陰溝腸桿菌與產(chǎn)氣腸桿菌。碳青霉烯類中介或耐藥的腸桿菌科細(xì)菌以肺炎克雷伯菌、大腸埃希菌、陰溝腸桿菌、產(chǎn)氣腸桿菌、黏質(zhì)沙雷菌等為主,這些細(xì)菌應(yīng)作為醫(yī)院感染防控的主要對(duì)象[6-7]。碳青霉烯類藥物被認(rèn)為是治療腸桿菌科細(xì)菌感染較為有效的藥物,但近年來,腸桿菌科細(xì)菌對(duì)此類藥物的耐藥率在逐年增加。耐藥的主要機(jī)制是菌株產(chǎn)生碳青霉烯類水解酶(包括A、B和D類),其次是 ESBLs 或頭孢菌素酶合并外膜蛋白改變和(或)外排泵作用,導(dǎo)致碳青霉烯類抗菌藥物敏感性下降甚至耐藥[8-9]。研究發(fā)現(xiàn)碳青霉烯類非敏感腸桿菌敏感率低于厄他培南以及亞胺培南,造成的原因有可能是非碳青霉烯酶引起的,造成其敏感率降低的原因還需進(jìn)一步研究。藥敏結(jié)果顯示碳青霉烯類腸桿菌科細(xì)菌對(duì)米諾環(huán)素和替加環(huán)素敏感率增高,臨床用藥時(shí)可根據(jù)患者病情進(jìn)行合理選擇,以達(dá)到控制感染的目的。

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        10.3969/j.issn.1673-4130.2016.16.054

        A

        1673-4130(2016)16-2333-02

        2016-03-05

        2016-06-18)

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