張麗麗+李博+譚燕華+曹揚(yáng)+易小平
摘要:為深入研究玉米轉(zhuǎn)錄因子基因ZmASR1的功能,提高玉米株系的產(chǎn)量和抗逆性,根據(jù)http://www.maizegdb.org/ 網(wǎng)站上公布的玉米自交系B73的ZmASR1序列和Cornejo發(fā)表的Ubiquitin啟動(dòng)子的序列,設(shè)計(jì)引物從玉米自交系B73的DNA序列中克隆了ZmASR1基因和Ubiquitin啟動(dòng)子,并對(duì)ZmASR1基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。序列分析結(jié)果表明,ZmASR1基因DNA全長(zhǎng)為1 381 bp,包含1個(gè)長(zhǎng)度為131 bp的內(nèi)含子序列,存在1個(gè)完整的開(kāi)放閱讀框417 bp,編碼138個(gè)氨基酸。氨基酸序列分析表明其具有ASR家族典型的保守結(jié)構(gòu)域ABA_WDS(abscisic acid/water deficit stress),氨基酸序列的N端有該家族成員所特有的依賴(lài)于Zn2+的DNA結(jié)合位點(diǎn),而C端則有1個(gè)核定位信號(hào),玉米的ZmASR1與單子葉植物的ZmASR1親緣關(guān)系較近,而與雙子葉植物的ZmASR1親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。并構(gòu)建了同時(shí)帶有該啟動(dòng)子和ZmASR1基因的植物表達(dá)載體。
關(guān)鍵詞:玉米;Ubiquitin啟動(dòng)子;ZmASR1基因;生物信息學(xué);植物表達(dá)載體
中圖分類(lèi)號(hào): Q785
文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2016)04-0016-06
玉米生產(chǎn)在保障我國(guó)糧食安全中具有十分重要的戰(zhàn)略地位,玉米在世界范圍內(nèi)廣泛種植,是我國(guó)播種面積最大的農(nóng)作物,同時(shí)也是我國(guó)產(chǎn)量第一大糧食作物,是主要的糧食飼料兼用作物,以產(chǎn)量高、營(yíng)養(yǎng)豐富且用途廣泛而被譽(yù)為三冠王——高產(chǎn)之王、飼料之王、加工原料之王。玉米的重要性為玉米的發(fā)展提供了難得的機(jī)遇,但同時(shí)我們也必須清醒地認(rèn)識(shí)到玉米生產(chǎn)中遇到的現(xiàn)實(shí)困難。糧食產(chǎn)量下降是由各種生物和非生物脅迫的影響造成的,干旱是最重要的環(huán)境脅迫,超過(guò)任何其他環(huán)境因素,嚴(yán)重?fù)p害植物的生長(zhǎng)和發(fā)育,限制植物生產(chǎn)和作物的性能[1]。玉米是對(duì)水分反應(yīng)敏感的旱地作物,玉米在整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中需水量較大,但其自身的耐旱性較差。我國(guó)每年受旱面積大約為種植面積的40%,干旱一般可使玉米減產(chǎn)20%~30%,因此,干旱成為制約我國(guó)玉米發(fā)展的首要不利因素。隨著全球氣候變暖、水資源的日益匱乏和干旱的日益加劇,耐旱玉米品種在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的地位顯得越來(lái)越重要。干旱脅迫對(duì)玉米根系的生長(zhǎng)發(fā)育、籽粒產(chǎn)量和品質(zhì)都有較大影響,干旱脅迫抑制了玉米植株根系的生長(zhǎng),導(dǎo)致產(chǎn)量降低、品質(zhì)變差。因此有關(guān)玉米干旱脅迫與抗旱性機(jī)理及其應(yīng)用的研究才更加迫切,培育耐旱抗旱的玉米品種才是促進(jìn)干旱和半干旱地區(qū)玉米生產(chǎn)發(fā)展的有效措施,同時(shí)也是抵御干旱提高產(chǎn)量的有效途徑。
ASR(abscisic acid,stress,ripening) 蛋白是一類(lèi)親水性小分子量的植物特異性蛋白。ASR基因在植物響應(yīng)發(fā)育和環(huán)境信號(hào)中發(fā)揮著重要的作用,包括衰老、果實(shí)成熟、花粉成熟和葡萄糖代謝[2-5]。并且ASR基因在ABA誘導(dǎo)和響應(yīng)生物及非生物脅迫時(shí)顯著上調(diào)[6-11]。大蕉ASR基因MpAsr受鐮刀菌(Fusarium oxysporum f. sp. cubense)誘導(dǎo)而上調(diào)表達(dá)[10]。ASR基因還可以影響果實(shí)的產(chǎn)量,玉米ASR基因(ZmASR1)的異位表達(dá)對(duì)玉米產(chǎn)量有很大的影響,這種影響并不受缺水脅迫條件的限制,ZmASR1通過(guò)調(diào)節(jié)支鏈氨基酸的生物合成基因可能有助于改善玉米的產(chǎn)量[12]。
由于ASR基因在擬南芥中不存在[9,13],對(duì)其功能和調(diào)控機(jī)制的研究非常有限。有研究表明小麥轉(zhuǎn)錄因子基因TaASR1轉(zhuǎn)入煙草之后通過(guò)激活體內(nèi)的抗氧化系統(tǒng)和脅迫相關(guān)基因的表達(dá)來(lái)賦予其抗旱性[14]。Ricardi等在番茄中通過(guò)ChIP-SEQ技術(shù)證明番茄ASR1基因可能通過(guò)調(diào)控番茄細(xì)胞壁和水通道蛋白相關(guān)靶基因的表達(dá)來(lái)賦予番茄對(duì)干旱脅迫的耐受性[15]。前期的研究證明[12],在玉米中ASR家族有9個(gè)成員,是目前ASR成員最多的品種,在玉米ASR基因家族9個(gè)成員中,在干旱脅迫條件下ZmASR1無(wú)論在轉(zhuǎn)錄水平還是蛋白質(zhì)組水平上都是表達(dá)量最大、變化最為明顯的,并且ZmASR1在玉米中的過(guò)量表達(dá)可以提高玉米在缺水脅迫下的籽粒產(chǎn)量,但是卻沒(méi)有對(duì)ZmASR1缺水脅迫下的調(diào)控機(jī)理進(jìn)行更深入的研究,因此我們選擇ZmASR1來(lái)進(jìn)行抗旱調(diào)控機(jī)理的研究更有針對(duì)性和目的性。在玉米自交系中過(guò)表達(dá)ZmASR1基因是研究ZmASR1基因在植物中如何發(fā)揮調(diào)控作用的有效途徑,對(duì)于培育玉米抗旱新品種,促進(jìn)玉米產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展具有重要的理論和實(shí)踐意義。
要想在玉米自交系中過(guò)表達(dá)ZmASR1基因,首先要構(gòu)建植物表達(dá)載體,隨著植物基因工程技術(shù)的發(fā)展,我們不僅要把特定的外源基因轉(zhuǎn)入受體植物,更要將外源基因特定而高效地表達(dá)才能滿(mǎn)足我們的需求。啟動(dòng)子序列中包含許多重要的順式作用元件,對(duì)植物基因的表達(dá)水平具有重要作用,使其成為表達(dá)調(diào)控的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一般認(rèn)為CaMV35S啟動(dòng)子在雙子葉植物的遺傳轉(zhuǎn)化應(yīng)用廣泛,但在單子葉植物中的活性較低。而Ubiquitin啟動(dòng)子來(lái)自于玉米多聚泛素蛋白基因,是一個(gè)在單子葉植物中有較強(qiáng)表達(dá)的組成型啟動(dòng)子,在脅迫條件下,Ubiquitin基因的表達(dá)活性會(huì)顯著增強(qiáng)[16]。本研究從玉米自交系B73中克隆了Ubiquitin啟動(dòng)子和玉米ZmASR1基因,構(gòu)建了同時(shí)含Ubiquitin啟動(dòng)子和ZmASR1基因的植物表達(dá)載體,為后續(xù)獲得轉(zhuǎn)基因抗旱株系奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 材料
植物材料為玉米自交系B73,菌株為大腸桿菌DH5α和植物表達(dá)載體為pCAMBIA3301,農(nóng)桿菌菌株為GV3101,酶與試劑為快速限制性?xún)?nèi)切酶 BamHⅠ、HindⅢ、PmlⅠ購(gòu)自Thermo Scientific公司,T4 DNA 連接酶,pMD18-T vector (simple)均購(gòu)自TaKaRa公司。