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        污水處理廠耐β—內(nèi)酰胺類乳糖發(fā)酵型腸桿菌Ⅰ類整合子及基因盒研究

        2016-05-03 19:59:31徐佳麗王小嬌張明任雪麗江濤
        安徽農(nóng)學(xué)通報(bào) 2016年7期

        徐佳麗+王小嬌+張明+任雪麗+江濤

        摘 要:該文首先用 PCR等方法,對閔行污水處理廠分離的β-內(nèi)酰胺類抗性菌株中Ⅰ類整合子和基因盒的存在情況進(jìn)行測定;其次,對含有Ⅰ類整合子-基因盒的抗性菌株抽提質(zhì)粒,分析Ⅰ類整合子-基因盒所在位置;最后,探討了含有整合子-基因盒菌株對多種抗生素的反應(yīng)。

        關(guān)鍵詞:β-內(nèi)酰胺類抗性菌株;Ⅰ類整合子;基因盒

        中圖分類號(hào) X703 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 A 文章編號(hào) 1007-7731(2016)07-15-03

        Abstract:In this paper,PCR techniques were used to detect the presence of classⅠintegron and gene β-lactam antibiotics which selected from sewage water samples. Second,the plasmid DNA were extracted from β-lactam resistant strains with classⅠintegron and gene cassette,which detected the position of classⅠintegron and gene cassette. Finally,the response of a strain containing classⅠintegron and gene cassette to antibiotics were investigated.

        Key words:β-lactam antibiotics;ClassⅠintegron;Gene cassettes.

        1 前言

        隨著抗生素使用越來越頻繁,細(xì)菌具有了更強(qiáng)的抗藥性,從而使耐藥性廣泛傳播。耐藥基因的水平傳播主要由質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子、噬菌體介導(dǎo),而整合子起著至關(guān)作用[1]。Stokes[2]在1989年首次提出了整合子的概念,Hall[3]在1991年正式提出了基因盒-整合子系統(tǒng)的概念。整合子是細(xì)菌DNA片段,與細(xì)菌耐藥性密切相關(guān)[4],是一種存在于細(xì)菌質(zhì)粒或染色體上的遺傳元件系統(tǒng),通過自身編碼的整合酶來獲取外源基因并使之表達(dá)。

        整合子由5′-保守末端(CS)、3′-保守末端及位于2段保守序列之間的可變區(qū)組成,它能夠捕獲、整合及表達(dá)耐藥基因。5′-CS是整合子的基本結(jié)構(gòu),包括一個(gè)編碼整合酶的IntⅠ基因、一個(gè)整合子重組位點(diǎn)attI和啟動(dòng)子(Pant)[5]。中間可變區(qū)域有不同種類和數(shù)量的耐藥基因盒,表現(xiàn)出多耐藥特征。而基因盒是一種結(jié)構(gòu)比較小的、自己無法轉(zhuǎn)錄翻譯,需要借助外界力量來幫助自己表達(dá),而整合子經(jīng)常是它的首選目標(biāo)?;蚝型ㄟ^整合子上整合酶被整合到整合子中或從整合子里被剪切下來,使耐藥基因得以傳播與擴(kuò)散[6]。3'-CS的結(jié)構(gòu)因整合子種類而不同。

        到目前為止,Ⅰ類整合子是研究最多也是被檢測到最多的。Ⅰ類整合子的5′-CS部分一般相似,而3′-CS存在差異。多數(shù)3′-保守端有3個(gè)開放的基因讀碼框:磺胺耐藥基因(SulⅠ),季銨鹽化合物及溴乙錠的耐受基因(qacE△1),以及功能尚不清楚的ORF5[5]。本實(shí)驗(yàn)主要通過PCR等方法檢測污水廠分離的39株抗性菌株的Ⅰ類整合子以及基因盒的存在情況。通過對含有Ⅰ類整合子-基因盒系統(tǒng)的抗性菌株提取質(zhì)粒,分析Ⅰ類整合子-基因盒所在的位置。最后,探討了整合子在介導(dǎo)LFE對抗生素產(chǎn)生多重抗性的作用。

        2 實(shí)驗(yàn)方法

        2.1 樣本采集及DNA的提取 實(shí)驗(yàn)菌株來自閔行污水廠中分離的39株耐β-內(nèi)酰胺類乳糖發(fā)酵型腸桿菌。用水煮法(99.5℃,10min)裂解提取菌落DNA。同時(shí)做好標(biāo)記保存使用。

        2.2 抗性菌株Ⅰ類整合子基因檢測 將水煮提取的39個(gè)菌落DNA在Ⅰ類整合子基因擴(kuò)增引物下進(jìn)行PCR檢測,反應(yīng)總體系為30μL:3μL 10×PCR Buffer,1.8μL MgCl2,3μL dNTPs,正、反向引物各0.6μL,2μL DNA模板,0.2μL的Taq聚合酶,18.8μL超純水。PCR擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性5min,94℃變型30s,59℃退火30s,72℃延伸60s,30個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10min。最后在1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。

        2.3 抗性菌株Ⅰ類整合子基因盒檢測 用上述使用過的39個(gè)菌落DNA在Ⅰ類整合子基因盒擴(kuò)增引物下進(jìn)行PCR檢測,反應(yīng)總體系為30μL:3μL 10×PCR Buffer,1.8μL MgCl2,6μL dNTPs,正、反向引物各1.2μL,4μL DNA模板,0.4μL的Taq聚合酶,12.4μL超純水。PCR擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性7min,94℃變型40s,59℃退火40s,72℃延伸80s,30個(gè)循環(huán),72℃延伸10min,最后在1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。

        2.4 帶Ⅰ類整合子抗性菌株整合子位置確定 用質(zhì)粒抽提試劑盒(桑尼生物科技有限公司)對閔行污水廠中分離的39株耐β-內(nèi)酰胺類乳糖發(fā)酵型腸桿菌抽提質(zhì)粒。用PCR方法對抽提的質(zhì)粒做整合子及基因盒檢測,步驟同上面2個(gè)實(shí)驗(yàn)相同。

        2.5 β-內(nèi)酰胺類抗性菌株對多重抗生素的耐藥性研究 將分離出的含有39株β-內(nèi)酰胺抗性菌株分別轉(zhuǎn)接于含有濃度為50μg/mL的氨芐西林鈉、16μg/mL的頭孢呋辛鈉、20μg/mL的四環(huán)素的麥康凱瓊脂平板中,37℃培養(yǎng)24h。

        3 結(jié)果與分析

        3.1 抗性菌株Ⅰ類整合子-基因盒檢測結(jié)果 取9、10、11月從閔行污水處理廠分離出的39株具有2種以上抗性基因的Ⅰ類整合子-基因盒檢測結(jié)果,見表1。從表1可以得出:在分離的39株具有多個(gè)抗性基因的菌株中,其中約15.38%含有Ⅰ類整合子但不含有基因盒;15.38%含有基因盒但是在intⅠ上沒有檢測到;同時(shí)15.38%的菌株檢測出Ⅰ類整合子及基因盒,另外約有30.77%未含有Ⅰ類整合子和基因盒。其中對于都含有Ⅰ類整合子及基因盒的月份上分析:11月份<9月份<10月份,這在一定程度上反應(yīng)出耐藥性的傳播和抗藥性的爆發(fā)期可能與時(shí)間有關(guān)。由此可知,環(huán)境中含有較多的Ⅰ類整合子-基因盒這個(gè)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)的菌株與環(huán)境中細(xì)菌抗性藥提高有著密切聯(lián)系。

        3.2 Ⅰ類整合子-基因盒位置的分析 對含有Ⅰ類整合子-基因盒的6株菌進(jìn)行了對該系統(tǒng)位置的研究,結(jié)果表明,這6株菌的質(zhì)粒DNA也都能檢測到該系統(tǒng),說明這6株的Ⅰ類整合子-基因盒系統(tǒng)均位于質(zhì)粒上。

        3.3 β-內(nèi)酰胺類抗性菌株多重耐藥性的研究 攜帶Ⅰ類整合子-基因盒系統(tǒng)的抗性菌株在不同抗生素中生長情況,結(jié)果見表3。從表3可以看出:SA15、OC4、OD6這3株菌能在氨芐西林鈉、頭孢呋辛鈉、四環(huán)素這3種抗生素中生長,說明這3株菌對這3種抗生素都具有抗性,即為多重抗性菌。另外,這也從側(cè)面反映出含有Ⅰ類整合子-基因盒的細(xì)菌對抗生素極易表現(xiàn)出多重抗性。

        4 結(jié)論

        在閔行污水處理廠分離出的39株帶有多重抗性的菌株中,Ⅰ類整合子的檢出率為30.77%,基因盒的檢出率為30.77%,同時(shí)帶有整合子-基因盒系統(tǒng)的檢出率為15.38%[7]。對6株含有Ⅰ類整合子-基因盒的β-內(nèi)酰胺類抗性菌株對其質(zhì)粒檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在這6株菌的質(zhì)粒上都檢測到了Ⅰ類整合子-基因盒的存在。β-內(nèi)酰胺類抗性菌株中的Ⅰ類整合子-基因盒可能位于質(zhì)粒上。整合子在介導(dǎo)β-內(nèi)酰胺類抗性菌株對抗生素產(chǎn)生多重抗藥性的過程中起到了重要作用。

        參考文獻(xiàn)

        [1]馮銀,陳體,伍勇.整合子介導(dǎo)細(xì)菌耐藥調(diào)控機(jī)制的研究進(jìn)展[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2013,34(10):1260-1262.

        [2]Stokes HW,Hall RM.A novel family of potentially mobile DNA elements encoding site-specific gene-integration functions: integrons [J]. Mol Microbiol,1989,3(12):669-1683.

        [3]Hall R M,Collis C M. Mobile gene cassettes and integrons:capture and spread of genes by site-specific recombination [J]. Mol Microbiol,1995,15(4):593-600.

        [4] Seputienv,Povilonisj,Ruzaukasm,et al.Prevalence of trimethoprim resistance genes in Escherichia coli isolates of human and animal origin in Lithuania[J].J Med Microbiol,2010,59 (Pt3):315-322.

        [5]李曉娜,張金寶,王桂琴.整合子-基因盒介導(dǎo)細(xì)菌耐藥基因水平傳播的研究進(jìn)展[J].黑龍江畜牧獸醫(yī)科技版,2015(01):47-49.

        [6] Partridgesr,Tsafnatg,Colerae,et al. Gene cassettes and cassette arrays in mobile resistance integrons[J].FEMS Microbiol Rev,2009,33(4):757-784.

        [7]王小嬌.污水廠耐耐β-內(nèi)酰胺類抗生素乳糖發(fā)酵型腸桿菌耐藥基因的研究[D].上海:華東師范大學(xué),2010.

        (責(zé)編:張宏民)

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