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        淺談蛋白質(zhì)印跡法操作過程中的實(shí)驗(yàn)技巧

        2015-11-14 19:38:38宋亮陳丹丹
        科技資訊 2015年21期
        關(guān)鍵詞:生物學(xué)

        宋亮 陳丹丹

        摘 要:蛋白質(zhì)印跡法(蛋白免疫印跡)即Western Blot,是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實(shí)驗(yàn)方法,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于基因在蛋白水平的表達(dá)研究、抗體活性檢測(cè)和疾病早期診斷等多個(gè)方面。其基本原理是將電泳分離后的細(xì)胞或組織蛋白從凝膠轉(zhuǎn)移到固相支持物上,然后用特異性抗體對(duì)相應(yīng)抗原進(jìn)行著色,隨后通過分析著色的位置和著色深度來反映蛋白質(zhì)表達(dá)情況。該文通過介紹實(shí)驗(yàn)操作過程中的一些心得體會(huì),簡(jiǎn)要闡述如何提高蛋白質(zhì)印跡法的實(shí)驗(yàn)效果。

        關(guān)鍵詞:蛋白印跡法 實(shí)驗(yàn)技巧 生物學(xué)

        中圖分類號(hào):Q81 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1672-3791(2015)07(c)-0063-02

        蛋白質(zhì)印跡法是分子生物學(xué)和生物化學(xué)中常用于分離和識(shí)別特異性蛋白的一種實(shí)驗(yàn)方法。這項(xiàng)技術(shù)主要包括三個(gè)主要步驟:(1)基于分子重量,利用電泳進(jìn)行蛋白分離。(2)將蛋白從凝膠轉(zhuǎn)移至固相支持物。(3)利用特異性的一抗和二抗使目的蛋白顯色。隨后通過分析著色的位置和著色深度來反映蛋白質(zhì)表達(dá)情況。Western Blot實(shí)驗(yàn)簡(jiǎn)單而又復(fù)雜,簡(jiǎn)單在于原理和操作過程,復(fù)雜在于每一步的精細(xì)化操作,常常一個(gè)很小環(huán)節(jié)的疏忽就會(huì)對(duì)最終結(jié)果產(chǎn)生很大的影響。該文中,作者結(jié)合自身多年的實(shí)驗(yàn)經(jīng)歷,簡(jiǎn)要談?wù)勅绾翁岣叩鞍踪|(zhì)印跡法的效果。

        1 制膠

        市售的成品膠簡(jiǎn)單,省時(shí),效果佳,但價(jià)格相對(duì)昂貴,因此多數(shù)實(shí)驗(yàn)室仍選擇使用聚丙烯酰胺自行配膠。由于凝膠的質(zhì)量會(huì)直接影響后續(xù)的實(shí)驗(yàn),因此要特別注意以下幾點(diǎn)。(1) 液態(tài)的分離膠及濃縮膠均可事先配好,四甲基乙二胺(TEMED)及10% 過硫酸銨(APS)除外,過濾后作為儲(chǔ)存液避光存放于4℃,臨用前取出室溫平衡,否則凝膠過程產(chǎn)生的熱量會(huì)使低溫時(shí)溶解于儲(chǔ)存液中的氣體析出而導(dǎo)致氣泡。(2)APS的使用比例大約0.7~0.8:100,通常情況下分離膠濃度越高,使用的APS濃度應(yīng)越低。(3) APS一定要新鮮,最好現(xiàn)配現(xiàn)用,如在4℃存放,勿超過兩周。也可將配好的APS分裝后凍存在-20℃,隨時(shí)取用。(4)混合好的凝膠要均一沒有氣泡,否則影響聚合,導(dǎo)致電泳帶畸形。(5) 灌好膠后需等待其完全凝固才可上樣,具體凝固時(shí)間與加入的APS及TEMED配比有關(guān),通常在0.5~1 h內(nèi)凝集最好。過快表示APS和/或TEMED用量過多,此時(shí)膠太硬易裂,而且電泳時(shí)容易燒膠。過慢則表明兩種試劑用量不夠。需要注意的是,膠結(jié)構(gòu)的完全形成需要較長(zhǎng)時(shí)間,肉眼觀察到膠凝時(shí),其內(nèi)部分子的排列實(shí)際尚未完成。因此也可提前一天制膠,保濕放置在4℃過夜,次日使用。

        2 上樣電泳

        制膠完成后,可使用提前變性好的蛋白樣品上樣電泳。上樣前蛋白樣品最好瞬時(shí)離心,隨后輕微混勻。加樣時(shí)間要盡量短,以免樣品擴(kuò)散。為避免邊緣效應(yīng),可在未加樣的孔中加入等量的樣品緩沖液。另外,上樣量不宜過多,以免蛋白條帶過于臃腫,影響美觀。隨后,只需要控制好電流強(qiáng)度,根據(jù)預(yù)染的蛋白Marker判斷目的蛋白的位置,適時(shí)終止電泳即可。有觀點(diǎn)認(rèn)為分離膠的下1/3處是最佳分辨區(qū),個(gè)人經(jīng)驗(yàn)是1/2處至下1/3處區(qū)別不大,考慮到蛋白的區(qū)分主要依靠分離膠的濃度,所以在此區(qū)間可隨時(shí)停止電泳,只需注意不要讓目的蛋白過于靠近凝膠的下緣或是移動(dòng)出凝膠就行。電泳過程中有時(shí)會(huì)出現(xiàn)一些異?,F(xiàn)象,如:(1)條帶呈笑臉狀(︶),這是由于凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好。(2)條帶呈皺眉狀(︵),可能是裝置不合適,或是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或兩邊聚合不完全。(3)條帶出現(xiàn)拖尾,提示蛋白樣品溶解不好。(4)條帶出現(xiàn)紋理(縱向條紋):可能是樣品中含有不溶性顆粒。(5)條帶偏斜,是由于電極不平衡,或加樣位置偏斜。(6)條帶向兩邊擴(kuò)散:提示加樣量過多。

        3 轉(zhuǎn)膜

        經(jīng)過電泳分離后的蛋白質(zhì)樣品需要經(jīng)過“轉(zhuǎn)膜”步驟,即從凝膠轉(zhuǎn)移到膜上固定,才能用后續(xù)方法進(jìn)行蛋白的檢測(cè)和顯色。為了防止已經(jīng)分離的蛋白條帶在沒有電場(chǎng)的情況下擴(kuò)散,轉(zhuǎn)膜需要盡快進(jìn)行。不論使用濕轉(zhuǎn)還是半干轉(zhuǎn),轉(zhuǎn)膜過程中特別需要注意的是兩個(gè)問題:(1)正確放置“三明治”的疊放次序,即:陽極、下層濾紙、膜、膠、上層濾紙、陰極。(2)仔細(xì)排除每層之間的氣泡,尤其是膜與膠之間的氣泡。大的氣泡可能會(huì)造成系統(tǒng)短路,小的氣泡則會(huì)影響蛋白質(zhì)成功轉(zhuǎn)移至膜上。至于轉(zhuǎn)膜的時(shí)間和電流大小,需要根據(jù)目的蛋白的分子量進(jìn)行調(diào)整。為防止轉(zhuǎn)膜過程中過多的熱量產(chǎn)生,可以提前將轉(zhuǎn)膜液放置在4℃預(yù)冷,并且在轉(zhuǎn)膜過程中使用冰盒降溫,從而改善轉(zhuǎn)膜效果。轉(zhuǎn)膜結(jié)束后可使用麗春紅S對(duì)膜直接染色來顯示蛋白條帶,從而檢測(cè)轉(zhuǎn)膜效果,它的好處是充分脫色后不會(huì)干擾后續(xù)的抗體孵育。

        4 封閉、抗體孵育及發(fā)光鑒定

        為了減少抗體孵育后的非特異條帶以及雜亂的背景,轉(zhuǎn)膜結(jié)束后需利用封閉液進(jìn)行處理,以封閉膜上剩余的疏水結(jié)合位點(diǎn)。最常用的封閉液是脫脂奶粉,這是因?yàn)槊撝谭蹆?nèi)的非特異性成分豐富,封閉效率高。需要注意的是,由于抗磷酸氨基酸抗體可以與牛奶中的某些成分結(jié)合,所以在檢測(cè)這些抗體時(shí),不能使用脫脂奶粉作為封閉液,而需換用牛血清白蛋白 (BSA) 進(jìn)行處理。封閉結(jié)束后就是決定蛋白質(zhì)印跡法成敗的關(guān)鍵――使用針對(duì)于目的蛋白的一抗進(jìn)行雜交。對(duì)于國內(nèi)的大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室來講,選擇抗體是個(gè)頭疼的問題。原因很簡(jiǎn)單,進(jìn)口抗體,如Abcam,Cellsignaling和Sigma的一抗雖然效果好,但是價(jià)格昂貴。相比之下,Santa Cruz的抗體則量大,價(jià)位也便宜些,性價(jià)比較高。至于進(jìn)口抗體國內(nèi)分裝,或純國產(chǎn)抗體,質(zhì)量則良莠不齊,購買時(shí)需要些勇氣及運(yùn)氣。因此選擇一抗前最好根據(jù)發(fā)表的文獻(xiàn)來查找有效的抗體,慎重選擇。至于抗體(包括一抗及二抗)濃度一般要參照抗體說明書多次嘗試,選擇最適比例,合適的比例直接影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果以及背景。此外,加一抗、二抗要嚴(yán)格保證反應(yīng)時(shí)間,洗膜要注意盡可能地將一抗、二抗洗凈,有利于降低背景??贵w孵育結(jié)束后,一般使用辣根過氧化物酶HRP-ECL發(fā)光法或堿性磷酸酶AP-NBT/BICP顯色法進(jìn)行發(fā)光鑒定。無論什么方法,都需要根據(jù)結(jié)果調(diào)整曝光或者顯色時(shí)間,達(dá)到最佳效果。

        5 結(jié)語

        雖然在蛋白印跡的操作過程中使用相應(yīng)技巧可以改善實(shí)驗(yàn)效果,但一抗的質(zhì)量,以及待檢測(cè)蛋白的提取質(zhì)量才是實(shí)驗(yàn)成功的決定性環(huán)節(jié),應(yīng)受到充分重視。

        參考文獻(xiàn)

        [1] Liu Zhi-qiang,Mahmood Tahrin,Yang Ping-changC. Western Blot:Technique,theory, and trouble shooting [J].N Am J Med Sci,2014,6(3):160.

        [2] 謝嵐,艾華.Western blot方法中不同電流強(qiáng)度對(duì)較大分子蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)膜效率的影響[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2012(1):42-44.

        [3] 肖德勝,李景和,文繼舫,等.Western blot檢測(cè)蛋白表達(dá)方法的改進(jìn)[J].臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志,2003(2):210-211.

        [4] MacPhee Daniel J.Methodological considerations for improving Western blot analysis [J].Journal of Pharmacological and Toxicological Methods,2009,61(2):171-177.

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