柴松 安文婷 郭麗麗 姜樂 高志嵩 李書軍
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)是一類長度大于200個(gè)核苷酸的非編碼RNA,在人類全基因組中有20萬-40萬種不同的lnc RNA。研究[1]表明lnc RNA可以通過多種方式影響編碼基因的表達(dá),在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中起調(diào)控作用。SPRY4內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄本1(SPRY4 intronic transcript 1, SPRY4-IT1)(基因號(hào)AK024556)是轉(zhuǎn)錄自SPRY4基因的第二個(gè)內(nèi)含子的長度為687個(gè)核苷酸的未剪接的、多聚腺苷酸化的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,最初在脂肪組織中得以鑒定,且過表達(dá)SPRY4-IT1在黑色素瘤中具有促進(jìn)細(xì)胞生長、遷移和侵襲的作用[2],然而其在肺癌細(xì)胞中的作用尚未報(bào)道。本研究擬探討SPRY4-IT1對(duì)肺癌細(xì)胞A549侵襲和遷移能力的影響,并初步探索可能的作用機(jī)制。
1.1 材料 人肺癌細(xì)胞系A(chǔ)549、95C、95D、Calu-3、H125、H1299、H1975、SPC-A1由河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院腫瘤中心提供;抗基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinase, MMP)-2抗體、抗MMP-9抗體均購自武漢博士德生物有限公司;Transwell(8 μm孔徑)小室及Matrigel膠購自北京樂博生物科技有限公司,實(shí)驗(yàn)中所用引物由廣州銳博生物有限公司設(shè)計(jì)并合成,檢測(cè)SPRY4-IT1在肺癌A549細(xì)胞中的表達(dá),RT-PCR上游引物為5'-AGCCACATAAATTCAGCAGA-3',下游引物為5'-CGATGTAGTAGGATTCCTTT-CA-3',GAPDH上游引物為: 5'-GACTCATGACCACAGTCCATGC-3',GAPDH下游引物為: 5'-AGAGGCA-GGGATGATGTTCTG-3'。
1.2 基因全長序列克隆 根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫SPRY4-IT1標(biāo)準(zhǔn)序列NR-002196.1設(shè)計(jì)引物,上游引物5'-TAAGCTTGTAGAGATGGGGGTTTCATCCTGTTGG-3',下游引物5'-ACTCGAGAAAGACTCCCTTTCCTTAAGCAGATTCAC-3’,循環(huán)條件:93oC預(yù)變性1 min,93oC變性30 s,65oC退火30 s,72oC延伸2 min,25個(gè)循環(huán),72oC終末延伸5 min,產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳分離擴(kuò)增產(chǎn)物并進(jìn)行產(chǎn)物純化回收,將產(chǎn)物連接T載體后,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,通過藍(lán)白斑篩選,挑取白色克隆,擴(kuò)增后進(jìn)行酶切鑒定,同時(shí)送測(cè)序分析證實(shí)擴(kuò)增片段的正確性。
1.3 構(gòu)建真核表達(dá)載體 雙酶切pcDNA3.1載體和插入正確片段的T質(zhì)粒,分別純化回收目的片段。連接線性化pcDNA3.1載體和目的片段,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行菌液PCR鑒定,并通過測(cè)序分析得到插入片段陽性克隆,命名為pcDNA3.1-SPRY4-IT1表達(dá)載體。用無內(nèi)毒素試劑盒大量制備質(zhì)粒。
1.4 細(xì)胞培養(yǎng)和細(xì)胞轉(zhuǎn)染[3]使用含10%小牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)液,在37oC、含5%CO2的培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中用到的肺癌細(xì)胞系。細(xì)胞生長融合度達(dá)到50%時(shí),用Lipo 2000進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,分為轉(zhuǎn)染空載體pcDNA3.1組和轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1表達(dá)載體組。
1.5 RT-PCR檢測(cè)肺癌細(xì)胞中SPRY4-IT1的表達(dá) 培養(yǎng)肺癌細(xì)胞,細(xì)胞生長融合度打70%時(shí)收集細(xì)胞,通過Trizol法提取細(xì)胞總RNA,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,應(yīng)用上述RT-PCR引物擴(kuò)增SPRY4-IT1,ABI7300檢測(cè)并分析各細(xì)胞中SPRY4-IT1的水平。
1.6 細(xì)胞劃痕遷移實(shí)驗(yàn) 將A549細(xì)胞以每孔5×105個(gè)接種于6孔板中,按照上述實(shí)驗(yàn)分組轉(zhuǎn)染48 h后,細(xì)胞融合度達(dá)到90%以上,用無菌移液槍頭部劃線,置于37oC、5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h后光學(xué)顯微鏡下拍照,隨即取5個(gè)視野,測(cè)量劃痕兩側(cè)細(xì)胞間距取平均值,每組實(shí)驗(yàn)設(shè)3個(gè)復(fù)孔,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.7 Transwell侵襲實(shí)驗(yàn) 將A549細(xì)胞以每孔5×105個(gè)接種于6孔板中,細(xì)胞生長融合度為60%時(shí)按照上述實(shí)驗(yàn)分組轉(zhuǎn)染空載體和pcDNA3.1-SPRY4-IT1過表達(dá)質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染24 h后收集轉(zhuǎn)染后的各組細(xì)胞,重懸于無血清RPMI-1640培養(yǎng)液,以每孔5×104個(gè)細(xì)胞加入預(yù)鋪好Matrigel的Transwell小室上室內(nèi),下室加入500 μL完全培養(yǎng)液,置于37oC、5%CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h 后多聚甲醛固定,0.05%結(jié)晶紫染色,400倍光學(xué)顯微鏡下計(jì)數(shù)穿膜細(xì)胞數(shù),隨即取10個(gè)視野,取平均值,每組實(shí)驗(yàn)設(shè)3個(gè)復(fù)孔,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.8 免疫印跡實(shí)驗(yàn)[4]收集細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)后的各組細(xì)胞,用胰酶消化并收集,用含有蛋白酶抑制劑的RIPA裂解細(xì)胞,置于冰上,每5分鐘震搖細(xì)胞1次,共裂解30 min,15,000 rpm在4oC離心機(jī)上離心15 min,取上清,即為提取的細(xì)胞蛋白質(zhì)。通過BCA法檢測(cè)蛋白濃度,水浴變性蛋白,加入5×SDS-PAGE上樣緩沖液,加樣等量蛋白的蛋白裂解液,用10%的SDS-PAGE膠進(jìn)行電泳分離,電轉(zhuǎn)印到尼龍膜上,用5%脫脂牛奶的PBS緩沖液室溫封閉1 h,一抗用1:1,000稀釋的抗人MMP-2、MMP-9單克隆抗體4oC過夜孵育,用PBS-Tween洗膜,室溫每次15 min,共3次;印跡膜用1:3,000的抗鼠IgG偶聯(lián)的辣根過氧化物酶作為二抗,室溫孵育1 h,用PBS-Tween洗膜,室溫每次15 min,共3次。用增強(qiáng)型化學(xué)發(fā)光液檢測(cè)試劑盒化學(xué)發(fā)光顯色。檢測(cè)細(xì)胞中MMP-2、MMP-9的表達(dá),以β-actin作為內(nèi)參照,結(jié)果進(jìn)行灰度值分析并通過統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn),實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.9 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)分析軟件,計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(Mean±SD)表示,組間比較采用t檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 pcDNA3.1-SPRY4-IT1真核表達(dá)載體構(gòu)建 以cDNA為模板,用引物擴(kuò)增目的片段,得到與預(yù)期片段大小相符的特異性片段(圖1A)。切膠純化回收目的片段,并與pGEMTeasy載體連接,插入目的片段后,通過酶切鑒定和測(cè)序分析證實(shí)插入片段的正確性(圖1B,圖1C)。將目的片段SPRY4-IT1與pGEM-Teasy載體連接后的重組體經(jīng)BamH I+Hind III雙酶切,與相同雙酶切線性化的pcDNA3.1載體連接,得到完整的pcDNA3.1-SPRY4-IT1表達(dá)載體,通過BamH I+Hind III酶切鑒定和測(cè)序分析(圖1D,圖1E),確認(rèn)載體構(gòu)建成功。將重組質(zhì)粒pcDNA3.1-SPRY4-IT1和空質(zhì)粒pcDNA3.1轉(zhuǎn)染A549細(xì)胞后,檢測(cè)細(xì)胞中SPRY4-IT1表達(dá),結(jié)果提示轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒pcDNA3.1-SPRY4-IT1的細(xì)胞中SPRY4-IT1表達(dá)量是轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒的32.7倍(圖2)。
圖1 pcDNA3.1-SPRY4-IT1真核表達(dá)載體構(gòu)建情況。A:目的片段擴(kuò)增產(chǎn)物;B:目的片段與T載體連接后酶切鑒定結(jié)果;C:目的片段與T載體連接后測(cè)序結(jié)果;D:目的片段與pcDNA3.1載體連接后酶切鑒定結(jié)果;E:目的片段與pcDNA3.1載體連接后測(cè)序結(jié)果。Fig 1 pcDNA3.1-SPRY4-IT1 eukaryotic expression vector construction. A: Amplification products of target fragment; B: Enzyme digestion identification results of target fragment and T vector; C: Sequencing results of target fragment and T vector; D: Enzyme digestion identification results of target fragment and pcDNA3.1 vector; E: Sequencing results of target fragment and pcDNA3.1 vector.
圖2 將重組質(zhì)粒pcDNA3.1-SPRY4-IT1和空質(zhì)粒pcDNA3.1轉(zhuǎn)染A549細(xì)胞后,檢測(cè)細(xì)胞中SPRY4-IT1表達(dá)。A:目的基因溶解曲線;B:目的基因擴(kuò)增曲線;C:SPRY4-IT1在細(xì)胞中表達(dá)水平比較。Fig 2 The expression of SPRY4-IT1 in pcDNA3.1-SPRY4-IT1 and pcDNA3.1 A549 cells. A:Dissolution curve of target gene; B: Amplification curve of target gene; C: The expression of SPRY4-IT1 in different cells.
圖3 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)結(jié)果。A:培養(yǎng)24 h后兩組細(xì)胞遷移結(jié)果的比較(×400);B:24 h后兩組細(xì)胞遷移距離比較。Fig 3 Cell scratch test results. A: Cell migration results of two groups (×400); B: Cell migration spaces of two groups.
圖 4 細(xì)胞Transwell小室結(jié)果。A:顯微鏡下兩組細(xì)胞穿過Transwell小室基底膜結(jié)果(×400);B:兩組細(xì)胞穿過基底膜細(xì)胞數(shù)目比較。Fig 4 Transwell assay results. A: Cells through the basement membrane results of two groups (×400); B: The numbers of transmembrane A549 cells of two groups.
2.2 SPRY4-IT1對(duì)細(xì)胞遷移能力的影響 將A549細(xì)胞接種于6孔板,轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1和空載體pcDNA3.1,24 h后結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1細(xì)胞劃痕兩側(cè)細(xì)胞間距較轉(zhuǎn)染pcDNA3.1細(xì)胞明顯變窄(圖3),提示A549細(xì)胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后細(xì)胞的遷移能力增強(qiáng)。
2.3 SPRY4-IT1對(duì)細(xì)胞侵襲能力的影響 A549細(xì)胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后其穿膜細(xì)胞數(shù)為(207±34)個(gè)/視野,對(duì)照組為(83±15)個(gè)/視野,組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(圖4)。表明A549細(xì)胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后細(xì)胞的侵襲能力增強(qiáng)。
2.4 SPRY4-IT1對(duì)MMP-2和MMP-9蛋白的影響 轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1細(xì)胞中的MMP-2及MMP-9蛋白表達(dá)較轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒組均有升高(圖5)。
圖 5 過表達(dá)SPRY4-IT1對(duì)MMP-2和MMP-9的影響Fig 5 Effect of overexpression of SPRY4-IT1 on matrix metalloproteinase (MMP)-2 and MMP-9
在人類基因組中除了編碼基因外,同時(shí)包含大量的非編碼RNAs(non-coding RNAs, ncRNAs)[5]。ncRNAs雖不具備編碼蛋白質(zhì)功能,但能通過不同方式調(diào)控編碼基因的表達(dá)和功能,lncRNA與多種類型的腫瘤發(fā)生發(fā)展有著密切聯(lián)系,已成為近年來的研究熱點(diǎn)之一[1]。這類ncRNAs既可以通過影響蛋白翻譯發(fā)揮轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,也可以通過影響基因的轉(zhuǎn)錄活性及蛋白降解等多種途徑發(fā)揮功能。
SPRY4-IT1是由SPRY4基因的一個(gè)內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄而來,其內(nèi)部含有多個(gè)二級(jí)發(fā)卡結(jié)構(gòu),已有研究表明SPRY4-IT1在黑色素瘤細(xì)胞中過表達(dá),并且參與調(diào)控黑色素瘤細(xì)胞的凋亡與遷移[2]。有關(guān)SPRY4-IT1在肺癌中的研究尚未見報(bào)道,為了更深入地探討SPRY4-IT1基因在肺癌細(xì)胞中的作用,本研究克隆了SPRY4-IT1基因,并構(gòu)建了SPRY4-IT1真核表達(dá)載體,用脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染A549細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)原本在A549細(xì)胞中表達(dá)量很低的SPRY4-IT1,在轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后,表達(dá)量升高了25倍(與轉(zhuǎn)染空載體相比較),能夠滿足進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)需要。
肺癌細(xì)胞最重要的惡性行為即具有高度的侵襲轉(zhuǎn)移能力[6-8],因此我們?cè)诜伟〢549細(xì)胞中轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1重組質(zhì)粒,觀察SPRY4-IT1對(duì)肺癌細(xì)胞遷移、侵襲能力的影響。我們的研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1細(xì)胞劃痕兩側(cè)細(xì)胞間距較轉(zhuǎn)染pcDNA3.1細(xì)胞明顯變窄,A549細(xì)胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后其穿膜細(xì)胞數(shù)為(207±34)個(gè)/視野,對(duì)照組為(83±15)個(gè)/視野,組間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),可見通過細(xì)胞劃痕運(yùn)動(dòng)實(shí)驗(yàn)和Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)均證實(shí)過表達(dá)SPRY4-IT1后可以明顯增加A549細(xì)胞的侵襲、遷移能力,提示SPRY4-IT1有可能與肺癌細(xì)胞的侵襲遷移相關(guān)。MMP-2和MMP-9是目前公認(rèn)的調(diào)控腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵因子[9-11],為了進(jìn)一步研究SPRY4-IT1對(duì)肺癌A549細(xì)胞侵襲遷移能力改變的作用機(jī)制,我們通過Western blot檢測(cè)其中MMP-2及MMP-9的表達(dá),發(fā)現(xiàn)在肺癌A549細(xì)胞中過表達(dá)SPRY4-IT1可以顯著增加MMP-2和MMP-9蛋白的表達(dá)。
綜上所述,在肺癌A549細(xì)胞中過表達(dá)SPRY4-IT1可增強(qiáng)細(xì)胞的侵襲、遷移能力;同時(shí)過表達(dá)SPRY4-IT1后MMP-2及MMP-9呈升高趨勢(shì),提示SPRY4-IT1可能通過對(duì)調(diào)控MMP影響肺癌的侵襲轉(zhuǎn)移能力??梢奡PRY4-IT1在肺癌的侵襲轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用,為肺癌的臨床治療提供了新的藥物靶點(diǎn)及監(jiān)測(cè)指標(biāo)。