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        實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄—聚合酶鏈反應(yīng)(RT—PCR)法與細胞培養(yǎng)法檢測流行性感冒病毒的比較

        2015-08-29 07:38:04姜紅濤姚秀林
        中外醫(yī)療 2015年8期
        關(guān)鍵詞:流感病毒

        姜紅濤 姚秀林

        [摘要] 目的 比較實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)法與細胞培養(yǎng)法檢測流行性感冒病毒的差異。方法 采用實時熒光定量RT-PCR及經(jīng)典的狗腎傳代細胞病毒分離2種方法,同時對流感監(jiān)測點送檢的80份疑似流感標(biāo)本檢測流感病毒。 結(jié)果 細胞培養(yǎng)病毒分離的陽性數(shù)為26份,實時熒光定量RT-PCR的陽性數(shù)為36份,χ2=8.1, P<0.005。 結(jié)論 通過該實驗,驗證了實時熒光定量RT-PCR的確快速敏感,適用于實驗室快速診斷。

        [關(guān)鍵詞] 實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng);細胞培養(yǎng)法;流感病毒

        [中圖分類號] R4 [文獻標(biāo)識碼] A [文章編號] 1674-0742(2015)03(b)-0192-02

        2013年出現(xiàn)的流感病毒H7N9經(jīng)自然重配,致病迅速,易變異,給人們帶來極度恐慌,引起WHO 的高度重視[1],從而使流感病毒病原學(xué)的準(zhǔn)確快速診斷顯得尤為重要。該實驗室在2014年1月采用整群抽樣法對撫順市流感監(jiān)測哨點醫(yī)院的80份疑似流感樣標(biāo)本進行了實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)法與細胞培養(yǎng)法進行了檢測流行性感冒病毒的方法比較,現(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        2014年1月在撫順市國家級流感監(jiān)測哨點醫(yī)院,每周采集內(nèi)科和兒科門診就診的流感樣病例(體溫≥38℃,同時伴有咳嗽或者咽喉疼痛等癥狀的急性呼吸道感染者)的咽拭子標(biāo)本,放人pH 7.4-7.6的DMEM采樣液中,當(dāng)日低溫送流感實驗室檢測,每周采集 20份流感樣病例的咽拭子標(biāo)本。

        1.2 主要試劑

        ①抗A(H1N1)亞型血清,抗A(H3N2)亞型血清,抗A(H3N2)亞型血清,抗A(SWL1)亞型血清,抗B型Yamagata系病毒血清,抗B型Victoria系病毒血清由國家流感中心提供。MDCK細胞,遼寧省疾控中心提供;胰酶、Hank液、胎牛血清﹑牛血清白蛋白組分V, 采購于BI公司。DMEM培養(yǎng)基,采購于GIBCO公司。

        ②提取RNA試劑盒為QIAGEN。

        1.3 主要儀器

        AB PCR儀;二氧化碳培養(yǎng)箱 ;倒置顯微鏡等。

        1.4 實驗方法

        1.4.1 采用細胞培養(yǎng)法分離流感病毒,細胞為狗腎傳代細胞(MDCK) 每份標(biāo)本接種細胞瓶2瓶,置34.5℃吸附1 h,倒掉感染液,再用Hanks液洗2遍,加入病毒維持液,置34.5 ℃培養(yǎng),每天觀察病理變化(CPU),當(dāng)CPU出現(xiàn)3~4個加號時,按常規(guī)法檢查維持液中的紅細胞凝集活性。將HA≥1:16的標(biāo)本采用血凝抑制方法(HI)進行流感病毒型別鑒定[2]。確定病毒的型別和亞型。并送國家流感中心做進一步鑒定。HA≤1:16的標(biāo)本未做分型鑒定。

        1.4.2 RT-PCR反應(yīng)體系的配置[3-4] 反應(yīng)條件:60℃ 5min→ 50℃ 30min→ 95℃ 15min→95℃ 15s,55℃退火30 s(收集熒光),72℃延伸 30s 45 cycle→ 72℃ 5min→4℃ 保存。見表1。

        1.5 統(tǒng)計方法

        配對設(shè)計的χ2檢驗,公式:χ2=(|b-c|-1)2/b+c v=1,P<0.005差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩種方法對80份咽拭液檢測流行性感冒病毒的結(jié)果

        細胞培養(yǎng)分離病毒26株,陽性百分率32.50%,RT-PCR檢出36株,陽性百分率45.00%,見表2。

        2.2 兩種檢驗方法統(tǒng)計結(jié)果比較

        細胞培養(yǎng)分離病毒36株,陽性26株,RT-PCR檢出36株,兩種檢驗方法統(tǒng)計結(jié)果為χ2=8.1,因為χ20.005,1=7.88,所以P<0.005,兩種檢驗方法敏感性差異有統(tǒng)計學(xué)意義。見表3。

        2.3 兩種方法對80份咽拭液檢測流行性感冒病毒的分型結(jié)果

        細胞培養(yǎng)分離病毒H1N1(22份),H3N2(4份),熒光定量RT-PCR分離病毒H1N1(31份),H3N2(4份),By(1份)。

        3 討論

        流感病毒病原學(xué)相關(guān)檢測目前常用的有病毒分離培養(yǎng)法、快速檢測、分子生物學(xué)方法等。病毒分離是診斷流感病毒的金標(biāo)準(zhǔn)[5],但耗時長是其缺點。而且宿主細胞生長狀態(tài)也是影響病毒生長及復(fù)制的關(guān)鍵因素[6],導(dǎo)致疑似流感樣標(biāo)本到實驗室后,培養(yǎng)完成時間不確定。同時培養(yǎng)液中營養(yǎng)物質(zhì)的持續(xù)消耗以及宿主細胞的逐漸死亡是導(dǎo)致病毒滴度降低的直接原因[7],收獲的病毒滴度高低存在著很多的不確定因素。而且,標(biāo)本采集后的保存運送等環(huán)節(jié)都對MDCK培養(yǎng)分離流感病毒存在較大的影響。而實時熒光定量RT-PCR法應(yīng)用于流感病毒實驗室診斷,國內(nèi)外早已有許多報導(dǎo)[8],它具有靈敏度高、特異性好、檢測所需時間短等等優(yōu)點,尤其在應(yīng)急疫情快速診斷中得到了廣泛的應(yīng)用。它與經(jīng)典的MDCK細胞分離法相比,檢測時間可縮短到1 d之內(nèi)。由于在封閉管中進行,省略了電泳這一步驟,減少了以往PCR技術(shù)導(dǎo)致的假陽性可能[8]。

        該實驗室對2014年1月流感監(jiān)測點送檢的80份標(biāo)本,采用細胞培養(yǎng)、實時熒光定量RT-PCR 兩種方法檢測,同時進行比較, 結(jié)果證實,實時熒光定量RT-PCR法對流行性感冒病毒的檢出率為45.00%,高于細胞培養(yǎng)法的病毒檢出率32.50%。實時熒光定量RT-PCR法和細胞培養(yǎng)法兩種檢驗方法χ2檢驗結(jié)果為χ2=8.1,P<0.005。對流感病毒的檢出敏感性差異顯著,對流感病毒的分型也是準(zhǔn)確無誤,在病毒含量較低的標(biāo)本中不存在漏檢情況發(fā)生。通過這兩種方法的比較,與浙江省疾病預(yù)防控制中心通過比較得出的,實時熒光定量RT-PCR法對大量疑似標(biāo)本進行實驗室快速鑒別診斷,實用性強,快速敏感[9]的結(jié)論一致。驗證了實時熒光定量RT-PCR法確實是實驗室快速診斷流行性感冒病毒的首選方法,用實時熒光定量RT-PCR法檢測為流感病毒陽性的標(biāo)本接種MDCK細胞,培養(yǎng)分離流感病毒,可以降低細胞培養(yǎng)法分離流感病毒的成本,減少不必要的試劑材料的消耗,提高檢測效率。這僅僅是本實驗室的驗證結(jié)論,還需要其它研究中心加以驗證。

        [參考文獻]

        [1] WHO. Human infection with influenza A(H7N9)virus in Chi-na[J].N Engl J Med, 2013(368):1888-1897.

        [2] 中國疾病預(yù)防控制中心.全國流感/人禽流感監(jiān)測實施方案(2005—2010年度)[Z].2005-09.

        [3] 《流行性感冒診斷標(biāo)準(zhǔn)》WS285-2008[S].

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        [5] 劉建軍,程小雯,賀建華.用雞胚和MDCK細胞分離流感病毒的實驗研究[J].中國公共衛(wèi)生,2002(8):335-336.

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        [9] 李嬋,盧亦愚,等.實時熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)法與RT-PCR法及細胞培養(yǎng)法檢測甲3型流行性感冒病毒的比較[J].中國計劃免疫,2005,11(5):360-363.

        (收稿日期:2014-12-16)

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