趙楚生,王奕忠,吳令杰,郭旭武
(廣東省汕頭市中心醫(yī)院,廣東汕頭515031)
·臨床論著·
Micro RNA-146a基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎患者抗病毒療效的相關(guān)性
趙楚生,王奕忠,吳令杰,郭旭武
(廣東省汕頭市中心醫(yī)院,廣東汕頭515031)
目的探討micro RNA-146a(miR-146a)基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)和慢性乙型病毒性肝炎(CHB)患者干擾素-α(IFN-α)治療應(yīng)答反應(yīng)的相關(guān)性。方法選擇接受IFN-α抗病毒治療的慢性乙型肝炎患者133例,其中應(yīng)答組79例,無(wú)應(yīng)答組54例。采集兩組靜脈血并提取DNA,用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性內(nèi)切酶長(zhǎng)度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法對(duì)miR-146a行SNP分型。結(jié)果miR-146a CT基因型與TT基因型比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.009);CC基因型與TT基因型比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.029)。T等位基因與C等位基因頻率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.020)。結(jié)論MiR-146a基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎患者抗病毒療效相關(guān),T等位基因或TT基因型與IFN治療應(yīng)答相關(guān),而C等位基因或CC基因型與干擾素治療應(yīng)答無(wú)相關(guān)。
RNA;基因多態(tài)性;肝炎病毒;等位基因
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是一種導(dǎo)致急、慢性乙型肝炎的病原體,世界上約有4億慢性HBV感染者,其中75%為亞洲人。急性感染可導(dǎo)致嚴(yán)重致命的爆發(fā)性肝炎,慢性感染可導(dǎo)致肝硬化甚至肝細(xì)胞癌,所以在許多國(guó)家,這是一非常嚴(yán)重的問(wèn)題[1]。干擾素-α(Interferon-α,IFN-α)有抗病毒、免疫調(diào)節(jié)、抗增生及基因誘導(dǎo)特性。應(yīng)用IFN-α治療可使CHB患者獲得病毒學(xué)應(yīng)答,并可改善臨床結(jié)果[2]。影響IFN-α療效的因素很多,本研究目的是探討microRNA-146a(miR-146a)基因多態(tài)性對(duì)慢性乙型肝炎患者IFN-α抗病毒治療應(yīng)答的影響。
1.1臨床資料
選取2010年1月-2013年12月本院感染科就診的CHB患者133例,HBeAg陽(yáng)性及HBV-DNA陽(yáng)性,所有患者接受24~72周的普通IFN或聚乙二醇化干擾素(PEG-IFN)治療。根據(jù)患者對(duì)IFN-α的病毒學(xué)反應(yīng)分成應(yīng)答組(n=79)和非應(yīng)答組(n=54)例。應(yīng)答組定義為治療期間患者血清HBV-DNA<100 IU/ml,隨訪1年未復(fù)發(fā)。非應(yīng)答組定義為治療期間未達(dá)到以上標(biāo)準(zhǔn),或者達(dá)到以上標(biāo)準(zhǔn)后隨訪1年復(fù)發(fā)。
1.2檢測(cè)方法
1.2.1 標(biāo)本采集和基因組DNA提取抽取靜脈血1 ml,乙二胺四乙酸抗凝外周全血。將1 ml全血加至2.5 ml抽提緩沖液中,60℃保溫1 h,15 000 r/min離心10 min,上清液轉(zhuǎn)入另一個(gè)新的離心管中。加入等體積的氯仿∶異戊醇(24∶1),混勻抽提至水乳膠融狀。15 000 r/min離心10 min,上清液轉(zhuǎn)入另一個(gè)新的離心管中。加入2/3體積的預(yù)冷異丙醇,置入-20℃冰箱保溫30~60min,緩慢混勻DNA成絮狀析出。15 000 r/min離心10 min,棄上清液。用70%乙醇洗2次沉淀DNA,加入400μl TE buffer溶解DNA。
1.2.2 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性內(nèi)切酶長(zhǎng)度多態(tài)性(polymerase chain reaction-restriction fragment lengthpolymorphism,PCR-RFLP)分析利用PCR-RFLP方法分析miR-146a基因多態(tài)性。其中PCR引物參照J(rèn)AZDZEWSKI等[3]的報(bào)道,并行PubMed blast比對(duì),與擴(kuò)增產(chǎn)物符合。PCR反應(yīng)體系為20μl,包括300 ng的基因組DNA,正、反向引物各0.2μmoL/L,10×PCR buffer 2μl,2.5 mmol/L dNTPs 2μl及l(fā)μl Taq DNA聚合酶(日本TaKaRa公司)。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5min,94℃變性30 s,57℃退火45 s,72℃延伸30 s,共33個(gè)循環(huán),72℃繼續(xù)延伸7 min,于40℃保存。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖溴化乙錠電泳分析,100 bp DNA Marker(日本TaKaRa公司)作為參照組,驗(yàn)證目的片段是否擴(kuò)增成功。138 bp PCR產(chǎn)物經(jīng)限制性內(nèi)切酶MspⅠ(立陶宛MBI Fermentas公司)消化,37℃、5 uEcoRⅠ過(guò)夜反應(yīng),經(jīng)3%瓊脂糖溴化乙錠凝膠電泳分析。單一138 bp條帶代表野生型TT純合子,雙帶112和26 bp代表突變的CC純合子,3條帶138、112和26 bp代表CT雜合子。為確保基因型分析的準(zhǔn)確性,隨機(jī)選取10%PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,與酶切結(jié)果100%符合。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
采用SPSS 18.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,組間比較用兩獨(dú)立樣本的t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料以率表示,用χ2檢驗(yàn),兩組患者等位基因頻率行Hardy-Weinberg equilibrium分析、等位基因頻率比較及A值計(jì)算用χ2檢驗(yàn),以TT基因型作為參照,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1兩組患者一般資料比較
兩組患者年齡、性別、丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶及天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.130、0.627、0.420和0.685)。兩組患者感染HBV的途徑比較,包括輸血史、吸毒史、其他醫(yī)療操作或其他方面,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.281),具有可比性。
2.2MiR-146a基因多態(tài)性分析
MiR-146a序列和PCR產(chǎn)物序列測(cè)序結(jié)果見圖1。MiR-146a PCR擴(kuò)增產(chǎn)物片段長(zhǎng)度為138 bp。其中野生型TT純合子不能被EcoRⅠ酶切,仍為138 bp。突變的CC純合子可被EcoRⅠ完全酶切,產(chǎn)物片段為112和26 bp(因片段太小,電泳條帶不清楚)。CT雜合子的擴(kuò)增產(chǎn)物部分酶切,可見138、112和26 bp片段(因片段太小,電泳條帶不清楚)。見圖2。
2.3MiR-146a C/T基因多態(tài)性與患者抗病毒療效的相關(guān)性
圖1 測(cè)序結(jié)果
慢性乙型肝炎患者miR-146a基因型分布經(jīng)χ2檢驗(yàn)符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=0.610,P=0.382),說(shuō)明研究對(duì)象具有群體代表性。兩組患者中miR-146a CT雜合子為主要的基因型,CT基因型與TT基因型比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義[A=2.935,(95%CI:1.291,6.341),P=0.009],CC基因型與TT基因型比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(A=3.027,95%CI:1.048,9.078,P=0.029)。應(yīng)答組的T等位基因頻率(64.6%)比非應(yīng)答組(49.1%)高,而非應(yīng)答組的C等位基因頻率(50.9%)比應(yīng)答組(35.4%)高,且C等位基因與T等位基因頻率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=1.782,95%CI:1.028和2.914,P=0.020)。miR-146a CC基因型或C等位基因可能與慢性乙型肝炎患者抗病毒療效欠佳有關(guān)。見附表。
圖2 miR-146a C/T多態(tài)性位點(diǎn)EcoRⅠ酶切電泳圖
附表 兩組患者的miR-146a C/T基因多態(tài)性例(%)
IFN-α是目前治療乙型肝炎病毒感染具有持久療效的抗病毒藥物,有抗病毒和免疫調(diào)節(jié)作用,可以清除HBV,抑制肝臟壞死性炎癥,降低肝硬化或肝細(xì)胞癌的危險(xiǎn)性。據(jù)報(bào)道,應(yīng)用IFN-α治療的患者中,HBeAg陽(yáng)轉(zhuǎn)率約為40%,HBV-DNA陰轉(zhuǎn)率約為50%[4]。
與核苷類似物相比,IFN-α治療療程有限,治療應(yīng)答率偏低。尋找影響治療反應(yīng)的預(yù)測(cè)因素對(duì)制定個(gè)體化治療方案、節(jié)省醫(yī)療成本、避免副反應(yīng),具有一定的臨床意義。研究證實(shí),高丙氨酸轉(zhuǎn)氨酶水平(>200 u/L)、女性、低HBV載量、病毒基因型(B>C)等因素可預(yù)測(cè)HBcAg陽(yáng)性的慢性HBV患者對(duì)干擾素治療的應(yīng)答,并預(yù)示良好的應(yīng)答效果[5-6]。除上述影響療效的外在因素,不同個(gè)體的遺傳背景亦影響自身對(duì)藥物的反應(yīng)性。通過(guò)SNP的研究,可以從遺傳背景的角度探討影響療效的預(yù)測(cè)因素,并為闡明干擾素確切的作用機(jī)制提供線索。
MiRNA是一種在機(jī)體中高度保守的20~23個(gè)核苷酸長(zhǎng)度的非編碼RNA,能夠廣泛地參與基因的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),包括調(diào)節(jié)生物體的生物學(xué)和各種疾病的進(jìn)程[7]。其中miR-l46a作為較早發(fā)現(xiàn)的與免疫炎癥相關(guān)的調(diào)節(jié)因子,與乙肝肝癌的易感性密切相關(guān)[8]。
本研究表明,miR-146a CT雜合子在慢性乙型肝炎患者中占優(yōu)勢(shì),且CT基因型與野生TT基因型比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。CT基因型在非應(yīng)答組頻率較高,表明CT基因型比野生TT基因型療效差。C等位基因與T等位基因比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,表明C等位基因或CC基因型與患者對(duì)干擾素應(yīng)答欠佳或治療后復(fù)發(fā)率高相關(guān)。MiR-146a基因多態(tài)性可能影響相關(guān)靶基因的表達(dá),從而影響疾病對(duì)藥物的療效。下一步筆者將通過(guò)研究miR-146a的可能調(diào)控因素和相關(guān)基因表達(dá),為慢性乙型肝炎患者個(gè)體化治療提供理論依據(jù)。
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(申海菊 編輯)
MicroRNA-146a gene polymorphism and antiviral therapy of chronic hepatitis B
Chu-sheng ZHAO,Yi-zhong WANG,Ling-jie WU,Xu-wu GUO
(Shantou Central Hospital,Shantou,Guangdong 515031,P.R.China)
【objertive】To investigate the relationship between the single nucleotide polymorphism(SNP)on miR-l46a gene and the treatment effects of TFN-α.【Methods】Totally 133 patients of chronic hepatitis B infection who
the treatment of IFN-α were enrolled in this study.The patients were divided into two groups:sustained virological response(n=79)group and non virological response(NVR)or recurrence(n=54)group.Blood samples were collected and chromosomal DNA was extracted.The miR-146a polymorphism was determined with the method of polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism(PCRRFLP).【Results】In our study,there was a statistical association between miR-146a polymorphism and the antiviral therapy efficacy in the hepatitis B patients.There was a statistical difference in the CT genotype and the TT genotype of miR-146a between the two groups(P=0.009).There was a significant difference in the CC genotype and TT genotype between the two groups(P=0.029).There was a significant difference in the C allele and T allele between the two groups(P=0.02).【Conclusions】These findings suggested that the SNP in miR-146a is associated with the antiviral therapy efficacy of hepatitis B patients.And the TT genotype or T alleles is associated with the response to TFN-α therapy while the CC genotype or C allele is not related to the response to TFN-α therapy or recurrence.
RNA;gene;hepacivirus;allele
R512.62
A
1005-8982(2015)35-0070-03
2014-03-27