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        微小RNA對自噬的調(diào)控作用

        2015-04-29 00:00:00莫永彪等
        醫(yī)學信息 2015年13期

        自噬是一種細胞內(nèi)嚴格調(diào)控下主要涉及溶酶體對胞內(nèi)細胞器和長壽命蛋白的分解代謝過程。自噬小體的形成是自噬過程的核心。在對酵母菌的基因進行篩選時發(fā)現(xiàn)了調(diào)控自噬過程的的核心機制-自噬相關(guān)基因,這些基因序列也可以逐步對自噬過程進行調(diào)控。另外上游信號通路網(wǎng)絡(luò)也作用于對自噬的調(diào)控,它是一種對調(diào)控自噬起關(guān)鍵作用的負性信號[1]。miRNA在轉(zhuǎn)錄后水平對基因表達進行調(diào)控,其在一系列生物活動中發(fā)揮重要作用,這就使得miRNA與包括腫瘤在內(nèi)的各種疾病間存在聯(lián)系。目前有大量關(guān)于用miRNA對腫瘤進行治療的研究報道[2]。在這篇綜述中,我們主要關(guān)注近年來miRNA在調(diào)控自噬方面的研究成果。

        1 miRNAs影響自噬核心程序

        哺乳動物細胞中自噬核心程序開始于隔離膜的形成,自噬過程主要包括五步:I自噬誘發(fā),主要有ATG1/ULK參與調(diào)控;II脂核形成,主要涉及Beclin-1/PI3K;III吞噬泡延伸,主要有ATG12和ATG8/LC3兩個共軛系統(tǒng)參與;IV吞噬泡膜功能完善,主要包括ATG9;V自噬體與溶酶體融合,相關(guān)的蛋白有LAMP2和RAB7。

        2 自噬誘發(fā)

        自噬的誘發(fā)起始于ULK復(fù)合物,它主要包括ATG1的同源產(chǎn)物ULK1、FIP200、ATG101。該復(fù)合物可以快速與下游的自噬抑制信號mTORC1相互作用。在營養(yǎng)充足的情況下,mTORC1可以與ULK復(fù)合物結(jié)合使UKL1和ATG13磷酸化并失去活性從而導(dǎo)致自噬被抑制。在自噬誘發(fā)因素作用下,mTORC1和ULK復(fù)合物分離,導(dǎo)致ULK1/2復(fù)合物中特意的殘基和ATG13去磷酸化。去磷酸化的ATG13、ULK1/2及其介導(dǎo)下磷酸化的FIP200具有催化活性,促進自噬發(fā)生。然而在葡萄糖缺乏的情況下,AMPK被證明可以通過直接磷酸化ULK1來促進自噬作用[3]。

        3 脂核形成

        脂核形成是蛋白質(zhì)和脂質(zhì)結(jié)合構(gòu)建自噬小泡膜的起始步驟。這個過程起始于三型PI3K/Beclin-1復(fù)合物的激活,該復(fù)合物的主要成份包括hVPS34,Beclin-1和p150。許多與該復(fù)合物結(jié)合的成分對自噬過程要么表現(xiàn)為抑制作用要么表現(xiàn)為促進作用。ZHU等人研究發(fā)現(xiàn)編碼Beclin-1蛋白的BECN1基因是miR-30a的靶基因,首次揭示了miRNA在調(diào)控自噬中的作用[4]。BECN1被發(fā)現(xiàn)為miR-30a的靶基因提示其對細胞自噬的調(diào)控作用可能發(fā)生于脂核形成過程中。這些miRNA對自噬活動的調(diào)節(jié)主要發(fā)生在脂核形成階段。

        4 吞噬泡延伸

        兩個泛素樣共軛系統(tǒng)參與自噬小泡的延伸。其中ATG12和ATG8相互反應(yīng)并結(jié)合在一起。在另一條通路中LC3與磷脂酰乙醇胺(PE)共價結(jié)合。研究發(fā)現(xiàn)miRNA-204參與對自噬小泡延伸過程的調(diào)控,其直接對LC3的同源產(chǎn)物LC3B進行調(diào)控最早發(fā)現(xiàn)于對心肌細胞并進一步在腎透明細胞癌的相關(guān)研究中被證實[5]。除了對LC3本身的表達水平進行調(diào)控外,miRNA對加工LC3的ATG4蛋白酶的調(diào)控作用正逐漸被報到。它們分別對同源產(chǎn)物ATG4C和ATG4D進行調(diào)控。ATG7是泛素化途徑中E1的同源酶,在兩條共軛途徑的起始過程中均發(fā)揮重要作用。

        5 吞噬泡膜功能完善

        主要是指吞噬泡形成過程中脂質(zhì)和蛋白質(zhì)成分的引入,該過程主要由ATG9復(fù)合物參與。ATG9參與自噬泡的形成,在前自噬體和其他胞質(zhì)點狀結(jié)構(gòu)間循環(huán)運動。ATG9的這種循環(huán)轉(zhuǎn)運功能對自噬體的形成是必須的,而且這種往復(fù)運動可能在前自噬小泡膜的構(gòu)建過程中發(fā)揮作用。另一個可能對吞噬泡膜功能完善發(fā)揮調(diào)控作用的是腫瘤抑制基因miRNA-34a,它在細胞周期抑制和細胞衰老方面的作用已經(jīng)被廣泛認可。有研究發(fā)現(xiàn)miRNA-34a可以通過直接調(diào)控ATG9對自噬過程發(fā)揮抑制作用[6]。

        6 自噬體與溶酶體融合

        自噬體與溶酶體外膜相互融合形成自噬溶酶體,自噬體中包裹的物質(zhì)被溶酶體內(nèi)的酸性水解酶分解。自噬體與溶酶體以及自噬體間的融合過程涉及Rab-SNARE系統(tǒng)和Ypt7。在哺乳動物細胞中,Ypt7的同源產(chǎn)物RAB7在自噬體與溶酶體的融合中發(fā)揮作用,而且溶酶體膜蛋白LAMP1和LAMP2也是融合過程所必需的。目前還沒有發(fā)現(xiàn)有miRNA直接參與了對融合過程的調(diào)控。但是通過計算機系統(tǒng)分析發(fā)現(xiàn),包括miRNA-130等在內(nèi)的一系列miRNAs都有可能在自噬體與溶酶體的融合過程中發(fā)揮調(diào)控作用。

        7 miRNAs和自噬在腫瘤發(fā)生中的作用

        自噬對腫瘤的發(fā)生可表現(xiàn)為促進作用亦可表現(xiàn)出抑制作用。在腫瘤發(fā)生的最初階段,通過減少細胞內(nèi)受損細胞器和蛋白質(zhì)復(fù)合物的聚集來限制炎癥反應(yīng)、增加基因穩(wěn)定性、減輕組織損傷,從而抑制腫瘤發(fā)生。但是很多人類腫瘤細胞中利于自噬發(fā)生的基因會出現(xiàn)突變,導(dǎo)致自噬水平下降。相反,有些腫瘤發(fā)生時腫瘤細胞通過損傷性刺激、剝奪生長因子、缺氧、原癌基因激活等方式使自噬水平大幅度的提升。

        8 展望

        如前所述,miRNAs與自噬發(fā)生的核心機制間存在重要的聯(lián)系。然而,盡管有研究表明miRNAs參與對自噬過程中相關(guān)蛋白的的調(diào)控,但是關(guān)于miRNAs對自噬水平影響或miRNAs在自噬過程中的生理作用的研究仍然很少。因此為了更全面的了解miRNAs對自噬調(diào)控作用的重要性,有必要進行更多的更加深入的研究。部分miRNA對自噬發(fā)揮負性調(diào)控,而且也被證實具有腫瘤抑制作用,為腫瘤治療尋找到新的方向。我們還可以進行精細的基因?qū)W研究,從而探討miRNAs對自噬的調(diào)控與神經(jīng)元退行性病變之間的關(guān)系。

        參考文獻:

        [1]Yang Z,Klionsky DJ.Eaten alive:a history of macroautophagy[J].Nat Cell Biol,2010,12(9):814-822.

        [2]Lujambio A,Lowe SW.The microcosmos of cancer[J].Nature,2012,482(7385):347-355.

        [3]Kim J,Kundu M,Viollet B,et al.AMPK and mTOR regulate autophagy through direct phosphorylation of Ulk1[J].Nat Cell Biol,2011,13(2):132-141.

        [4]Zhu H,Wu H,Liu X,et al.Regulation of autophagy by a beclin 1-targeted micro-RNA,miR-30a,in cancer cells[J].Autophagy,2009,5(6):816-823.

        [5]Xiao J,Zhu X,He B,et al.MiR-204 regulates cardiomyocyte autophagy induced by ischemia-reperfusion through LC3-II[J].J Biomed Sci,2011,18:35.

        [6]Yang J,Chen D,He Y,et al.MiR-34 modulates Caenorhabditis elegans lifespan via repressing the autophagy gene atg9[J].Age(Dordr),2013,35(1):11-22.

        編輯/蘇小梅

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