林源,闕庭志,趙珍敏
(上海市法醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室司法部司法鑒定科學(xué)技術(shù)研究所,上海 200063)
X染色體STR和InDel在親緣鑒定中的應(yīng)用1例
林源,闕庭志,趙珍敏
(上海市法醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室司法部司法鑒定科學(xué)技術(shù)研究所,上海 200063)
法醫(yī)遺傳學(xué);X染色體;短串聯(lián)重復(fù)序列;插入/缺失;親緣鑒定;半同胞
兩位女性因懷疑彼此為同父異母姐妹,委托本中心進(jìn)行DNA檢驗(yàn),判斷她們是否符合同一父親的遺傳條件。經(jīng)了解,她們的父母均已過世。接受委托后,本中心采集當(dāng)事人指尖血備檢。采用Chelex-100法提取血樣基因組DNA,采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)20A試劑盒和Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒[基點(diǎn)認(rèn)知技術(shù)(北京)有限公司]對39個(gè)常染色體STR進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增。采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)17X試劑盒[基點(diǎn)認(rèn)知技術(shù)(北京)有限公司]對X染色體上的16個(gè)STR基因座進(jìn)行PCR復(fù)合擴(kuò)增,參考文獻(xiàn)[1]對18個(gè)X-InDel位點(diǎn)進(jìn)行PCR復(fù)合擴(kuò)增。以上擴(kuò)增均在9700型基因擴(kuò)增儀(美國AB公司)上完成,擴(kuò)增產(chǎn)物在3130XL遺傳分析儀(美國AB公司)上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,用GeneMapper ID v3.2軟件進(jìn)行基因分型。
經(jīng)對常染色體39個(gè)STR基因座的檢驗(yàn),參考文獻(xiàn)[2]計(jì)算半同胞指數(shù)(half sibling index,HSI)為218。對16個(gè)X-STR基因座進(jìn)行分型檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)兩女性除DXS10134基因座外,其余15個(gè)X-STR基因座上均具有一個(gè)相同的等位基因。經(jīng)X-InDel位點(diǎn)檢驗(yàn),兩女性在18個(gè)X-InDel位點(diǎn)上均具有相同的等位基因。綜上檢驗(yàn),初步認(rèn)為兩女性符合同一父親的可能性更大,DXS10134基因座可能存在突變的可能。
涉及半同胞關(guān)系鑒定的案例,部分學(xué)者嘗試依托常染色體STR結(jié)果,采用ITO法進(jìn)行探索研究[2-4]。本案例的常染色體STR結(jié)果表明,他們具備半同胞關(guān)系的可能較大,但是X-STR檢驗(yàn)卻發(fā)現(xiàn)在DXS10134基因座有不符合同一父親的現(xiàn)象,這給本案的判斷帶來了困擾??紤]到STR基因座的突變率較高,故采用了自行研制的X-InDel復(fù)合擴(kuò)增體系,結(jié)果表明,所檢驗(yàn)的18個(gè)X-InDel位點(diǎn)上均檢見相同的等位基因,從而為本案的判斷起到了支撐作用。
插入缺失(InDel)多態(tài)性是一種特殊類型的二等位基因遺傳標(biāo)記,是由單個(gè)或多個(gè)堿基的插入或缺失造成的,這種遺傳標(biāo)記具有較低的自發(fā)突變率和較小的擴(kuò)增產(chǎn)物片段。同時(shí),作為長度擴(kuò)增多態(tài)性遺傳標(biāo)記,大多數(shù)法醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室已具備PCR擴(kuò)增儀和毛細(xì)管電泳平臺(tái)足以用來對其進(jìn)行分型分析,無需增加額外的儀器設(shè)備。本案的檢驗(yàn)也再次證明這一遺傳標(biāo)記在類似親緣關(guān)系鑒定中有較好的應(yīng)用價(jià)值。
[1]孫寬,趙書民,張素華,等.X染色體上18個(gè)InDel多重PCR系統(tǒng)的建立[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2014,30(2):101-109.
[2]陸惠玲,周科偉,呂德堅(jiān),等.ITO法和判別函數(shù)法在同胞關(guān)系鑒定中的應(yīng)用[J].法醫(yī)學(xué)雜志,2009,25(2):118-122.
[3]陸惠玲,楊慶恩.用ITO法計(jì)算兩個(gè)體間的血緣關(guān)系機(jī)會(huì)[J].中國法醫(yī)學(xué)雜志,2002,17(3):188-191.
[4]史紹杏,馬偉,朱傳紅.Y-STR家系分型及ITO分析法偵破強(qiáng)奸殺人案1例[J].刑事技術(shù),2005,(4):58-59.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.026
1004-5619(2015)06-0496-01
2015-08-25)
(本文編輯:李成濤)
國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81302620);國家“十二五”科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2012BAK16B01)
林源(1967—),男,主任法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學(xué)研究;E-mail:liny@ssfjd.cn