周健,吳曉雪
(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)
·研究簡(jiǎn)報(bào)·
湖南地區(qū)漢族人群20個(gè)非CODIS STR基因座多態(tài)性
周健,吳曉雪
(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)
法醫(yī)遺傳學(xué);多態(tài)現(xiàn)象,遺傳;短串聯(lián)重復(fù)序列;湖南;漢族
本研究采用Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒,對(duì)湖南湘西自治州300名漢族無(wú)關(guān)個(gè)體的20個(gè)非CODIS STR基因座進(jìn)行群體遺傳學(xué)調(diào)查,以獲取20個(gè)STR基因座在該地區(qū)的相關(guān)群體遺傳學(xué)數(shù)據(jù),為該地區(qū)的法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),現(xiàn)報(bào)道如下。
湖南漢族人群血樣在知情同意原則下采自健康志愿者,包括男性180名,女性120名。采用Chelex-100法[1]提取DNA。Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒購(gòu)自基點(diǎn)認(rèn)知(北京)公司。PCR反應(yīng)體系為10 μL,循環(huán)條件:95℃11 min;94℃30 s,60℃60s,70℃60s,30個(gè)循環(huán);60℃30min。PCR產(chǎn)物變性后在3130XL型遺傳分析儀(美國(guó)AB公司)上進(jìn)行毛細(xì)管電泳,用GeneMapper ID v3.2.1軟件對(duì)STR基因座進(jìn)行分型。對(duì)基因型頻率進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)。采用PowerStats軟件分別計(jì)算20個(gè)基因座的雜合度(H)、個(gè)人識(shí)別率(DP)、非父排除率(PE)、多態(tài)信息含量(PIC)等群體遺傳學(xué)參數(shù)。
目前市場(chǎng)上的商業(yè)化試劑盒中大多數(shù)基因座是CODIS基因座結(jié)合個(gè)別非CODIS基因座,由于STR基因座的突變率較高,在親權(quán)鑒定中對(duì)于非CODIS基因座的需求比較大。本研究采用的Goldeneye誖DNA身份鑒定系統(tǒng)22NC試劑盒則涵蓋了20個(gè)非CODIS基因座,這20個(gè)STR基因座的群體遺傳學(xué)參數(shù)見(jiàn)表1。
經(jīng)對(duì)每個(gè)基因座的基因型分布進(jìn)行χ2檢驗(yàn),符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。20個(gè)STR基因座的DP值均大于0.85,在群體中的累積個(gè)體識(shí)別率為1-3.2264×10-26。該20個(gè)STR基因座在二聯(lián)體和三聯(lián)體中的累積非父排除率均大于0.99999。以上表明,這20個(gè)STR基因座在湖南漢族人群中具有良好的多態(tài)性,能夠用于日常法醫(yī)學(xué)實(shí)踐。
表1 20個(gè)STR基因座在湖南漢族人群中的群體遺傳學(xué)參數(shù)(n=300)
[1]Walsh PS,Metzger DA,Higushi R.Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material.BioTechniques 10(4):506-513(April 1991)[J].Biotechniques,2013,54(3):134-139.
DF795.2
B
10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.017
1004-5619(2015)06-0478-01
2015-08-24)
(本文編輯:李成濤)
周健(1982—),男,法醫(yī)師,主要從事法醫(yī)物證學(xué)鑒定;E-mail:45159121@qq.com