亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        葉點(diǎn)霉屬真菌寄主(宿主)和地理分布的多樣性

        2015-04-11 08:38:48吳石平劉作易
        貴州農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年6期
        關(guān)鍵詞:支系宿主真菌

        吳石平,陳 文,劉作易

        (1.貴州大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,貴州 貴陽(yáng)550025;2.貴州省植物保護(hù)研究所,貴州 貴陽(yáng)550006;

        3.貴州省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,貴州 貴陽(yáng)550006)

        葉點(diǎn)霉屬(Phyllosticta)是葡萄座腔菌目中最重要的幾個(gè)屬之一,廣泛分布于世界各地,常寄生或腐生于多種植物或有機(jī)基質(zhì)上,是農(nóng)作物、林木、經(jīng)濟(jì)作物和觀賞植物上的重要病原菌[1-4]。有的葉點(diǎn)霉屬存在于植物體內(nèi),為植物的重要內(nèi)生真菌,對(duì)植物的生長(zhǎng)和抗病起著重要的作用,有的還可分泌一些有生物活性的化合物[5-7]。多樣性研究對(duì)新種的發(fā)現(xiàn)、物種的認(rèn)識(shí)、完善生物演化理論、利用有益物種和控制有害物種有著重要意義[8]。由于葉點(diǎn)霉屬真菌的分類爭(zhēng)議較多及系統(tǒng)學(xué)資料缺乏,其多樣性研究未見報(bào)道。因此,筆者以近年已準(zhǔn)確分類且有明確寄主、采集國(guó)家及序列數(shù)據(jù)的菌株為研究對(duì)象,進(jìn)行寄主的多樣性及地理分布研究,以期為今后新種的發(fā)掘和鑒定、有益內(nèi)生真菌的利用及其與寄主(宿主)植物的協(xié)同進(jìn)化研究提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 菌株

        從近年發(fā)表的葉點(diǎn)霉屬真菌分類及鑒定文章[9-30]中篩選分類信息準(zhǔn)確的菌株共67種203株(表1),其中,53株為模式(type)或外模(epi-type)菌株,提取這些菌株的基因序列獲取號(hào),從Gene-Bank下載ITS、ACT、TEF-1 和GPDH 基因序列,同時(shí)提取這些菌株的寄主信息及地點(diǎn)(國(guó)家)。

        1.2 系統(tǒng)學(xué)分析

        采用 在線比對(duì)軟件MAFFT(http://www.ebi.a(chǎn)c.uk/Tools/msa/mafft)對(duì)篩選的基因序列進(jìn)行比對(duì);在BioEdit(1.7.3.0)中打開已完成比對(duì)的序列進(jìn)行手工校正,并將序列兩端剪切整齊,將4個(gè)基因的序列進(jìn)行連接;用Gblocks對(duì)保守區(qū)序列進(jìn)行選擇,用PAUP(v4.0)軟件進(jìn)行最大簡(jiǎn)約法(MP)重建系統(tǒng)樹,并進(jìn)行自展檢驗(yàn),將自展檢驗(yàn)值標(biāo)記在系統(tǒng)樹的分枝上。

        1.3 多樣性分析

        采用Shannon指數(shù)(H)和Simpson指數(shù)(D)[31]分析內(nèi)生真菌的群落生物多樣性。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 系統(tǒng)發(fā)育

        6 7種的ITS、ACT、EF和GAPDH 基因聯(lián)合

        表1 67種203株葉點(diǎn)霉屬真菌菌株Table 1 203 Phyllostictafungus strains of 67species

        后,序列總的位點(diǎn)數(shù)為1 751個(gè),其中,保守位點(diǎn)為912個(gè),無簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)238個(gè),最大簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)數(shù)601個(gè)(占總位點(diǎn)數(shù)的34.8%),采用最大簡(jiǎn)約法分析得到48棵系統(tǒng)樹,經(jīng)Kishino-Hasegawa檢驗(yàn),各個(gè)系統(tǒng)樹之間無顯著差異。系統(tǒng)發(fā)育樹的樹長(zhǎng)為3 245,一致性指數(shù)(CI)為0.418,同型指數(shù)(HI)為0.582,保留指數(shù)(RI)為0.643,重標(biāo)定指數(shù)(RC)為0.268。根據(jù)自展支持率、支系拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)、支系包含的物種數(shù)量等信息將系統(tǒng)樹分為9個(gè)支系(圖示)。

        圖示 葉點(diǎn)霉屬真菌的系統(tǒng)樹及寄主多樣性Fig. Phylogenetic tree and host diversity of Phyllostictafungus

        2.2 寄主(宿主)的多樣性

        經(jīng)專化性分析(表2),葉點(diǎn)霉屬寄主范圍較廣,在蕨類植物、裸子植物和被子植物上均有分布。67種菌株的寄主分屬32目45科;在蕓香目、百合目、杜鵑花目、囊荷目、無患子目、微子目和鼠李目等7個(gè)目中分離到的菌株較多,共140個(gè),占69.0%。7個(gè)目中,百合目上真菌的多樣性較多,其上分離的葉點(diǎn)霉屬真菌分屬于5 個(gè)支系,Shannon 指數(shù)為1.357,Simpson指數(shù)為0.732;其余各目中葉點(diǎn)霉屬真菌多樣性較小,其中,鼠李目(葡萄科)、荷囊目(芭蕉科)和無患子目的漆樹科上均只分離到1個(gè)支系的葉點(diǎn)霉真菌。不同種的寄主多樣性不相同(表3),其中,中央葉點(diǎn)霉(P.capitalensis)的寄主范圍最廣,54 個(gè)菌株來源于24 科的植物;芒果球座菌(G.mangiferae)的寄主也較廣,3個(gè)菌株分別來源于3科的植物;大多數(shù)種的寄主范圍較窄,均來源于一個(gè)科,甚至一個(gè)屬,如P.citricarpa 的16個(gè)菌株均分離于蕓香科的柑桔屬,P.vaccinii的16個(gè)菌株均分離于葡萄科。部分親緣關(guān)系較近的種只寄生于一個(gè)科或一個(gè)目的幾個(gè)科,如P.citriasiana、P.citriasiana和P.citriasiana 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系較近,均屬蕓香科;有的葉點(diǎn)霉在系統(tǒng)發(fā)育上屬于較高支持率的同一支系,卻分離于親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的植物,如P.fallopiae和P.a(chǎn)lliacea 分別分離于雙子葉植物的蓼科和單子葉植物的百合科,從葉點(diǎn)霉屬真菌和宿主植物來看,其系統(tǒng)發(fā)育無明顯相關(guān)性(圖示)。

        表2 不同寄主(宿主)植物上葉點(diǎn)霉的多樣性Table 2 Diversity of Phyllostictaon different hosts

        表3 葉點(diǎn)霉屬真菌葉點(diǎn)霉屬真菌的寄主(宿主)數(shù)量Table 3 Host number of Phyllostictafungi

        表4 不同國(guó)家葉點(diǎn)霉屬真菌的多樣性Table 4 Diversity of Phyllostictafungi of different countries

        2.3 地理分布的多樣性

        從表4看出,67種(203個(gè)菌株)葉點(diǎn)霉屬真菌來源于23個(gè)國(guó)家或地區(qū)。其中,來源于泰國(guó)、美國(guó)、中國(guó)、日本、巴西、澳大利亞和南非等7個(gè)國(guó)家和地區(qū)的菌株較多,共159個(gè)菌株,占78.3%;各個(gè)支系在地理分布上無明顯的偏好性。分離到菌株較多的7個(gè)國(guó)家中,美國(guó)的多樣性最高,34個(gè)菌株分屬于7個(gè)支系,shannon 指數(shù)和Simpson 指數(shù)分別為1.418和0.722;其次為中國(guó)和日本;泰國(guó)多樣性最低,38個(gè)菌株分屬于2個(gè)支系,且C1支系占了92.1%;shannon指數(shù)和Simpson 指數(shù)分別為0.642和0.542。

        3 結(jié)論與討論

        葡萄座腔菌科真菌由于孢子較小,可用于分類特征較少,所以寄生的部位和寄主常作為分類的輔助依據(jù),如從銀杏葉部分離到的葡萄座腔菌就為銀杏葉點(diǎn)霉,胡桃科植物葉片上分離到的葡萄座腔菌就為胡桃葉點(diǎn)霉[32-33]。因此,葡萄座腔菌科內(nèi)屬間分類長(zhǎng)期以來較為混亂[34],在葉點(diǎn)霉屬的屬內(nèi)種間分類也存在較多的爭(zhēng)議。筆者從系統(tǒng)學(xué)的角度分析了葉點(diǎn)霉屬的寄主多樣性,證實(shí)了大多數(shù)葉點(diǎn)霉屬真菌在種內(nèi)存在寄主的特異性,部分親緣關(guān)系較近的種也存在寄主的特異性,僅寄生于一個(gè)科或一個(gè)目的幾個(gè)科,但整個(gè)葉點(diǎn)霉屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系與寄主的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系并無明顯相關(guān)性;一個(gè)科的寄主植物上常寄生(內(nèi)生)多種葉點(diǎn)霉屬真菌,因此,以寄主植物來作為分類的輔助依據(jù),有一定的弊端。

        共選擇67 種,203個(gè)菌株進(jìn)行研究,這些種在地域分布上無明顯的偏好性,但有的國(guó)家分離到的葉點(diǎn)霉種類較多,菌種多樣性較高,有的國(guó)家分離到的種類較少,多樣性較低,這有可能與葉點(diǎn)霉屬真菌在與寄主(宿主)協(xié)同進(jìn)化過程中的寄主植物廣泛分布有關(guān)。具體原因有待于聯(lián)合種內(nèi)和種間的數(shù)據(jù)進(jìn)一步的試驗(yàn)和分析。

        [1] 張漢榮,羅金水,李美桂.國(guó)內(nèi)外柑桔黑斑病研究進(jìn)展[J].中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2011,27(6):40-44.

        [2] 洪勝福.香蕉黑星病發(fā)生規(guī)律及其防治技術(shù)[J].福建熱作科技,2010,35(1):14-15.

        [3] 王興紅.中國(guó)柑橘黑斑病相關(guān)的葉點(diǎn)霉屬真菌種類,遺傳多樣性和快速診斷技術(shù)研究[D]:杭州:浙江大學(xué),2012.

        [4] 宋海超,張 勇,邢 波,等.海南石斛蘭葉片黑點(diǎn)病的病原鑒定及室內(nèi)藥劑毒力測(cè)定[J].中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2011,27(19):110-114.

        [5] 韓 潔,趙杰宏.篦子三尖杉產(chǎn)高三尖杉酯堿內(nèi)生真菌的分離 與 鑒 定[J].貴 州 農(nóng) 業(yè) 科 學(xué),2011(1):158-161.

        [6] 杜少康,陳雙林,林 岱,等.銀杏葉部?jī)?nèi)生真菌多樣性的研究[J].菌物學(xué)報(bào),2009(4):504-511.

        [7] Kumaran R S,Muthumary J,Kim E K,et al.Production of taxol from Phyllosticta dioscoreae,a leaf spot fungus isolated from hibiscus rosa-sinensis[J].Biotechnology and Bioprocess Engineering,2009(14):8-10.

        [8] 莊文穎.認(rèn)識(shí)我國(guó)的菌物物種多樣性[J].大自然,2008(3):4-6.

        [9] Zhou N,Chen Q,Carroll G,et al.Polyphasic characterization of four new plant pathogenic Phyllosticta species from china,japan and the united states[J].Fungal Biology,2014,119(5):433-446.

        [10] Wulandari Nilam F,To- Anun Chaiwat.Phyllosticta capitalensis,p.Helicteres,p.Sterculiae and other Phyllosticta species from sterculiaceae[J].Journal of Agricultural Technology,2014,10(1):133-146.

        [11] Wulandari N F,Bhat D J,To-Anun C.Redisposition of species from the Guignardia sexual state of Phyllosticta[J].2014,5:23-30.

        [12] Hyde Kevin D,Nilsson R H,Alias S A,et al.One stop shop:Backbones trees for important phytopathogenic genera:I[J].Fungal Diversity,2014:1-105.

        [13] Zhang K,Zhang N,Cai L.Typification and phylogenetic study of Phyllosticta ampelicida and P.Vaccinii[J].Mycologia,2013,12(3):547-556.

        [14] Wong M H,Henderson J,Drenth A.Identification and differentiation of Phyllosticta species causing freckle disease of banana using high resolution melting(hrm)analysis[J].Plant Pathology,2013,62(6):1285-1293.

        [15] Wikee S,Lombard L,Nakashima C,et al.A phylogenetic re-evaluation of Phyllosticta(botryosphaeriales)[J].Studies in Mycology,2013,76(1):1-29.

        [16] Wikee S,Lombard L,Crous P W,et al.Phyllosticta capitalensis,a widespread endophyte of plants[J].Fungal Diversity,2013(2):1-15.

        [17] Miles A,Tan Y,Tan M,et al.Phyllosticta spp.On cultivated citrus in australia[J].Australasian Plant Pathology,2013(1):1-7.

        [18] Diego A,Pinho D B,Junior B T H,et al.First report of leaf spot caused by Phyllosticta yuccae on Yucca filamentosa in brazil[J].Plant disease,2013,97(9):1257.

        [19] Zhang K,Su Y Y,Cai L.Morphological and phylogenetic characterisation of two new species of Phyllosticta from china[J].Mycological Progress,2012(2):1-10.

        [20] Wong M H,Crous P W,Henderson J,et al.Phyllosticta species associated with freckle disease of banana[J].Fungal Diversity,2012,56(1):173-187.

        [21] Wang X H,Chen G Q,Huang F,et al.Phyllosticta species associated with citrus diseases in china[J].Fungal Diversity,2012,52(1):209-224.

        [22] Su Y,Cai L.Polyphasic characterisation of three new Phyllosticta spp[J].Persoonia-Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi,2012,28(1):76-84.

        [23] Sultan A,Johnston P,Park D,et al.Two new pathogenic ascomycetes in guignardia and rosenscheldiella on new zealand's pygmy mistletoes(korthalsella:Viscaceae)[J].Studies in Mycology,2011,68(1):237-247.

        [24] Glienke C,Pereira O,Stringari D,et al.Endophytic and pathogenic Phyllosticta species,with reference to those associated with citrus black spot[J].Persoonia:Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi,2011(1),26:47.

        [25] Wulandari N F,To-Anun C,Lei C,et al.Guignardia/Phyllosticta species on banana[J].Cryptogamie,Mycologie,2010,31(4):403-418.

        [26] Wulandari N,To-Anun C,Hyde K,et al.Phyllosticta citriasiana sp.Nov.,the cause of citrus tan spot of Citrus maxima in asia[J].Fungal Diversity,2009,34(2):23-39.

        [27] Wickert E,Goes Antonio D,Lemos E G D M,et al.Phylogenetic relationships and diversity of Guignardia spp isolated from different hosts on ITS1-5.8S-ITS2 region[J].Revista Brasileira de Fruticultura,2009,31(2):360-380.

        [28] Polashock J,Caruso F l,Oudemans P,et al.The north american cranberry fruit rot fungal community:A systematic overview using morphological and phylogenetic affinities[J].Plant Pathology,2009,58(6):1116-1127.

        [29] Motohashi Keiichi,Inaba Shigeki,Anzai Kozue,et al.Phylogenetic analyses of Japanese species of Phyllosticta sensu stricto[J].Mycoscience,2009,50(4):291-302.

        [30] Liu Q,Yu J C,Hu Y C,et al.Phyllosticta sp.Nov.,a new pathogenic species from Buxus sincia[J].Journal of Phytopathology,2009,157(7):470-473.

        [31] Piclou E.Ecological diversity[M].J Wiley and Sons NY,UK,London:1975.

        [32] 白金鎧.中國(guó)真菌志[M].北京:中國(guó)科學(xué)出版社,2003.

        [33] Van D A H.Studies in Phyllosticta[J].Studies in Mycology,1973,5:1-110.

        [34] Liu J K,Phookamsak R,Doilom M,et al.Towards a natural classification of botryosphaeriales[J].Fungal Diversity,2012,57(1):149-210.

        猜你喜歡
        支系宿主真菌
        病原體與自然宿主和人的生態(tài)關(guān)系
        科學(xué)(2020年3期)2020-11-26 08:18:22
        高等大型真菌與人類
        科學(xué)(2020年2期)2020-08-24 07:56:56
        龜鱉類不可能是新冠病毒的中間宿主
        論邊疆哈尼族支系語(yǔ)言
        ——以云南墨江自治縣為例
        廣西凌云地區(qū)背隴瑤的支系研究
        真菌造房子
        苗族支系服飾色彩探析
        流行色(2017年1期)2017-05-31 19:18:01
        彝族祭祖大典“耐姆”是彝族自稱形成和分支的重要原因
        表現(xiàn)為扁平苔蘚樣的慢性移植物抗宿主病一例
        艾滋病合并侵襲性真菌感染的診治
        久久精品国产亚洲av豆腐| 91亚洲色图在线观看| 日韩精品无码av中文无码版| 亚洲中文无码av永久| 日本熟女视频一区二区三区| 久久精品国产91久久性色tv | 国产精品高清一区二区三区人妖 | 女人一级特黄大片国产精品| 久久久国产精品麻豆| 成人国产精品一区二区视频 | 粉嫩小泬无遮挡久久久久久| 国产偷窥熟女精品视频| 国产日产精品一区二区三区四区的特点| 国产不卡视频在线观看| 日本无吗一区二区视频| 亚洲精品一二区| 人人玩人人添人人澡| 无码国内精品久久人妻| 国产性感丝袜在线观看| 一区二区三区在线观看视频| 无码在线观看123| 97精品伊人久久大香线蕉| 国产精品免费_区二区三区观看| 亚洲中文字幕在线一区| 麻豆三级视频网站在线观看| 欧洲国产精品无码专区影院| 亚洲男人天堂2019| av一区二区三区人妻少妇| 色欲av伊人久久大香线蕉影院| 少妇太爽了在线观看免费| 免费av在线视频播放| 在线a人片免费观看国产| 日韩国产欧美视频| 国产欧美日韩一区二区三区在线| 日本真人做爰免费视频120秒| 成人免费在线亚洲视频| 亚洲国产综合精品一区| 国产亚洲一区二区三区夜夜骚| 激情久久无码天堂| 成人区人妻精品一区二区不卡网站 | 亚洲精品第一国产麻豆|