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        21-羥化酶缺陷癥基因診斷方法的建立及應(yīng)用

        2015-03-13 06:44:17麗,焦凱,張
        檢驗醫(yī)學(xué)與臨床 2015年17期
        關(guān)鍵詞:羥化酶增生癥偏振

        張 麗,焦 凱,張 菊

        (第四軍醫(yī)大學(xué)唐都醫(yī)院內(nèi)分泌科,西安 710038)

        ?

        ·論 著·

        21-羥化酶缺陷癥基因診斷方法的建立及應(yīng)用

        張 麗,焦 凱△,張 菊

        (第四軍醫(yī)大學(xué)唐都醫(yī)院內(nèi)分泌科,西安 710038)

        目的 建立一種熒光偏振檢測技術(shù)聯(lián)合直接測序法診斷先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥中21-羥化酶缺陷癥的新方法,并對中國人群中最常見的2種基因缺失和8種點突變進(jìn)行檢測。方法 收集40例健康者及2例患者外周血,提取基因組DNA。設(shè)計通用引物,同時擴(kuò)增CYP21A2和CYP21A1P等位基因片段,然后用序列特異的TAMRA熒光標(biāo)記探針對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行雜交檢測,利用熒光偏振儀檢測擴(kuò)增雜交的熒光偏振值,確定是否存在該基因的缺失,同時用直接測序法驗證檢測結(jié)果;對Exon3 Del 8 bp(GAGACTAC)缺失進(jìn)行檢測時,將缺失的8個堿基設(shè)計在引物上,確保引物的特異性。同時根據(jù)CYP21A2基因與其假基因序列差異,設(shè)計5對特異性引物擴(kuò)增CYP21A2基因,PCR后直接測序檢測中國人群中最常見的8種點突變,包括P30L、i2g、I172N、E6Cluster、V281L、920-921insT、Q218X、R356W。結(jié)果 熒光偏振法未檢測到CYP21A2基因大片段缺失,檢測結(jié)果與直接測序法結(jié)果對比差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),一致率達(dá)100%,40例健康者未檢測到點突變,1例患者檢測出Exon1 G56R,Exon7c.920-921InsT插入雜合突變,1例患者檢測出Exon4I172N、Exon8Q318X雜合突變。結(jié)論 熒光偏振檢測法聯(lián)合直接測序法診斷21-OHD是一種高效的檢測手段,可以廣泛用于臨床,不僅能對患者基因突變類型進(jìn)行分析,在指導(dǎo)遺傳咨詢及產(chǎn)前診斷方面亦發(fā)揮重要作用。

        先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥; 21-羥化酶缺乏癥; 熒光偏振; CYP21A2基因

        先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥(CAH)是一組由于腎上腺皮質(zhì)激素合成途徑中的必需酶基因的缺陷所引起的一種常染色體隱性遺傳病,是引起兩性畸形最常見的病因[1]。其中,90%~95%的CAH由21-羥化酶基因缺陷所致[2]。由21-羥化酶缺陷引起的先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥的發(fā)病率為1∶16 000~1∶20 000,如果沒有早期診斷及治療,CAH會導(dǎo)致休克,低血鈉及高血鉀,從而引起新生兒死亡。在美國及其他一些發(fā)達(dá)國家,CAH列入新生兒疾病篩查目錄[3]。目前對于21-羥化酶基因缺陷征(21-OHD)的診斷主要是通過臨床癥狀和生化檢測,此方法不僅存在容易發(fā)生誤診或漏診的弊端,而且無法對患者的基因型進(jìn)行分析。因此對CAH開展分子診斷非常有必要,不僅能為臨床提供明確的診斷依據(jù),還可避免發(fā)生誤診和漏診。本試驗采用熒光偏振方法聯(lián)合直接測序法對中國人群中21-OHD患者常見的10種突變進(jìn)行檢測,分別為30 kb 缺失,Exon1,P30L(CCG→CTG),Intron2,nt656A/C>G(i2g),Exon3,nt707-714 del (△8bp GAGACTAC),Exon4,I172N(ATC→AAC),Exon6,簇狀突變,Exon7,V281L,nt1757 ins T,Exon8,Q318X,R356W,通過檢測以驗證本方法的準(zhǔn)確性,特異性及臨床可實施性。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 選擇2014年5~10月在第四軍醫(yī)大學(xué)附屬唐都醫(yī)院內(nèi)分泌科就診的患者,在知情同意的原則下,取患者外周血5 mL(本研究中所有患者及健康對照組人員均簽署知情同意書)。嚴(yán)格按照TIANamp Blood DNA Kit說明書按步驟提取DNA,用紫外分光光度計測定產(chǎn)物DNA的濃度和純度,置于-20 ℃保存。

        1.2 儀器與試劑 熒光偏振檢測儀 Victor2 Wallac 1420(Perkin Elmer),verti 96well PCR擴(kuò)增儀(東勝創(chuàng)新生物科技公司),臺式離心機(jī)(德國Eppendorf公司),恒溫水浴鍋(美國思伯明公司),凝膠成像儀,穩(wěn)壓電泳儀(美國Thermo公司)。血液基因組DNA提取試劑盒(Tiangen),pUCm-T載體,Taq DNA 多聚酶,普通質(zhì)粒小提取試劑盒,DNA膠回收試劑盒(sangon)等。

        1.3 方法

        1.3.1 熒光偏振檢測法 (1)引物與探針設(shè)計:根據(jù)GenBank 確定CYP21A2及CYP21A1P的基因片段序列,按照引物設(shè)計原則,結(jié)合熒光偏振反應(yīng)的特殊要求設(shè)計引物和探針(見表1),并由上海生工有限公司合成。(2)標(biāo)準(zhǔn)品的構(gòu)建:用特異性引物將獲得的DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后將目的片段切下進(jìn)行膠回收,回收后的產(chǎn)物與PUCm-T載體進(jìn)行連接并轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,挑取單克隆后構(gòu)建重組質(zhì)粒,同時測序驗證。將只載有CYP21A1P序列的質(zhì)粒用作陽性標(biāo)準(zhǔn)品,同時載有CYP21A2和CYP21A1P的質(zhì)粒用作陰性標(biāo)準(zhǔn)品。使用PUCm-T空載體分別作為以上兩個標(biāo)準(zhǔn)品的陰性對照。(3)建立熒光偏振的檢測反應(yīng):熒光偏振檢測反應(yīng)體系為(25 μL):10×PCR Buffer(含MgCl2)2.5 μL,4×dNTPs 0.5 μL,上下游引物(10 μM)各0.5 μL,探針(5 μM)0.25 μL,DNA模板2.5 μL,Taq DNA聚合酶0.5 μL,去離子水17.75 μL。PCR反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共35個循環(huán),72 ℃延伸3 min。將構(gòu)建的兩個標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)粒按濃度梯度分別進(jìn)行稀釋,從1.0×107copy/μL稀釋至1.0 copy/μL,與PUCm-T陽性標(biāo)準(zhǔn)品、陰性標(biāo)準(zhǔn)品以及樣本分別按以上條件進(jìn)行檢測,每個標(biāo)本均設(shè)置副孔。(4)熒光偏振檢測與直接測序法對比:將熒光偏振檢測的樣本同時進(jìn)行PCR后送測序,對比兩者檢測結(jié)果的一致性,同時驗證熒光偏振法的靈敏性和特異性。

        表1 熒光偏振檢測分析的通用引物及探針

        1.3.2 點突變的檢測 針對要檢測的CYP21A2基因上的點突變設(shè)計特異性引物,見表2,共進(jìn)行5個PCR擴(kuò)增反應(yīng)。其中,第二對引物針對CYP21A2基因外顯子3的特殊序列將與CYP21A1P相區(qū)別的8個堿基設(shè)計在引物上,保證了引物的特異性(下劃線)。點突變PCR反應(yīng)體系(25 μL):10×PCR Buffer(含MgCl2)2.5 μL,4×dNTPs 2 μL,上下游引物(10 μM)各1 μL,cDNA模板5 μL,Taq DNA聚合酶0.5 μL,去離子水13 μL。PCR反應(yīng)條件95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共35個循環(huán),72 ℃延伸3 min。引物1 Tm為59 ℃,引物2和引物3 Tm為61 ℃,引物4和引物5 Tm為58 ℃,其余反應(yīng)條件均一致。將擴(kuò)增的大小不同的片段送上海生工公司進(jìn)行測序,并且與GenBank對比,檢測點突變。直接測序結(jié)果不滿意者可進(jìn)行克隆后再測序。

        表2 擴(kuò)增CYP21基因的PCR引物

        注:CYP21A2標(biāo)準(zhǔn)參照序列為GenBank,GeneID 1589,NG_007941.2;CYP21A1P標(biāo)準(zhǔn)參考序列為GeneID 1590,AL645922.12;起始密碼子ATG中A的核苷酸位置定為1。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)處理 熒光偏振法及測序法之間的比較采用χ2檢驗,統(tǒng)計經(jīng)SPSS19.0軟件處理,P<0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 標(biāo)準(zhǔn)品的驗證 將PCR擴(kuò)增的目的片段經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行驗證,紫外光凝膠成像系統(tǒng)可見到213 bp大小的目的片段條帶。同時,重組質(zhì)粒送上海生工公司測序,測序結(jié)果與GenBank序列一致。

        2.2 熒光偏振檢測反應(yīng)的FP臨界值的建立 對熒光偏振檢測反應(yīng)所得的FP值用t檢驗,可以發(fā)現(xiàn)陽性對照的FP值分布與陰性對照的FP值存在顯著差異。在Victor2 Wallac熒光偏振檢測儀分別于激發(fā)光波長535 nm、吸收波長590 nm檢測每個對照品及樣本反應(yīng)產(chǎn)物的TMARA熒光偏振值(FP),以mp為單位??瞻讓φ誘MARA為(236.3±6.9)mp,CYP21A2缺失TAMRA為(116.8±6.2)mp,CYP21A2TAMRA未缺失為(222.6±5.8)mp。

        2.3 熒光偏振法與直接測序法比較 Fisher精確概率法得兩種方法檢測效率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.753)。兩者符合率達(dá)到100%。熒光偏振檢測結(jié)果2例患者熒光偏振檢測FP值分別為228、232 mp,檢測結(jié)果為陰性,表明未發(fā)生CYP21A2基因的缺失。

        2.4 點突變的檢測 健康對照者均未檢測出基因突變。2例患者,男性患兒基因突變類型為G56R/920-921insT雜合突變,女性患兒基因突變分析提示為I172N/Q318X雜合突變。

        3 討 論

        先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥是最常見的遺傳性疾病之一,常見的潛在突變存在于編碼21-羥化酶的基因中,占CAH的90%~95%。其他能引起缺陷的酶還包括11β-羥化酶、17α-羥化酶、3β-類固醇脫氫酶等。21-羥化酶是腎上腺類固醇激素合成的關(guān)鍵酶之一,也稱為CYP21或P450c21,是存在于腎上腺皮質(zhì)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的一種細(xì)胞色素P450酶,主要的生物作用是將孕酮和17-羥孕酮轉(zhuǎn)化為脫氧皮質(zhì)醇和11-脫氧皮質(zhì)醇。21-OHD的臨床表現(xiàn)由基因突變所致的殘余酶的活性決定,包括經(jīng)典型和非經(jīng)典型(NC),前者又根據(jù)有無失鹽表現(xiàn)分為失鹽型(SW)和單純男性化型(SV)。失鹽型、單純男性化型和非經(jīng)典型在本質(zhì)上定性劃分,但在出生時沒有高雄激素血癥表現(xiàn)的男性中鑒別SV和NC是很困難的,必須借助于基因型檢測,對于其他難以判斷的病例也要依靠基因診斷?;驒z測分析,不僅可以對疾病進(jìn)行早期診斷,并且可以對患者的基因類型進(jìn)行鑒別,是一種基于病因檢測的確診手段,對臨床具有重要的診斷價值。

        目前用于檢測21-OHD的方法有直接測序法,多重連接依賴性探針擴(kuò)增技術(shù)和位點特異性PCR-限制性酶切分析等,這些方法不同程度的存在低通量、技術(shù)操作復(fù)雜,標(biāo)本易污染和成本高的缺點,不易推廣到臨床大規(guī)模應(yīng)用。熒光偏振檢測技術(shù)是一種熒光標(biāo)記檢測技術(shù),利用熒光標(biāo)記的探針與目的片段的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行雜交,用熒光偏振儀檢測FP值,陽性對照發(fā)生擴(kuò)增反應(yīng),熒光標(biāo)記探針與擴(kuò)增產(chǎn)物中待測靶基因單鏈分子同源互補(bǔ)雜交,F(xiàn)P值會隨熒光標(biāo)記分子的相對分子質(zhì)量增加而增加,反之陰性對照品與熒光探針分子未發(fā)生同源雜交,熒光標(biāo)記分子的相對分子質(zhì)量保持不變,F(xiàn)P值較陽性對照低[4]。FP法不需分離游離和結(jié)合的示蹤物,而且所有測定均在溶液中進(jìn)行,結(jié)果判斷僅需數(shù)字比較,不需高精度的實時熒光強(qiáng)度檢測設(shè)備與圖像分析,F(xiàn)P值的大小與熒光強(qiáng)度無關(guān),易實現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化和自動化,因而具有快速、簡單和準(zhǔn)確靈敏等特點[5]。本方法已廣泛用于包括單核苷酸多態(tài)性(SNPs)和單倍型在內(nèi)的基因變異研究[6]。

        本研究共收集到2例患者,通過本體系檢測,男性患兒基因突變類型為G56R/ 920-921insT雜合突變,女性患兒基因突變分析提示為I172N/Q318X雜合突變。上述4種基因突變中,920-921insT和Q318X為酶活性完全喪失的突變。G56R是一種罕見的突變,保有正常酶活性的0.7%~1.4%,表現(xiàn)為單純男性化型[7]。I172N為中等程度的突變,保有正常酶活性2%,為單純男性化型中最常見的類型。21-OHD中,95%是由于基因間重組所致,僅有5%為自發(fā)突變[8]。本研究中該女性患兒I172N為自發(fā)突變,其父母均未檢測到攜帶此致病突變。

        本研究中建立了一種基于熒光偏振的檢測體系,同時聯(lián)合直接測序法,對于中國人群常見的10種21-OHD進(jìn)行檢測,熒光偏振檢測技術(shù)與直接測序法相比,兩者沒有明顯差別,符合率高達(dá)100%。熒光偏振檢測技術(shù)是一種簡單、敏感和特異的檢測方法,其高通量及低廉的價格給試驗帶來諸多方便。先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥的臨床表現(xiàn)缺乏特異性,在新生兒時期易與幽門狹窄,食道閉鎖等疾病混淆,嬰幼兒時期易與性早熟,引起兩性畸形的其他疾病相混淆,經(jīng)典型CAH嚴(yán)重者可出現(xiàn)腎上腺危象、休克等嚴(yán)重危害生命的并發(fā)癥,為防止并發(fā)癥的產(chǎn)生,降低病死率,早期診斷及合理治療至關(guān)重要?;蛟\斷對于21-OHD患者的遺傳咨詢和產(chǎn)前診斷是唯一可靠的方法,本研究旨在建立一種簡便、價廉、準(zhǔn)確,可廣泛應(yīng)用于臨床的21-OHD檢測手段,熒光偏振檢測聯(lián)合直接測序法為21-OHD的診斷提供了新思路。

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        [2]郁婷婷,王劍,余永國,等.先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥基因突變位點診斷方法的建立[J].中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志,2010,33(7):1236-1237.

        [3]White PC.Neonatal screening for congenital adrenal hyperplasia[J].Nat Rev Endocrinol,2009,5(9):490-498.

        [4]姜英浩,張濰,俞青苗,等.宮頸癌中EGFR啟動子甲基化熒光偏振技術(shù)檢測方法研究[J].現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2014,18(11):2162-2165.

        [5]李丁,張菊,顏真,等.熒光偏振技術(shù)分析全血XPD基因單核苷酸多態(tài)性的研究[J].分析化學(xué),2010,9(4):585-588.

        [6]Kwok PY,Chen X.Detection of single nucleotide polymorphisms[J].Curr Issues Mol Biol,2003,5(2):43-60.[7]Soardi FC,Barbaro M,Lau IF,et al.Inhibition of CYP21A2 enzyme activity caused by novel missense mutations identified in Brazilian and Scandinavian patients[J].J Clin Endocrinol Metab,2008,93(6):2416-2420.

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        Establishment and application of a method for gene diagnosis of 21-hydroxylase deficiency

        ZHANGLi,JIAOKai△,ZHANGJu

        (DepartmantofEndocrinology,TangduHospital,FourthMilitaryMedicalUniversity,Xi′an710038,China)

        Objective To establish a new method for detecting 21-hydroxylase deficiency in congenital adrenal hyperplasia(CAH) by using the fluorescence polarization technology combined with direct sequencing,and to detect 2 most common gene deletions and 8 point mutations of CYP21A2 gene in Chinese population.Methods The peripheral blood samples in 40 normal people and 2 patients were collected and genomic DNA were extracted.To detect the gene deletion of CYP21A2,at first,universal primers were designed to amplifly CYP21A2 and CYP21A1P allele fragments,and then the specific TAMRA fluorescence labeled probe was used to hybrid with amplification products,at last,the fluorescence polarization instrument was adopted to test FP value for determining whether the gene deletion was happened.The sequence GAGACTAC was designed on the primer which was specific to CYP21A2 to detect the Exon3 Del 8 bp(GAGACTAC) deletion.To detect point mutations,5 pairs highly specific primers for CYP21A2 gene were designed according to the sequence differences between CYP21A2 and its pseudogene.The whole CYP21A2 gene was amplified and sequenced to detect the most common type of 8 kinds of point mutations in Chinese people,including P30L,i2g,I172N,E6Cluster,V281L,920-921insT,Q218X and R356W.Results CYP21A2 gene deletion was not detected by the fluorescence polarization method,the results had no statistical differences compared with the direct sequencing method,the consistency rate reached up to 100%.No point mutation of CYP21A2 gene was found in the 40 healthy people.The two patients,one case was detected with Exon1 G56R,Exon7 c.920-921 insert T heterozygous mutations,another patient carried Exon4 I172N,Exon8 Q318X heterozygous mutations.Conclusion The fluorescence polarization method combined with direct sequencing in the diagnosis of 21-OHD is an effective way,which can be widely used in clinic,not only can analyze the type of gene mutation,but also can play an important role in genetic counseling and prenatal diagnosis.

        congenital adrenal hyperplasia(CAH); 21-hydroxylase deficiency; fluorescence polarization; CYP21A2 gene

        張麗,女,在讀碩士,主要從事先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥基因診斷方面的研究?!?/p>

        ,E-mail:1845370877@qq.com。

        10.3969/j.issn.1672-9455.2015.17.025

        A

        1672-9455(2015)17-2545-03

        2015-04-16

        2015-05-15)

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