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        羅漢果三倍體雌株與二倍體雄株遺傳背景的RAPD分析

        2015-03-12 12:18:07韋榮昌
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年2期
        關(guān)鍵詞:三倍體二倍體羅漢果

        摘要:為了給無籽羅漢果優(yōu)良品種的選育提供分子生物學(xué)依據(jù),利用RAPD標(biāo)記對28份羅漢果三倍體雌株與二倍體雄株進(jìn)行遺傳背景分析。結(jié)果表明,羅漢果三倍體雌株和二倍體雄株的遺傳背景存在一定的豐富性,但大多遺傳相似性系數(shù)較大,遺傳距離較近??偟膩碚f,羅漢果三倍體雌株和二倍體雄株遺傳背景的復(fù)雜性較低,應(yīng)該盡快采取相應(yīng)措施,進(jìn)行種質(zhì)創(chuàng)新,豐富無籽羅漢果親本的遺傳背景。

        關(guān)鍵詞:羅漢果;二倍體;三倍體;遺傳背景;RAPD

        中圖分類號: S567.903文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號:1002-1302(2015)02-0241-03

        收稿日期:2014-04-15

        基金項目:國家科技支撐計劃 (編號:2011BAI01B03);國家自然科學(xué)基金 (編號:81373914);廣西自然科學(xué)基金(編號:2013GXNSFDA019021、2013GXNSFBA019170)

        作者簡介:韋榮昌(1983—),男,廣西梧州人,博士,助理研究員,主要從事生藥學(xué)研究。E-mail:wrc830612@163.com。羅漢果[Siraitia grosvenorii (Swingle) C. Jeffrey]是雌雄異株的葫蘆科(Cucurbitaceae)羅漢果屬多年生藤本植物[1],為我國南方特有的珍貴藥用植物和甜料植物,主產(chǎn)于廣西壯自治區(qū)永福、臨桂、龍勝、興安和融安等地[2]。羅漢果果實含多種甜苷,其中甜苷V為世界上最強(qiáng)的非糖甜味物質(zhì)之一,為蔗糖甜度的300~400倍,是一種綜合性狀極佳的天然甜味劑,廣泛應(yīng)用于食品、藥品和保健品中,適合所有人群長期食用,是肥胖者、糖尿病人和高血壓患者的理想糖替代品[3-4]。多倍體羅漢果可大幅提高根、莖、葉、果實等部位的生物量和產(chǎn)量,其中三倍體羅漢果還具有無籽的特性,大大提高了整果利用率和甜苷提取收得率,對整個羅漢果產(chǎn)業(yè)具有里程碑的意義[5]。羅漢果三倍體雌株經(jīng)二倍體雄株授粉后所結(jié)的果實即為無籽羅漢果。本研究利用RAPD分子標(biāo)記技術(shù)[6-9]探討羅漢果三倍體雌株和二倍體雄株的遺傳背景,為無籽羅漢果優(yōu)良品種的選育提供依據(jù)。

        1材料與方法

        1.1試驗材料

        試驗材料采自廣西桂林興安縣漠川鄉(xiāng)的羅漢果種植基地,總共采集到28份材料:二倍體雄株7份,三倍體雌株21份,利用二倍體(或四倍體)父本花粉對四倍體(或二倍體)母本柱頭進(jìn)行人工授粉雜交獲得(表1)。每份材料選取生長狀況良好的羅漢果單株3~5株,采集約10張健康成熟的葉片并混合成該份材料的樣品,用硅膠干燥保存,帶回實驗室中待用。

        1.2RAPD分析

        采用改良CTAB(2×)法[10]提取羅漢果葉片的總DNA。

        引物篩選:從材料中隨機(jī)選出6份樣品(包含2x、4x)進(jìn)行引物篩選,從200條RAPD引物中篩選出20條擴(kuò)增反應(yīng)穩(wěn)定、條帶清晰、具有多態(tài)性的引物,并用于所有材料的擴(kuò)增。20個RAPD引物名稱、序列見表2。

        瓊脂糖凝膠電泳檢測擴(kuò)增產(chǎn)物:將擴(kuò)增產(chǎn)物置于1.5 %瓊脂糖凝膠中電泳,凝膠上所加電壓不超過5 V/cm,用 Lambda DNA/EcoRⅠ+HindⅢ Marker (MBI Fermentas公司)作為標(biāo)準(zhǔn)分子量對照,經(jīng)溴化乙錠(EB)染色20~30 min,在凝膠成像系統(tǒng)上觀察拍照、記錄。

        RAPD為顯性標(biāo)記,同一引物的擴(kuò)增產(chǎn)物中電泳遷移率一致的條帶被認(rèn)為具有同源性,相同遷移位置上有擴(kuò)增條帶記錄為1,無擴(kuò)增條帶記錄為0,構(gòu)建0-1原始矩陣。僅清晰、穩(wěn)定、可分辨的并且長度在400~2 000 bp范圍內(nèi)的ISSR擴(kuò)增條帶才被記錄。用AFLP-SURV version 1.0[12]計算材料間遺傳距離D,按D=-lnⅠ計算Nei & Li遺傳相似性系數(shù);用NTSYS-pc version 2.02[13]軟件的UPGMA(unweighted pair group method using arithmatic average)方法進(jìn)行聚類分析;用GenAIEx version 6.3[14]進(jìn)行主坐標(biāo)分析。

        2結(jié)果與分析

        2.1多態(tài)性分析

        用20個RAPD引物對28份材料的總DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,重復(fù)2次,2次擴(kuò)增產(chǎn)物重復(fù)性好且穩(wěn)定,擴(kuò)增得到的總條帶數(shù)及多態(tài)性條帶數(shù)見表2。20個引物擴(kuò)增條帶數(shù)的范圍為 6~17條,共同帶在1~8條內(nèi),多態(tài)性條帶數(shù)范圍為3~13條,多態(tài)性百分比為25.00%~88.89%,且由總計的結(jié)果可知,擴(kuò)增總條帶數(shù)為239條(平均每個引物11.95條),其中最多,為17條;引物S170得到的條帶最少,為6條。其中,引物S411的擴(kuò)增圖譜見圖1。此外,在不同羅漢果品種間存在的多態(tài)性條帶可作為鑒定品種的特征帶。

        2.2遺傳相似性系數(shù)及遺傳距離

        28份材料間的相似性系數(shù)變化范圍為0.691 0~0.920 6,其中F302與M202間的相似性系數(shù)最低(0.691 0),遺傳距離最高(0.369 6);而F305與F306間的相似性系數(shù)最高(0.920 6),遺傳距離最?。?.082 7)。

        2.3聚類分析

        從圖2可看出,F(xiàn)305和F306直接聚為一類,具有很高的相似性系數(shù),兩者距離最近;F321獨成一支,與其余材料相距較遠(yuǎn);基本上相似性系數(shù)較高的材料排列并聚為一類。

        2.4雙變量主坐標(biāo)分析

        主坐標(biāo)分析(principal coordinate analysis,PCoA)是基于Nei & Li遺傳距離及相應(yīng)的相似性系數(shù)進(jìn)行的。因此,主坐標(biāo)分析圖中各個個體(品種)間的位置關(guān)系反映了它們在遺傳上的相似性。由于每份試驗材料都是通過選取生長狀況良好的羅漢果單株3~5株,共采集約10張健康成熟葉片混合而成的,因此這28份材料的主坐標(biāo)分析可看作“雙變量主坐標(biāo)分析”(double principal coordinate analysis,DPCoA:一種將物種與物種之間差異考慮到群體間相互關(guān)系的測度之中的排序方法)[15-16]。通過RAPD標(biāo)記對28份材料進(jìn)行DPCoA排序發(fā)現(xiàn),前3個主坐標(biāo)的方差貢獻(xiàn)率分別為26.81%、21.86%endprint

        和17.60%,相對應(yīng)的累積貢獻(xiàn)率分別為26.81%、48.67%和66.27%。一般認(rèn)為,如果前3個主要特征向量的方差占總方差的40%以上,則排序效果是滿意的[17],本試驗結(jié)果 28 份材料的前3個主要特征向量的方差累積貢獻(xiàn)率高達(dá)6627%,說明降維效果較好。因此,保留DPCoA的前二軸對28份材料進(jìn)行排序分析,應(yīng)用GenAIEx version 6.3獲取坐標(biāo)軸特征值及樣品特征向量,并據(jù)此劃分出28份不同材料在DPCoA前二軸空間中的排序圖見圖3。

        由Proj劃分而得的28份材料在PCoA排序圖中空間分布十分明顯,除F316和F318有部分交叉重疊外,其余樣品間均無交叉重疊現(xiàn)象。PCoA排序圖把28份材料分為三大類。第一大類位于A區(qū)間,其中三倍體雌株4份(F312、F313、F320、F321),二倍體雄株2份(M201、M204)。第二大類位于B和第D區(qū)間,其中只包括三倍體雌株12份(F301、F302、F303、F304、F305、F306、F307、F308、F309、F310、F311、F314)。第三大類位于C區(qū)間,其中只包括三倍體雄株3份(F316、F318、F319)、二倍體雄株5份(M202、M203 、M205、M206 M207)。

        比較圖2和圖3可知,對28份材料所進(jìn)行的親緣關(guān)系聚類分析和雙變量主坐標(biāo)分析的結(jié)果基本上是一致的,雌株和雄株間的距離相對較近聚在一起,而雙變量主坐標(biāo)分析能從多個方向、多個層面更直觀和準(zhǔn)確地反映材料間的遺傳關(guān)系。

        3結(jié)論與討論

        3.1羅漢果三倍體雌株與二倍體雄株的RAPD相關(guān)遺傳

        根據(jù)RAPD分析結(jié)果可知,有的材料之間雖然是不同的種質(zhì),但遺傳相似性系數(shù)較高,說明它們的親緣關(guān)系近;如F315因為由Nongyuan B6與M204株系雜交而成,所以與M204關(guān)系較近,其相似性系數(shù)高達(dá)0.816 3。此外,在三倍體雌株中,如果其親本相同或相似性系數(shù)較高,由于子代繼承了親本一定的遺傳物質(zhì),因而子代間的相似性系數(shù)也會較高,如F318和F319,由于其母本都是Yongqing 1,因此其相似性系數(shù)高達(dá)0.912 3;而因為F305和F310也都為同一父本M205,所以其相似性系數(shù)也高達(dá)0.858 0。

        3.2羅漢果三倍體雌株與二倍體雄株的合理組配

        F302與M202間的相似性系數(shù)僅為0.6910,還有M201與F302、F309及F312與M207間的相似性系數(shù)都僅為0.716 1,遺傳距離較大;而且M202與母本間的相似性系數(shù)均在 0.6~0.7 之間。因此,初步推測羅漢果三倍體雌株與二倍體雄株中最適合作雌雄組配的是F302與M202,其次是F302與M204、F309與M204、F312與M207。

        值得指出的是,雖然羅漢果三倍體雌株和二倍體雄株的遺傳背景存在一定的復(fù)雜性,但大多遺傳相似性系數(shù)較大,遺傳距離較近,應(yīng)該盡快采取相應(yīng)措施,進(jìn)行種質(zhì)創(chuàng)新,豐富三倍體雌株和二倍體雄株的遺傳背景,為無籽羅漢果優(yōu)良品種的選育奠定堅實基礎(chǔ)。endprint

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