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        兩株高效耐鹽菌的分離鑒定及生長特性研究

        2015-01-20 18:52:16單德鑫李海統(tǒng)黃河
        湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年22期
        關(guān)鍵詞:分子鑒定生長特性鹽堿土

        單德鑫 李海統(tǒng) 黃河 等

        摘要:從大慶不同利用類型的鹽堿土地區(qū)取土樣,經(jīng)馴化、分離篩選出兩株高效耐鹽菌,分別命名為A和B。經(jīng)形態(tài)特征觀察、生理生化試驗(yàn)、掃描電鏡觀察和16S rDNA鑒定得知,菌種 A 為脫氮嗜鹽芽孢桿菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌種 B為咸魚芽孢桿菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),均為芽孢桿菌屬。經(jīng)過單因素試驗(yàn),得出A、B的最適生長條件均為溫度30 ℃,pH 7~9,鹽濃度20%,這將為以后該地區(qū)微生物資源開發(fā)利用提供理論依據(jù)。

        關(guān)鍵詞:鹽堿土;高效耐鹽菌;分離;分子鑒定;生長特性

        中圖分類號:X172 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2014)22-5395-03

        松嫩平原鹽漬土分布十分廣泛,是我國鹽漬化土壤的最大分布區(qū),其地處半濕潤半干旱區(qū),具有廣泛的閉流區(qū)和礦化度很高的無尾河,年降水量約450 mm[1],該區(qū)鹽漬土主要分布在平原西部的半干旱和干旱地區(qū),主要包括吉林西部的松原和白城地區(qū),黑龍江的三肇、安達(dá)、大慶和齊齊哈爾等地區(qū)[2]。其中大慶的鹽堿化土地面積為13.69×104 hm2,占其土地總面積的28.3%[3]。土壤鹽漬化導(dǎo)致大量土壤資源喪失,農(nóng)業(yè)生產(chǎn)條件惡化,嚴(yán)重阻礙了當(dāng)?shù)剞r(nóng)業(yè)和農(nóng)村經(jīng)濟(jì)的持續(xù)健康發(fā)展。因此本試驗(yàn)從大慶鹽堿地區(qū)取樣,分離篩選耐鹽菌種,對當(dāng)?shù)佧}堿土中微生物資源狀況進(jìn)行初步探索,為以后該地區(qū)微生物資源開發(fā)利用提供理論依據(jù),為研發(fā)更加成熟的菌劑提供基礎(chǔ)和依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        分別從大慶的鹽堿地區(qū)的農(nóng)田、農(nóng)田秸稈還田結(jié)合區(qū)、農(nóng)田休耕結(jié)合區(qū)、湖邊、堿泡地、石油區(qū)取得土樣,具體地點(diǎn)如表1所示。

        培養(yǎng)基的組成如下。牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH 調(diào)至7.2~7.4。牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,瓊脂15.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH調(diào)至7.2~7.4。LB培養(yǎng)基:酵母膏 5.0 g,蛋白胨 10.0 g,NaCl 10.0 g,蒸餾水1 000 mL,pH調(diào)至7.2~7.4。所有培養(yǎng)基在121 ℃,0.1 Mpa下滅菌20 min備用[4]。

        1.2 菌種的分離純化及篩選

        將土壤樣本分為6組,每組各取0.1 g置于100 mL三角瓶中,加入50 mL蒸餾水,加玻璃珠充分打散,于120 r/min搖床中培養(yǎng)3 d[5]。各取1 mL懸液稀釋濃度至10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7,分別涂布到牛肉膏蛋白胨瓊脂培養(yǎng)基培養(yǎng)3 d,用劃線法純化培養(yǎng),然后把已經(jīng)純化得到的菌種接種到NaCl濃度分別為5%、10%、15%、20%、25%、30%和32% 的牛肉膏蛋白胨的液體培養(yǎng)基里[6-8],置30 ℃下培養(yǎng),觀察生長情況,以確定細(xì)菌耐鹽程度[9]。

        參考《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》,通過對菌種進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察及相關(guān)生理生化試驗(yàn),從而對菌種A、B進(jìn)行初步鑒定[10],掃描電鏡觀察進(jìn)一步鑒定。而后進(jìn)行耐鹽菌的分子鑒定,即提取菌種的DNA,然后采用細(xì)菌16S rDNA的通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增。BSF8/27:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′;BSR

        1510/1492:5′-GGTTACCTTCTTACGACTT-3′。

        PCR反應(yīng)體系(50 μL):5 μL 10 × Buffer,4 μL 2.5 mmol/L dNTP,2 μL BSF8/27 引物(0.1 nmol/μL),2 μL BSR1510/1492引物(0.1 nmol/μL),0.5 μL Taq酶(5 U/μL),1 μL模板DNA,35.5 μL雙蒸水。反應(yīng)條件如下:

        94 ℃ 預(yù)變性 5 min

        94 ℃ 變性 45 s

        55 ℃ 退火 90 s

        72 ℃ 延伸 2 min

        72 ℃ 延伸 10 min

        PCR反應(yīng)產(chǎn)物的純化以及測序由上海生工完成。16S rDNA同源性比較與系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析將所測得的序列于Genbank上進(jìn)行Blast比對,利用MEGA 4.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[11]。

        1.3 菌種的生長特性研究

        為研究菌種的最適生長條件,進(jìn)行單因素試驗(yàn)。

        1.3.1 溫度 向液體牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基中接入2 mL菌懸液,分別在15、20、25、30、35、40 ℃條件下培養(yǎng),均做3個平行試驗(yàn),120 r/min振蕩24 h后,測定培養(yǎng)基內(nèi)菌液OD值。

        1.3.2 pH 將菌懸液分別接入pH為3、5、7、9、12的牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基內(nèi),其他條件同上,測定24 h后培養(yǎng)基內(nèi)菌液OD值。

        1.3.3 鹽濃度 將菌懸液分別接入鹽濃度為10%、15%、20%、25%、30%的牛肉膏蛋白胨液體培養(yǎng)基內(nèi),其他條件同上,測定24 h后培養(yǎng)基內(nèi)菌液OD值。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌種的分離純化及篩選

        將取樣地樣本進(jìn)行初篩,共獲得34株菌。再經(jīng)富集培養(yǎng)、梯度稀釋的菌液涂布于篩選培養(yǎng)基培養(yǎng),將其純化后轉(zhuǎn)接到篩選培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)2~5 d。在平板培養(yǎng)基上選取高濃度區(qū)域以外分散的單菌落,根據(jù)菌落大小、形狀、顏色、隆起程度、表面光澤、透明程度、邊緣形狀和在高鹽濃度下生長情況等差別,最終分離出2株菌落,分別命名為菌種A、B。

        2.2 菌種鑒定

        2.2.1 菌種形態(tài)特征觀察 菌種A呈米黃色,菌體表面光滑并且濕潤,單一菌落形狀為長圓形,邊緣平滑,在液體培養(yǎng)基生長渾濁,容易被挑起,沒有菌膜形成,無沉淀。菌種B呈乳脂狀,呈現(xiàn)乳白色,透明,單一菌落形狀為圓形,邊緣為鋸齒狀,菌體表面光滑且濕潤,不容易被挑起;在液體培養(yǎng)基生長渾濁,沒有菌膜形成,無沉淀。

        2.2.2 菌種生理生化鑒定 菌種A、B均能進(jìn)行葡萄糖氧化產(chǎn)酸,在生長溫度測定試驗(yàn)中均有渾濁,無沉淀物和懸浮物產(chǎn)生。生長物有穿刺線向四周呈云霧狀擴(kuò)散,表示菌種均有運(yùn)動性。其他結(jié)果見表2。

        2.2.3 掃描電鏡觀察 菌種A和菌種B都是桿狀菌,菌種A和B的掃描電鏡的照片見圖1,照片的放大倍數(shù)是10 000倍。菌體大小分別為(1.0~1.5) μm×(0.5~1.0) μm和(0.5~2.0) μm×(0.5~1.5) μm,均無芽孢,無鞭毛。

        2.2.4 菌種的分子鑒定 菌種A及菌種B的完整基因序列長度分別是1 452 bp和1 451 bp。將菌種A的16S rDNA基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比對發(fā)現(xiàn)該耐鹽菌的基因序列與Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037同源性達(dá)到了99%。根據(jù)比對結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖2。由分子鑒定結(jié)果可知,高效耐鹽菌A屬芽孢桿菌屬。

        將菌種B的16S rDNA基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比對,該菌基因序列與Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1同源性達(dá)99%。根據(jù)比對結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖3。由分子鑒定結(jié)果可知,高效耐鹽菌B屬芽孢桿菌屬。

        2.3 菌種的生長特性研究

        2.3.1 溫度對菌種生長的影響 由圖4可知,菌種A和B的最適生長溫度均為30 ℃,溫度升高至35 ℃時(shí),菌液的濃度降低,菌種生長十分緩慢。

        2.3.2 pH對菌種生長的影響 由圖5可知,菌種A在pH為7~9時(shí)生長狀態(tài)良好,pH為3~5時(shí)生長十分緩慢。菌種B在pH為7~9時(shí)生長情況較好,pH為12時(shí)仍能生長。綜上所述,菌種A、B的最適pH值范圍為7~9,強(qiáng)酸的條件不適合菌種的生長,強(qiáng)堿性的條件菌種能夠生長。

        2.3.3 鹽濃度對菌種生長的影響 由圖6可知,鹽濃度為10%~15%時(shí),菌種A和B生長緩慢,鹽濃度為15%~25%時(shí),菌種A和B生長迅速,鹽濃度為25%~32%時(shí),菌種A和B仍能生長,但生長緩慢,綜上所述,菌種A和B耐鹽范圍比較大,可耐受較高鹽濃度。

        3 小結(jié)與討論

        1)以大慶鹽堿地取得的土壤樣本為菌源,利用采用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,稀釋平板法分離純化,最終篩選得到能夠最高耐受鹽濃度32%的菌種A和菌種B。

        2)經(jīng)一系列生理生化試驗(yàn)鑒定和16S rDNA測序比對,菌種A 為脫氮嗜鹽芽孢桿菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌種 B 為咸魚芽孢桿菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),菌種A和B均屬芽孢桿菌屬。

        3)通過單因素試驗(yàn)可知,菌種A、B最優(yōu)條件組合均為:溫度30 ℃,pH在7~9,鹽濃度20%。在此條件下,菌種生長最好。

        參考文獻(xiàn):

        [1] 劉興土.松嫩平原退化土地整治與農(nóng)業(yè)發(fā)展[M].北京:科學(xué)出版社,2001.

        [2] 宋長春,何 巖,鄧 偉.松嫩平原鹽漬土壤生態(tài)地球化學(xué)[M].北京:科學(xué)出版社,2003.

        [3] 李取生,李秀軍,李曉軍,等.松嫩平原蘇打鹽堿地治理與利用[J].資源科學(xué),2003(1):17-22.

        [4] 周德慶,徐德強(qiáng).微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教程[M].第三版.北京:高等教育出版社,2013.

        [5] 姜朵朵.耐鹽苯酚降解菌的篩選鑒定及其降解特性研究[D].鎮(zhèn)江:江蘇科技大學(xué),2013.

        [6] 米 琴,張玉琴,陳義光,等.青海鹽環(huán)境下革蘭氏陽性中度嗜鹽細(xì)菌的分離及其生物學(xué)特性[J].陜西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),2005,33(3):86-90.

        [7] 韋 娜,張前前,杜宗軍,等.極端嗜鹽菌Halomonas elogata的分離鑒定及其降解偶氮染料活性蘭BRF的條件優(yōu)化研究[J].環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào),2012,32(9):2091-2096.

        [8] 程麗娟,薛泉宏.微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)[M].西安:世界圖書出版公司,2000.

        [9] YOICHI K, MAKOTO O, TAKANORI I, et al. Varietal and seasonal differences in oxalate content of spinach [J]. Scientia Horticulturae,2003,97:203-210.

        [10] 東秀珠,蔡妙英.常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊[M].北京:科學(xué)出版社,2001.

        [11] 劉旭光,張 杰.分子生物學(xué)軟件應(yīng)用[M].北京:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)出版社,2007.

        (責(zé)任編輯 彭西甜)

        2.2.2 菌種生理生化鑒定 菌種A、B均能進(jìn)行葡萄糖氧化產(chǎn)酸,在生長溫度測定試驗(yàn)中均有渾濁,無沉淀物和懸浮物產(chǎn)生。生長物有穿刺線向四周呈云霧狀擴(kuò)散,表示菌種均有運(yùn)動性。其他結(jié)果見表2。

        2.2.3 掃描電鏡觀察 菌種A和菌種B都是桿狀菌,菌種A和B的掃描電鏡的照片見圖1,照片的放大倍數(shù)是10 000倍。菌體大小分別為(1.0~1.5) μm×(0.5~1.0) μm和(0.5~2.0) μm×(0.5~1.5) μm,均無芽孢,無鞭毛。

        2.2.4 菌種的分子鑒定 菌種A及菌種B的完整基因序列長度分別是1 452 bp和1 451 bp。將菌種A的16S rDNA基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比對發(fā)現(xiàn)該耐鹽菌的基因序列與Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037同源性達(dá)到了99%。根據(jù)比對結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖2。由分子鑒定結(jié)果可知,高效耐鹽菌A屬芽孢桿菌屬。

        將菌種B的16S rDNA基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比對,該菌基因序列與Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1同源性達(dá)99%。根據(jù)比對結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖3。由分子鑒定結(jié)果可知,高效耐鹽菌B屬芽孢桿菌屬。

        2.3 菌種的生長特性研究

        2.3.1 溫度對菌種生長的影響 由圖4可知,菌種A和B的最適生長溫度均為30 ℃,溫度升高至35 ℃時(shí),菌液的濃度降低,菌種生長十分緩慢。

        2.3.2 pH對菌種生長的影響 由圖5可知,菌種A在pH為7~9時(shí)生長狀態(tài)良好,pH為3~5時(shí)生長十分緩慢。菌種B在pH為7~9時(shí)生長情況較好,pH為12時(shí)仍能生長。綜上所述,菌種A、B的最適pH值范圍為7~9,強(qiáng)酸的條件不適合菌種的生長,強(qiáng)堿性的條件菌種能夠生長。

        2.3.3 鹽濃度對菌種生長的影響 由圖6可知,鹽濃度為10%~15%時(shí),菌種A和B生長緩慢,鹽濃度為15%~25%時(shí),菌種A和B生長迅速,鹽濃度為25%~32%時(shí),菌種A和B仍能生長,但生長緩慢,綜上所述,菌種A和B耐鹽范圍比較大,可耐受較高鹽濃度。

        3 小結(jié)與討論

        1)以大慶鹽堿地取得的土壤樣本為菌源,利用采用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,稀釋平板法分離純化,最終篩選得到能夠最高耐受鹽濃度32%的菌種A和菌種B。

        2)經(jīng)一系列生理生化試驗(yàn)鑒定和16S rDNA測序比對,菌種A 為脫氮嗜鹽芽孢桿菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌種 B 為咸魚芽孢桿菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),菌種A和B均屬芽孢桿菌屬。

        3)通過單因素試驗(yàn)可知,菌種A、B最優(yōu)條件組合均為:溫度30 ℃,pH在7~9,鹽濃度20%。在此條件下,菌種生長最好。

        參考文獻(xiàn):

        [1] 劉興土.松嫩平原退化土地整治與農(nóng)業(yè)發(fā)展[M].北京:科學(xué)出版社,2001.

        [2] 宋長春,何 巖,鄧 偉.松嫩平原鹽漬土壤生態(tài)地球化學(xué)[M].北京:科學(xué)出版社,2003.

        [3] 李取生,李秀軍,李曉軍,等.松嫩平原蘇打鹽堿地治理與利用[J].資源科學(xué),2003(1):17-22.

        [4] 周德慶,徐德強(qiáng).微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教程[M].第三版.北京:高等教育出版社,2013.

        [5] 姜朵朵.耐鹽苯酚降解菌的篩選鑒定及其降解特性研究[D].鎮(zhèn)江:江蘇科技大學(xué),2013.

        [6] 米 琴,張玉琴,陳義光,等.青海鹽環(huán)境下革蘭氏陽性中度嗜鹽細(xì)菌的分離及其生物學(xué)特性[J].陜西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),2005,33(3):86-90.

        [7] 韋 娜,張前前,杜宗軍,等.極端嗜鹽菌Halomonas elogata的分離鑒定及其降解偶氮染料活性蘭BRF的條件優(yōu)化研究[J].環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào),2012,32(9):2091-2096.

        [8] 程麗娟,薛泉宏.微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)[M].西安:世界圖書出版公司,2000.

        [9] YOICHI K, MAKOTO O, TAKANORI I, et al. Varietal and seasonal differences in oxalate content of spinach [J]. Scientia Horticulturae,2003,97:203-210.

        [10] 東秀珠,蔡妙英.常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊[M].北京:科學(xué)出版社,2001.

        [11] 劉旭光,張 杰.分子生物學(xué)軟件應(yīng)用[M].北京:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)出版社,2007.

        (責(zé)任編輯 彭西甜)

        2.2.2 菌種生理生化鑒定 菌種A、B均能進(jìn)行葡萄糖氧化產(chǎn)酸,在生長溫度測定試驗(yàn)中均有渾濁,無沉淀物和懸浮物產(chǎn)生。生長物有穿刺線向四周呈云霧狀擴(kuò)散,表示菌種均有運(yùn)動性。其他結(jié)果見表2。

        2.2.3 掃描電鏡觀察 菌種A和菌種B都是桿狀菌,菌種A和B的掃描電鏡的照片見圖1,照片的放大倍數(shù)是10 000倍。菌體大小分別為(1.0~1.5) μm×(0.5~1.0) μm和(0.5~2.0) μm×(0.5~1.5) μm,均無芽孢,無鞭毛。

        2.2.4 菌種的分子鑒定 菌種A及菌種B的完整基因序列長度分別是1 452 bp和1 451 bp。將菌種A的16S rDNA基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比對發(fā)現(xiàn)該耐鹽菌的基因序列與Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037同源性達(dá)到了99%。根據(jù)比對結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖2。由分子鑒定結(jié)果可知,高效耐鹽菌A屬芽孢桿菌屬。

        將菌種B的16S rDNA基因序列與GenBank數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)比對,該菌基因序列與Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1同源性達(dá)99%。根據(jù)比對結(jié)果建立系統(tǒng)發(fā)育樹,見圖3。由分子鑒定結(jié)果可知,高效耐鹽菌B屬芽孢桿菌屬。

        2.3 菌種的生長特性研究

        2.3.1 溫度對菌種生長的影響 由圖4可知,菌種A和B的最適生長溫度均為30 ℃,溫度升高至35 ℃時(shí),菌液的濃度降低,菌種生長十分緩慢。

        2.3.2 pH對菌種生長的影響 由圖5可知,菌種A在pH為7~9時(shí)生長狀態(tài)良好,pH為3~5時(shí)生長十分緩慢。菌種B在pH為7~9時(shí)生長情況較好,pH為12時(shí)仍能生長。綜上所述,菌種A、B的最適pH值范圍為7~9,強(qiáng)酸的條件不適合菌種的生長,強(qiáng)堿性的條件菌種能夠生長。

        2.3.3 鹽濃度對菌種生長的影響 由圖6可知,鹽濃度為10%~15%時(shí),菌種A和B生長緩慢,鹽濃度為15%~25%時(shí),菌種A和B生長迅速,鹽濃度為25%~32%時(shí),菌種A和B仍能生長,但生長緩慢,綜上所述,菌種A和B耐鹽范圍比較大,可耐受較高鹽濃度。

        3 小結(jié)與討論

        1)以大慶鹽堿地取得的土壤樣本為菌源,利用采用牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,稀釋平板法分離純化,最終篩選得到能夠最高耐受鹽濃度32%的菌種A和菌種B。

        2)經(jīng)一系列生理生化試驗(yàn)鑒定和16S rDNA測序比對,菌種A 為脫氮嗜鹽芽孢桿菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌種 B 為咸魚芽孢桿菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),菌種A和B均屬芽孢桿菌屬。

        3)通過單因素試驗(yàn)可知,菌種A、B最優(yōu)條件組合均為:溫度30 ℃,pH在7~9,鹽濃度20%。在此條件下,菌種生長最好。

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        (責(zé)任編輯 彭西甜)

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